Francisella tularensis subsp. novicida DPG 3A-IS: CH70_1289
Help
Entry
CH70_1289 CDS
T03875
Name
(GenBank) ompA family protein
KO
K03286
OmpA-OmpF porin, OOP family
Organism
fty
Francisella tularensis subsp. novicida DPG 3A-IS
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fty00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fty02000
]
CH70_1289
Transporters [BR:
fty02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CH70_1289
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OmpA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJJ47634
LinkDB
All DBs
Position
complement(1303203..1304381)
Genome browser
AA seq
392 aa
AA seq
DB search
MRLKSIVIATTVLLGSATASIAAGSDNIDTSANTNSATTQSSGFAANNFIAPFANTYSAL
TNKDNTWGPQDRTGQWYLGVDANGLAGTPNSPSGAGANFTIGYNINKYFAVQYNQLVGRV
FAGLGEGVVNFSNNTMFTPYAAGGAGWANLAGQATGAWDVGGGLKFELSRNVQASVDYRY
IQTMAPSNISGANGRAGTNMIGAGLTWFFGGKDTTNNDTGNIQDNGATTAAQTVAMPTID
ESKYVLPAGIKQCEGNFNLTEDGVACYTVNGDDVTVYLDTKFAYDKATLNAKGKKAIASF
VNFIKDSNIGSVTVKGYASQGQTGSEFDIYNQKLSEKRAQAVADYMKQLGLDSEKIITKG
FGYDDTLGGIPKSDPRNQRVEASVSAPLKEAN
NT seq
1179 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagattaaaaagtattgttatagctacaactgtattgttaggttcagctacagcatct
atcgctgcaggttcagataatatcgatacgtcagcaaacactaattcagctactacgcaa
agcagcggctttgcagctaataatttcattgctccttttgcaaatacttatagcgctttg
actaacaaggacaatacttggggacctcaagatagaactggccagtggtacttaggtgta
gatgctaacggtctagctggaactcctaattctccatcaggtgctggtgctaacttcaca
atcggttataacatcaataaatacttcgctgtacagtacaaccaattagttggtagagta
tttgctggtttaggtgaaggtgttgtaaactttagtaataatactatgtttactccatat
gctgcaggtggtgctggttgggcaaatctagcaggtcaagcaacaggtgcttgggatgtt
ggtggtggtcttaagtttgaactatctagaaatgttcaagcaagtgttgactacagatat
atccaaacaatggcacctagtaatatttctggtgctaatggcagagcgggtactaacatg
attggtgctggtttaacatggttctttggtggcaaagatactactaataatgacactggt
aatatccaggataatggtgcgactacagctgctcaaactgttgctatgccaactattgat
gagtctaagtatgttttacctgctggtattaagcaatgtgaaggcaactttaatctaact
gaagatggtgtcgcgtgctatacagtaaatggtgatgatgtaacagtttacttagatact
aagtttgcttacgataaagctactttaaatgctaaaggtaaaaaagctattgcatctttt
gttaattttatcaaggatagtaacattggctccgtaacagttaaaggttatgcttctcaa
ggtcaaactggtagcgagtttgatatatataaccaaaaactttctgagaagagagcacaa
gctgttgctgactacatgaagcaattaggtttagatagtgagaaaataatcactaaaggt
ttcggttatgatgatactttaggtggtattcctaaatctgatccacgtaaccagcgcgta
gaagctagcgtatcagctccacttaaagaagctaactaa
DBGET
integrated database retrieval system