Candidatus Fukatsuia symbiotica: CCS41_10315
Help
Entry
CCS41_10315 CDS
T06003
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
fsm
Candidatus Fukatsuia symbiotica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fsm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fsm02000
]
CCS41_10315
Transporters [BR:
fsm02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CCS41_10315
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_stalk
ESPR
YadA_anchor
Spore_YhaL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWK14777
UniProt:
A0A2U8I6Q0
LinkDB
All DBs
Position
complement(2169174..2174177)
Genome browser
AA seq
1667 aa
AA seq
DB search
MNRIYKIVWHGSLGCWIAASELAKASGKKGKKKLWVYRLIIGLFLSGIVFGSYAANSGQR
IEAANGALVIDGGVPESASTKTDATGHMGKGGAQGKTLAGVAIGSRAQGYFGSVAIGDDP
SANSVYGVAIGSGVSIDRRGSGDADSDVGRTFGDKDTKGPSERAVSIGSGVWVKQSFGGI
SVGNEASVNNSTKGIAIGNGAKVDSSVGSVAIGSEARVDGFANSVALGSGSIVHQDKTVS
IGTLTNPRKLTSLAKGTVSNSSTEAVNGSQFFQLEQEVTKNANSIRTHRSEVDSGLFGIV
QQDVITQEITVAGRKTGRQVSLLGTSGTRKLTGVMEGILNANSSDAVNGSQLFATNGEVT
KNTRSITQNAADVSTLTTNINAGSVGLVRQNPSSKAVTVAATSAGNQISFAGTAGSRMLT
GVGEGVLSVSSTDAVNGSQLFSTNTAVTINTEGIERNTLEVKKNTARSRTNSDTILDNAS
SIRLNNDAVSQLKVDIGKGAIGLVQQTPVTGVITVAADSGGDNISLKGKTGERRLSGIKA
GELSTVSTDAVSGSQLFATDTNVTGNLNNIRRLISNLHQGAIGLVQQDGTTKVVTVAATQ
AGNQVSFAGSAGTRKLTGVTQGDITADSSDAINGAQLFTTNKNIVKNSDDIAKSTKDIVE
SAQKITENVNTISKLTRDISQGTIGLVLQDPSSKAITVAADSAGTQISFTSNTGAARTLS
GIKAGTLSISSSDAVNGAQLFATNENVTRNVRDIGEGAKKITENAAAVSTLTNNISQGAI
GLVRQDPLSNVITIAADRAGEQVSFAGNAGVARRLNGLKSAELSTSSSDAVNGAQLFATN
ENVAKNSQSVAKNISDITQHEGKIAQNSADIRSNASGITQNADKITQHEGKTAQNSADIR
SNASGITQNADKITQHEGKIAQNSADIRLNTSGVTQNADKITQHEGKIAQNSADIRSNTS
GITQNADKITQHAGKIAQNSADIRSNTSGITQNADKITQHAGKIAQNSTDIRLNASGITQ
NADKITQHEGKIAQNSTDIRLNASGITQNADKITQHEGKIAQNSTDIRSNTSGITQNTGE
IRTLTNNISQGSIGLVQQDTPTNTITVAATNSGDKVSIVGTSGVRTLNGLKDGELSASSS
DAVNGSQLFATNTDIAKNADDINKFSNSVIKGASGLVRQKSPTDIITVASESAGDQVSLA
GKTGSRKLSDLKDGVLSIDSSDAVNGSQLFTVNQNVAKNTGNIVQNAADIVENAGKIVQN
SESISKLTTDISEGVVGLVQQNSPIATITVAAMKGGEQISFAGQSGSRILTRVKRGALST
TSTDAINGSQLLTTNNEVEKNADGIEQLREEIMNGSIGLLLDNPKHGGWSTDSNSTRKTR
SITLAAGHVAEEVSIEGKNGERRLIGVAPGELSPTSVDAVNGSQLLKTNNELMQNANNIA
AIANSFGGGAMIDPTEDKFVSPSYIVQNREVNNVGDALSMLNDVVVLNSSDIAALKAGRN
KYPSNTMTQLVREDASSKKITVGKLTGGKSVDITGTEGVRRISGVKAGVADNDAVNLEQL
NKTLADMRSANDHSVNRAIKKLDNRLDQVKNKLTAGIASSMAMAGIPQAYVPDSSLLGAA
VASYRGGSAIAIGVSTVSESGKWITKLQSSNNTQKDFGVSLGIGYQW
NT seq
5004 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacagaatatataaaatagtttggcatggctctttaggctgttggatagctgcttca
gaactggcaaaagcgtcgggaaagaaaggcaaaaaaaaattgtgggtttataggttaatt
