Fusobacterium ulcerans: C4N20_11720
Help
Entry
C4N20_11720 CDS
T05433
Name
(GenBank) autotransporter domain-containing protein
Organism
ful
Fusobacterium ulcerans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVQ28715
UniProt:
A0AAX2J8J1
LinkDB
All DBs
Position
2531483..2534410
Genome browser
AA seq
975 aa
AA seq
DB search
MIEKIMKAVKSGNKKRGRNITVGAVVGMLLSCTAVMGTDVSGLEITKDSDIIIFKGENGN
EFDPEKLEGNPYPDNTWANNTYTNNSSIVGENASGNAYGVKVSESISIVNNGEIRGSSEN
GHTYGIGISEDIEIKKLENNGMIISYSESNGDSHGITIGMIGKSAKVTELINRGFINATS
TEGESYGISTFASVEIDNLINDGLIRGTTRATGEKNGYGIKVFFGSKVNSLTNDGLVIGT
AVGGEGYGIEIKNSKDFSDSSAVNVENIKNNGIISGTSTDNDGYGILIGDSVDGGLVSVG
KILNNGIISGSSSVEDHNKYGYGIFVGSNHGGGPGIVGQIENNGIISGNGFVESVSSSGI
STESDSKISEMVNKGIIYGKKYAISVAPGTIESAKNYGILVSNNADGDVVNSYLEIIAPG
ESPSSGASIENYGLAFLVDGDVYKAKDNYGVPYNKFGEKQTVGEYTIINAKNTGNNDDIK
TVSMKLKNGILFHDNSDTSRIKDFSSEKKYILNGIEDTLKVSGMENELNNSVINAYKTAV
VINENMSMLTLDNTVVNGGVADGSTTISITENGSTLTVKGDSVINTRDKGVAITVDGNDN
AVVLEGNAIVNGKMEAAGKDNILALYGKTKGSMNMFHDISGFADMNIDNNVTFSEEMTVT
GTDRVTVEGTGVLNLRLKKETPVTSPYGTDTPPTATHAFSGRSGKHKMTIEGSGEVGTLN
FITNGIGREILVDMENIKLENMQIRASSIIDKAEFDGNYIRLGAGSDLNGIVNPKEVKRY
GQLNKIYKSIYNSREENIDGLRDILSLSTYLGKNYDYNNITDEEQLLSLVTYLNSVYTGT
PYSYSSELSRRSVGMFRDIVVDNIFRPETNKWLIMGGLTHADGGTKDTYYGRNYHGFDTG
TSDTSADMKLTGAYMLAKYGYSENTSLGLTLGGNKSEAELDMAKVKGNSGYLGAFAENYR
GNLTLKVGAGVGYKF
NT seq
2928 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagaaaagattatgaaggctgtaaaaagcggtaacaaaaaaaggggaagaaatatt
acagtaggagcagtagtgggaatgcttctatcttgtacagctgtaatggggacagatgta
tcagggttagaaataacaaaagatagtgacataataatatttaaaggtgaaaatggaaat
gaatttgatccagaaaaattagaggggaatccatatcctgataatacttgggctaataat
acttatacaaataattcttcaatagttggagaaaatgcaagtggtaatgcttatggagta
aaagtaagcgaatcaataagcattgtaaataatggggaaataagaggaagttctgaaaat
ggtcatacttatggaataggtatatcagaagatatagaaataaaaaaattagaaaataat
ggaatgataattagttatagtgaaagcaatggagatagtcatggaataacaattggaatg
attggaaagtcagctaaagtaacagaactaataaatagaggctttataaatgcaactagt
actgaaggggaaagttatggaatatctacttttgcgtcagtagaaatagataatttaata
aatgacggtcttataagaggaactactagagctactggagagaaaaatggttatggaata
aaagttttttttggtagtaaagtaaatagtttaacaaatgatggtctggtaattggaact
gctgtaggtggagaaggttatggaatagagattaaaaacagtaaagacttctcagactca
tcagcagtaaatgtagagaatataaaaaacaatggaattataagtggaactagtactgat
aatgatggttatggaatacttattggtgactcagtagatggaggactagtaagtgtggga
aaaatattaaacaatggaattataagtggaagtagttctgttgaggatcataataagtat
ggttatggaatattcgttggatctaatcacggtggtggtccaggaatagtagggcaaata
gaaaataatggaattataagtggaaatggatttgttgagagtgtttctagttctggaata
tctactgaatcagattcaaaaataagtgaaatggtaaataaaggaattatctatggaaaa
aagtatgctatttctgtagcgcctggaacaatagagagtgcaaaaaattatggaattctt
gtatctaataatgctgatggagatgtagtaaatagttatttggagataattgctcctggt
gagtctccaagtagtggagcctcaatagaaaattatggattagctttcttggttgatggt
gatgtatataaagcaaaagataattatggagttccctataataaatttggggagaaacaa
acagttggtgaatatactatcataaatgctaagaacactggcaataatgatgatataaaa
actgtaagtatgaaattaaaaaacggaattctattccatgataattctgatacttcgaga
ataaaagatttctcttcagaaaagaaatatattttaaatggaatagaagatactctaaaa
gtttctggtatggaaaatgaattaaataacagtgtaatcaatgcatataaaacagcagta
gttataaatgaaaacatgtcaatgcttactcttgataatacagtagtaaatggaggagtt
gcagatggtagtacaacaataagtataactgaaaatggaagtactcttactgtaaaaggt
gactctgtaataaatactagagataaaggggttgctataacagtagatggaaatgacaat
gctgttgttttagaaggaaatgcaatagttaatggaaaaatggaagctgctggaaaggat
aatattcttgctctttatggaaaaacaaaaggaagtatgaatatgtttcatgatatatct
ggatttgctgatatgaatatagacaacaatgtaacattctctgaagagatgacagtaaca
gggactgatagagtgacagtggaaggaacaggggtattaaatcttagattgaaaaaagaa
actccagtaacatcaccatatggtactgatacaccacctacagcaactcatgctttttca
ggtagaagtggtaaacacaaaatgacgatagagggatcaggtgaagtaggaactttaaat
ttcataacaaatggaataggaagagaaatattagttgatatggaaaacataaaacttgaa
aatatgcagataagagcaagttcaattatagataaagctgaatttgatggaaattacata
cgtttaggagcaggttcagatttaaatggaattgtaaatccaaaagaagtaaaaagatat
ggtcaattaaataaaatatacaaaagtatttacaacagcagagaagaaaatattgatgga
ttgagagatatattaagtctatcaacttatcttggaaaaaattatgattacaataatatt
acagatgaagaacagcttctaagtcttgtaacttacttaaacagtgtctatactggaact
ccttactcatacagttcagagttatcaagaagatcagtgggaatgttcagagatatagtt
gttgataatattttcagaccagagacaaataaatggttgataatgggtggacttactcac
gctgatggaggcactaaagatacatactatggaagaaattatcatggatttgatactgga
acatcagatacaagtgcagatatgaaattgactggagcatatatgctggctaaatatgga
tattcagaaaatacttctctaggtttaacacttggaggaaataaaagtgaagcagaacta
gatatggcaaaggtaaaaggaaacagcgggtatttaggtgcatttgctgaaaactataga
ggaaacttgacattgaaagtaggagcaggggtaggttacaagttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
