Francisella tularensis subsp. novicida DPG 3A-IS: CH70_1819
Help
Entry
CH70_1819 CDS
T03875
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
fty
Francisella tularensis subsp. novicida DPG 3A-IS
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Helicase_C
SNF2-rel_dom
PLDc_2
DEAD
MEDS
AAA_19
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJJ46413
LinkDB
All DBs
Position
complement(1864896..1868147)
Genome browser
AA seq
1083 aa
AA seq
DB search
MPSKFFTNQSDNTLENRLTDILKNYDIKNLEFLLGYFRISGFKKISKYLQGVDRARILVG
INIDKLTLDAQNRGKELNRHNSEIFQNEFLSQQSDVLKKSQYAQEVDESVSLLVEMLASK
QLEIRISREKNIHAKVYILREKDIKRHNETTEYRGSIITGSSNLSENGLTKNYEFNVELK
DSDDIEFGLYEFEKLWQDAIEISEQDVENIKSNTYLKEITPYELYLKFLIEHFGERIDYD
PSVANDLPKGFMKLAYQIDAVNDGFLKIQKHNGFFLSDVVGLGKTITTTMIVRKLLSYTK
GKILIIAPPSIKQEWEETFSKFAIGTARGYQFVSNGSLNKIKNIEDYETIIIDESHKFKN
WATSRYKELEKITKENSKYNKKIILISATPLNNAPMDLANQLYLFQDSRNSTIDSFPNLA
EFFSNINDRFKKIIGRKPIDSLDPNQASAELTVEERQELEELSKEIGTKILREVMVRRTR
TDILTFPRYKEDIDRQGLKIPKINPVELVEYKLDDRLLELFNQTVDILTTQVKYSRYMIL
AKLGDHARAEFKLTSNDMPDNIFEVGAKNLADIIRTSSIKALESSFVAFKSMMNNQKKSL
EKLIQMFNKDEIFVSTDVNVYELADKYDEDEFTDKLDEMVFEGKAKKLSKDDFADGYLDE
LKADLYFIDKLCKDWGNVNKDPKLDRLKQIIQSNKKDKIVVFTESKQTANYLGQQLADTE
QVLTITSENRDRLKDTIRENFDANYHKQKNDYSVIISTDTLSEGVNMHRSNIIYNYDIPW
NSTRLMQRIGRINRIGTKHDEIFVYNFKPTAESEKYIELSKKAFTKLQAFHDALGEDSQI
YTQDEKVGTKNLYSQDSFLDIDKELEFLEEIREFAEQNPKKYREIKKLDNKVRVQRRVDN
HKDISFVFIKNDTHKNYYKVADINDLGIRVKAIDFVEMAKNLKAQPDEKPILPIIKKHYQ
DVTDAYQQYENEINSIIQKQNSVVKDLGTKKNSKDKKALQYLNKLQLSKQISKELFQQYK
ELITNGRYQNLAKEVLAIEKDSKDMSIEFALQKVLEDKNITTDKTVTNKINKNLEIILSE
TFV
NT seq
3252 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccatctaaatttttcacaaaccagtcagataacactttagaaaatcgtttaacagat
atattaaaaaactatgatattaaaaacctagagtttctacttggatattttagaattagt
ggttttaagaaaatatctaaatacttacaaggagttgatagggctagaatcttggtaggt
ataaatatagataagcttactttagatgctcaaaatagaggtaaagaattaaataggcat
aattctgaaatatttcagaatgagtttttatctcagcaatctgatgttttaaaaaaatct
caatatgctcaagaagttgatgagagtgtaagtttacttgttgagatgttagcatctaaa
caattggaaataagaatctctcgagaaaaaaatatccatgctaaagtttatattcttaga
gagaaagatataaaaagacacaatgaaacaactgagtatagaggttcaattatcacagga
agctctaatttatcagagaatggactcactaaaaattatgagtttaatgttgagttgaaa
gatagtgatgatattgagtttggattatatgagtttgaaaaactatggcaagatgctata
gaaatatctgagcaagatgttgaaaatatcaagtcaaatacatatctcaaagaaataact
ccgtatgagttatatctgaaatttctaatagaacactttggtgagagaatagactatgat
ccaagtgtagctaatgatttaccaaaaggtttcatgaagctggcatatcaaatagatgct
gtaaatgatggttttctgaagattcaaaagcataatggattctttttatcagatgttgta
