Flavobacterium sediminilitoris: LXD69_05135
Help
Entry
LXD69_05135 CDS
T08185
Name
(GenBank) T9SS type B sorting domain-containing protein
Organism
fsd
Flavobacterium sediminilitoris
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SprB
BiPBP_C
CHU_C
DUF11
Y_Y_Y
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOX34896
UniProt:
A0ABY4HQI8
LinkDB
All DBs
Position
complement(1103120..1113568)
Genome browser
AA seq
3482 aa
AA seq
DB search
MKLKITQFKRLVFVVVCMININLFAQNYVPFSGPGRLTPIPFNESLKGDMLLIGNNILNR
STSSNGPNVPYNGTDINDNLNMQYVDIDGDPSTFNSSTADLTIPVANSGCYVIKYAALYW
AGLYNEGNIDDEVDRSRLGNVKFKLPGGNYTDITGAVIYDTYPTGLNQKYSYVASYDVTT
LLQGLTDASGTYGVANVQCGLGVKTSGGWSLFVVYEDPLSTAKNITLFDGFSSIQGTTSL
DIPISGFNSIPVGPVRAKLAFAALEGDNGISGDRLRINGTSMSIPTRLASNFFNSTINDI
NGAYTTRNLNSSNTLGYDSGIINIPNPGNAVIANNATSANVQLQTSGDAYVYYLNAFAVE
IIQPQINLIKIVRDLADNDIGNTTVSLGQEIFYELDFQNIGNDGATGFTIKDQLPLNVTF
LPADLEVPPGVTYTFDPVTNEIIFTIPDNLVTESGANYLIRIKVRVAETCYDLRDACSNE
IRNQAYKTYSSINSGNIVENEEPSASGINSCLILSPGTTNFLADIDDCVFEREEVLCGNS
VTLTAGNGYVSYQWHSGSPPTAANAIAGATNQSYTVTGTGTYSVVNTAPAPCLSITETFN
VIDFNGVVPNPVIPYADQVDVCPNDDSDLPKIYLCGETDSQLIETNILNATSIIWEVLST
PSTCTDPTPSTNCPNTTCPDSAWSQVGTGSNFNAVDAGEYRVRIVFQNGCFRTYYFNVYK
NLFTPTATSTDIICNTPGTITVNGVPNGYEFSLDGTNWQSGNLFTINTAGAYTVYIRQIG
GGVGNCIFDIPNIQILNRDFNVDVIVNDALCNGGQGSIRVQINNVDPQYTYQLSQGGTPI
NNVGPINANDYTFPNLPAGTYTVNISTTDGCTYSETVTISDPPLLTLTGAVTIPLTCTDG
EITVYPVGGTPPYTYGINNDPGTIYSLPNFVITTPGTYTFTVTDSNNCTATTDVIIDNIP
QPVYTVSQIDVLCYGESTGQIEFNVTNTNGYTLEYSIDNGVTFGTNPVFSNLPAGTYETI
VQYSLGGTICTTTVETIVISQPDTALTASAGVSELAGCGPNGEGKVRITNPQGGVPGYEY
SFDGGTTWVTSNEAYLLPGTYSVCIRDTNNCTFCTSVTIDPAPQDPTISVEDPDFNCTGT
ATSTVTVSSGSTNFSYTYLLDGVVNTNVPENVFVDVPCGDHEITVQYRSLSVPTYSNLLF
EDFGRGDNTTSPGINPAYCFERQVAATQCNGSIQINDGDYAVTKRIDPRFGTWADPSDHT
SNGTDPEGRFLCVNIGGTAGVGGILYSKPITDIIPNQPVQVSLWAMNLIRSSSSTLGDPQ
LTIQLIADLGTPSEVIVATTPTASPIIVPKSNQWESYSLALNPGSYTSLSFVIRSYSTVI
NGNDVVIDDINVFQEPIACITEVKYPIHIDCNQAFSAQITSSSDVSCNGATDGQITIAAQ
NFELPYGFDYSIDGGASWTNSTTSPVTITGLSANTYNIEIRFDDTAGTCSFPFTQVISEP
DSLLADAVLTSPATCLVGGVITASASGGTPNYQYELQNSTGTVLVPFQVNNVFSNLTPGD
YIVVVRDVLNCTDPIDVAINIPVPTPPTAVVDASSDLCYDGTNAATIVVTASGGVSPYQY
SLNGGTYQNGNTFSGLTPGNYTITVRDSYGCEVTMSTVTIAPQLIANAVLTNGLDCTASP
DADIDVTINGGSAPYTYQVTFNTAFDPTINNITGNTFTYSTANAGTYQFTITDAIGCTVT
TSVITVNPLPVLNPPVVAQTGFNLCNGDTNGAISVTPSGGQAPYIIDIVNTTTSVSYGAQ
TTGLTAGDYTITVTDANSCIETVTITLTEPDPVDFTFTKTDIQCGAVGTAPGTINIINVT
GGTSPFTYTISNSTGTYTDTYNAVSNEDHIFNILNFGIYTISVVDANGCQLVENNITIAS
PPNNLNINVSQAITDCTVGGTIEVCVDPAVAGGPYHFAIYEDLSPNNPPYATYPGPQYQP
