Fulvivirga ulvae: LVD17_19335
Help
Entry
LVD17_19335 CDS
T09269
Name
(GenBank) gliding motility-associated C-terminal domain-containing protein
Organism
fua
Fulvivirga ulvae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Calx-beta
Big_13
CHU_C
CFSR
Cadherin_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UII30449
LinkDB
All DBs
Position
complement(4546224..4553246)
Genome browser
AA seq
2340 aa
AA seq
DB search
MKSSITRNLIVIICFVLLSTSWSLAQPTIGTSTFDGGFLQIAGFGASPRSGSLDGWTFTS
VGGGNGFTSRNGSGQISMSMQTPTYFSIGSDDGSEFQLDNINIGFFLGATTYTITGFRDG
SAVTGAVFSESVVNAEAKFIDVSSDTDFDNIDEFRFTFSTSPSSSSITIEDITISAAAAG
NTAPTASSFTASNGPYENLTYTFSTANFGYSDGDGDILSHVLIEAVPGAGTLYVDADNDD
TYDGGEEVSVSDQISKADLDAGNLQYIQNGSTNTSFQFEVNDGTENSTGNYIATLNVTPV
PTVTLGISPTSKSEAITTATTVTATLSNAYGINTTVNLGFSGTATNGVDYSTSGTTITVT
AGATTGTITLTNINDALFEGNETVVIDISGVPAGGIEDGTQQVTYTIINDDPQPTASLLL
RPIYNPITDESGGQAYIVGELSAAAGVTVSIPLSFGGTAVGGGTDYSITGSVITINPGFS
MDSIRVTSLFDGIEEGNETVIIDMLTPTNATEDGVQQVTLTIIDEDAAPPSGYSVSIDQS
PINAGNETAASFTFAGAEVGATYNYTFSSSGGGTNVTGSGTVSSANQQISGIDLSGLGDG
TITLSVTLTDTFGNTGTAATDTETKDTTAPSGYSVTIDQAGINSGNESAVSFTFAGAEVG
STYNYTFSSSGGGTNVTGSGTIATATDQISGIDLSGLGDGTITLSVTLTDAAGNVGSTAT
DTETKDTTVPSGYSVTIDQSPINNGNESNVSFTFAGAEVGTTYNYTFSSTGGGTNVTGSG
TIVTATDQISGIDLSGLGDGTITLSVTLTDGGGNTGAPATDTETKDTSVPTGYSVSIDQT
AINVANETAVSFTFAGAEVGTTYNYTFSSSGGGTNVTGSGTIASATAQVSGIDLSGLGDG
TITLSVTLTDSNGNTGTAATDTKTKDTAAPSGYSVAIDQSPINNGNETAASFTFAGAEAG
TTYNYTFSSSGGGTNVTGSGTIVTATDQITGIDLSGLGDGTITLSVTLTDAIGNTGSPAT
DTETKETVPPAGYSVVIDQSPINSGNESTVSFTFSGAEAGTTYNYTFSSSGGGTNVTGSG
TIATATDQISGIDLSGLGDGTITLTVTLTDTNGNTGNAATDTETKDTVAPAGYTVTIDQS
PINSGNETAVSFTFAGAETGATYNYTFSSSGGGTNVTGSGTIATATDQISGIDLSGLGDG
TITLSVTLTDTNGNTGSTATDTETKDTAAPAGYTVTIDQSPINSGNETAVSFTFGGAETG
ATYNYTFSSSGGGTNVTGSGTIATATDQISGIDLSGLGDGTITLAVTLTDVNGNTGSTAT
DTEIKETVPPAGYSVVIDQSPINTTNETAVSFTFAGAETGATYNYTFSSSGGGTNVTGSG
TVASATDQISGIDLSGLGDGTITLSVTLTDTNGNTGSPATDTEIKDTTSPTGYSVTFDQA
AANSTNSTAISFTFAGAETGTTYNYTISSSGGGTNVTGSGTVASATEQISGIDVSGLGDG
TLTLSVTLTDNAGNIGAAATDNITKDTGVPSGYTVSIDLLGETVINVINQNIIEFSASGL
EIGTTLNYAFTSDGGGTPVTGTETVTAATEQFDNGGAGYDLSGLTDGTITLTINLTDNAG
NTGPDATATETKDAGPPTGYSVTWDDALINATEATTASFTVSGAEIGTTINNTVSSSGDG
NTATVSNPTTVVSSSQVVTIDVSSLTDGTLTVEVTLTDAGGNTGGVVSDNSAILDQTAPT
GYTVDIDQTSINSGNVAAVSFTFASAEIGTTYNYTFSSSGGGTNVTGSGTIATATDQITG
IDLSGLADGTVTLSVTLTDPAGNTGSQATSTAPKDASAPVFISVDDNGGDNSYRSGESLT
IVADLGEAGLTVTADLSVINSGLSATAAMTDNGDGTYSVTIADVDNAGNMIEGSAIAVTI
TATDAANNQQTDNSLVLNLDKTAPAGYTVTIDQTDINAGNQNAVSFTFAGAETGTTYNYT
FSSSGGGTSVTGSGTVGTAGEQVNGIDLSGLADGTITLSVTLTDAAGNAGAPATDNVNKT
