Flavobacterium sediminilitoris: LXD69_14080
Help
Entry
LXD69_14080 CDS
T08185
Name
(GenBank) gliding motility-associated C-terminal domain-containing protein
Organism
fsd
Flavobacterium sediminilitoris
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHU_C
PKD_4
PKD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOX33162
LinkDB
All DBs
Position
complement(3069038..3076720)
Genome browser
AA seq
2560 aa
AA seq
DB search
MRAKITLLILYAFIGINSVYSQFTADKPDLRLCGSPPNYYTDYFNCTSNNYTLNNVFLSL
TNINGVPLDNTTCIPGTTQTMYIMLNYTSNSNSDIYHARIFADLIIDGITTPLNVNFGTV
APGSGQRLLYGPFNWTCGQELLLDKILIVWKTSGNGNELVPYNCNSYTKSQCELPGGTKI
SAPLAVQFTYTGCTSGTSSSINFQSTTNGGTPPYTYEWDFDSNGTVDSTIENPSHTYDNS
IPYSAELKVTDSNGLTNVYIVPINYPSEIIINANIEELDCNIGSTASIDLSISGGSPPYS
FLWNTGATTEDLTNLGVGTYSVTVTDDLGCTKNYSTTISPIVCCSFNVICPTFSMTSLQC
YDELPTQVNYTIQEFEALGNGDGDIGDTPCGIIQITASNSAYLGCNTNVTRTYNITEYED
SNNNGIRDLGENTILNTTNCEQIILINDTTNPNISTQANDLSVECDGNGNTTDLNNWLTN
NGSAVASDDCSNVTWSNDFSQISDTCGQTGAVTVTFTATDDCGNFSTTTATFTIIDTTNP
NISTQANDLSVECDGNGNTTDLNNWLTNNGSAVASDDCSNVTWSNDFSQISDTCGQTGAV
TVTFTATDDCGNFSTTTATFTIIDTTNPNISTQANDLSVECDGNGNTTDLNNWLTNNGGA
VASDDCSNVTWSNDFSQISDTCGQTGAVTVTFTATDDCGNFSTTTATFTIIDTTNPNIST
QANDLSVECDGNGNTTDLNNWLTNNGGAVASDDCSNVTWSNDFSQISDTCGQTGAVTVTF
TATDDCGNFSTTTVTFTIIDTTNPNISTQANDLSVECDGNGNTTDLNNWLTNNGGAVASD
DCSNVTWSNDFSQISDTCGQTGAVTVTFTATDDCGNFSTTTATFTIIDTTNPNISTQAND
LSVECDGNGNTTDLNNWLTNNGGAVASDDCSNVTWSNDFSQISDTCGQTGAVTVTFTATD
DCGNFSTTTVTFTIIDTTNPNISTQANDLSVECDGNGNTTDLNNWLTNNGGAVASDDCSN
VTWSNDFSQISDTCGQTGAVTVTFTATDDCGNFSTTTATFTIIDTTNPNISTQANDLSVE
CDGNGNTTDLNNWLTNNGGAVASDDCSNVTWSNDFSQISDTCGQTGAVTVTFTATDDCGN
FSTTTATFTIIDTTNPNISTQANDLSVECDGNGNTTDLNNWLTNNGGAVASDDCSNVTWS
NDFSQISDTCGQTGAVTVTFTATDDCGNFSTTTATFTIIDTTNPNISTQANDLSVECDGN
GNTTDLNNWLTNNGGAVASDDCSNVTWSNDFSQISDTCGQTGAVTVTFTATDDCGNFSTT
TATFTIIDTTNPNISTQANDLSVECDGNGNTTDLNNWLTNNGGAVASDDCSNVTWSNDFS
QISDTCGQTGAVTVTFTATDDCGNFSTTTATFTIIDTTNPNISTQANDLSVECDGNGNTT
DLNNWLTNNGGAVASDDCSNVTWSNDFSQISDTCGQTGAVTVTFTATDDCGNFSTTTATF
TIIDTTNPNISTQANDLSVECDGNGNTTDLNNWLTNNGGAVASDDCSNVTWSNDFSQISD
TCGQTGAVTVTFTATDDCGNFSTTTATFTIIDTTNPNISTQANDLSVECDGNGNTTDLNN
WLTNNGGAVASDDCSNVTWSNDFSQISDTCGQTGAVTVTFTATDDCGNFSTTTATFTIID
TTNPNISTQANDLSVECDGNGNTTDLNNWLTNNGGAVASDDCSNVTWSNDFSQISDTCGQ
TGAVTVTFTATDDCGNFSTTTATFTIIDTTNPNISTQANDLSVECDGNGNTTDLNNWLTN
NGGAVASDDCSNVTWSNDFSQISDTCGQTGAVTVTFTATDDCGNFSTTTATFTIIDTTNP
NISTQANDLSVECDGNGNTTDLNNWLTNNGGAVASDDCSNVTWSNDFSQISDTCGQTGAV
TVTFTATDDCGNFSTTTATFTIIDTTNPNISTQANDLSVECDGNGNTTDLNNWLTNNGGA
VASDDCSNVTWSNDFSQISDTCGQTGAVTVTFTATDDCGNFSTTTATFTIIDTTNPNIST
QANDLSVECDGNGNTTDLNNWLTNNGGAVASDDCSNVTWSNDFSQISDTCGQTGAVTVTF
TATDDCGNFSTTTATFTIIDTTNPNISTQANDLSVECDGNGNTTDLNNWLTNNGGAVASD
DCSNVTWSNDFSQISDTCGQTGAVTVTFTATDDCGNFSTTTATFTIIDTTNPVFTSDLPE
NISASCDNIPEPEKVTASDNCSTNVTILVNDEVVSDGENCAGNYTIIRTWTITDDCGNND
