Fluviicola taffensis: Fluta_1597
Help
Entry
Fluta_1597 CDS
T01455
Name
(GenBank) peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin
Organism
fte
Fluviicola taffensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_M10
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEA43589
UniProt:
F2IFW8
LinkDB
All DBs
Position
1823069..1829050
Genome browser
AA seq
1993 aa
AA seq
DB search
MKRTLTILFSLFLFVLNAQQDSSNLSPNGIFDKVFDMNGRQYQLSDLQVGSIPKNAQLAP
ALLCSSGYFDLYFEQGSGMEGSSQTEIDRRNVICQVFSDLSQFIVPANSNVHVNILVRNI
NQELPGYDPLTNPFPAAISNVLGLASGFYVVPSNASATKGIIDNEIWKTINSGVDSYTGV
ASPLISTVPNGAMFYHGMVGFNFDNIGNPWNILLNQAPSSSSYFDLYSVALHEITHALGF
ASLIDANGDSKFNTGYEYYSRYDLFLKTAGNQSLITNTGACSLYNYSFNPALNPTVMTPA
SFDCATHIKFAGTVNKSVYSPSTFQPPSSLSHMEDVCHHTVNPYLDDEYYVMSNGQNGGS
MKRYLKPEERAVLCDIGYQVNTTYGITSNLNYFNYNVGVCPGLQIAGVNDGITSGGLYQH
VVSPGGSLTISTILQNDVNASSFECLENIYGNGTLTAISSTSFTYTAATPGVVLLRYIPV
SGTGVRGNITYVLIYVSAGNCTPTVCSMLNNGNFEGAGQCGQLEVPASNGISINCWSPAV
LTPDLFKRNCTSTFNNNFSIPATYYNSPGAESWNGSPNNHFMGFAGLSNGFEAAQSLLNI
PLVQNQTYTLSFRAKVAYNAMNQMPPLGTNGQITFGAALSTIAWPGANSVLPSIPGSVYQ
LGTPIIINNTANNNWDYYSQTFTYTGSGNLSNFFIANTSLLGTSGNTYGLYIYMDDISLV
AANPTIVMDLPNAMCSNQSISDLSPYAPLPNGSFSGNGVQYSGGVYSFNAAVAGIGMHTI
VYTYTDNNGCSQTISDIIEVGPIITVSAINNFICSGQQVSITASGADTYTWSPATGLSTT
TGPVVIASPTASTTYTITGTNSLGCTASKLVHVFITPPTATISGTTSVCQNSGSPSIALT
ASFGTAPYTFVYTINGGANQTITTTYGNGIGIPVPTNTSGTFTYNLVSVTSATGCSQILS
GSATVTIKPLPTATISTVPTVCQGAPSPTITFTGLNGTAPYTFYYTTNGVNQSIGSGSGN
VATVLVPTSATGTFTYTLTSVNSAMGCSKSQSGTAAITVSPCPDCGTGTLISGTVTTSPT
ANTTLRVASNTTISGNVTFTGNNVKIQPGVTITVASTATLNITGSHFYGCENMWQGIVVQ
PGGKVNMQPYIVSSTVTKTPLIEDAVIGVDFLPVTTQQSVILLQVNNATFNKNATAIRVQ
GYPFANVASMFSVKNSLFTCRTIYNTSASTWPLTTTVKALNGSTDPYVNPYITTTYPITT
MKVPQNSTFSDKGIQLVNVGTVFNSMNIGSTVAAEYNVFDNLKVALHCSNANVKVENTAV
QFPQIITSAMYSSQSLPNIGTGIFATATSGYLGKVDVAGTTSLPNKFYGLSRVLHVVNYQ
NVQFNYNTIRSTRTNNYPVQGYYNGNMGLYLSLEQFQTVGVVYNTIYNTNTGVFVSVNNG
INPCVGASIAVSNNLFQKNLGTNNGSFGTSAIHLENNSALDVFAGSIYSISNTITGSLRG
ITVNNWLKTSITTNENTLTLGINPNAFVGASSYGIAYNNCTAGNGMNQIYGNNVIGFSQA
YENYKGIQFTQSMGNNISCNGTRDTHTGLYFNGTCSQTKTYKTTMQNHRYGFVLDNSAII
GQQGTTTTPTDNTWVGTTWSPTGTTNGNFKNACLNGSNTNNSKMYVRNSSSCNPNGSTFT
SGLGSWSYTASISPITLFYVSNPPLETACVTSLPPEEGLMAGTNGSEEGIASETASAEES
AASWLEESAELVESVIDSDHQVVMKNQLYRLSEEESGTLSSAQPELDALIETESQTNIGT
LWEVEKSLSVGDLAEAAAINNSVNPENRLEESYQLLYEADLHYRNEVFNTSDSLVLVDLA
QGCPAQQGGSVFQAQALYNHVYHTATIFTPDCQTSSAKSMQQTASADHPDDENVLYKLYP
VPNNGIFKLQGSLLAGDQLQIMQLDGKLLLAQTIMQDEETMDLATHLSSGTYVVVLKNSE
GQVKYRNRIVVLQ
NT seq
5982 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacgtaccttaactattctattttcacttttcttatttgtattaaacgcccaacaa
gactcgagtaatctgtctcccaacggtatatttgacaaggtttttgacatgaatggaagg
cagtaccaattaagtgatttacaagttggcagtattcctaaaaatgcacagctcgcgccc
gcattattgtgttccagtggttacttcgatttatacttcgaacaaggaagtggcatggaa
ggcagttctcagactgaaattgaccgcagaaatgtgatttgtcaggttttttccgattta
tctcagtttattgtacctgcaaactccaacgtgcatgtcaatattttggtgcgaaatatt
