Flavobacterium sediminis: DI487_12260
Help
Entry
DI487_12260 CDS
T06625
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
fse
Flavobacterium sediminis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fse00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fse02000
]
DI487_12260
Transporters [BR:
fse02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
DI487_12260
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarboxypepD_reg
TTR_TEN1-4
CooC_C
Tweety
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWM14552
UniProt:
A0A2U8QWG6
LinkDB
All DBs
Position
2651828..2654821
Genome browser
AA seq
997 aa
AA seq
DB search
MRQILVIISMLFIPIVSLAQEIKGNVVDEFGTPLSGVTIQVLETEKYSITDFDGNFTIEA
KEGQDLKFTMIGMEDLVAKATTNMNVVMKESLTQLNDIVMVGYGVRKKIDNTSSIVSLKA
EDISERKVQNAVQAVQGKVAGVNITSSDAPGSQPSVIIRGINSIEGGRSPLYVVDGVFMD
DITNINSSDIVTFDVLKDASSLAIYGTRGANGVIIITTKQGKGDKMDVTIDSNYGIRMPL
KKVKMSGSNLFALYNNTALGTITFSQDQPVNTNWFDEITRTGTYSQNNITLSGSTKAVDY
MLSSNFYDEDAILNGQGYSRVTIRNNNKFKFNDNIYLKQNINVAFVNNTPKPYGAFTAAY
KQSPAVPVYFNTGQYGVPLVGDDGFVSTSGTNLFNNVGNPVAMLNFHNEQQKNLNLIGAF
EFGAKLFDGLKFTSNFGIEYNTFKSYNFVDSKNIWLAADPTRTSEAYDALDPAQPVNLLT
KTRNSNYKYNWSGYFTYSNVFADIHDVELTAGVETVYDDGNEYLAVTYRDVPANENYWYY
SFSTSDLSNTINEVKNNSNRILSYFGRLQYKLMDKYLVSATLRRDGSSRFQKDYRWGTFP
SVGIGWIVSREDFLADINFVNFLKVRGSWGKLGNQKVPLNQLPFTSGLDYSYGNGYPSAG
ITVSSIVDPELTWEVVEELSGGVDFEVLDSRLKGSFDLYHKKTDKIIIPISAYLTSGTAS
ATYAYAGSVSNKGYEIALRWDDKINDNLSYWISGNLTQNKNELTSLSDNISAQTGGGLGN
GQYTKVLNQDAVGQPLGSFYLWEQAGYDDQGNMTFYDKDGNVVAQDQLTEDDRKFVGSVM
PKTMYGFSVGVKYKNFDLSVDAYGTAGAKIYNGKKAQRFGGENVEYDVASDFWTSTNTNA
GNPAPFNTVPIASTYYLESGDFLRINNISFGYTLPKFTKVISSARIYFNAINPFIFQKYS
GYSPEINGDGNPFNMQGIELDAYPTLRSFVFGVNLKL
NT seq
2994 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagacaaattttagtaattatttcaatgctctttattccgatagtttccttagcgcag
gaaattaaaggaaatgtagtagatgaattcgggacacctctgtcaggggtaaccatacaa
gttctggaaacagaaaagtattccattactgattttgatgggaattttacaatagaggct
aaagaaggccaggatttgaaatttaccatgataggtatggaagatttggtagccaaagcg
actactaatatgaatgttgtcatgaaagaaagcttgacacaattaaatgatattgtaatg
gtaggttatggtgtcagaaaaaaaatagataatacttcttctatagtttctttaaaagca
gaagacatttcagaacgtaaagtacaaaatgctgtacaagccgttcagggtaaagtagcc
ggggtaaatattacatcaagtgatgctccgggaagccaaccttctgtaattataagaggt
attaattcaattgagggcggtcgtagccctttgtatgttgtggatggtgtttttatggac
gatattacaaatatcaactcttcggatattgtaacttttgatgttttgaaagacgcttct
tcattagcaatatacgggacacgtggagcaaatggtgttataattattacgaccaaacaa