attggtctttttctatccggcatagtatttggtagttacgctgcaaattctggacagagg
attgaggctgcaaatggagcattggtaattgatggaggggtgcccgagagtgcaagcaca
aaaactgatgcaacgggtcatatgggtaaaggtggggcgcaagggaagacgcttgctggc
gttgcgattggttcaagagctcagggttattttggcagtgttgccattggtgacgacccg
agtgctaattctgtatatggtgtggcaataggttcaggagtgtcgattgatcgcagaggt
agtggtgacgctgatagtgatgtgggtagaacttttggtgataaggatacaaaagggcca
tcggagcgtgctgtttcaataggaagtggggtatgggtaaagcaatcgttcgggggtatt
agtgttggtaatgaagccagtgtcaataactcgacgaagggtattgccataggtaatggt
gctaaggttgatagctccgtaggttctgttgccataggtagtgaagccagagttgatggc
ttcgcaaattctgttgctcttggtagtggttcaatcgttcatcaagacaaaacggtatcg
ataggaactctaaccaatccacgtaaattaaccagccttgctaagggaaccgtgagcaac
agtagtacggaggccgtcaacggtagtcaattttttcagcttgagcaagaagtgacgaaa
aatgctaatagtattagaactcatagatctgaagtcgatagtggattattcggcatagta
caacaggatgtgatcactcaggagattacggtagctgggaggaaaacaggaagacaagtc
tcgcttctaggtacgtcgggaactcgtaagttaaccggtgtcatggaaggtatattaaac
gctaacagcagtgacgctgttaacggcagtcagctgtttgccactaacggagaagtgacg
aaaaataccagaagcattacacaaaatgctgctgacgtaagtacattgaccactaacatc
aatgcggggtcggtcggcttggtgaggcaaaatccatcaagcaaagccgtcactgtcgcc
gctaccagtgcaggaaatcaaatttcttttgctggtacagcaggatcacggatgttaacc
ggtgttggggagggtgtgttaagcgtgagtagcactgatgcggttaacggcagtcagctt
ttttctactaacaccgccgttaccattaatactgaagggattgagagaaatacccttgaa
gtgaaaaaaaacacagctagaagtaggaccaattccgatacgattttggacaatgctagc
agtattaggctaaataatgatgctgtcagccagctaaaggtagatatcggcaaaggagcg
attggtttggtgcagcaaactccggtgacaggggttatcactgtagcggccgacagtgga
ggagataacatctcattaaagggaaaaacaggggagcgcagattgagtggcattaaggca
ggcgagttaagcaccgttagcactgatgctgtcagcggcagccagctttttgctactgac
accaatgtgacgggaaatctcaataatattagaagattgatcagtaaccttcatcaggga
gcgattggtttagtacaacaggatggtactactaaggtcgtcactgttgcagctactcaa
gcaggaaatcaggtttcttttgctggtagcgcagggacacgcaaattaacgggtgttaca
caaggcgacataacggcagatagcagcgatgccatcaatggtgctcaactttttactact
aataaaaatattgtgaaaaatagtgatgatattgcaaaaagcactaaagatatcgtagag
agtgcgcaaaaaattaccgaaaatgtaaatactatcagtaaattgacccgtgatattagt
caaggaactatcggattagtactacaggatccatcaagcaaagcgattaccgtcgcggcg
gatagtgcaggaacacaaatttcttttacgagtaacactggagccgctcgcacattaagc
ggtataaaagcgggtacgttaagtatcagtagcagcgatgcggtcaacggtgcccagctt
tttgctaccaatgagaatgtgacgagaaatgtccgagatatcggggaaggcgcgaagaag
ataacggaaaatgcggcggcggtgagtacactgactaacaatataagccaaggagccatt
ggattagtgcgacaggacccgttaagcaacgtgattactatcgcggcggacagagcaggt
gagcaggtgtcttttgccggtaatgcaggggtggcacgtaggttaaacggcctaaaatcc
gctgagttaagcacgagcagtagtgatgcggtcaacggtgctcagctttttgctactaat
gaaaatgttgcaaaaaatagtcaaagtgttgcaaaaaatatcagtgacatcacgcaacat
