Fulvivirga ulvae: LVD17_10540
Help
Entry
LVD17_10540 CDS
T09269
Name
(GenBank) PAS domain S-box protein
Organism
fua
Fulvivirga ulvae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_3
PAS_9
HATPase_c
PAS
PAS_8
PAS_4
HisKA
PAS_7
PAS_10
HATPase_c_5
PAS_GdpP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UII34248
LinkDB
All DBs
Position
2536491..2539130
Genome browser
AA seq
879 aa
AA seq
DB search
MNELSTDRFILNDFIEENAEAIFIFDSNFSVVAWNRRCYELFGIKREIAVSKELGHVAPV
FSDQYFKMLALKAMAAKPSVAKKSYTISGNVSSTYVVPSFSPVRLSEWEGNGCMVILRET
ELTERPSKFRPLIAESPIATAIYRPDGTPKYFNKAYSNLWGATKGMSDVVIKYYNIFEDE
QLEELGLTVFIQKAFLGEATEIPPIAYNPYDTASIRRLGLRQRKYVKGHVFPIKDEFGEV
EEVVMVLSDITFQKQAEEILTDTHLKFQMLTLGLPGVIYEYEEQADGGSRFKYISQGCNE
MFGFSPEEIMKDASLLNKLVHPQDLDDFLMTSGDSNRQNREWQWEGRVLVDGKEKWIEGK
SSPTRQKDGSIIRYGLLLDVTDKKEVEKRYKLSEERLQLALRGAELGLWEWDLKDKKTIF
NKAWAAKYGYDHHELELQFDDWGKLIHPEDLPCVKEKLTGHLKGETEYFEAEYRFKTKSG
SYRWILDKGRAVQRDEKGRVTKASGTYLDINEKKNAQLLIQRNEQLFTQLFENSPLGIVL
LDEKHRVIQMNQGFKDMFGYSINDIIGNQLNNILVPKDLHQEAIDINLLTVSGKVGMLES
HRTHKNGSLVPVIIYGVPVTLDNKTIGIYGIYVDITARTKAENELQVRNNELDNFVYKVS
HDLRAPLSSILGLVNLAQHQDNDDDLLQYIGLIENRVKQLDLFINDVLSHSKNLKLAIMV
DPINFKQIIDNCFTDLSYLPNAHKVDIKTRVSSRPFYSDRWRINEIFRNLISNAIKYLNP
DIDNPYVAIDINITDKSANIKFRDNGIGIEKNTLPKVFEMFYRATEYSEGSGIGLYIVKN
AIEKLGGKIRVESKPKQGTFFDITIPNSKEAWLERENEK
NT seq
2640 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgaattaagtacggatcgcttcatattgaatgatttcatagaggagaatgcggaa
gcgatctttatattcgatagcaactttagtgtggtggcttggaatagaaggtgttatgag
ttgtttggtatcaaaagagaaatagctgttagtaaagagctgggccatgttgcccctgtc
tttagtgatcagtattttaagatgctggccctaaaggcgatggctgccaaaccatcagta
gccaaaaaaagctacaccatttcgggtaatgtatcttcaacctatgtggtgccgagtttc
tcaccggtcaggctttctgagtgggaaggtaacggttgtatggttatactcagggaaaca
gagcttacagagcgaccaagtaagtttcgtccgctgattgcggaatccccgattgcaact
gctatttacaggcctgatggtacgccaaagtatttcaataaagcttatagtaacctttgg
ggggcgaccaaaggtatgagcgatgttgtaattaaatactacaatatttttgaagatgaa
caacttgaagagctcggcctcacagtcttcattcaaaaggcctttttaggagaggctacg
gaaataccacctattgcttataatccctatgatactgcttctatacgccgtcttggctta
aggcaacgaaagtacgtgaagggtcatgtttttcctataaaggatgagtttggagaagtt
gaggaagttgtgatggtgctttcggatataacttttcagaagcaggccgaagaaatattg
accgatacacatcttaaatttcaaatgcttactctcgggcttcccggagtaatctatgaa
tatgaagagcaggctgacggtggttccaggtttaaatatattagtcaggggtgtaatgag
atgttcggcttttctcctgaggagatcatgaaagatgcaagtctgctaaataaattagtc
catccgcaggatctggacgattttttaatgacatccggagattccaacaggcagaacagg
gagtggcagtgggaaggccgtgtgctcgtggacggtaaagaaaagtggattgaaggtaaa
tcaagcccaaccaggcaaaaagatggtagtattatccgctatggattacttttggatgtt
acggataaaaaggaagtagaaaaaagatataagctttccgaagagcgattgcaactggcc
cttcgcggcgctgaactgggcctttgggaatgggacctgaaagataaaaaaactattttt
aacaaagcatgggcagccaaatacggatatgaccatcatgagttagagcttcagtttgat
gattggggaaaacttatccaccctgaagacctgccttgtgtcaaggagaaattgacaggg
caccttaaaggagaaactgaatattttgaagcagaataccgtttcaaaaccaaaagtgga
agctataggtggatattggacaaaggaagggcagtgcagagagatgaaaaaggaagagtc
accaaggcttccggaacctacctagatatcaatgagaagaaaaatgctcaactgctgatc
cagcgcaatgagcaactgtttactcaattatttgaaaactctcctttaggtatagtattg
cttgatgaaaagcatagggtaatccagatgaatcaggggttcaaggatatgtttggctac
tctatcaatgatataataggtaatcagcttaacaacattttggtaccaaaagatcttcat
caggaggctattgatattaatttacttactgtaagtgggaaagtaggaatgctggagtct
caccggactcataaaaatggcagcctcgtaccagtgataatctatggagtgcccgtaaca
ctggacaataagaccatcggaatttatggtatctacgtagacataacagccaggacaaaa
gccgagaatgagcttcaggtcaggaataacgagctggataattttgtttacaaggtttct
catgatcttcgcgctccgttatcttctattctggggctggtaaaccttgcccagcaccag
gataatgatgatgaccttcttcaatatatcgggcttatagaaaaccgtgtcaagcaattg
gatctctttatcaatgatgtattgagtcactccaaaaacctgaagttggctattatggtg
gaccctatcaactttaaacagataattgataattgctttacggacctcagttatctgccg
aatgcccataaggttgatataaaaaccagagtttcttccagacccttttatagtgacaga
tggcggataaatgaaatattcagaaaccttatctccaatgccataaaatatctaaatccg
gatattgacaatccttatgtggcaattgatattaacatcactgataagtcggcaaatatc
aaatttagggataacggaataggcattgagaagaataccttgccaaaggtgtttgagatg
ttttatcgtgctactgagtactcggaaggttccggtatcgggctctatatagtgaaaaat
gccatagaaaaacttggtggtaaaataagggttgaaagcaagcccaagcaaggtacgttt
tttgatatcacgattccaaacagcaaagaagcatggttagaacgcgaaaatgagaaataa
DBGET
integrated database retrieval system