ggcttgggtaaaactataactacgactatgattgttaggaagttattaagctatacaaaa
ggtaaaatattgattatagctccaccatctatcaaacaagaatgggaagagacatttagt
aaatttgcaataggaacagcaagaggttatcagtttgtatctaatggatcgctaaataag
ataaaaaatatagaagattatgaaactataattatagatgagtcgcataagttcaaaaat
tgggcaacatctagatataaagagctagaaaaaattaccaaagaaaatagtaaatataat
aaaaaaataattcttatatctgcaacacctcttaataatgctccgatggatttagctaat
cagttatatttattccaagatagtagaaattctacgatagactcttttccaaacttggca
gagtttttttcaaatataaatgatagatttaagaaaattattggtagaaaacctatagat
agcttagacccaaatcaagcatcagcagaacttactgtagaagagaggcaagagctagaa
gagctatcaaaagagattggaactaaaatacttagagaagtcatggttagaaggactagg
acagatattctgacttttccacgctataaagaagatattgataggcagggtttgaaaatt
cctaagattaatccagtagagcttgtggagtataagttagatgataggttattggagcta
tttaatcaaaccgtagatattttgacgacacaagttaagtactctagatatatgatatta
gcaaagctaggagatcatgctagagcagaatttaaacttacttcaaatgatatgccagat
aatatttttgaggttggagcaaaaaacttagcagatattataagaacatcatctattaaa
gcactggagagttcatttgttgcttttaaatcaatgatgaataatcaaaagaaaagctta
gaaaaactaattcaaatgtttaataaagatgagatttttgtatctacagatgtaaatgta
tatgagttagcagataaatatgatgaggatgaatttacagataaacttgatgaaatggtg
tttgaaggtaaagcaaaaaaactttcaaaagatgattttgccgatggttatttagatgag
ctaaaagcagatttatattttatagacaagctttgcaaagattggggaaatgtaaataaa
gatccgaagcttgatagattaaagcagataatacagtctaacaaaaaggataaaattgta
gtatttacagagtcaaaacaaacagctaattatttaggtcagcagttagcagatacagag
caagttttgacaattactagtgaaaatagagatagattaaaagacacgatcagagaaaac
tttgatgcaaactatcataaacaaaaaaatgactatagtgtaatcatatctactgatact
ctaagcgaaggtgtaaatatgcaccgtagtaatataatttataattatgatattccgtgg
aactctactagattaatgcaaagaattgggcgtattaatcgtataggaaccaagcatgat
gagatatttgtctataactttaagccaacagcggagagtgagaaatatatagaactatca
aaaaaagcatttactaaattacaagcattccatgatgcactaggagaggatagccaaata
tatactcaagatgagaaagttggtacgaaaaacctatacagtcaggatagttttttagat
atagataaagagcttgagtttcttgaggaaatacgagaatttgcagagcaaaaccctaaa
aaatatcgtgaaattaagaagcttgataataaagtcagagtacagcgaagagttgataat
cataaggatatatcttttgtatttatcaaaaatgatactcataaaaactattataaagta
gctgatattaatgatttaggtatcagagttaaggctatagattttgttgagatggctaag
aacctaaaagctcaaccagatgaaaagcctatactaccgattataaaaaaacattatcaa
gatgtcacagatgcctatcagcaatatgaaaatgagataaatagtatcatccaaaaacaa
aatagtgttgttaaagacttaggaactaaaaagaatagtaaagataagaaagctctacaa
tatctcaataagctacagttatcaaaacagatatctaaagagttatttcaacaatataaa
gaactaataactaatggtaggtatcaaaatttagctaaagaggtcttagctatagaaaaa
gatagcaaagatatgtctatagaatttgcattacaaaaagttttagaagataaaaatatt
accactgataagacggtaactaataaaattaataaaaatttagaaataatactgagtgaa
acctttgtttga
DBGET
integrated database retrieval system