Flavobacterium soyae: AABD74_06385
Help
Entry
AABD74_06385 CDS
T10840
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
fsf Flavobacterium soyae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fsf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fsf02000
]
AABD74_06385
Transporters [BR:
fsf02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
AABD74_06385
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
SdrD_B
TTR_TEN1-4
Big_1
MetallophosN
Phage_integrase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WYZ21085
UniProt:
A0ABZ2UHU0
LinkDB
All DBs
Position
complement(1436253..1438460)
Genome browser
AA seq
735 aa
AA seq
DB search
MKKLIIALVLGFSGLLSAQNSVSGTVTDNQNQPLPGVSVYAPELHKGTTTDVNGKYELNN
LPNGNLRLSFSYVGYATQNKNIPKLVKQNTIDVTLEESILEMDEVVVSTPFNKLQSQNVM
KIEHESIKTLQQKGTSTLIEGLATIPGVSQISTGTSIGKPVIRGLSGNRVLVYSQGVRIE
NQQFGDEHGLGLNDAGIESVEVIKGPASLLYGSDALGGVLYFNPEKFADAGTFKANFSQK
YFTNTEGSNSSIGLKTSTDNWKFLARGSYNTHSDYKISGGDRVTNSRYNETDFKTGIGYS
NSSFSSVLRYNYNKLDIGMPEDGIAEQSSSKDTQFPRQGIFNHLLSLNNVIFFENSKLDV
DLGYISNDRSEFEDSNDPSLHMRLNTLNYNLKYHFPKFGKIETIFGVQGMHQTNKNSGEE
YLIPDATTNDFGVFGTANYEWNNSVLQTGLRFDNRNVTSDPHGIEGEEGYFQALDRSFDS
FNASLGYKTKLAEPFTLRLNVATGFRAPNLAELTSNGVHEGTNRYEIGNANLKTEQNVQT
DLNLEYKNTHFEFFVNGFYNHVNNYIYTSPTGETRDDNDVFAYVQDNAQLYGGEAGIHFH
PHPLDWLHFETSFETVTGKKDNNDYLPLIPANNWNNTLRTEFNIKNWLSEGFASLNVSST
FSQDNVSGFETASKGYTLVNLGFGGTVKLGKTAFDINLNGNNLFDKKYIAHLSRLKTDGI
PNIGRNIVLGVNFNL
NT seq
2208 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaattaataattgcccttgttttagggttttcgggcttactttctgcccagaat
tcggtttcaggaacagtaactgacaatcaaaatcaacctttacctggcgtttctgtttac
gcaccggaactgcataaaggaacaacaactgatgtaaacggaaaatatgaattaaacaat
cttccaaacggaaatcttcgtctgtctttttcttatgttggatatgccactcaaaataaa
aacatccccaaattagtaaaacaaaataccattgatgtaacgctcgaagaatcgatttta
gaaatggatgaagttgtggtttctactcctttcaacaaactgcaatctcaaaacgtaatg
aaaattgagcatgaaagcattaaaactttacagcaaaaaggaacttcgactttaattgaa
ggtttggctacaattcccggggtttcgcagatttctaccggaacttctattgggaagccg
gtaattcgcggattgagcggtaaccgtgttttagtgtattctcaaggtgttcgtatcgaa
aaccagcagtttggagatgagcatggtttaggcttaaacgatgccggaattgaaagtgtc
gaagttattaaaggccctgcatcgctattgtacggttctgacgctttaggaggagtttta
tacttcaatcctgaaaaatttgctgatgccggtacttttaaagctaatttcagtcaaaaa
tattttacgaatacagaaggaagtaattcttctattggattaaaaacgtctacagataat
tggaaatttctggcgcgtggaagttacaacacacattctgattacaaaatttccggtggc
gaccgcgtaacaaattcgcgctataatgaaactgattttaaaaccggaattggttacagt
aactcaagcttctcaagtgttttaagatacaattacaataagctggatattggaatgcct
gaagatggaattgcagaacaatcttcaagcaaagacacacagttccctaggcagggaatt
tttaatcatttattgagtttaaacaatgttatcttttttgaaaactcaaaacttgatgtt
gatttaggatatatttcaaatgacagaagtgagtttgaagacagcaatgatccttcactt
cacatgagattaaatactttgaattacaacttaaaatatcactttcctaaattcggaaaa
atcgaaaccatttttggggttcagggaatgcatcaaacgaataaaaattctggtgaagaa
tatttaattccagatgcaacaacaaatgattttggtgtttttggaactgcaaattacgaa
tggaacaacagtgttttacaaaccggattacgttttgacaacagaaacgttacttctgac
ccacacggaattgaaggtgaagaaggttattttcaggctttagacagatcttttgacagt
tttaatgcttctttaggatataaaacaaaattggcagaaccgtttacgcttcgtttaaat
gttgcaaccggatttagagcgccaaacttagcggagttaacctcaaacggggttcacgaa
ggaacaaaccgctatgagattggaaacgccaatttgaaaacagaacaaaatgttcaaact
gatttaaatttagaatacaaaaacacgcattttgagtttttcgtaaacggtttttacaat
cacgtaaacaattatatctatacttccccaaccggagaaactcgtgacgataatgatgtt
tttgcttatgttcaggataatgcacaattgtacggaggtgaagctggtatacattttcat
ccgcatcctttagactggttacattttgaaactagttttgaaaccgtaactggtaaaaaa
gacaataatgattacttaccgctgattcctgccaacaactggaataatacgcttagaaca
gaatttaacatcaaaaactggttaagtgaaggttttgcttcattaaatgtatcttcaact
ttcagccaggataatgtgagtggtttcgaaactgcttctaaaggttatactttggttaat
ttaggttttggaggaacggtaaaattgggtaaaacggcttttgacatcaacctgaacgga
aacaatttattcgacaaaaaatacattgcgcacctttcaagattaaaaacagatggaatt
ccaaatattggaagaaacatcgttctgggcgttaatttcaatttataa
DBGET
integrated database retrieval system