Fusobacterium ulcerans: C4N20_09765
Help
Entry
C4N20_09765 CDS
T05433
Name
(GenBank) autotransporter domain-containing protein
Organism
ful
Fusobacterium ulcerans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
DUF2997
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVQ28353
UniProt:
A0AAX2J723
LinkDB
All DBs
Position
2100078..2104367
Genome browser
AA seq
1429 aa
AA seq
DB search
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DBGET
integrated database retrieval system