SYSQTISVYDTTPPSLITPYDTELNVTCDEVPSAPQLEFEDNCSGIYQVTYNENTTTISI
YEYIITRNWSVSDNCGNASDFSQTINVSVSEPFDAIPFSICQNDEPIDLFSILDSSIPTN
GEWIDVNNTGGLTGSIYNPNNIPIGYYTLQYIVTLNESSCPMKFEIYLNVNDDCIVLPAC
SIEIYNAVSPNDDGYNDFFFIDGIECYPDNSIEIYNRWGILVYDTTGYDNSFKSFKGYSE
GRSTVNKNELLPDGTYYYILKYRDIMNTMHDKSGYLYLSK
NT seq
7683 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagagcaaaaattacgctattaatactttatgcttttattgggataaactcagtttat
tctcaatttactgctgataaacccgatttaagattatgtggttctcctccaaattattat
acagattattttaactgtacatcaaacaattacacattaaataatgtttttttaagtcta
actaacataaacggtgtacctttagataatacaacttgtattcctggaacaacacaaact
atgtatattatgttgaattatacatctaattcaaatagtgatatatatcatgcaagaata
tttgcagaccttattatagatggaataacaactcctttaaatgttaattttggtactgtt
gctcctggttcaggtcaaagattattatatggcccttttaattggacttgtggtcaagaa
ttattacttgacaaaatattaatagtttggaaaactagtggaaacggaaacgaattagta
ccttataattgtaattcatatacaaaatcacaatgtgaattacctggcggaactaaaatt
tcagctcctttagctgttcagtttacatatacaggatgtacttctggaacatcttcatct
attaattttcaatctacaactaatggtggaacaccaccatatacttacgaatgggatttt
gattccaatggtacagttgattcaacaattgaaaaccctagtcatacatatgataattca
attccttattcagctgagctaaaagttacagattcgaatggattaacgaatgtatacatt
gtacctatcaattatccatctgaaatcattattaatgcaaatattgaagagttagattgt
aatataggatctactgcttcaatagatttatccatttctggaggaagtccaccatattct
tttctttggaatactggtgcaactactgaagatttaaccaatttaggagtaggaacttat
agtgtaactgtaactgatgatcttggctgtactaaaaattatagtactacaatatctcct
attgtctgttgctctttcaatgttatatgtccaactttttcaatgacaagtttacaatgt
tatgatgaactccctacacaagttaattatacaatacaagaatttgaagcattaggaaat
ggtgatggagatattggagatacaccttgtggtattattcaaattacagcttcaaatagt
gcatatttaggatgtaatacaaatgttactagaacatataatattacagaatatgaagat
tcaaacaataatggaattcgagatttaggagaaaatacaattctaaacactacgaattgt
gaacaaatcatattaatcaatgataccacaaaccctaacatcagcacacaagctaatgat
ctaagcgtagaatgtgatggaaacggaaacactaccgatttaaacaattggttaactaat
aatggtagtgctgtagcttctgatgattgttcaaacgtaacttggtcaaatgatttcagt
caaatttctgatacttgcggacaaacaggtgctgtaacggtaactttcacagcaactgac
gattgtggaaacttctcaaccacaacagcaacctttaccattatcgataccacaaaccct
aacatcagcacacaagctaatgatctaagcgtagaatgtgatggaaacggaaacactacc
gatttaaacaattggttaactaataatggtagtgctgtagcttctgatgattgttcaaac
gtaacttggtcaaatgatttcagtcaaatttctgatacttgcggacaaacaggtgctgta
acggtaactttcacagcaactgacgattgtggaaacttctcaaccacaacagcaaccttt
accattatcgataccacaaaccctaacatcagcacacaagctaatgatttaagcgtagaa
tgtgatggaaacggaaacactaccgatttaaacaattggttaactaataatggtggtgct
gtagcttctgacgattgttcaaacgtaacttggtcaaatgatttcagtcaaatttctgat
acttgcggacaaacaggtgctgtaacggtaactttcacagcaactgacgattgtggaaac
ttctcaaccacaacagcaacctttaccattatcgatactacaaaccctaacatcagcaca
caagctaatgatctaagcgtagaatgtgatggaaacggaaacactaccgatttaaacaat
tggttaactaataatggtggtgctgtagcttctgatgattgttcaaacgtaacttggtca
aatgatttcagtcaaatttctgatacttgcggacaaacaggtgctgtaacggtaactttc
