Fulvivirga ulvae: LVD17_20255
Help
Entry
LVD17_20255 CDS
T09269
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
fua
Fulvivirga ulvae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
fn3
Por_Secre_tail
PhoD_N
Ig_7
Pur_ac_phosph_N
Tissue_fac
Ig_J_second
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UII30629
LinkDB
All DBs
Position
4787288..4792693
Genome browser
AA seq
1801 aa
AA seq
DB search
MSNYIRLSVLILICFIVSSFTGKNIGGTNGYFAASITASNVSNITSSSATAGGESLSTDG
TITEKGVYYKESSILSLITGATKVAATGGGTASFSVALTGLDPETNYFYVAYAIDADGEI
YSANEIDFWTLAVSPSTYPATFSASANSSSSISITYESIDDFGGADGYIIIKTTGTFDFS
MITDGVAPSSLAGVELVDHVTDEFQTSTDDISLDPETSYSYAIIPYNVGSDDATYNYFTG
GAVPTASATTDPLAAPANLSASAITANGFDINWDDEPEADSYDWDVSEASDFSTTLASYT
NQSTTSTGSAITESISSLSSGVTYYFRVRSVKGTFTSDYVTSSQVTTPEVPTGMSATNAI
PDGFTLSWNAVTGATNYDVQISSSATAFSSNLIVGYNPINTTTNSLAVSDATKFSANTTY
FFRVRAKNGGIQSSYSTITSATTAADLEVYLATTEPDLEICSGDNVSFYAFGATTYQFFV
GAQLRGTNSTFSIDNLQNNDVVSVNGTTGASVASASLGPFTVHDLPIASLSGSNPSFFIE
DDPVSLEDYITYSGGTLSVSGTGVAKGADGYKFYPEIAGEDNHEIIYSVKSPDGCIREIP
MNIDVFAGALTLSGRYCSNLSTTTITVNLDLIPEGKIYQRLRFLHNGIEINDPSIYESTS
NYQYTFHPAEAHAAGMESVEVQVIVVSVDECDSRHSNYPLDCSDIMDDPCHPDNPGPDSE
CTDCSLNPSSCSVCDPRHSNYPLDCSTVMNNPCHPDHPSYPGSCSNCDTRNPNYPTSCDA
VMNNPCHPDNPSYPGSCSDCDTRNPNYPYSCDNVMNNPCHPDNPSYPSGCDIGPDPCYKL
EAGRIIDCQLQRMEEARVQRIAKRSAMLMEYNKLAFPQLYALASDEEVFQSKETNIITPE
IGEVTSLNEFYCANSGNVLLEGTFSGNFSGTNVEKVGEQFFYKPSEAIIPNGEAYVNDTI
VYSYFDNGGCANSVEAYVKVYELPPSPIVDDIVLCQGDTPENFIIQNPVTGSSVIWYSDA
DLTTPVGSGTVFNSGLSTTSPGSATFYVTQGVNGCQSLSDTVSILVNSLPNGLAMHGLSN
TTYCNDYQEPIPLIAEPAPVPGTSAAFIIGNAVLQRYDTISATVSDDGTLGVASFVPADF
GIGVYKIHYRFINEKGCVNESATETVNLVNFKPTVDFGVSRIREGEQTFFKGDDAIIDNL
SSAGQVLDSVFWDFGGEATASDGSNIDSLYRHQFSGAGVYGVTYSILTESFCSGQITKKV
GIFPVIEVSDDNFYFESFEGASHGWIESEKLELGNASSWSLSTPQGDTIIGAASGANAWI
TNAGEDVSGNPNNSYNKSEDSWIEGPCFYINDLSRPVLSLKIWSDTEDGFDGAVVEYSIG
DTTQWNTLGSIDEGLEWYNTQGLVGSPGNQSGASFGWSGKLHGDWTLAKFPLDEIHAEAG
NKPVRFRVAFASTSDNPFGKTFDGFAFDDFSIESRNRVVLLEHFTNMSSTESRNEDSRLR
TFVEGRNQEVIDIQYHTSFPGADPLNQFNKADPSARALHYAIAEVPRTVMDGIYGVYYKN
EPFFRDSWGVNAYNTRALISAPFNINVLLGDDVSTTLEVTVEISKNTTAEPIEGNLIVQL
AVVERQVTVDGNTYYNVVRQLLPNAAGNRLFGDWQTDDSRVERVIQTWNPAVEPDDSEFM
IVASLYNEKSKEVYQAAFMSIPASKMPPMAKVTGVDDLLSKEGIYLFPNPTEKEINMLFP
APLNEEYTLTVYDLHGVEVYRGTVRRGADKATLNTETYSSGVYSIRLNSSTDQVIRRFVK
K
NT seq
5406 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaactatataagactgtccgtattaatcttaatttgctttattgtttcatctttt
actggtaaaaacataggtggcacaaatggttattttgctgcttcaataacagctagtaat
gttagtaatataacttcctcatctgctacagcaggaggagaatcattatcaactgacgga
acgatcactgaaaagggagtatactacaaggaatcttcaatattatcactcattactggg
gcaacaaaagttgctgcaacaggtggtggtaccgcttctttttctgtggcattgacaggt