ADGGATGLCATFTGLMPGVTYSFIVYDEATNCYYFETATEPVPTLSTITSTITPNNVTCT
GAADGSVSFVISNYSGTSVSYQVYLALNNTPVSAVGTSTGTGTPITVNDFGVLPPGEYFV
LFTENDGPNAACSQTSINFTISESPVLLSLTASVTKNDNCNPNAGQITVTGSNGTPPYTY
QVVPAGSPAPTVWPGQTSNVFNVEGGSYDVYIMDAYGCIQPSTNIFVPTDTTPNIDLDID
AATLCNINEGNYSIIVTRDNTVGVGPFTYSVDGAAFTTYTENASFSFTLTGLNSGTHTVI
IKDSNGCTETETITIYPPLNGTITTTIDAVANCGVSDGIITVNASGGSDASNYVYTITPN
IAPISQLGNVFSNVPAGNYTVTVTDNITGCSIDKSVILDMPTVPVFDTTVTNATCNLGTD
GTITVNLTGSNPNPVYMYEITSPIVVGPQTSNVFTGLSAGNYTVVVTSGRNCVTTEIVTV
GEATAINIPTVTVTEFGCNSGSNTVNNATIVVNGVNGGSGTYINYEFLDSSNNILQTGTS
NTYIESNILGGTYTINVYDNNGCIGTTTAVINPFIAISNPRVTVTTPITCTNPEDITINI
DTTGGTPTTLVYTVVGLSTGSTYNVSQTNNPNFTGLTIGNYQITVENATTGCSVQTIHYV
FDPNTFIVNAVVNNNVTCFDGADGSIDITFIDQNTIPTDDAGSFDYDIIDTATGLSVSSG
TSPDAGPFTVDNLPSGVYQLQAVLNQNPSCPVTTNFTITQPIETLSITTSSTPISCIPGS
DGSISAVGNNGWGAPYEYQLESGGSVIVAWSSVNNFTGLGAGTYTVSVRDNIGCEVSSSN
IILDVPTPIDATINASTTFLPCRGDNDATITITNVTGGYGSGYLFVLNNITTGTSSAPQT
SNVFTNLGAGEYNVTITDSFNCEFPTASVIIDEPNDDVMASLAMTVDPTCDQGATLELTA
IGGTAPYAYSTTPGGPYIPFTGTMVFNNVASGTYSYYVVDANDCFEDFASIIVEPVIPVS
VTVDTTRTVISCNGYTTSVTATAVNGLGNYVYTLLPATAGVVQSSPGVFINVPAGTYTVH
VDSGDCDGDSESFTITEPTPIEYELTITQPTCASLPNDGSIEVIATGGTGIIQFSISSAP
NETVNSGIFNNLTPGSYTIFIQDQNGCSLSLGPLDITAPPTFELVDAPNIIDELCLGDGG
SVSFSVQGGSPSPVFGYEATNGSTTLTSLTGDFTFDNLSYGYYEFIVTDGTGVCTVDFAI
DLEPGEDIQPGVEFDNSCVNDSPNVNVLITFNEDIPIGDLTFDLDGVTQVGNNLFVNVAD
GNHTATVTHNDGCVKQISFNVTISSSPVLTLAQSGLNQFTMSTQGGTAPYSYNVNGQDVG
SNTTYLVNQTGLYTVIVTDANGCTDVDTIQMTFYDVEIPDYFTPDGDGTNDGWTPNYLDH
YPKAVTYVFDRYSRKIITLRPGQSWNGTYNGNELPSGDYWYVLKLNGENDAREFVGNFTL
YR
NT seq
10449 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattaaaaattactcaattcaaaagattggtgtttgtcgtcgtttgcatgataaat
attaatctgtttgcacaaaattatgtacccttttcgggaccaggtcgtttaactccgata
ccctttaatgagagtttaaaaggagatatgcttcttataggaaataatatcctaaataga
agcacaagttcaaatggtccaaatgttccttataacggaacagatataaacgacaatttg
aacatgcagtatgttgatattgatggagatccttcaacatttaattcaagtactgcggac
ttaactattcctgtcgccaattcgggttgttacgttataaaatatgcggctctttattgg
gctggactttataatgagggtaatattgatgatgaagtcgatagaagccgattaggaaat
gtaaagtttaaattaccaggaggtaattatactgatattacaggtgctgtaatatatgat
acttatcctacaggtcttaatcaaaaatatagttatgttgcttcttatgatgtaacaact
ttgctacaaggattaacagatgcaagcggtacttatggagttgcaaatgtccaatgtgga
ttaggtgtaaaaacctcaggtggatggtctctttttgtagtttatgaagacccattatca
actgctaaaaacattaccttatttgatggatttagtagtattcaaggaactacaagttta
gatattccgatttctggttttaattcaatacctgttggtccagtaagagctaaattagct
tttgcagcattagaaggagataatggaatttcaggagatcgccttagaataaatggaacc