AASIQFSTTSSSGSEATASASLLVELSVISAQNVTVDYAVSGTATGGGTDYTLANGTLTI
NAGDQSGNIDITGIVDDQLVEADETIVVTLSSPTNATLEANTVHTYTITDNDARQAQVIT
FEPIPDMTLGEGPVELKASGGNSGEPVTFAITTQPASGVATLSNGMVIIEGIGTVTITAS
QAGNDFFEPAEDVTVTFEILPNELFLPTLFSPNNDQTNDRFILRGGGDIADIELSIFDRE
GNLVYSSGSFAELSQSGWDGTNEGTKQPQGAYVWVVRGSFSNGSPILINGKDTGIIRLAR
NT seq
7023 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatcgagtattaccaggaatttaatagtcattatatgtttcgttttattgagcaca
tcatggtcactggctcaaccaactataggaacatctacgtttgatgggggttttctacaa
attgcaggctttggggcatcaccaagaagcggaagtctggatgggtggacttttacttct
gtaggaggtggaaatggcttcaccagtcgtaatgggtctggtcaaatcagtatgagtatg
caaaccccaacctacttttctataggaagtgatgatgggtctgaatttcaacttgacaac
attaatataggattctttttaggtgcaactacttataccattacaggattcagagatggt
tcagcggtgaccggagcagtattttctgagtcagtagtaaatgccgaagctaaatttatt
gatgtttcctcagatactgatttcgacaacatcgatgagtttaggtttactttttctacc
tctccctctagtagttctattaccattgaggatataacaatatctgcggcagctgcaggt
aatacagctcctacagcatcaagttttaccgcctctaacggcccatacgagaacctgacc
tacaccttttcaaccgccaacttcggatattcagatggcgatggagacatcttatcccac
gttcttatagaagcggtacccggagcaggaacactctatgtagatgctgataatgatgat
acttatgacggtggtgaagaagtctccgtcagcgaccagataagcaaagctgatttggac
gcaggcaacctgcaatacattcaaaatggctccactaacacctcatttcagtttgaggta
aacgacggaactgaaaacagtacaggaaactacatcgctaccttaaatgtcactccggtt
cccaccgttactttaggaataagcccgacaagtaaatcagaagcaataaccactgccaca
acagttacggctacactttctaatgcatatggtattaacacaaccgtaaacctgggattt
agtggcactgcaacaaatggtgtagactactccactagtggtaccaccataacagtaacc
gccggagcaactaccggaactattacattaactaatattaacgatgccctttttgaaggt
aatgaaacagtagtgatagacatctccggcgtacctgccgggggtattgaggatggcaca
cagcaggttacatacaccattatcaatgacgaccctcaaccgacggcctcccttctgcta
aggcctatttacaacccgataactgatgaaagtggtggccaggcatacattgtcggtgag
ctaagtgcagcagccggggtaacagtcagcatccccctaagctttggcggaacggccgtt
ggcggtggtactgactatagtatcaccgggtcagtcattacgatcaaccccggattctct
atggatagtattagagtcacctcattatttgatggtattgaagaagggaatgaaacagtt
attattgacatgctcacccctaccaatgctactgaagatggggttcaacaggtaaccctg
acgattattgatgaagatgctgctcccccttccgggtactcagtatccatagaccaaagt
ccgatcaatgccggtaatgaaacggctgccagcttcacctttgcgggggctgaggtgggt
gctacctacaattacacttttagcagcagcggaggtggtaccaatgttaccggttcaggc
accgtaagctcagccaaccagcaaatttctggtattgacctcagcggactgggagatgga
acgattacactttccgtaacacttacagatacttttggcaacacgggcacagcggccacg
gatactgaaaccaaagatactactgcgccatcgggctattctgttaccatagaccaggca
gggattaactcgggcaacgaatctgcggtgagcttcacctttgccggtgccgaagttggg
tctacttacaactatacgtttagcagttcgggcggcggtaccaatgtcaccggttcaggc
actattgccacggccaccgatcaaatctcaggaattgatctcagcggcctcggtgatgga
