Candidatus Fokinia solitaria: Fsol_00448
Help
Entry
Fsol_00448 CDS
T05415
Name
(GenBank) putative VirB6/TrlB type IV secretion protein
Organism
fso
Candidatus Fokinia solitaria
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TrbL
FlaE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWD33243
UniProt:
A0A2U8BSF2
LinkDB
All DBs
Position
complement(466305..469787)
Genome browser
AA seq
1160 aa
AA seq
DB search
MFFIGCIVLPRYSIGEELSIYSKCIFGYDNRALPQEVMVVTPHGCQDSCNSNCSIFNQDI
DQQNFSACYSYCVQGLPYVGNPVMEIADSIIVSDSSTICASQYNKSTSSSTYDCTGTSET
VSQYYYGNAISAAGCPNAVLLSSDYTPPPQQASSTFSYPQGAKYSEMEMKITFEKNSTVC
PNGNLYVTLLPIMSNLFQRAPEAVTGGNAAANAINNNIYNRALNFSFAAKAINAVTNFGT
SSSDASAMGEWCPDIDSFQSCLGQSSSSGTSSSTVTSSTASSNTISSSAVQQNMMHPCFA
GLISSQPTIANSSVMGTSNVVTYLYNVDLSYIYGSDIYNPQANTSHTLNTIVSEVNSDNI
ANLINPIVGCFPEWRLNGPAVPIARSISEEAIPLQAGDDFSVTWGGDVFVTGILYNENGL
LMPLGTLNTTGSNTEPLQNNITDLRDLVYAVMIGDASTTTNVLLQYNAAVSSCKKLPPSV
SISISSLLQQLTALTISSQGTANPLTMMSFSSKSNDSCGSYKYCRTKGSGIFEFCTKSEQ
TILGLNGSVQQTGYKIQTGTKSQDRKEEKGDVFHCKHVLDPGLPVYTFSGKINTTLPNPS
IQMPSTYVQGNDFSAPPQSASHSFKAAQCYNSSSSTGYLGFAGGYQATIQWCGNPQVNGQ
GLQIAIADPSISTDSLQWNDLSAAASATSNTISIGGAKSNFVVTNISNGMVTIGESGIGG
ENIGEGTLDADINYNIYFRLDPKLYKPTINSNGYITYPPTGQYNIGISQGYRGSATLSNG
TAPQNISWPQKVIKKLLTLMFGSNICSIAQSNESTAQESASNTDIGAVWIIMNGANTVIS
RYIPIIIIIAIMVAGIGFLAGTTKVTTSEVMAVIARLIIVVLLVQPNTILQNTVTSGSKN
STLSELVARTSICSGVIAASYVTPSISSVDGKYQYTPSLNGIFEVTLETWYVLTSQNTWL
KVWSLAGIGLSGLMFAGVMVAGLVYSLILVCFTMLTYIYLVIGLAAVTAPMPLFAICLLF
SSTRTMAYQYGKKFICFALYNVVLSAGVTLIDVVITTIILSALSFTICDAVYQLKILVFH
IPVTSWVPLLTVHSPVGSSTLLPLAAVEGGIALCAVGHMGTEFVQQLLRIVDKIVDPYGG
SSDIVLRGVNRIVDRVKGKE
NT seq
3483 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgttttttatcggctgtatagtacttcctagatattcaataggagaagagttatcgatt
tattcaaaatgcatttttggatacgacaatcgtgcattacctcaggaggtaatggtcgta
actccgcatggatgtcaagattcttgcaacagcaattgcagtatttttaatcaagatata
gatcagcaaaatttttctgcatgctattcgtattgtgtgcagggattaccttacgtagga
aatccagtaatggaaatagcagattctattattgtatcagatagcagtacgatatgtgct
tcgcaatataataaaagtactagtagtagtacatacgattgtactggtacaagtgagaca
gtgtcgcagtactactatggtaatgctatttctgctgctggatgtcctaatgcagtctta
ttgtcttcggattatactcctcctccgcaacaagcttcaagtacgttttcttatcctcaa
ggcgctaaatatagcgaaatggagatgaaaattactttcgaaaagaatagtaccgtttgt
ccgaatggcaatttatacgttacattacttccgataatgtcgaatttatttcaaagagcg
ccggaagcggtaacgggtggaaatgctgctgcaaatgctattaataataatatatataat
cgtgctctgaattttagctttgcagcaaaggctattaatgctgttactaattttggcact
agttcgagtgatgcaagtgcaatgggagaatggtgtccggatattgatagttttcaatca
tgtttaggacagtcatctagtagcggcacatcttcaagtactgtaacttcaagtactgcg
agttcaaatactataagttcaagtgctgtgcaacagaatatgatgcatccatgttttgct
ggtcttataagctctcagccaactattgccaatagcagtgttatgggtacgagtaatgta