ttggatcccgaaacaaattacttttacgttgcatatgcaattgatgcagatggagagatt
tatagtgctaatgagattgatttttggaccctagctgtttctccaagtacttatccagct
actttttcagcatctgccaattcatccagttcaatttctataacttacgaatctattgat
gattttgggggtgcagatggttacattattattaaaactactggaacgtttgatttttca
atgataactgatggtgtcgcgccgagtagtttagctggggtggagttggttgaccatgtt
acagatgagtttcaaacctctacagacgatattagtttagatcccgaaacttcatactct
tatgcaatcattccctacaatgtaggttcagatgatgcaacctacaattactttacagga
ggggccgttccaaccgcttctgccactacggatccgttagcagcaccggcgaatttaagt
gcatctgcaattactgccaatggatttgatatcaattgggatgatgagccggaagctgat
tcatatgattgggatgtttccgaggcaagtgacttttcaaccaccttggcgagttacact
aatcagtcgacaacaagtacaggttcggcaattacggaatcaattagcagccttagctcc
ggtgttacttactattttcgagtaaggtccgttaagggtacttttaccagtgattatgtg
acatccagtcaggttacgacaccagaagttccaacaggaatgtcagcaaccaatgccata
ccggatggtttcaccttgtcttggaatgcggtaacaggcgcaactaattatgatgttcaa
atttcatccagtgcaaccgctttttctagtaatttaattgtgggttataatcctattaat
acaacaacgaatagtctggcagtaagtgatgccactaagttttcagcaaatacgacatat
tttttcagagtacgggctaaaaacggaggtattcaaagtagttattccactattacttca
gcaactacagctgctgatttggaagtttatctggcaactactgaacctgatttagaaata
tgttcaggagacaatgtgtctttttatgcttttggggcgacaacttatcaattttttgtc
ggtgcccagttgagaggtacgaatagcactttttcaattgataatttgcagaataacgat
gtagtttcagtaaatggtacgaccggggcaagtgtagcttcggcctcgttagggcccttt
accgttcatgatttaccaatagccagtttatcaggatctaacccatcattttttattgag
gatgatccagtgtctctggaagattatattacttactctggtggtacgttatccgtttcg
ggtacaggagtagctaaaggtgctgatggatataaattttatccggagatagccggcgaa
gataatcatgagatcatttactcagtgaaatctcccgatgggtgtataagagaaataccc
atgaatattgatgtatttgcaggggcgttgacattatcgggtagatattgcagcaattta
tctactacaacaattactgtaaatcttgatttaatacctgaaggtaaaatctatcaaagg
ttacggtttttgcataatggaatagagattaatgatccatcaatctatgaaagtacgtca
aattatcaatatacttttcatccggcagaagcccatgccgccgggatggagtcagttgaa
gttcaggtgatagtggtgtctgtagatgagtgtgattcgagacattctaattacccactg
gattgctctgacatcatggatgatccatgccatccggataaccctggccctgatagtgag
tgtacagactgtagtcttaatccgtccagttgtagtgtatgtgatccaaggcactcaaat
tatcccttagattgcagcacggtaatgaacaatccatgtcaccctgatcacccgtcatac
ccaggtagttgtagcaattgcgatacacgaaatcccaactatcctactagttgcgatgca
gttatgaataacccatgtcaccctgataacccatcatatccgggcagctgtagtgactgt
gatacacgaaatcctaattatccgtatagctgtgataatgttatgaacaatccatgtcat
ccggataacccaagttacccaagtggatgtgatattggtccggatccctgctataagctc
gaagctgggcgtataattgattgccagctacagcgcatggaagaggctagagtacaaagg
attgctaaaagatctgctatgctaatggagtataataaactggcattccctcaattgtat
gctcttgcctcggatgaagaagtgttccaatctaaagaaactaatataattacccctgaa
attggagaagtaacttctcttaatgaattctattgtgccaattccggtaatgttcttttg
gaaggcaccttttccggtaattttagcgggacaaatgttgaaaaagtcggtgaacaattc
ttttataaaccaagcgaggcgattattccaaatggggaagcttatgttaatgatactatt