acgataacactttctgttaccctcaccgatgcagccggaaatgtgggaagtactgctaca
gatactgaaaccaaagatactacggtaccctcaggttactctgtcactattgatcaaagt
ccgatcaataatggaaatgaatctaatgtgagtttcacctttgccggtgccgaagtaggc
acaacttacaactacacctttagcagcacgggtggtggcaccaatgttaccggctcgggc
actatagtaacggctacagaccaaatttccggaattgatctcagtggcttaggtgatggc
accatcacactttcggtaacacttactgatggcggaggaaatacaggagcacctgccact
gatactgaaaccaaggacacctccgtccctacgggctactcagtatctattgatcaaaca
gctattaatgtcgccaacgagacggcggtaagcttcacttttgcgggagcagaagtaggt
actacctacaactacacgttcagcagctccggaggtggcaccaatgttacaggttccggc
actattgcttccgcaaccgcacaggttagtggaattgacctcagcggactgggtgatggc
accattacactctcggtaaccctgaccgacagcaatggtaatacaggaactgccgctaca
gataccaaaacaaaagatacggcagctccatcaggttactcggttgccattgatcaaagc
ccgataaataatggtaatgaaactgcggcaagcttcaccttcgcaggagctgaagcggga
acaacttacaactacacgtttagcagctctggcggtggcaccaacgttacaggttcgggc
accattgttacggctacagatcagattactggcattgacctcagcgggctcggagacgga
accattacactttcggtaacattaactgatgctatcggaaacaccggcagccctgctaca
gatactgaaaccaaagaaaccgtaccccccgcaggttattcggtggttattgaccaaagt
ccgataaacagtggtaatgaatctaccgtaagctttactttctcaggagctgaggcagga
acaacttacaactacacgttcagcagttccggtggtggcaccaatgttaccggttcgggc
accattgctacggccaccgatcagatcagtggcatagacctaagcgggttaggtgacggt
accattacccttactgtaacgcttaccgataccaatggcaatacagggaacgcagctaca
gatactgaaaccaaagacaccgttgctccagcgggatacactgtaactattgatcaaagt
cctataaattcaggaaatgaaaccgcagtaagcttcacttttgcaggagctgaaaccggc
gctacctataactacacattcagcagctctggtggcggcactaacgtcaccggatcgggt
accattgccacggcaacagaccagatcagtggcatagacttaagtggactgggtgacgga
accattaccctgtccgtcacactaacggacaccaatggcaacaccggaagcacggctacg
gacacagaaacaaaagacactgctgctccggccggatacaccgtaaccattgatcaaagc
ccgataaattcaggaaatgaaaccgctgtgagcttcacttttggcggggctgaaaccggc
gctacctataattacacgttcagcagctccggcggcggtacgaatgttactgggtcaggc
accattgccacggccaccgaccaaatcagtggaatagacctgagcgggctgggtgatggt
accataactttagcagtaacgctcacagatgttaatggtaatacaggaagcacagccaca
gatactgagatcaaggagactgtacctcctgccggttactcagtggttatcgaccaaagt
ccgataaacactaccaatgaaacagctgtgagttttacttttgcaggagctgaaaccggg
gctacctataattacacattcagcagctccggaggcggcaccaatgttaccggatcaggt
actgttgcctctgccactgatcagatcagcggtatagatctcagtggacttggcgatggc
accattaccctgtccgtcacactaacggacaccaatggcaacaccggaagtccggctaca
gatacagaaataaaagacaccacctctcccacaggatattcggtaacctttgatcaggct
gctgccaactccaccaacagtactgctattagctttacctttgcaggtgcagaaaccggc
actacctacaactataccatcagcagctctggcggtggcaccaatgttaccggatcgggt
acggttgcctctgctaccgaacagattagtggcatagatgtcagtggcctgggtgatggt
acgcttactctatcagtgactttaactgataatgcaggcaacatcggcgctgcagccacg
gataatataaccaaggacacgggagttccctcaggatacaccgtctccatagaccttctc