agtatgtcaattccaactagattggcttccaacttttttaatagtaccataaatgatata
aatggagcatatactactcgaaatttaaatagttctaatacattaggatatgattcagga
ataattaatattcccaatccaggaaatgcggttattgcaaacaatgcaacaagtgcaaat
gtccaacttcaaactagtggagatgcttatgtctattatttaaatgcttttgccgttgaa
attattcagcctcaaataaatttaataaaaattgtaagagatttagctgacaatgatatt
gggaacacaactgtttcattaggacaagaaattttttatgaattagattttcaaaatatt
ggaaatgatggagcaacagggtttactataaaagatcaattaccattaaatgtaactttt
ttaccagcagacttagaggttcctcctggagtaacttatacttttgatccagtaacaaat
gaaattatatttactattcctgataatttagtaaccgaatcgggtgcaaattatttaatt
agaataaaagtaagagtagcagaaacatgttatgatttaagagatgcatgttcaaacgaa
attcgcaatcaagcatataaaacatatagcagtataaattctggaaatatagttgaaaat
gaagagccaagtgcatctggaattaatagctgtttaattctatcaccaggaactacaaac
ttcttagctgatatagatgattgcgtttttgaaagagaagaagttttatgtggtaactca
gttactttaacagcgggtaatggttatgtttcttaccaatggcatagcggatcaccacct
actgctgcaaatgcaattgctggagcgactaatcaatcatatacagttacaggaacagga
acttacagtgttgtaaatacagcaccagctccgtgtttatctattactgaaacttttaat
gtaattgattttaacggagtagtacctaatccggttattccttatgcagatcaagttgat
gtttgtccaaatgatgattcagatttaccaaaaatatatttatgtggtgaaacagatagt
caattaatagaaacaaatatactaaatgcaacaagtattatttgggaagtattaagtaca
cctagtacttgtactgatcctacaccttcaacaaattgtccaaatacaacatgtccagat
agtgcatggtcacaagttggtacaggatcaaattttaatgcagttgatgctggtgaatat
agagtcagaatagtgtttcaaaatggatgttttagaacatattattttaatgtttataaa
aacctttttacacctacagcaacatctacagatattatttgtaatacacctggaacgatt
acagttaatggagttcctaatggatatgaatttagtttagatggaaccaattggcaatca
ggaaatttatttacaattaatacagcaggagcatatactgtttatattagacaaattgga
ggtggtgttggaaattgtatttttgacattcctaatattcaaattcttaatagagatttt
aatgttgatgttatagttaatgatgctctttgtaatggaggacaaggaagtattagagtt
caaattaataatgttgatccgcaatatacatatcaattatcacaaggcggaacacctata
aacaatgtaggacctataaatgcaaatgattatacatttccaaatttacctgcaggaaca
tatacagttaatatttcaacaacagatggatgtacatattcagagactgtaacaatttct
gatccaccattacttactttaacaggagcagtaacaattccattaacatgtacagatgga
gaaataacagtttatccagttggaggaacacctccttatacttatggaattaataatgat
ccaggaacaatttattctttacctaattttgttattacaacacctggtacatatacattt
acagtaacagattcaaataactgtacagctactactgatgtaattatagataatatacca
caaccagtatataccgtttctcaaatagatgtattatgttatggagaatcaacaggacag
atagaatttaatgttacaaatacaaacggttacacattagaatatagtattgataatgga
gtaacatttggtacaaatccagttttttcaaatttacctgcaggaacttatgaaacaata
gttcaatattctttaggaggaacaatatgtactactacagtagaaacaattgttataagt
caacctgatacagcattgacagcttcagcaggagtttctgaattagcaggttgtggacct
aatggagaaggtaaagtgagaattacaaatcctcaaggaggagtcccaggttatgaatat