aatcaagagctgccaggatatgatccgttgaccaatccttttccagcagctataagtaat
gtgttgggtttagcctcgggtttttacgtagtcccttcaaatgcgtccgctactaaagga
ataattgacaatgaaatttggaaaacaatcaattcaggtgttgattcctataccggagtg
gcatctcctcttatttcaacagttccaaatggggccatgttttatcatggaatggtagga
tttaattttgataatatcggaaacccctggaatatcctgttaaatcaagctccatcctct
tcaagttattttgatttatattcagtagcacttcatgaaattacacatgctttgggcttt
gcttcgttaattgatgcgaatggagattcaaaatttaatacgggttatgaatattattcg
cgttacgatttgtttttgaaaaccgccggaaatcaatctttaataacaaataccggagca
tgttctttatacaattacagcttcaatcctgcattgaatccaacggttatgactcctgct
tcatttgattgtgcaacgcacattaaatttgcaggaacggttaataaatcggtatattct
ccatcaacttttcaaccgccaagcagtttaagccacatggaagacgtgtgtcatcataca
gtgaatccttatctggatgatgaatattatgtgatgtctaacggacaaaacggcggttct
atgaaaaggtatttaaaaccagaagaaagagctgttttgtgtgatattggttatcaggta
aatacaacttatggtattacttccaacttaaattatttcaactataatgtgggtgtttgt
ccaggactgcaaattgccggagttaatgatggaattacatcagggggattataccaacat
gttgtaagtcctggtggatcactgaccatttcaactatcctgcaaaatgatgtaaatgcg
agtagctttgagtgtttggagaatatttatggaaatggtacactgaccgcgatttccagt
accagttttacctatacagcagctactccgggagttgtcctgttaaggtatattcctgtt
tcaggcaccggggtgagaggaaacattacctatgtacttatttatgtttcagcaggaaat
tgcacaccaacagtttgcagtatgctgaataacggcaattttgaaggtgctggtcaatgc
ggtcagctggaagtacctgctagtaacggaatttcgataaattgttggtctcctgcagtt
cttacaccagatctttttaaaaggaattgtaccagcaccttcaataataatttttctatt
cctgctacttattataattccccgggagctgaatcctggaatggttctcctaacaatcac
ttcatggggtttgcaggtttgagtaatggatttgaagccgcacaatcgttactgaatatt
cctttagttcaaaaccaaacgtatacactttcgttccgtgcaaaagttgcttataatgcg
atgaatcagatgcctcctctaggtacgaatggtcaaataacttttggtgctgcactttca
actattgcatggcccggtgctaattcagttttaccgtctattcccggttcggtatatcaa
ttgggtactccgataataataaacaataccgctaacaataattgggactattattcgcaa
acatttacctatacaggttctggtaatttgtccaatttttttattgcgaatacctcctta
ttgggaacgtctggaaatacttacggtttgtacatttacatggatgatatttcattggtt
gcagcaaatcccacgattgtgatggatttgccaaatgcaatgtgttccaatcaatctatt
tctgatttatccccatatgcacctcttccaaatggatctttttccggaaacggggtgcaa
tacagtggaggtgtttacagcttcaatgcagctgttgcgggtattgggatgcacaccatt
gtttatacctatacggataataatggttgctctcaaacgatttcagacatcattgaggta
ggaccaattattaccgtttcagccattaataattttatttgttcaggtcagcaggtgtca
ataactgcaagtggagcagatacttatacctggtctcctgcaaccggattatctacaact
acaggccctgttgtcatcgcatctcccacagcaagtactacctatacgattacaggaaca
aattctttaggatgtacagcatcgaaattggtgcatgtttttattacacctccaaccgct
actatttcaggtactacatcggtctgtcaaaactccggatcaccgagtattgctttaact
gcatcatttggaactgcaccatatacatttgtctatactatcaacggcggagcaaaccaa
acgatcaccacaacctatggaaatgggattggtattcctgtacccaccaatacttctgga
acattcacatataatttagtcagtgtaacaagcgcaacaggctgttcccaaattctgagc
ggttcagctaccgttacaataaagccgctgccaacagcaaccatttcaactgttccaact
gtgtgtcagggagcaccttcaccaactattacctttacaggattaaatggtactgcacct
tacacgttttattatacgacaaatggggttaatcaatcaattggaagtgggagcggaaat
gttgctacggttctagtaccaacaagtgctacgggaacgtttacctatactttaacaagt
gtaaacagtgctatgggatgttctaaaagccaaagcggaactgctgcaattacggttagt
