Francisella tularensis subsp. holarctica PHIT-FT049: X557_06860
Help
Entry
X557_06860 CDS
T03033
Name
(GenBank) membrane protein
KO
K03286
OmpA-OmpF porin, OOP family
Organism
fto
Francisella tularensis subsp. holarctica PHIT-FT049
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fto00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fto02000
]
X557_06860
Transporters [BR:
fto02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
X557_06860
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OmpA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHH46672
LinkDB
All DBs
Position
complement(1258633..1259811)
Genome browser
AA seq
392 aa
AA seq
DB search
MRLKSIVIATTVLLGSATASIAAGSDNIDTSASTNSATTQSSGFAANNFIAPFANTYSAL
TNKDNTWGPQDRTGQWYLGVDANGLAGTPNSPSGAGANFTIGYNINKYFAVQYNQLVGRV
FAGLGEGVVNFSNNTMFTPYAAGGAGWANLAGQATGAWDVGGGLKFELSRNVQASVDYRY
IQTMAPSNISGANGRAGTNMIGAGLTWFFGGKDTTNNDTGNIQDNGATTAAQTVAMPTID
ESKYVLPAGIKQCEGNFNLTEDGVACYTVNGDDVTVYLDTKFAYDKATLNAKGKKAIASF
VNFIKDSNISSVTVKGYASQGQTGSEFDIYNQKLSEKRAQAVADYMKQLGLDSEKIITKG
FGYNDTLGGIHKSDPRNQRVEASVSAPLKEAN
NT seq
1179 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagattaaaaagtattgttatagctacaactgtattattaggttcagctacagcatct
atcgctgcaggttcagataatatcgatacgtcagcaagcactaattcagctactacacaa
agcagtggttttgcagctaataatttcattgctccttttgcaaatacttatagcgctttg
actaacaaggacaatacttggggtcctcaagatagaactggccagtggtacttaggtgta
gatgctaacggtctagctggaactcctaactctccatcaggtgctggtgctaacttcaca
atcggttataacattaataaatacttcgctgtacagtacaaccaattagttggtagagta
tttgctggtttaggtgaaggtgttgtaaactttagtaataatactatgtttactccatat
gctgcaggtggtgctggttgggcaaatctagcaggtcaagcaacaggtgcttgggatgtg
ggtggtggtcttaagtttgaactatctagaaatgttcaagcaagtgttgactacagatat
atccaaacaatggcacctagtaatatttctggtgctaatggcagagcgggtactaacatg
attggtgctggtttaacatggttctttggtggcaaagatactactaataatgacactggt
aatattcaggataatggtgcgactacagctgctcaaactgttgctatgccaactattgat
gagtctaagtatgttttacctgctggtattaagcaatgtgaaggcaactttaatctaact
gaagatggtgtcgcgtgctatacagtaaatggtgatgatgtaacagtttacctagatact
aagtttgcttatgataaagctactttaaatgctaaaggtaaaaaagctattgcatctttt
gttaattttatcaaggatagtaacattagctctgtaacagttaaaggttatgcttctcaa
ggtcaaactggtagtgagtttgatatatataaccaaaaactttctgagaagagagcacaa
gctgttgctgattacatgaagcaattaggtttagatagtgagaaaataattactaaaggt
tttggctataatgatactttaggtggtattcataagtctgatccgcgtaaccagcgtgta
gaagctagcgtatcagctccacttaaagaagctaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