gtgacttacttgtataatgttgatctaagctacatatatggtagtgatatatataatccg
caagctaatacaagtcacacattaaatacgatagtatctgaagttaacagtgataatata
gcaaatcttataaatcctatagtagggtgttttccagagtggagattaaatggccccgca
gtaccaattgcgagaagcatcagtgaagaagctataccattacaagcaggagatgatttt
tccgtcacttggggaggtgatgtgtttgtaactggaatactctataatgagaatggatta
ttaatgccgcttggaacgctaaatacaacagggagtaatactgagcctctacagaataat
attacagatttgagagatcttgtatatgctgtgatgataggagatgcctctacaaccact
aatgtactgctgcaatacaatgcagcggtatcttcatgtaagaaattaccaccatctgtt
agtatatctatatcaagtttattgcaacaactgacagcacttacaatatcatctcaaggt
acagctaatcctcttacaatgatgtcgttttcttcaaaatcaaatgatagctgtggtagt
tataagtactgtagaacaaaaggtagcggaatatttgagttttgtacgaaatcggagcaa
acaatacttggattgaatggttctgtccagcagacaggttataagatacaaacaggtacg
aaatcgcaagatagaaaggaagagaaaggtgatgtatttcactgcaaacatgtacttgat
ccaggtttgccagtatatacctttagcggtaagatcaatactactttgccaaatccttct
atacaaatgccatcaacttatgtgcagggaaacgatttttctgctccaccgcagtccgct
tcacatagttttaaagcagctcaatgttataactcttcttcctccactggatatttaggt
tttgccggtggatatcaagctaccattcaatggtgtggtaatcctcaagtgaacggtcaa
ggattgcagatagcaatagcagatccaagtatatctacagattcattacagtggaacgat
ctcagtgcggctgctagcgcgacgtccaatactatctctattggtggcgcaaagtctaat
tttgtagtaactaatatttcaaatggtatggttactatcggtgaatctggtattggagga
gaaaatattggagaaggcacactagatgcagatatcaactataatatatatttcagacta
gatcctaaactatataagccaacaataaacagtaatggatatattacttaccctccaaca
gggcagtataatattggtatatctcaaggatatcgtggaagtgctacattaagcaatggt
acggcgcctcaaaacatatcgtggccacaaaaggtcattaaaaaattacttacattaatg
tttggtagtaatatttgctctatcgcgcaaagcaatgaatctactgcgcaagaaagtgcg
agtaatactgatattggtgcagtttggattataatgaatggcgctaacacagtaatttct
cgatatattccaattattataataattgctataatggtcgcgggtataggttttttagca
ggcactacaaaagttactacctcagaggtaatggcagttattgcgcgattaataatcgta
gtacttctagtgcagccaaataccatattgcaaaatactgtaacgtccggctcgaaaaat
tctacgttaagcgagttagtagcgagaacaagtatatgtagtggagtgatagcagcaagt
tatgttactccaagtatttcatctgttgatggaaagtatcaatatactccttctttaaat
ggcatattcgaggttacgcttgagacatggtatgtactgacttcgcagaatacttggtta
aaggtatggtcgttagctggcattggtttatcaggcttaatgtttgctggcgtaatggtt
gcaggacttgtgtactctttgattttagtatgctttacaatgctgacatacatttatctc
gtaataggtcttgcggctgttacagcgcctatgccgcttttcgctatttgtttgctgttc
tcatctacaagaacaatggcttatcaatacggaaagaaatttatatgcttcgccttgtac
aacgtagtactatctgcaggagttacgttaatagatgttgtaattacgacaataatactt
tccgctttatcattcacaatatgtgatgctgtgtatcaactgaaaatactagtatttcat
attcctgtaacttcatgggtgcctttactcactgttcattctccagtcggttcttctact
ctcttgcctcttgctgctgtagaaggggggattgcgttatgtgcagtagggcatatggga
acagaattcgtgcaacaattattacgtattgttgataagattgtagacccgtatggaggc
agtagtgacatagtgttaagaggagttaatcgaatagtagatagagtgaaaggcaaagaa
tga
DBGET
integrated database retrieval system
