Flavobacterium sangjuense: GS03_02445
Help
Entry
GS03_02445 CDS
T06656
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
fsn
Flavobacterium sangjuense
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fsn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fsn02000
]
GS03_02445
Transporters [BR:
fsn02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
GS03_02445
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Laminin_G_3
HYDIN_VesB_CFA65-like_Ig
Cep192_D4
Por_Secre_tail
ASH
DUF1573
Laminin_G_2
DUF3244
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QBZ98933
UniProt:
A0A4P7PXW1
LinkDB
All DBs
Position
complement(2836842..2842241)
Genome browser
AA seq
1799 aa
AA seq
DB search
MKNLLLTAENNQILLVLMLLSFTIGRGQVVTQTYTTSTTFTVPAGVTQVSVEAWGGGGKG
GTINGIGYGGGGGGGAYSSGLVTVVPGNTYTVTVGTGATTTAAGGDSWFDTATTILAKGG
GSVANNSTAGAAGGSAAASIGTTKYSGGNGANGSAILIIGGGGGSSAGTAAAGNSGANNN
GGTAPAGGGDGGNGSALVGNGSPGISPGGAGGGAYGLIFSLFTGGVGANGQVKLTYTLVP
EITVSGNGNTIADGDASPSTTDWTDLGTTTGATCSLTKTFTIANIAAGDLSVGAISISGT
NAADFSVTTLPASTVVYGGSTTFVVTFTPSGSGVRTANLSIANSDADENTYDFAISGTGS
NPEINIQGNATSISNGDVTPSTVDGTDFGSMELSSGTVVRTFAIQNTGGSTLTLSNPTIS
GANAADFSVTTNPGLSVTAGNSTTFTITFNPSAAGTRTATITIANIDCDESSYTFGVQGT
GIVYTNGPGGVLDDLQLWLRADLIDGTTTVSDNSNVSTWYTQAGGANAIKPAAVGSPVYK
NNTSNNLNFNAVVDFTNNYNLPSQVYTDTDSSRQYLRGASGFYTNDMFVVIVPDVSVTAS
LSCMDIFCGDQVSEINELDTSGVGYGNSTTRFTNEVLAYGLGTSAKYGVGEVSTTASYSS
AGIINARNNTANTGMQLCYNENSVGTAEVNTATYGNVNNSQFWIGRSEGWDGSLDGRVAE
IITFSSRKNDATERAKIQSYLAIKYGITLGTNGTSQNYLSSTGTTLWNTATNAGYNYNIA
GIGRDDISKLNQKQSKNGVANSVVTIGLGTIASTNTANTNTFDTDGEYLVWGENGGNMND
SGSDISVTFGGNNVTTLIDVPNKKWKIVETGGNVGITKAAVATSDLSGLPALSGNDAYVM
LVADDASFTTNVEAVFLNTNGANQEALYDFDGTKFFTFGVAHETVASRHVSLDGVDDRIK
FDAVNNLSNAFTMMFWVRPTGQNTLSNDRTIASKYDGTTGYRVYLSTDNKINVSWTGGTT
VTSATVLPTSVWHNIGIIYSGGSVKLYIDGVLDSTVASSSPSANVNTFSIGAEYRSKSDT
RNYFKGDIDEFRLWDKALTLNELRFIMNQEIFQNGTGTKGGIVSSTITKNDISTLNWSNL
IAYYSMNSFIATYVNDDSSNTNRGTLFVPNKVTVTLQSSPVPYETATNDLWSNGAAWANS
SGLYLPNSLSIVDGVTPIDWGIVKTSHNLSSTGNKKLLGLVVNNNTLTVSNDSKIEISHY
LKLDGKIDLQGKSQLIQTTDSDLDANSIGSLERDQQGQSIKYNYNYWSSPVSSINNTTIN
HGFTVAGVMKDATDVNNIQNLQWTAGVNGSPTTPITLSSYWIFKFQNSTNNYANWAQVGP
NGTLLPGQGYTMKGCGSAAADQNYTFVGKPNNGTITSTVGPNNLNLCGNPYPSAIDANQF
IDDNASSITGTLYLWEHYNTNPSHTTIQYQGGYATYTKTGGTAPIAPAGISGAGSSSKTP
KRFIPVGQGFFVTGSTSGGTITFNNGQRLFIKEDDAVNSYAMFKMDRGGRTSVIDPMYNN
TPDSFEQEQFTKIKLGYTSKDNYHRQILLGFMNQHATAAYDAGYDGLSIETPTNDMYFIN
GANKLNISGDGYFNPNNIYPLGVKNATAGTVVFGLDSLENFNDRYEIYIYDSEDNTYNSI
KTQNFKVSLPVGTFENRFSLRFTNSPTSLRSLKDDTINYGIEVTNSQSDNMINIKNELEE
TTVKSVALFNMVGQNMMNWTASKQNQKLIQLPVSELSTGTYIVKVNTDKGIVTKKILIK
NT seq
5400 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaatttactacttacagctgagaacaatcaaattttacttgtcctaatgttacta
tcatttaccataggtaggggacaggtagttacacaaacttacacaacaagtacaaccttt