acagcaactgacgattgtggaaacttctcaaccacaacagtaacctttaccattatcgat
actacaaaccctaacatcagcacacaagctaatgatttaagcgtagaatgtgatggaaac
ggaaacactaccgatttaaacaattggttaactaataatggtggtgctgtagcttctgat
gattgttcaaatgtaacttggtcaaatgatttcagtcaaatttctgatacttgcggacaa
acaggtgctgtaacggtaactttcacagcaactgacgattgtggaaacttctcaaccaca
acagcaacctttaccattatcgatactacaaaccctaacatcagcacacaagctaatgat
ctaagcgtagaatgtgatggaaacggaaacactaccgatttaaacaattggttaactaat
aatggtggtgctgtagcttctgatgattgttcaaacgtaacttggtcaaatgatttcagt
caaatttctgatacttgcggacaaacaggtgctgtaacggtaactttcacagcaactgac
gattgtggaaacttctcaaccacaacagtaacctttaccattatcgatactacaaaccct
aacatcagcacacaagctaatgatttaagcgtagaatgtgatggaaacggaaacactacc
gatttaaacaattggttaactaataatggtggtgctgtagcttctgatgattgttcaaat
gtaacttggtcaaatgatttcagtcaaatttctgatacttgcggacaaacaggtgctgta
acggtaactttcacagcaactgacgattgtggaaacttctcaaccacaacagcaaccttt
accattatcgatactacaaatccgaacatcagcacacaagctaatgatttaagcgtagaa
tgtgatggaaacggaaacactaccgatttaaacaattggttaactaataatggtggtgct
gtagcttctgatgattgttcaaatgtaacttggtcaaatgatttcagtcaaatttctgat
acttgcggacaaacaggtgctgtaacggtaactttcacagcaactgacgattgtggaaac
ttctcaaccacaacagcaacctttaccattatcgatactacaaatccgaacatcagcaca
caagctaatgatttaagcgtagaatgtgatggaaacggaaacactaccgatttaaacaat
tggttaactaataatggtggtgctgtagcttctgatgattgttcaaacgtaacttggtca
aatgatttcagtcaaatttctgatacttgcggacaaacaggtgctgtaacggtaactttc
acagcaactgacgattgtggaaacttctcaaccacaacagcaacctttaccattatcgat
actacaaaccctaacatcagcacacaagctaatgatctaagcgtagaatgtgatggaaac
ggaaacactaccgatttaaacaattggttaactaataatggtggtgctgtagcttctgat
gattgttcaaacgtaacttggtcaaatgattttagtcaaatttctgatacttgcggacaa
acaggtgctgtaacggtaactttcacagcaactgacgattgtggaaacttctcaaccaca
acagcaacctttaccattatcgatactacaaaccctaacatcagcacacaagctaatgat
ctaagcgtagaatgtgatggaaacggaaacactaccgatttaaacaattggttaactaat
aatggtggtgctgtagcttctgatgattgttcaaacgtaacttggtcaaatgatttcagt
caaatttctgatacttgcggacaaacaggtgctgtaacggtaactttcacagcaactgac
gattgtggaaacttctcaaccacaacagcaacctttaccattatcgatactacaaaccct
aacatcagcacacaagctaatgatctaagcgtagaatgtgatggaaacggaaacactacc
gatttaaacaattggttaactaataatggtggtgctgtagcttctgatgattgttcaaac
gtaacttggtcaaatgatttcagtcaaatttctgatacttgcggacaaacaggtgctgta
acggtaactttcacagcaactgacgattgtggaaacttctcaaccacaacagcaaccttt
accattatcgatactacaaaccctaacatcagcacacaagctaatgatctaagcgtagaa
tgtgatggaaacggaaacactaccgatttaaacaattggttaactaataatggtggtgct
gtagcttctgatgattgttcaaacgtaacttggtcaaatgattttagtcaaatttctgat
acttgcggacaaacaggtgctgtaacggtaactttcacagcaactgacgattgtggaaac
ttctcaaccacaacagcaacctttaccattatcgatactacaaatccgaacatcagcaca
caagctaatgatttaagcgtagaatgtgatggaaacggaaacactaccgatttaaacaat
tggttaactaataatggtggtgctgtagcttctgatgattgttcaaacgtaacttggtca
aatgatttcagtcaaatttctgatacttgcggacaaacaggtgctgtaacggtaactttc
acagcaactgacgattgtggaaacttctcaaccacaacagcaacctttaccattatcgat