agttttgatggaggaactacttgggttacatctaatgaagcttatttattaccaggaaca
tattctgtatgtatacgtgatacaaataattgtactttttgtacaagcgttactattgat
cccgctcctcaagatccaacaatttcagtagaagaccctgattttaattgtacaggaaca
gcaacgtctacagtgacagtaagttcaggatctactaatttttcatatacttatttatta
gatggagttgtaaatacaaatgtacctgaaaatgtttttgtagatgtcccatgtggagat
catgaaattacagttcaatacagaagtttatctgttcctacatatagtaatttattattt
gaagattttggacgaggagataatacaacttcaccaggtattaatcctgcctattgtttt
gaaagacaagttgcagcaactcaatgtaatggaagtattcaaataaacgatggagattat
gccgtaacaaaaagaattgatccaagatttggtacgtgggcagatcctagtgaccatact
tctaacggaacagatccggagggaagatttttatgcgtgaatataggaggaactgctggt
gtaggtggtattttatatagtaaaccaatcacagatattatacctaatcaacctgttcaa
gtttcattatgggctatgaatttgattagaagtagttcatctactttaggagaccctcaa
ttaacaatacaattaatagcagatttaggaactccttccgaagtaattgttgctacaaca
cctactgcttcaccaattattgttcctaaatcgaatcaatgggaatcgtatagtttagct
ttaaacccaggttcttatacatcattgagttttgtaattagatcatatagtactgttata
aacggaaatgatgtggtaatagatgacattaatgtttttcaagaaccaatagcatgtatt
acagaagttaagtatccaatacatatcgattgtaatcaagcgttctctgcacaaattaca
agctcaagtgatgtaagttgtaatggagctactgatggtcaaattacaattgcagcacaa
aattttgaattaccttatggatttgattattctatagatggaggtgcaagttggactaac
tctactacttctcctgtaacaataacaggtttatctgcaaatacatataatatcgaaatt
agatttgatgatacggctggaacatgttctttccctttcacgcaagtaatttctgaacca
gactcattactagcagatgctgtattaactagtccagctacttgtttagttggtggtgta
attacagcttcagcttcaggaggaactccgaattatcaatatgaattacaaaatagtaca
ggaacagtccttgttccgtttcaagtaaataatgttttttcaaatttaacaccaggagat
tatattgtggttgttagggacgttcttaattgtacagatccaattgatgttgctataaat
atcccagtacctactcctcctacagcagttgtagatgcgtcatctgatttgtgttatgat
ggaacaaatgctgcaacaattgtagttactgcttcagggggtgttagtccttatcaatat
agtttaaatggaggaacatatcaaaatggaaatactttttctggtttaacacctggaaac
tatacaataacagttagggattcttatggttgtgaagtgacaatgtcaacagtaaccatt
gcacctcaattaatagcaaatgctgttttaactaatggattagattgtacagcatcacca
gatgcagatattgatgtaacaattaatggaggttctgcaccttatacatatcaagttaca
tttaatacagctttcgacccaacaattaataatattacaggaaatacttttacatattca
acagcgaatgctggaacatatcagtttactataactgatgcaataggttgtacagtgaca
acttctgtaataacagtaaaccctttgcctgtattgaatcctccagttgttgctcaaaca
ggatttaatttatgtaatggagacactaatggagctatatccgttactccatctggagga
caagctccatatattatagatatagtaaacacaacaacgtctgtttcttatggagcacag
actacaggacttacagcgggagattatacaattacagttactgatgcaaattcttgtata
gaaacagtaacaattacattaacggaaccggatcctgttgattttacatttacaaaaaca
gacattcaatgtggagctgttggaacagcccctggaacgattaatataattaatgttaca
ggaggtacatcaccttttacatatactatttcaaatagtacaggaacctatactgacacc
