Fusobacterium animalis 4_8: HMPREF0409_02365
Help
Entry
HMPREF0409_02365 CDS
T02680
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
fus
Fusobacterium animalis 4_8
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
PTPA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGM23953
LinkDB
All DBs
Position
1580729..1584061
Genome browser
AA seq
1110 aa
AA seq
DB search
MVRLSKTDYGDEKNVSPAEFAAKYSDPKKYYSYPEEDDDGNILYYVVREIIKKVGEFDVN
DKEGINKFKGNSLGVQEEKFDKEVQETVKVKKDVTKSLNDFIATAKERAEKGEAPRNQFD
QYFYDKKHLSEEDFENKWVKPFKNPEYIKAKENYERELAEAQKRYEAAKKEFDNAAKEEN
GFYDNPNRPANFYGIATWEGLDTEQQKKDYLNSLSDKDRKYVETWVKLYENRIKLENETT
KLNSDIASGIAKKYGFWNDPSATPEQRKYAGLNGLIKDLELTRSIAGKNVEFRGIGRIEG
TVDLGEGKNTLKIAEQITGQYGTNITLGAYAKLKNIDTVEVGGSLTLDNAQASISGRTSL
SMDIDATKKNSEGHYYQHALKDSDPNIRFIKYGTTNMDSRNDFMIELLTSKITENEAIID
MGRKIDYTWHDMITGKDYDMTIPFVSDSIAHQLINNKKLSKNGTSLLELKTREELRRLNA
DENAVYRSIRNANKLGILSPTLTTSNKKTTFNIVDEEKEAKKKKDLLTYLKTKSGEELLN
DLSQFNLSADEKKEALNLIKNLKENNDFKSIINKEKELKNKLDEFNKIEKDANYQKLAFK
DLSDSVENNFSKLSNNIYSSFANKNNLEKSLNVDLDRTDSFEIIQKAILLGDKVPELKNK
MNDIRTELKTSLNNFEQSLRKDLETVKALKAKYPNSKFGEIEKTIESILADNKIRTVLSR
NLNNDNELAKVIADYKVLLSNISMQLNTRKTIEKELEENDASIEQPRYADYHRLKSKIFY
TMREEEVLSELKNMLNQLSDRNIYSKLNKVSKNEISTYTTLPFEVTHALTDKKHIGRGGF
ISNRTVQDNFKGNIYTAYGLYETTANSGTKYGILFGGAHTKHNEVYQRSLTTVATESEIK
GTSAYVGGYFNKPVVNNLNWITGIGTQYGRYKVKREMRNNYQDLHSDGKVNTTSLNTYSG
LIINYPIQEDVFVQLKGLLAYTMVKQSKINESGDLPLDINGKTYHYVDGEAGISFNKIFY
GEDLKSSISAGAYGILGITGYKNGDMEAKINGSSSSFGIKGDRVKKDAVKIHLDYNVQTD
AGYTYGLEGTYITNSKENNVKIGIKGGYTF
NT seq
3333 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttagattgagtaagacagattatggagatgaaaaaaatgttagtcctgctgaattt
gcagctaaatactcagatccaaaaaaatattattcttaccctgaggaagatgatgatgga
aatatactttattatgttgttagagagattattaaaaaagtaggggaatttgatgtaaat
gataaagaaggtataaataaatttaagggtaactcattaggagtacaagaagaaaaattt
gataaagaagtccaagaaactgtaaaagtcaaaaaagatgtaacaaaatctttaaatgat
tttatagcaacagccaaagaaagagctgaaaaaggggaagctcctcgtaatcaatttgat
caatatttttatgataaaaagcatttatcagaagaggattttgaaaataaatgggttaaa
ccttttaaaaatccagaatatataaaagctaaagaaaactatgaaagagaattagcagaa
gctcaaaaaagatatgaagctgctaaaaaagaatttgataatgcagctaaagaagaaaat
ggtttctatgataaccctaatagaccagctaatttttatggaatagcaacttgggaagga
ttagatactgaacaacaaaagaaagattatttaaatagtttatctgataaagatagaaaa
tatgttgaaacttgggtaaaactttatgaaaaccgtataaaattagaaaatgaaactact
aaattaaattccgatatagcttcaggtattgctaaaaaatatggtttctggaatgaccct
tctgccaccccagaacaaagaaaatatgcaggattaaacggacttataaaagatttagaa
ttaactagaagtattgctggaaaaaatgttgagtttagaggaataggaagaatagaagga