gtatattcttattttgataacggaggatgtgctaatagtgtagaggcatatgtgaaagtt
tacgagctgccgccttcaccaattgttgatgatattgttttgtgtcagggagatactcct
gagaatttcattattcagaaccctgtgacgggaagctctgtaatctggtatagcgatgct
gacctgacaacaccagtaggtagcggcactgttttcaattcggggttaagtacaacaagc
cctggaagcgccacattttatgttactcagggagtaaacgggtgccagagtctttcggat
acagttagtattttggtcaattcattgcctaatggtttagcaatgcatgggctttcaaat
acaacatattgtaatgattatcaagaaccaatcccgcttattgctgagccagctcctgtg
cccggaacttcagcagcatttattataggaaatgcggtactgcaaaggtatgatactatt
tcagcgacagtttcggacgacggaactctgggcgtagcctcatttgtacctgcagatttt
ggaattggggtttataaaattcattacaggtttattaatgaaaaaggctgtgttaacgag
tcggcgaccgaaaccgtcaatcttgttaattttaaaccaactgttgactttggtgtctcg
agaattcgtgaaggagaacagaccttcttcaaaggagatgatgctataattgataactta
tcatctgctggtcaggttctggactctgtcttttgggattttggaggagaggcgactgct
tcggacggtagtaatattgatagcttgtatagacatcaattctcaggagctggggtctat
ggcgttacttattcaattctgacagaaagcttttgctcaggacaaatcactaagaaggtt
ggtatattcccggtaatcgaggtatccgatgataatttctattttgagagttttgagggg
gcttctcatggctggatcgaaagtgaaaaattggaattaggtaatgcatccagttggtca
ttgagtaccccgcagggtgatacaattataggtgctgcttccggagctaatgcatggatt
accaatgcaggtgaggatgtatccggaaatcctaacaactcttacaacaaaagtgaggat
tcctggatagaaggaccatgcttctatattaatgacttaagcaggcctgttctttcctta
aaaatctggtctgatacagaagatgggttcgatggggcagtggttgagtattctattgga
gacacaactcaatggaatacactgggaagtattgatgaagggttggagtggtacaatact
cagggacttgttggatcacctggtaaccagagtggggcgagctttggatggtcaggtaaa
cttcatggcgattggacgctggcaaagttccctttggacgaaatacatgctgaagctggt
aataaacccgttcgtttcagggttgcttttgcgagtaccagtgataatccttttggtaaa
actttcgatgggtttgcctttgatgatttctccattgaaagcaggaaccgtgtagttctc
ctggagcattttacgaatatgtccagcacagaatcccgaaatgaggacagcagattgcga
acttttgtggaaggaagaaaccaggaagttatagatatccaataccatacatcattcccg
ggtgcggatcctttgaaccagtttaataaagctgatcctagtgcaagagcattacactat
gccattgcagaagtgccaagaacggttatggatggtatatatggtgtgtattataagaat
gagccgttcttcagagatagttggggtgttaacgcttataatacaagggcgttgatatca
gctccatttaatattaatgttctactaggtgatgatgtttctaccactttggaggttact
gttgaaattagcaaaaatactactgcggaacctattgagggtaatttgatagtgcaactt
gccgtggtagaacgtcaggtaaccgtagatggaaatacttactacaatgtggtgaggcaa
ttattacctaatgctgcaggtaatcgactttttggtgactggcagactgacgattctcgt
gtagaacgcgtgatccaaacctggaaccctgcggttgagccggatgattcagagtttatg
atcgttgcttccttgtataatgagaaaagcaaggaggtatatcaggcggcatttatgagt
atacctgccagcaaaatgcctcctatggctaaggtaacaggggtagatgatctcttaagt
aaggaaggcatctatttgttcccgaacccgacagagaaagaaatcaatatgctcttccct
gctccattaaatgaggaatatacattaacagtttatgatttgcacggcgtagaagtgtac
agaggaactgttaggagaggtgcagataaagctacgttaaatacggagacttactcgagt
ggagtatactctataagattgaatagtagtactgatcaggtgatcaggaggtttgtaaag
aagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
