Fluviicola taffensis: Fluta_3281
Help
Entry
Fluta_3281 CDS
T01455
Name
(GenBank) PKD domain containing protein
Organism
fte
Fluviicola taffensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHU_C
Por_Secre_tail
Ig_7
SprB
PKD
PKD_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEA45253
UniProt:
F2IA76
LinkDB
All DBs
Position
3758978..3763780
Genome browser
AA seq
1600 aa
AA seq
DB search
MKSLLLFILLLLTSNFGFSQKAKNGAFTITAPLTVVNTYAQVTANVAIGSTTFPVSNTLS
LTQGDLILIIQMQGASVDIDTISASPWGWGWGGTYTMSSNSFQALNGLIPGVWTDYRSEF
GAVTNYNNAGKHELAEVLSVAGSNVTVRCGLKNNYTATGHVQIVKVPRYSSLTLNANTSI
VPQAWNGTTGGIVALEVEGAISFGNLSKISASGFGFRGGLVENVSGSASSANEVGYPGHK
INVAGTGGVGGAEKGEGIGGSATAEYTTLYSRYGNGAIANGAGGGNNKNAGGGGGSNVGN
TAGYTGKGIPVPGYTAIWDLEAPGMGTSSSPGGGRGGYTGTTKAASIPAWDPDETTVGPN
NATWVGDFRRNEGGLGGHPLAYDATRVFCGGGGGAGEMDNSDGGSGGAGGGIVFLQSYGN
ITGTALIEANGANGQKSNPTDAPHGGARRGVDGAGGAGGGGAIVISNGTALPGTLTLSAI
GGNGGNNAIISSSTNNPREADGPGGGGGGGMIAFTSGTPVQNVGGGNSGIVVTTNLTNVV
ANFPPNGATNGATGTSSLPQTYYNLTANNATICTGGTANLSVSVQGTLPAPVTNANITWY
ATYTSTAALGTGLTFTTPVLAATTTYYVGFCPGGTFRIPVTVTVGGPTISGTAVVSNATC
STGGSITGLTTSGGAPTPVITWNSVVNPTMNLTNASAGSYTVTVTDGVGCTATSGPYVIG
TSGGPTINSTNMVVTNASCTGGGGSISGITATGTGLTYNWNTGAYSSLDITNINSGNYSL
LVTDNNGCTATLGPINVGQNAGPTINTTNMVFANTTCGLSNGSITGISATGTGLTYNWNT
GAYSTLDITGLASGNYNLVVTDNIGCTASVGPIVIGASSAPVINSASIAITHAHCGQSTG
AISGLTVSGGQTAYTYSWNSGAYSTLNLSAIPAGNYSLQVTDNLGCIVNAGPFTVNDIAG
PTINSTNVVITNETCAGNDGAITGITASGAGTLTYTWNLVPSAGLNHTNIPGGTYGLIVS
DAFGCNAVAGPFNVGLSPGPAINTTNMVVTNTTCGLSNGSITGINATGTGLTYQWNGVGS
TLNQSNLASGNYTLIVTDANNCTTTYGPISIGASNSLTLNTTNVQITHETCALNDGTISG
LIANGTGTLTYTWNGGVSPTLNQTGLSPGVYNVVVSDVFGCSVNGGPFTVNAVIPLSLNQ
NSLLITPTGCTGNIGAIHGLQIVGGINPTVSWSPNGQTTLSIGALAAGNYTITVTDDQNC
SIQETFTVPTTSGLAVNTNNVVITNDNCGTGTGTISGVTVSGGTNPYSYSWNNSSTLNTL
DISNLTTGNYVLVVTDNAGCQATTTLFVGVVPASVIDQTNVLVSNESCIGNNGSINGIQI
AGNGPYSYSWTGTPLTSLNLTNLTAGVYTLTITDVNGCTTTGLPITVSSGPMPNANFTIS
PVIASPGELINFTDASSGGVIVDYSWNISGVGSISTSSSCTYNSMIEGDYHMTLVIETAD
GCIDSITKGFQILGELKIPNIVTANGDHTNDEFYITNLKPNSKLIIQNRWGNLVFESANY
KNDWGGKDLEGNKIDDGVYFYQLITADGKIWQGNVHLLID
NT seq
4803 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatctcttctactcttcattttactattactaacaagcaattttggatttagtcaa
aaagctaaaaatggtgcatttacaataactgctccacttactgttgtaaatacatacgct
caggttacagcgaatgttgccattggtagtacaacttttcctgtttctaatacgctatcc
ttaactcaaggagatttaatattaattattcaaatgcagggagcaagtgttgatattgac