ccatgtccggattgtggaacaggaacactgatttctggaacggtaactacttcaccaaca
gcgaatactactttgcgtgttgcaagcaatactacaatctccggaaatgtaacgtttacc
ggaaacaatgtaaaaattcagcctggagttacaattacagtagcttcaacggcaacatta
aatattacaggatcacatttttacggttgtgaaaacatgtggcagggaattgttgtgcaa
cctggtggaaaggtaaatatgcagccatacatcgtgtcttcaacggttacaaaaacaccc
ctaattgaagatgcagttattggggtagactttttaccggttacaacccagcaaagcgtt
attttattgcaggtaaataatgcaacgtttaacaaaaacgcaacagcaatcagagtgcag
ggttatccgtttgcgaacgttgcaagcatgttctcggtgaagaacagtttgtttacttgc
agaactatctacaatacttctgcttcaacttggcctttgacaactaccgtgaaagcttta
aacggaagtacagacccatacgtaaatccttacattaccacgacttatccaataacgact
atgaaagtgcctcaaaacagcaccttttcagataaaggaattcaattggtaaatgttggt
acagtatttaattcaatgaatattggatctactgttgcggctgaatacaatgtatttgat
aacttaaaggttgcacttcattgttcgaatgccaatgttaaagtagaaaatactgcggta
caattcccgcagatcattacttctgccatgtattcaagccaaagtttgcccaatattgga
actggaatttttgccacagctacatctggttatttgggtaaagtagatgttgcaggaact
acctcgcttcctaataaattttatggattgagcagagtacttcatgtggtcaattatcag
aatgttcagttcaattacaatacgattcgcagcacccgtaccaacaattatccagtacaa
ggctattacaatggaaatatggggctttatctctctttggagcaatttcaaacagtgggt
gttgtttacaataccatttacaataccaatacaggtgtttttgtgagtgttaacaatgga
attaatccatgtgttggagcaagcattgccgtttccaacaatttatttcaaaagaattta
ggaacgaataatggctcttttggaacgagtgccattcatttagaaaataatagtgcgctt
gatgtttttgcaggatctatttactcaattagcaatactattacaggttctctgcgagga
atcactgttaataattggcttaaaacgagtattacgaccaatgaaaacacccttactttg
ggtattaaccccaatgcttttgtgggtgcttccagttatggtattgcgtataataattgt
acagctggaaatgggatgaatcagatctatggaaacaacgtaattgggttttcacaggct
tatgaaaactataaaggcattcagtttacgcaatcaatgggaaacaatatctcttgtaat
ggaacacgtgacacacataccgggttgtattttaatggaacttgcagccaaaccaaaacc
tacaaaacaaccatgcaaaaccaccgctacggctttgtgttggataatagcgcaattata
ggacagcagggaaccaccaccacacccacggataatacctgggtgggtacaacttggtct
cccactggaaccacaaatggaaattttaaaaatgcctgtttgaacggaagtaatacaaat
aattcaaaaatgtatgtgcggaatagcagcagttgcaatccgaatggttcaacatttact
tcaggattaggtagttggtcatataccgcgagcatttctccaatcaccttattttacgtg
tctaatccaccacttgaaacagcatgtgtgaccagccttccaccagaagaaggcttgatg
gctggaactaacggcagtgaagaaggcatcgcatcagaaacggctagtgcagaagaatct
gcggctagttggttggaagaatctgcagaattggtcgaatcggttatagattcagatcac
caagtggtgatgaagaaccaattgtatcgattatcggaagaggaatcgggtactttaagt
tcagctcaaccagagttggatgctttaattgaaacagagtcacaaaccaatattggcacg
ttatgggaagtggaaaaatccttgtcagttggcgatttggcagaggccgcggcaattaac
aatagcgtgaatccggaaaacaggttggaagaaagttaccaacttctctacgaagcagat
ttgcattaccgcaacgaggtgtttaacacatcggacagtttggtgctagttgatttggct
caaggttgccctgcccaacaaggaggatctgtgttccaagcacaagcgctctataatcac
gtgtaccacacagctactattttcacgccagattgtcaaactagttcagcgaaaagcatg
caacaaactgctagtgcagatcatcccgatgatgaaaatgtgttgtataagttgtatcct
gttcctaataatgggatcttcaagttgcaaggatccttgttagcaggtgatcaattacaa
atcatgcagttggatggtaagttattgctagcacaaacaatcatgcaagatgaagaaaca
atggatttggcaactcatttgagttcaggaacctatgtggttgtattgaaaaatagcgag
ggacaagtgaaataccgaaaccgcattgttgtgctccagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