gggaaaggtgacaaaatggatgttacaattgactcaaattacggaataagaatgccattg
aaaaaagtaaagatgtccggtagtaatttatttgccctttataataatacagctttagga
accattactttttctcaggatcaaccggttaatactaattggtttgatgaaattaccaga
acaggtacttattctcagaacaatattacattatcaggatcaactaaagcagttgattat
atgttaagtagtaatttttatgatgaagatgctattttaaacggtcaagggtatagcaga
gtgaccattagaaataacaacaaatttaaatttaatgataatatttatttaaaacaaaat
attaatgttgcttttgtaaataatacacctaaaccatacggtgcatttacagcagcatac
aaacaatctccggcggttccggtttactttaatacaggtcaatatggtgtgcctttagtt
ggagatgacggttttgtgtctacatcgggtacaaatctgtttaataatgtaggtaatccg
gtagcaatgcttaattttcacaatgagcaacaaaagaatctgaatttaattggcgcattt
gaattcggtgccaaactatttgacggattaaaatttacttcaaatttcggtatcgagtac
aatactttcaaatcatacaattttgtagattcaaaaaatatctggttagcagctgatcct
accagaacaagtgaggcttatgatgcattagatccagctcaacctgtgaatttattgact
aaaacacgtaatagtaattacaaatacaattggtcaggttattttacttattctaatgtt
tttgcagatattcatgatgtggaattaacagccggtgttgaaacggtttatgatgacgga
aatgagtatctggctgtaacttatcgcgatgtgccggctaatgaaaattattggtattac
agtttttcaacctctgatttaagcaatactatcaatgaagtgaaaaataattccaataga
atattatcttatttcggaagattgcagtataaattgatggataaatatctagtgtctgca
acgcttagaagagatggttcttccagatttcagaaagattacagatggggaacttttcct
tctgtaggaataggatggattgtttcaagagaagattttttagcagatatcaattttgtt
aatttcttaaaggtaagaggttcttggggtaaacttggtaaccagaaagtacctttgaac
caattgccgtttacttcgggtttagattattcttatgggaatgggtatccgtcagcaggg
ataacagtttcttccattgttgaccctgaattaacatgggaagttgtagaagaattatca
ggaggagtagattttgaagttttagattcaagattgaaaggatcttttgatttatatcat
aagaaaacagataagattattatcccgatttcagcatatctgacttcaggaacggctagt
gcaacttatgcttatgccggttctgtttcaaataaaggttatgaaatagcattgcgttgg
gatgataagatcaatgataatttatcgtattggatatcagggaacctaacccaaaataag
aatgaattaaccagtttaagcgataatatatcagctcagacaggtggaggtttagggaat
gggcaatatacaaaagtattgaatcaagatgcagtagggcagcctttaggtagtttttat
ttatgggaacaagcaggttacgacgatcagggaaatatgactttttatgacaaagacgga
aacgttgtggctcaggatcaattaacagaagatgatagaaaatttgttggttctgttatg
ccgaaaactatgtatggttttagcgtgggagttaaatataaaaatttcgatctatctgtt
gatgcttacggaactgccggagcaaaaatatataatggtaagaaagcacaacgatttggc
ggagaaaatgtggagtatgatgtagcatctgatttttggacatcaacaaatacaaatgca
ggtaatcctgccccatttaatactgtgcctattgcttcaacatattacttagaatcagga
gatttcttaagaattaataatatctctttcggatatactttacctaagtttacgaaagtt
atttcttcagcaagaatctattttaacgcgatcaatccatttattttccaaaaatattcc
ggttattcaccggagatcaatggtgacggaaaccctttcaatatgcaagggatagaatta
gatgcttatcctacattacgttcatttgtattcggagttaacttaaaattatag
DBGET
integrated database retrieval system