tataatgcggtgtcaaatgaagatcatatatttaatattttaaattttgggatatataca
atatctgttgtagatgcaaatggttgtcaattagttgaaaataatattacaattgcttca
ccacctaataatttaaatattaatgtgtctcaagcaataacagattgtacagttggtggt
acaattgaggtttgtgtggatccagcagtagcaggaggtccttatcattttgcaatttat
gaagatttatcaccaaataatcctccttatgcgacttatcctggaccacaatatcaacca
gcagatggaggtgcaacaggattatgtgcaacatttacaggattaatgccaggagttaca
tatagttttattgtttatgatgaagctactaattgttattattttgaaactgcaacagag
ccagtacctacattgtcgactattacttctacaataacaccaaataatgtaacttgtaca
ggagcagcagatggaagtgtctcttttgtaatttcaaattattcaggaacaagtgtttca
tatcaagtttatttagcattaaataatacacctgtaagtgctgtaggaacctctacagga
acaggtacaccaataacggtaaatgattttggagtattacctccaggagagtactttgta
ttatttactgaaaacgatggtccaaatgctgcttgttctcaaacatcaattaattttaca
atttctgagtcacctgttttattgtcacttacggcatcagtaactaaaaacgataattgt
aatccaaatgcaggtcaaattacagttactggttcaaatggaacgccaccttatacttat
caggttgttccagcaggttcaccagctccaacagtttggccaggtcaaacttcaaatgtg
tttaatgttgaaggaggatcttatgatgtttatataatggatgcttacggatgtattcaa
ccaagtacaaatatttttgtaccaacggatacaacaccaaatatagatttagatattgat
gcggctacactttgtaatataaatgaagggaattattcaataattgttacgagagacaat
acagttggagttggtccatttacatatagtgttgatggtgcagctttcacaacatatact
gaaaacgcttctttctcatttactttaacaggtttaaattcaggtacgcatactgttatt
ataaaagattctaatggatgtacagagacagagacaataacaatttacccaccattaaat
ggaacaattacaacaactatagatgcagttgcaaattgtggagttagtgatggaattata
actgttaatgcatcaggaggttcagatgcttcaaattatgtatatacaattacacctaat
atagcacctatatcgcaattaggtaatgtattctctaatgttcctgcaggaaattataca
gttacagttacagataatattacaggatgttcgatagataaatctgtaattttagatatg
cctaccgttccagtatttgatacaacggttacaaatgcaacttgtaatttaggaactgat
ggaactattacagtaaatttaacaggttcaaatcctaatccagtttacatgtatgaaatt
acttcaccaatagttgttggtcctcaaacttctaatgtatttacaggtttatcagcagga
aactatacggttgttgttacatctggaagaaactgtgttacaacggagattgtaactgta
ggtgaagctacagcaattaatatacctactgttactgttactgaatttggatgtaattca
ggttcgaatacagttaataatgcaacaatagttgttaatggagtaaatggaggatctgga
acatatattaattatgagtttttagatagttctaataatatacttcaaacagggacaagt
aatacttatatagagtcaaatattttaggaggtacatatacaataaacgtttatgataat
aatggatgtataggtactacaacagcagttataaatccatttatagcaatttctaatcct
agagtaactgttacaactccaattacatgtacaaatcctgaagatattacaataaatatt
gatacaacaggaggaacaccaactacattagtttatacagtagtaggattaagtactgga
agtacatataatgtatcacaaactaataatcctaattttacaggattaacaattggtaat
tatcaaattacagttgaaaatgcaactacaggatgtagtgtacaaacaatacattacgta
tttgatccaaacacatttattgtaaatgctgtagtaaataacaatgtaacgtgttttgat
ggagctgatggaagtattgatattacttttatagatcaaaatactatacctactgatgat
gcagggtcatttgactatgatataattgatacagctactggtttatcagtatcatctgga