ggagaaaccgttatcaatgtgatcaatcagaacattatagaattctccgcttcaggcctt
gaaataggtactacgctcaactatgctttcaccagcgacggaggtggcacacctgtaact
ggaacggaaacagtaactgctgccacagagcaattcgataatggcggtgcaggctatgac
ctgagcggccttacagatggtaccatcacacttaccatcaacctgactgataatgcagga
aataccggcccggatgccaccgctacagaaactaaagatgcaggccctccaacaggctat
tcagtaacctgggacgatgccctgatcaacgcaaccgaggctaccaccgcatcatttaca
gtatccggtgccgaaataggtacaacgatcaataatacggtgagcagttctggtgatgga
aatactgctaccgtatctaatcctacaacagtagtcagcagcagtcaggtagtaaccatt
gacgtaagctcacttacggatggaaccctgaccgttgaggttaccttaactgacgcaggt
ggcaataccggaggggttgttagtgacaactctgctattcttgatcagacagctccgaca
ggttatactgttgatatagatcagacaagtataaactccggtaacgtagctgcagtgagt
tttacctttgccagcgctgaaattggtaccacttacaactacacgttcagtagctccggt
ggcggaacgaatgttacaggctcaggcaccattgccacagctactgaccaaatcaccgga
attgacttgagtggcttggcagatggtacggttacgctcagcgtcacgctgactgaccct
gcaggaaatactggttctcaggctacaagcactgcacctaaagatgcatctgcaccagtg
tttatctcggtggatgataatggcggtgataactcataccgctcgggggaaagcctgacc
attgtggctgaccttggtgaagcaggacttacagtaaccgctgacctgtcagtgatcaat
tcagggctaagcgctacggctgctatgacagacaatggcgatggcacttacagtgtgacc
attgcagatgtagataacgcaggtaatatgatagaaggttctgctattgcggttacgata
acggcaacagatgctgcaaacaaccagcaaactgataacagtttagtccttaacctggac
aagactgccccggcgggctatacggttactatcgatcagactgatattaatgcaggaaac
caaaatgctgtaagctttacttttgcaggagccgaaacaggcaccacatacaattatacc
tttagcagctctggtggtggcacaagcgtcacaggttcaggcactgtgggaacagccggt
gagcaggtaaacggcatcgacctgagcggacttgccgatggtacgattacccttagcgtc
acccttactgatgctgccggtaatgcaggagccccggctacggataatgttaataaaacg
gctgccagcattcaattcagcactacaagcagttcgggcagtgaagctacggccagtgca
agccttcttgtagaactatctgtaatcagcgcacaaaatgtaactgtagattatgcagtt
agcgggaccgctaccggcggaggaacggattacactttggctaacggcacattgacaatc
aacgctggtgaccaaagcggtaatatcgatatcactggcatagttgatgatcagcttgtt
gaggctgatgagactatagttgttacattgtcctcaccaacaaatgccacacttgaagcc
aataccgtacacacttatactattactgataatgatgcccgacaagcccaggtaataact
tttgaaccgatcccggatatgacccttggagaaggccctgttgagcttaaagccagtggc
ggaaactcgggagagccggtaactttcgcgataactacccaaccggcatcgggcgtagcc
acactttcaaacggcatggtgatcatagagggtattggtacggtcaccatcactgccagc
caggccggaaatgactttttcgaacctgcggaagatgtaacagtaacatttgaaatttta
cctaatgaactgttcttacctaccttgttcagccctaataacgaccaaaccaatgaccgt
ttcattcttcgcggtggtggcgatattgctgatatcgagctgagcatttttgacagagag
ggaaacctggtatatagttcaggtagttttgcagaactctctcagtcaggatgggatggc
accaatgaagggaccaaacagcctcaaggggcatatgtttgggtagtcagaggtagcttc
tccaatggatctccgatattgatcaacggaaaagataccggcatcatcaggttagccaga
taa
DBGET
integrated database retrieval system