Francisella tularensis subsp. holarctica LVS: FTL_0590
Help
Entry
FTL_0590 CDS
T00331
Name
(GenBank) ATp-dependent helicase
KO
K03578
ATP-dependent RNA helicase HrpA [EC:
5.6.2.6
]
Organism
ftl
Francisella tularensis subsp. holarctica LVS
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ftl00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
ftl03019
]
FTL_0590
Enzymes [BR:
ftl01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.6 RNA 3'-5' helicase
FTL_0590
Messenger RNA biogenesis [BR:
ftl03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
Other RNA degradation factors
Others
FTL_0590
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3418
OB_NTP_bind
Helicase_C
DEAD
HA2_C
AAA_22
HA2_N
RsgA_GTPase
AAA_19
nSTAND3
gp37_trimer
T2SSE
ABC_tran
NACHT
NTPase_1
Flavi_DEAD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAJ79030
UniProt:
A0AAI8FUD0
LinkDB
All DBs
Position
572637..576971
Genome browser
AA seq
1444 aa
AA seq
DB search
MSIHIDAFLNQIPTKFRGKFISVINNKNLPNQQLLEQLQVLAEQTKQKILPKITYPDLPV
AERVDDIKKLLQDNQVIVVAGETGSGKSTQLPKICLDLGLGKRGLIGHTQPRRLAARSIA
SRIANEIGDQSKVSFKIRFSDQTSENTLIKVMTDGVLLSEIKNDRFLSQYEVIIIDEAHE
RSLNIDFLLGCIKKILPFRPDLKVIITSATIDHQKFINFFQNAKDIIISGRTYPVEIRYQ
NDEDFDEFSLQERILYALDELGRGDVLVFLPTERDIHETLAYLNKQNLRFTEVLPLFSRL
SNKDQNKIFNPEGSVRRVILATNVAETSLTVPRIKYVIDSGLARISRYSYRTKVQRLPIE
KISQASANQRAGRCGRLSAGICIRLYSEEDFNNRKEYTEPEILRTNLASVILQMLFLKLG
SIQDFPFIDAPDARFVKDGFKLLFELQAISELNYSKPKITDDGMKMAVMPLDPKLAKIVI
EGYRQKTLREIVSIVSFLSVQDPRERPLNLQQKADEKHSVDKDKSSDFVAILNLANRLNS
DLKGLSNREKKEYFKKNFISLVRFNEWNDIYRQIIEVIHGFGWKLNSQLVIKKDSGHSGL
DPESFEHIGKSHDNEILKQVHNDRQILTNSSNIKINRHFHESANLIANDQNLKDTRLHVY
DNGSAMINYENLHKAIASGFLSNIGYNYENAEYLGARGLKFFIFPGSFQFKAKPKWLLSS
EIVETTKTYVRNVAKIEPEWLESLASHLVKKHYDEPVWSKKRRAVIVNERVTLYGLEIVS
KRVVQYSKINPREAREIFIREALVKGDFDSKTYFYQQNLKLINQVEDLENKSRRKDILVD
EQTMFEHYDAFISDEVCNGATFDKWLKTVRKAQQQKFIFGLESLMQHGAKEITQQKFPDV
LTIGDMHLPLEYNFDPLDERDGATVTVPIVFINNISSAVLEWGVYGFLYDKIVALLRALP
KNIRKNCVPVPTYAQAIFESLDFDKDRYIPLKSVIAKHITRIVGFVVDETVWQNEELEKY
LVLNIKVVDEHGKTLALGKDINTLKQKLKNLVNKPKQAVDEKIYYDWDFADIALTNQIKE
YGIVVKVYNCLEEYKGGVKLSYKATLAEAQSCMKRALKRLIKIRLQNQLSQKIKNNDLTS
LSMSLKLSDSKDNVVDKAIDLSFFDDVISSDLFTEFKKQNSSRNYYENGNLTVNLRNQRD
NRFDRHDNKSVITDCDQESSILKHDSKSSETMFSDYAQQSVQDDSNVNLAGLPYTKSDFE
QFFKAGISSFVANKTKVELLFTEILRAKEQLDKKLNINKIPLNFIELFTAVRNELNELFT
DNYLSQPMIYLQRYKYYIQALENRLDKAKLNLQRDRNYQLEADELKAKLAKKLVTKHLST
GDEEVTKIRFLIKELWISWYLQNIKTSESISVKKILVYINQIVKNLDSVHRDFNIYFIEG
YRSI
NT seq
4335 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctatccatattgatgcttttcttaatcaaatacccaccaagtttcgtggtaaattt
atatctgtaataaacaataaaaatcttccaaaccagcagctacttgagcagctacaagta
ttagctgagcaaactaaacaaaagatcttacctaaaataacctatccagatctacctgtt
gctgaaagagtcgatgatataaaaaagcttctccaagataatcaagttatagttgtagca
ggtgaaactggctctggtaaatcaacccagcttcctaaaatctgtctagatttaggactg
ggtaagcgtggattaattggacacactcaacctagaagacttgcagctagatctattgct
agtagaattgctaatgaaataggtgatcagtcaaaagtatcttttaaaattcgtttttct
gatcaaacatctgaaaatactttaataaaagtaatgaccgatggggtattactgtctgaa
atcaagaatgatagatttttgtcgcagtatgaggttattatcattgatgaggctcatgaa
agaagcttaaatattgattttctacttggctgtataaaaaagattttaccatttagacct
gatttaaaagtaattattacttcagcaaccatagatcatcaaaaatttataaattttttt
caaaatgctaaagatattataattagtggtagaacatatcctgttgaaattcgctatcaa
aatgatgaagattttgatgagttctcattacaagaaagaatattatatgctcttgatgag
cttggtcgaggagatgttttagtttttttaccaaccgaaagagatattcatgaaacatta
gcatatttgaacaagcaaaatcttagatttacagaagttttacctttattttcaaggtta
tcaaataaggatcaaaataaaatttttaaccctgaaggttctgtgcgtagagttatttta