acggtgcctgccggtgttacacaggtttccgttgaagcctggggtggtggtggaaaagga
ggtaccataaatggaatcggatacggtggtggcggtggcggtggcgcttattcaagcggt
ttagtaactgttgttcccggaaatacctatacggttacagtaggtacaggcgctacgact
actgctgcaggaggtgattcctggtttgatacggcaacgactattcttgccaaaggtgga
ggcagtgttgccaataacagtacagccggtgcggcaggaggttctgctgctgcttcaata
ggaactacaaaatattcaggaggaaatggtgccaatggttcagccatacttatcatcggt
ggcggtggtggttcatctgcaggaacagcagctgcaggaaattcaggtgcaaataataat
ggaggtactgcaccagctggcggtggagatggtggaaatggatctgcactagtcggaaat
ggatctccaggaatatctcctggtggagcaggtggaggtgcgtacggacttatattttct
ttattcacaggtggtgttggagctaatggacaagttaaacttacctatactttagtaccg
gaaattacggtgagtggtaatggtaataccattgccgatggagatgcatcgccttcaact
actgactggacagatttaggcacaactaccggggcaacttgttcgttgaccaaaacattt
acaatagctaatattgccgcaggagatttgagtgttggtgctatcagcatttctggtacc
aatgctgccgatttctcggtgacaactttaccagcttcaacagtggtttatggaggtagt
acgacttttgtagttacttttaccccaagcggaagcggtgtacgaactgctaacctgagt
attgctaatagtgatgctgatgaaaacacttatgactttgctattagcggaacaggaagc
aatcctgaaattaatatacagggaaatgcaacaagcatcagcaatggagacgttacacca
tcaacagttgacggaacagattttggttctatggaactttcttccggaactgttgttaga
acttttgcaatacaaaataccggaggttctactttaactttatcgaatccaactatttca
ggggcaaatgctgctgattttagcgtaaccacaaaccctggtttgtcggttacagccgga
aacagcactacttttacaataacatttaatccgagtgccgcaggcacaagaacagctact
atcactatagctaatatagactgtgatgaaagttcatacacttttggtgttcagggaaca
ggcatagtatatactaatggtccgggaggtgtattggacgatttacaactttggttgaga
gctgatttgattgacggaacgactactgtcagcgataattcaaatgtttctacctggtat
actcaggctggaggagcaaacgctataaaaccagccgccgtcggatcaccagtatataaa
aacaatacttccaataacttaaactttaatgcggttgttgattttacaaacaactataat
ttaccttcccaggtttatacggatactgactcctcaagacaatatttaagaggagcttcc
ggattttacaccaacgatatgtttgtcgtgattgtaccggatgtttctgtgacggcaagt
ttgtcatgtatggatattttttgtggcgatcaggtttcagaaatcaatgagttggatacc
tctggtgttggatatggaaattctaccacaagatttaccaatgaagtactggcttatgga
ttgggaaccagtgcaaaatatggagtaggtgaggttagtacaacagcctcttattcttca
gccggaattatcaatgcgagaaataatacggcaaacacgggaatgcaattgtgctataat
gaaaatagcgtaggtactgcagaagtaaatacggcaacgtatggaaatgtcaataacagc
cagttttggataggaagaagtgaaggttgggatggaagcttagatggaagagtggctgaa
atcataactttcagctcccgaaaaaacgatgctacggaaagagcaaaaatacaaagttat
ctggcgattaaatatggtatcactttaggtaccaatggaacttcgcaaaattatttaagt
tctacaggaactaccctttggaacactgctactaatgccggatacaattataatatagcg
ggtatcggtagagatgatatctctaaactaaatcagaaacaatcaaaaaacggagttgcc
aattcagttgtaaccatcggattgggaactatcgcctcaaccaatactgccaataccaat
acatttgatactgatggagaatatttggtttggggtgagaacggaggaaatatgaatgat
tcgggtagcgatattagtgtcacttttggaggaaataatgttacaacccttattgatgtt
ccaaataaaaaatggaaaattgtagaaacaggtggaaatgttggaattacaaaagcagct
gtagcaacttctgatttgagcggcctgcctgctttatcaggtaatgatgcttacgttatg
ttagtagctgatgatgcctcttttaccacaaatgttgaagctgtttttttaaatactaat