actacaaaccctaacatcagcacacaagctaatgatctaagcgtagaatgtgatggaaac
ggaaacactaccgatttaaacaattggttaactaataatggtggtgctgtagcttctgat
gattgttcaaacgtaacttggtcaaatgattttagtcaaatttctgatacttgcggacaa
acaggtgctgtaacggtaactttcacagcaactgacgattgtggaaacttctcaaccaca
acagcaacctttaccattatcgatactacaaaccctaacatcagcacacaagctaatgat
ctaagcgtagaatgtgatggaaacggaaacactaccgatttaaacaattggttaactaat
aatggtggtgctgtagcttctgatgattgttcaaacgtaacttggtcaaatgatttcagt
caaatttctgatacttgcggacaaacaggtgctgtaacggtaactttcacagcaactgac
gattgtggaaacttctcaaccacaacagcaacctttaccattatcgatactacaaaccct
aacatcagcacacaagctaatgatctaagcgtagaatgtgatggaaacggaaacactacc
gatttaaacaattggttaactaataatggtggtgctgtagcttctgatgattgttcaaac
gtaacttggtcaaatgatttcagtcaaatttctgatacttgcggacaaacaggtgctgta
acggtaactttcacagcaactgacgattgtggaaacttctcaaccacaacagcaaccttt
accattatcgatactacaaaccctaacatcagcacacaagctaatgatctaagcgtagaa
tgtgatggaaacggaaacactaccgatttaaacaattggttaactaataatggtggtgct
gtagcttctgatgattgttcaaacgtaacttggtcaaatgattttagtcaaatttctgat
acttgcggacaaacaggtgctgtaacggtaactttcacagcaactgacgattgtggaaac
ttctcaaccacaacagcaacctttaccattatcgatactacaaaccctaacatcagcaca
caagctaatgatctaagcgtagaatgtgatggaaacggaaacactaccgatttaaacaat
tggttaactaataatggtggtgctgtagcttctgatgattgttcaaacgtaacttggtca
aatgatttcagtcaaatttctgatacttgcggacaaacaggtgctgtaacggtaactttc
acagcaactgacgattgtggaaacttctcaaccacaacagcaacctttaccattatcgat
actacaaaccctaacatcagcacacaagctaatgatctaagcgtagaatgtgatggaaac
ggaaacactaccgatttaaacaattggttaactaataatggtggtgctgtagcttctgat
gattgttcaaacgtaacttggtcaaatgatttcagtcaaatttctgatacttgcggacaa
acaggtgctgtaacggtaactttcacagcaactgacgattgtggaaacttctcaaccaca
acagcaacctttaccattatcgatactacaaatcctgtatttacatctgatttaccagaa
aatatttctgcttcatgtgataatattccggagccagaaaaagtaacagcttcagataat
tgttcaacaaatgtcacaattttagttaatgatgaagttgtttctgacggtgagaattgt
gctggtaattatactatcattagaacatggacaattactgatgattgtggaaataatgat
tcgtatagtcaaactatttcagtttatgacacaacacctccatcattaattactccttat
gatactgaactaaatgtaacgtgtgatgaagtacctagtgctcctcaattagaatttgaa
gataattgttcaggtatttatcaagtgacttataatgaaaacacaacaacaatttccatc
tatgaatatatcatcacaagaaattggagtgtaagtgataattgtggtaatgcatctgat
ttctcacaaacaattaatgttagtgtttcggaaccatttgatgctattcctttttcaatt
tgtcaaaatgatgagcctatcgatttatttagtatattagatagttcaattcctacaaat
ggagaatggattgatgtgaataatactggtggattaacaggaagtatttataatccaaat
aatattcctattggttattacactttacaatatatagttactttaaatgaaagcagttgc
cctatgaaatttgaaatttatttaaatgtaaacgatgattgtattgttttaccagcttgt
tcaattgaaatatacaatgccgtatcaccaaatgatgatggatataatgatttcttcttc
attgacggaatagaatgttatcctgataattctatagaaatatacaatagatggggaata
ttagtttatgatacaactggatatgataatagtttcaaatcttttaaaggatattctgag
ggaagatctactgtaaataaaaatgaattattacctgatggaacttactactatatatta
aaatatagagatataatgaatacaatgcacgataaatctggatacttatatctaagtaaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