gcgacaaatgttgcggaaacatctttgacagtaccacgtataaagtatgttatagattca
ggtctggcgcgaataagtagatacagttatcgtactaaggtgcaacgcctaccaatagaa
aaaatctctcaagcaagcgccaatcaaagagcaggtcgctgtggtaggttatctgctggt
atctgtatacgcctttatagtgaggaagactttaataatcgtaaagagtacacggagcct
gaaattttacgtactaatttggcatcggttattttacagatgttatttctgaaattagga
agtattcaagattttccatttattgatgctcctgatgcaagatttgtaaaagatggtttt
aaacttttatttgagttacaagctatttcagaacttaattattcaaagcctaaaattact
gatgatgggatgaaaatggcagttatgccattagatcctaagttggcaaaaatagttatt
gagggttacagacaaaagactcttagagaaatagtttcgattgttagtttcttgagtgta
caagatcctagagaaagacctttgaacctccagcaaaaggcagatgaaaaacactcagta
gataaagataaatcttctgattttgttgcaatattgaatttggcaaatagactaaattct
gatttaaagggtttatcaaatagagaaaaaaaagaatatttcaaaaagaactttatttcg
ctagttagatttaacgaatggaatgatatttatcgacaaattattgaggtcattcatgga
tttggttggaagctaaatagtcaacttgtaataaaaaaagatagtggtcattccggactt
gatccagaatcttttgagcatataggcaaaagccatgataatgagattttgaaacaagtt
cataatgataggcagattttaacaaatagttcaaatattaaaattaatcgtcatttccac
gaaagtgcgaatctcatagctaatgatcaaaatttaaaagatacccgtctgcacgtgtat
gacaatggtagcgccatgataaactatgaaaacctacataaagccatagccagtgggttt
cttagtaatattggttataactatgaaaatgcagagtatctaggagctagaggacttaag
ttttttatctttcctggatctttccagtttaaggcaaagccaaagtggttactttcatcc
gaaatagttgaaactactaaaacatatgttcgaaatgttgcaaagattgagcctgagtgg
ttagagagtttggcaagccaccttgtcaaaaaacactatgatgagcctgtgtggagtaaa
aaacgtagagctgtaatagtaaatgaaagggtaacattgtacggcttagagatagtttca
aaaagagtagtgcaatactcaaagataaatcctcgagaggctcgagagatttttattcga
gaagctttagtaaagggtgattttgactctaaaacatatttttatcaacaaaatctcaag
cttataaatcaagttgaagatcttgaaaataaatcacgtcgaaaagatatattggtagat
gagcagacgatgtttgagcattatgatgcttttatttcggatgaggtttgtaatggcgca
acatttgataaatggctaaaaacagttagaaaagctcaacaacaaaagtttatttttggc
ttagaaagcttaatgcaacatggtgctaaagagattacgcaacaaaagtttccagatgtt
ttaactattggagatatgcacttaccattagaatacaactttgatccactagatgagcga
gatggtgcaactgttacagtaccgatagtttttatcaataacattagttccgcagtgtta
gagtggggggtgtatggtttcttgtatgataagatcgttgctttattgcgagcattgccg
aaaaatatccgtaaaaactgtgtaccggtgccaacttatgctcaagctatatttgagtcg
ctagattttgataaagatagatatattcctttaaaatctgtcattgctaaacatattacg
cgtattgttggattcgtagttgatgagacagtatggcagaatgaagagttagagaaatat
ttagttttaaatataaaagttgttgatgagcatggtaaaacacttgcgctgggtaaagat
atcaatactttaaaacaaaagctcaaaaacctagttaataaacctaagcaagcagtcgat
gagaaaatttattatgattgggattttgctgatattgctttgaccaatcaaattaaagag
tacggtatagtagtcaaagtatacaattgtcttgaggaatataaaggtggtgtgaaactg
tcatataaagccacgttagcagaagcacagtcttgtatgaaaagggctttgaagagactt
attaagatacgtctacaaaatcaattatcgcaaaaaatcaaaaataatgatttaacaagt
ctatcaatgtcattaaaacttagtgattcaaaagataatgtggttgataaagctatagat
ttaagcttttttgatgatgtcatttcgtcagacttgtttactgaatttaagaaacaaaat
agtagtcgtaattactacgaaaatgggaatctcacagttaatcttagaaaccaaagagat
aatcgttttgacaggcatgacaacaaatctgtcattactgactgtgatcaggaatcttct
atacttaagcatgatagtaaaagtagtgagaccatgttctccgactatgctcagcaatcg
gttcaggatgatagtaatgtaaatttagccggtttaccatacaccaaaagtgattttgag
cagttttttaaagctggtataagtagttttgtagctaataaaactaaggttgaactacta
tttacagagatactcagagcaaaagagcaacttgataagaagctcaatattaataaaatc
ccacttaattttatcgaactttttacagctgttagaaatgagctaaatgagctttttact
gacaattatttatcacaacctatgatttacttgcagcgatataagtattatattcaagct
ttagaaaaccgattagataaggcaaaactaaatctgcaaagagataggaactatcaatta
gaggctgatgagcttaaagctaaactagctaaaaagcttgttactaaacatcttagcact
ggcgatgaagaagtaaccaaaattcgctttctgataaaagagttatggatatcttggtat
ttacaaaatataaaaactagtgaatcaatttcggttaagaagattctagtttatattaac
cagatagttaagaatttagattctgtgcatagagattttaatatttattttatagaggga
taccgctctatatga
DBGET
integrated database retrieval system