actgttgatttaggagaaggtaaaaatacattaaaaatagcagaacaaataactgggcaa
tatggaactaatataacattaggtgcttatgcaaaacttaaaaatatagatactgttgaa
gttggtggctcattaactcttgataatgcacaagcctcaatatcaggaagaacttcttta
agtatggatatagatgccactaaaaagaatagtgaaggacattattatcaacacgctcta
aaagattctgatccaaatatcagatttataaaatatggcacaactaatatggatagtaga
aatgattttatgattgaattgttaacaagtaaaatcactgaaaatgaagctattatagat
atgggaagaaaaatagactatacttggcatgatatgataactggaaaagattatgatatg
actattccatttgtgtcagattcaatagctcatcaattgattaataataaaaaattatct
aaaaatggaacttcacttttagaattaaaaacaagagaagaattaagaagattaaatgct
gatgaaaatgctgtatatagaagtattagaaatgcaaataaattaggtattctttctcca
acccttacaacatcaaataaaaagactacttttaatatagttgatgaagaaaaggaagct
aagaaaaagaaagatttattaacttatttgaaaacaaaatctggtgaagaattattaaat
gatttatcacaatttaatttatcagctgatgaaaaaaaagaagccttaaatttaatcaaa
aatttaaaagaaaataatgattttaaatctatcattaataaagaaaaagagttaaagaat
aaactagatgagtttaataaaattgaaaaagatgcaaattatcaaaaacttgcttttaaa
gatttaagtgatagtgtagaaaataatttttctaaactttctaataatatttactcttca
tttgcaaataaaaataatttagaaaaatctttaaatgtggatttagatagaacagattct
tttgaaattattcaaaaagcaattttattaggagataaagttccagaattaaagaataaa
atgaatgatataaggactgaattaaagacttctttgaataattttgaacaaagtttaaga
aaggatttagaaacagtaaaagccttaaaagctaaatatcctaactctaagtttggagaa
atagaaaaaactatagaatctattttagctgataataaaataagaacagttttatcaaga
aatctaaataatgataatgaactagcaaaagttatagctgattataaagtattactttca
aatatttcaatgcaattaaatacaagaaaaactattgaaaaagaattggaagaaaatgat
gctagtatagaacaacctcgttatgcagattatcatagattaaaatctaaaatattctat
actatgagagaagaagaagttttatctgaattaaaaaatatgcttaaccaattaagtgat
agaaatatttattctaagttaaataaagtttctaaaaatgaaatctcaacttatacaact
cttccatttgaagtaactcatgccttaactgataagaaacatataggaagaggtggattt
atttctaatagaacagttcaagataattttaaaggaaatatttacacagcttatggactt
tatgaaacgacagctaattcaggaactaaatatggtatcttatttggaggagctcataca
aaacacaatgaagtatatcaaagaagccttacaactgttgcaactgaatctgaaataaaa
ggaacttctgcttatgttggaggatatttcaataaacctgttgtaaataatttgaattgg
attactggaattggtactcaatatggaagatataaggtaaaaagagaaatgagaaacaat
tatcaagatttacattcagatggaaaagttaatacaacttcattgaatacatacagtggt
cttattattaactatcctatacaggaagatgtatttgtacaactaaaaggacttttagca
tataccatggtaaaacaaagtaaaattaatgaaagtggagatttacctcttgatataaat
ggaaaaacttaccattatgttgatggagaagcaggaattagctttaataaaattttctat
ggagaagatttaaaaagtagcatttcagctggtgcttatggaatcttaggtatcactgga
tataaaaatggtgatatggaagcaaaaattaatggaagttcatcttcatttggaataaag
ggagatagagttaaaaaagatgctgtaaaaattcatttagattacaatgttcaaacagat
gcaggatatacttatggacttgaaggaacatatataactaattcaaaagaaaacaatgta
aaaattggaattaaaggtggatatacattctaa
DBGET
integrated database retrieval system