gaaggaaagatcgcacaaaacagtgccgatattcggtcgaatgcgagtggtataacgcaa
aatgccgacaaaatcacgcaacatgaaggaaagactgcacaaaatagcgccgatattcgg
tcgaatgcgagtggtataacgcaaaatgctgacaaaatcacgcaacatgaaggaaaaatc
gcacaaaacagtgctgatattcggttgaatacgagtggtgtaacgcaaaatgctgacaaa
atcacgcaacatgaaggaaagatcgcgcaaaacagcgccgatattcggtcgaatacgagt
ggtataacgcagaatgctgacaaaatcacgcaacatgcaggaaagatcgcgcaaaacagt
gccgatattcggtcgaatacgagtggtataacgcagaatgctgacaaaatcacgcaacat
gcaggaaagatcgcacaaaatagcaccgatattcgattgaatgcgagtggtataacgcaa
aatgctgacaaaatcacacaacatgaaggaaagattgcgcaaaatagcactgatattcga
ttgaatgcaagtggtataacgcaaaatgctgacaaaatcacacaacatgaaggaaagatt
gcgcaaaatagcaccgatattcggtcgaatacaagcggtataacgcaaaatactggcgag
attagaactttgactaacaatattagtcagggatctatcggtttggtacagcaagacact
cctaccaatactatcactgtggctgccacaaactcaggtgataaagtttccatcgttggt
acgtcaggtgtgcgcaccttaaacggcttaaaagatggtgaattaagtgctagtagtagc
gatgcggttaacggcagtcagctttttgccactaatacggatattgcgaaaaatgctgac
gatatcaacaaatttagcaacagtgttataaaaggggcaagtggtttggtgcggcaaaaa
tcgccgacggatattatcactgtagcgagtgaaagtgccggagatcaggtttctctggca
ggtaaaacaggatctcgtaaattaagcgatttaaaagacggtgtgttgagtatagatagt
agcgatgctgtcaatggcagtcagctttttactgttaatcaaaatgtggcgaaaaatact
ggaaacattgtgcaaaatgctgctgatattgtcgaaaatgctggcaaaattgtgcaaaat
tctgaaagtatcagcaaattgactactgatattagtgaaggcgtggtcggtctggtacag
caaaattcgcctatagcgactatcactgtcgctgctatgaaaggtggagaacagatttcc
tttgcaggtcaaagcggatcacgcattttaacccgtgtcaaacggggtgcgctaagtacg
actagtacagatgccatcaatggtagccaattgctgacgaccaataatgaagtcgaaaaa
aatgccgatggtatcgagcaattgcgggaagaaattatgaacggatcgatcggcctatta
ctagataatccgaaacatggtggctggtcaacagactccaatagtacaaggaaaacgaga
agtatcaccttggcggcgggacacgtagcagaagaagtttccattgagggtaaaaatgga
gagcgtagattaatcggtgttgcgccgggtgagctaagcccaaccagtgtggatgcggtc
aacggcagtcagcttctcaaaacgaataacgaattgatgcaaaatgccaacaatattgcc
gctattgccaacagcttcggtggcggtgcgatgattgatccgacagaggacaagtttgtt
tccccaagttatatcgtacaaaatagggaggtcaacaacgttggggatgcgctctcaatg
ctaaatgatgtggtggttctaaatagtagcgacattgctgcattgaaagcaggtagaaat
aaatatccgtctaatactatgactcagctagtacgtgaggatgcgagtagcaaaaagatc
acagtaggaaaactgactggaggaaagtcagttgacattacgggaacagaaggggttcgt
aggatcagtggtgttaaggcgggtgtggcggataacgatgcggtgaaccttgagcaattg
aataagacgttggctgacatgcgatccgctaatgaccattcagtaaatcgggcaattaaa
aaattggataatcgccttgatcaggtaaaaaataaacttactgcgggcatcgcttcatct
atggcaatggccgggatcccacaggcatatgtaccggattccagtttgctaggtgctgcg
gttgccagctatcgtggcggatctgcgattgccattggagtttctaccgtttctgaaagt
ggtaaatggataacgaaactacagagcagtaataacacgcaaaaagattttggtgtctct
ttggggataggttatcaatggtaa
DBGET
integrated database retrieval system