acgatttctgcatcaccatggggatggggatggggtggcacctatacaatgtcaagcaac
tcatttcaagcattaaatggattgataccaggggtatggacagactatcgttcagaattt
ggagcagttactaattataataatgcaggaaaacacgaattagcagaagtcctttcagtg
gcaggatcgaatgtaacggtccgctgtggattgaagaataattatacggcgactggtcat
gttcaaattgttaaagttcctagatattcttccttgactttaaatgcaaatacctcaatc
gttccgcaagcgtggaatgggactacgggtggaattgtagctttggaggtggaaggtgct
atttcctttggaaacttgtcaaaaattagtgcttctggatttggatttcgtggtggttta
gttgaaaatgtttctggttcagcttcaagtgcaaatgaggttggttatccagggcataag
ataaatgttgcaggtactggaggtgttggaggtgctgaaaaaggcgaaggaattggtggt
tctgctactgctgaatatacaacgctttattctcgttatggtaatggagctattgcaaat
ggtgccggtggtggaaataataaaaatgccggtggtggtggtggttccaatgtgggaaac
acagcaggttataccggaaaaggtattccggttcccggatataccgcaatatgggacctt
gaagcaccaggaatgggtacttcatccagtcctggtggtggtagaggtggttatacaggt
acaacgaaagctgctagtattcccgcttgggatccggacgaaacaacagtgggccctaat
aatgccacttgggtaggtgattttagaaggaatgaaggcggattaggaggccacccattg
gcttatgatgctacacgagtattctgtggaggtggtggaggagctggcgaaatggataat
tctgatggaggaagcggtggagccggagggggaattgtatttctccaatcttacggtaac
attaccggaacagcattaattgaagcaaatggagcaaatggtcaaaagtctaatcctact
gatgccccacatggtggggctagaagaggtgttgatggcgctggtggagcaggtggaggt
ggtgcgattgtcatttcaaatggaactgcacttccgggtacacttactttaagtgcgatt
ggcggaaatggtggaaacaatgctattatctctagttcaacgaataatcctcgtgaagca
gatggtccaggtggtggtggtggtggtggtatgattgcctttacctcgggtacaccagta
caaaatgttggaggaggaaatagtggaattgttgtaacaacgaatttgacgaatgttgta
gctaattttcctccaaatggagcaactaacggagctactggaacttcttctttacctcaa
acatattacaacttaaccgcaaacaatgcaacgatttgtactggaggcacagcaaatctc
tcggtaagtgttcaaggaactttgcctgcacccgtaacgaatgcaaatatcacttggtat
gctacatatactagtactgccgcattaggaacaggattaactttcacaacaccagtttta
gcagcaacaacaacttattatgtcggcttttgtcctggtggaacattcagaattcccgta
actgttacagttggtggaccaaccatttctggaacagcggtagtatctaacgcgacttgt
tcaactggtggttcaattacaggattaacaacttctggtggggcaccaactccagtaatc
acttggaatagtgttgttaatccaacaatgaatttgacaaatgcatctgctggatcatac
actgttactgttacagatggagtaggttgtacggcaacttcaggaccttatgttattgga
acatctggcggacctacaatcaactcaacaaacatggttgttactaatgcatcttgcaca
ggaggtggaggttcaatttcaggtattacagcaacaggaacaggattgacatataattgg
aatactggagcttattcaagcttggacattacaaacataaattcaggtaattacagtttg
ctagtaaccgataataatggatgtacagctactttgggcccaatcaatgtcgggcaaaat
gctggtccaactattaatactacaaatatggtgtttgcgaatactacttgtggattaagt
aatggaagtattacagggatttcagctactggaacaggtttaacttataactggaataca