ggtgcgaatcaggaagcgctgtatgattttgatggtacaaaattctttactttcggtgta
gctcatgaaacggttgcctcaagacatgtatcattggatggtgttgatgaccgaattaaa
tttgatgcagtaaacaatttgagcaatgcatttacgatgatgttttgggtacggccaaca
ggtcaaaatacgttatccaatgatagaacgattgcttctaaatatgatggaaccactggt
tacagagtatatttgtctacagacaacaaaattaatgtgtcctggacaggtggaactaca
gtaacttctgctacagtattaccaacttcagtatggcataatatcggaatcatctattca
ggaggttctgtaaaattatatattgacggtgtattagattcgactgttgcttcttcaagt
ccttccgccaatgtcaatactttctctattggtgcagaatacagaagcaagtcagatacc
cgaaattattttaaaggtgatatcgatgaatttaggctttgggataaagcgctgacattg
aatgagctgaggttcataatgaatcaggaaatttttcaaaacggaaccggaacaaaagga
ggcatagtgtcatcgacaattacaaaaaatgatataagtactttaaactggagtaatctt
attgcttattactctatgaattcctttatagcaacttatgttaacgatgattcatcaaat
acgaatagaggaactttatttgtgccaaataaagtaactgtaacattgcaatcttcacca
gtaccatatgaaactgccacaaatgacctttggtcaaacggcgcagcatgggcaaacagc
tctggtttatatcttccgaatagtctgtcaattgtggatggagttacacctattgattgg
ggtattgtcaaaaccagccataatttgagttctacaggaaacaagaaattactgggtctg
gtggtgaataataacacactgacggtttccaatgacagtaaaatagagatttcacattat
ttaaaattagatggtaaaattgatttacaaggcaagtctcaattaatacaaaccactgat
agcgatttggatgctaacagtattggttctctggaaagagatcaacaagggcagtctata
aaatacaattataactattggtcttctcctgtgagctccataaacaatacaacaattaat
cacggatttacggtagccggagttatgaaagatgcaactgatgtaaacaacatacagaat
ttacaatggacagctggagtaaatggctccccaacgacacctataacattaagcagctat
tggatatttaaattccaaaactcaacaaataactatgccaattgggcacaggttggtcct
aacggaacattattaccgggacaaggttacactatgaaaggatgtggttcggcagcggct
gatcaaaattatacttttgtgggtaaacctaataatggaactattacttcaacggttgga
ccaaataatctcaacctttgtggaaatccttatccatcagctattgatgccaatcagttt
attgatgacaatgcttcaagtataacaggaacattatatctgtgggagcattataacacg
aatccttcgcacacgactattcaatatcagggaggttatgctacttatacaaaaacaggt
ggaacagcaccaattgctccggcagggataagtggagcgggttcaagcagtaaaacacca
aaaagatttattccggttggacagggattctttgtaacgggttcaactagtggtggaaca
attacattcaataatggtcaaaggttatttattaaagaagatgatgcagtcaattcttat
gcgatgttcaaaatggatagaggaggaagaacttcggttattgatccgatgtataataat
acgcctgacagttttgagcaggaacaatttacaaaaataaaactgggatatacttcaaag
gacaattatcacagacaaatcctgttgggctttatgaaccagcatgccactgcagcatat
gatgcgggttatgatggtttaagcatcgaaacacctactaatgatatgtatttcattaac
ggagctaataaattaaacattagcggcgatggttattttaatccgaataatatttatcct
ttgggtgttaaaaacgctactgccggaactgttgttttcggactcgattcactggaaaat
ttcaatgatcgttatgagatatacatttatgacagcgaagacaatacctataacagtatt
aaaacacaaaactttaaagtcagtttacccgttggaacctttgagaacagattttcattg
cgatttacgaatagcccaacttcacttcgatcactaaaagatgatacaataaactacgga
attgaagttaccaattcacagtctgataacatgataaatatcaaaaatgagttggaggaa
accactgtgaaatcggttgcattgttcaatatggtagggcaaaatatgatgaattggaca
gcaagcaaacaaaatcaaaaacttattcaactgccggtttctgagttaagtacaggaact
tatattgtaaaagtaaatacggataaaggtattgtcactaaaaaaatactaatcaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