actagtcctgatgcaggaccatttacagtggataatttaccaagtggtgtatatcaatta
caggctgttttaaatcaaaacccgtcttgtcctgtaacaacaaactttacaataactcaa
cctattgaaactttatcaattactacaagtagcactcctatttcatgtattccaggtagt
gatggtagcatttctgcagtaggaaataatggttggggagcaccatatgaatatcaatta
gaatctggtggtagtgtaattgttgcttggtcatctgtaaataattttacaggattagga
gcaggtacatatactgttagtgtaagagataacattggttgtgaggtttcgtcatctaat
ataattttagatgttccaactcctattgatgctacaatcaatgcttctactacattttta
ccatgtagaggagataatgatgcgactattacgattactaatgtaacaggaggatatggt
agtggatatttattcgttttaaataacataacaacaggtactagttctgcacctcaaaca
agtaatgtatttactaatttaggagcaggagagtataatgttactattacagattcattt
aattgtgaatttccaacagcaagtgttattattgatgagccaaatgatgatgtaatggct
agtttggcaatgacagttgacccgacatgtgatcaaggagcaacattggaattaactgct
ataggaggaacagctccttatgcttacagtactacaccaggaggaccatatattccgttc
acaggaactatggttttcaataacgtagcttcaggaacatatagttactatgttgtggat
gcaaacgattgttttgaagattttgcttctataattgttgaacctgtaattcctgttagt
gttacggttgatactactcgaacagtaatttcatgtaatggctatactacatcagtaacg
gctacagcagttaatgggttaggaaattatgtttatacattgttgccagctacagcaggg
gttgtacaaagttcaccaggagtatttataaatgttccagcaggtacatacacagtacat
gttgatagtggtgattgtgatggtgattctgaatcatttactataacggaacctacacct
atagagtatgagcttaccattactcaacctacatgtgctagtcttccaaatgatggttcg
attgaagttattgctacaggaggaacaggaataattcagttttctatttcttctgcacct
aatgaaacagttaattcaggaatttttaataatctaactccaggaagctatacgatattt
attcaggatcaaaacggatgttcattatctctagggcctcttgatattactgctccacct
acttttgaattagttgatgcaccaaatattatagatgagttgtgtttaggtgatggtgga
tcagtatcatttagtgtacaaggaggtagtccatcaccagtatttggttatgaagctaca
aatggatcaactactttaacttcattaacaggagattttacttttgataatttaagttat
ggttattatgaatttatagtaacagatggtacaggagtatgtactgtagattttgcaatt
gatttagagccaggtgaagatattcaaccgggtgttgaattcgacaattcatgtgttaat
gactcaccaaatgttaatgttttaatcacatttaatgaagatataccaatcggagatctt
acttttgatttagacggtgttactcaagtaggaaataatttatttgtaaatgttgctgat
ggaaatcatactgctacagttactcataatgatggatgtgtaaaacaaattagttttaat
gtgactatttctagttcaccagttttaacattagctcaaagtggattaaatcagtttacc
atgtcaacgcaaggaggaacagctccatatagttataatgttaatggacaagatgttgga
agtaatacaacttatttagttaatcaaacaggtctttatacagtaattgtaacagatgct
aatggatgtacagatgttgatactatacaaatgacattctatgatgttgagataccagat
tatttcacaccagatggtgacggaacaaacgatggttggactcctaattatttagatcat
tatcctaaagctgtaacttatgtttttgatagatacagtagaaaaataattactttgaga
ccaggtcaatcatggaatggaacttacaacggaaacgaattaccttcaggagactattgg
tatgtgttgaaattgaacggagagaatgatgcaagagagtttgtaggtaatttcacatta
tatagataa
DBGET
integrated database retrieval system