ggagcatattcaaccttagatattacaggtttagcaagtggaaattataatttagtggtt
actgataatattggatgtacagcatctgtaggaccaatagtaattggcgcatcgagtgct
ccagtgatcaattcggcgtctattgcaattactcatgctcattgtggacagtctacaggt
gcaatttcgggacttacagtttccggaggacaaacagcatatacgtattcttggaactca
ggagcttattcaaccttgaatttaagtgcaattccagccggaaattattcgttacaagtc
acggataatttagggtgtattgtaaatgcaggacctttcactgtaaatgatatcgctgga
ccaacaattaatagcacgaatgtggttattacaaatgaaacttgtgcgggaaatgatggt
gcaattactggaattacagcaagtggagcaggaacattaacttacacttggaatctagtc
ccaagtgctgggttgaatcatacaaatattcctggtggaacttatggtttaatagtgtct
gatgcatttgggtgcaatgctgttgctgggccgtttaatgtaggcttatcacctggacct
gcaatcaataccacaaacatggttgtaactaacaccacttgtggcttgagtaatggaagt
attacaggaattaatgcaacaggaacaggtcttacctatcaatggaatggagtgggttct
acattaaatcaatcaaatttagcatcaggaaattataccctgattgttacagatgcaaat
aactgtacgactacttatggtccgatttcaattggagcttcaaattcactaacgctaaat
acaacaaatgttcaaatcacacacgagacatgtgctttaaatgatggaacgatttctgga
ttaatcgcaaatggaacaggaacattaacttatacttggaatggtggggtaagtccaaca
ttaaaccaaaccggtttatctccaggagtatataatgtcgttgtatcagatgtatttggc
tgttcggtaaatggagggccttttacagtaaatgcagttattcctttgagtctgaatcaa
aattcactgcttattacaccaactggctgtactggaaatataggagcaattcatggattg
cagatcgttggaggtataaatccaacagtctcttggtcacctaatggtcaaactacattg
agtattggagctttagctgcaggtaattataccattacagttacagatgatcaaaattgc
agtattcaagaaacatttacggttccaacaacatctggattagcggtcaataccaataat
gtagttattacaaatgacaattgtggtactggaacaggaacaatttcaggtgttacagtt
tcaggaggtacaaatccttacagctattcttggaataattcttccacattaaatacatta
gacatttcgaatctaacaacagggaattacgtcttggttgttacagataatgcgggatgt
caagccacaacgactttatttgtaggtgttgtacctgcgtccgttattgatcaaacgaat
gtgcttgtttctaatgaaagctgtatcggtaacaacggttcaattaatggaattcaaatt
gctggaaatgggccatactcttattcctggacgggaacacctttgactagtttgaatttg
acgaatttaactgctggagtttacacattgacgataactgatgtgaatggatgtactact
acaggtttaccaataacagttagttcaggtccaatgcccaatgcaaactttacaatttca
ccagtaattgcttcgcctggagaactcattaacttcaccgatgcgagctctggaggagtg
attgttgattacagttggaatatttcgggtgttggttctattagtacatcttcatcttgt
acttataattcaatgattgaaggagattaccatatgacgttggtgattgaaacggcagat
gggtgtattgattcaattacgaaaggcttccagattttgggtgagttgaaaattccaaat
attgttacagcaaatggagatcatacaaatgatgagttttacattaccaatttgaagcca
aattctaaattgattattcaaaatagatggggaaatttagtttttgaatcagcgaattat
aaaaatgattggggaggaaaagatcttgaagggaataagatagatgatggagtctatttc
taccaattaataactgcagatggtaaaatatggcagggaaatgttcatttgctcattgat
taa
DBGET
integrated database retrieval system