Fusobacterium animalis 4_8: HMPREF0409_00533
Help
Entry
HMPREF0409_00533 CDS
T02680
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K00375
GntR family transcriptional regulator / MocR family aminotransferase
Organism
fus
Fusobacterium animalis 4_8
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fus00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
fus03000
]
HMPREF0409_00533
Transcription factors [BR:
fus03000
]
Prokaryotic type
Helix-turn-helix
GntR family
HMPREF0409_00533
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Aminotran_1_2
GntR
HTH_41
HTH_11
HTH_36
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGM23646
UniProt:
R9RA06
LinkDB
All DBs
Position
1235761..1237170
Genome browser
AA seq
469 aa
AA seq
DB search
MIILNLINKSKIPLYIQIYAEIKKLIQSKILKANEKLPSKKDFMDYYNISQNTIQNALYL
LLEEGYIFSIERKGYFISDIENLIVHDVKIENKTQHKEKKKIHYDFSYSGVDSKSLAKTI
FKRITKDVYDEENDDLIFQGHIQGDFLLRKSICEYLSQSRGFKVEAEQLIISSGTEYLFY
IIFKLFNNKIYGLENPCHKMFKELFLTNNVSFKSIPLDESGIIIEELKKHNVNIAYVTPS
HQFPTGTIMSISRRTELLNWANENFNCYIIEDDYDSEFKYTGRPIPALKANDINDKVIYL
GSFSKSISPAIRVSYLVLPKELLNIYQKKLPYFICPVPTLNQKILYKFIKDGYFVKHINK
MRTLYKKKREFLVNTIKKYSSEIFNKEIYIQGADAGLHLVIKLNQKINEKAFLKECLENS
LQLYSLEEYYLEETYNETSSFLLGYANLTNNEIDEGILLLLRILKKYYI
NT seq
1410 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattattttaaatttaattaacaaatcaaaaattcctttatatatacagatatatgca
gaaattaaaaaattgattcaatctaaaatcttaaaggcaaatgaaaagctaccatctaag
aaagattttatggactattacaatattagtcaaaatactattcaaaatgctctttatctt
ttattggaggaaggatatattttttccatagaaagaaaaggttattttatttctgacata
gaaaatttaattgtacatgatgttaaaattgaaaataaaacccaacataaagaaaaaaag
aaaattcattatgatttttcctattcaggagttgacagtaaaagtttagcaaaaacaatc
tttaaaagaattactaaagatgtctatgatgaagaaaatgatgatttaatttttcaaggt
catatacaaggagattttttattaagaaaaagtatttgtgaatatctatcacaatcaaga
ggattcaaggtagaagctgaacaactcattattagctcaggtacagaatatttattttat
ataatttttaaactttttaataataaaatttatggtttagaaaatccttgtcataagatg
tttaaagaattatttttaacaaacaatgttagttttaaatctattcccttagatgaatct
ggaattataattgaagaattaaaaaaacataatgttaatatagcctatgttactccttca
catcaatttccaactggaacaattatgagtattagtagaaggactgaacttttaaattgg
gcaaatgaaaattttaattgttatataattgaagatgattatgacagtgaatttaagtat
acaggtcgtccaattccagcattgaaagcgaatgatattaatgataaggtaatttactta
ggtagtttttcaaaatcaattagtccagcaattcgtgtgagctacttagttttaccaaaa
gaacttttaaatatttatcaaaagaaacttccatattttatttgccctgttcccacttta
aatcaaaaaattctttataagtttataaaagatggttattttgttaaacatatcaataaa
atgagaacactttataaaaaaaagagagaatttcttgtaaatacaataaaaaagtattcc
tctgaaatatttaataaagaaatctatatccaaggagcagatgcaggtttacatttagtg
ataaaattaaatcaaaaaattaatgaaaaagcatttttaaaagaatgtttagaaaattct
ttacaattatatagtttagaagaatattatttggaagaaacctataatgaaacttcatct
tttcttttaggatatgctaatttaacaaataatgaaatagatgaaggaatattattattg
ttacgaattttaaaaaaatattatatataa
DBGET
integrated database retrieval system
