Fulvivirga lutea: JR347_00540
Help
Entry
JR347_00540 CDS
T07076
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16092
vitamin B12 transporter
Organism
fuv
Fulvivirga lutea
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fuv00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fuv02000
]
JR347_00540
Transporters [BR:
fuv02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
JR347_00540
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Phage_tail_NK
DUF2542
DUF5123
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QSE97609
UniProt:
A0A974WGT8
LinkDB
All DBs
Position
complement(107395..109530)
Genome browser
AA seq
711 aa
AA seq
DB search
MRKLLFIVLAAAPAYLFAQEIKQDTVLNEVIISGNRMAKEVFTTSRSARVITSSEIEKSA
YNTVGELLSNETSIYVVGSGQNPGSNQSLFMRGSNSNHVNVLIDGVKITDPSSPNGAIDF
SEISVANIERIEIIKGSHGALYGTGGIGGVINIITKKAQEGLAGNASLQVGSLGGGGVAT
NQNLYVNYGKKGFYVNGSVFNSNINGINAAQDTSTADTFKKPDEDDFRKTDYSIKAGYKN
NVVDISIGYKKADQRADIDDGAFADDDNYKLDFDRDLYQYGINYQLNEKLSASFNGGYSE
STRLSLDDSSLVAPNVYDQTFVSSETDGLLNTNEVQLTYQGIGSFSAILGAGMYKEEMDL
LTYFYSNGPFGVFEQTTDYDSVDMSLESKYAFASINYHIGESVEFLNNLYITSSVRYTDL
SNGSDNWSFDFSPSYQLNNSLIYLSYSQGFNQPSLTQLYSPNGVFNFTTRGNENLNPETS
RTYEVGVKHKLTTKGFLTASAFRTTVKNAIEYVYLWNANTPISNLSFGDYLGDTYINIAE
QNILGLELEAEYNIANTLKLRAGGTWLETEMVSSDEDLDVGYTGNNHVQLYSNGVFLSSE
DQDSELVRRPTRQIFGAVEYNPKNKFSTQLTANFINSRPDVVYDPSLGPFGALGTSEVDD
YLLFDLSGTYQLKENMTLTGRIENLLDEDYFEINGFNSRGRSFYIKLSYNF
NT seq
2136 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaaactactatttattgtgctggccgcagctccagcttatctttttgcacaggag
ataaaacaagatactgtgctcaatgaggtcattatttcaggaaacagaatggccaaagaa
gtatttactacaagcagaagtgccagagttattaccagttcagaaattgagaaaagtgct
tataatacggtaggcgaactactttcaaatgaaacctcaatttatgtggttggttctggt
caaaatcctggtagcaaccagtctttatttatgcgcggtagcaacagcaaccatgtaaac
gtattaattgacggtgttaagattacagacccatcatcacccaatggagcaattgatttt
tcagaaatttctgtagccaatatagaacgaattgagatcataaaggggtctcacggggca
ttatacggcacaggaggcattggtggggttatcaatatcattacaaaaaaggcgcaagaa
ggattggccggcaatgcgtcactacaagtgggatcgcttggtggaggaggagtagcaaca
aatcaaaacctctatgtgaattacggcaaaaagggtttttatgtgaatggatctgtattt
aattcaaacataaatgggatcaatgctgctcaggatacttcaactgctgatacttttaaa
aagccggatgaagatgactttagaaagacagattactctataaaagcaggctataaaaat
aatgtagttgatatatccattggctacaaaaaagcagatcagagagctgatattgatgat
ggagcgtttgccgatgatgataattataaattggactttgatcgggatttatatcaatac
ggtatcaattatcaattgaatgagaaattaagtgcatccttcaacggtgggtacagcgaa
tcaacacgtttatcactagatgattcttcattggtggcacccaatgtttacgaccaaact
tttgtaagcagcgaaacggatggactcctaaacactaatgaagttcagctaacatatcag
ggtattggatcattttcagcaattcttggcgctgggatgtacaaggaagaaatggattta
ctaacctatttttatagtaatgggccatttggtgtttttgagcaaactacggattacgat
tcggtagacatgtcattagaatctaaatacgcctttgccagcatcaattatcatattggc
gagtcagttgaatttttgaataacctatatattacctcaagcgtgaggtacacagattta
tcaaatggttctgataactggagttttgattttagcccttcttatcaactgaataattct
ttgatttatctatcctattcacaaggcttcaatcaaccatcgctaactcagctttattct
ccaaacggggtatttaattttacaaccagaggcaatgaaaatctaaatcctgaaacttcc
agaacgtatgaagtaggagtaaaacataaattgacaacgaaagggtttcttactgcttcg
gcatttagaaccacggtaaaaaatgcgattgaatatgtttacctatggaatgctaacaca
ccaatctctaatttatcgtttggagattatttaggagatacgtatatcaatattgctgag
cagaacattttaggattggagttggaggccgagtacaatatagctaataccctaaaatta
cgagcgggcggtacgtggttggaaacagaaatggtgagtagcgatgaagatttggatgta
ggttataccggtaataatcatgttcaactatattcaaacggtgtttttttatcttcagaa
gaccaagactcggaattagtaagaaggcctaccagacaaatttttggagcagttgaatac
aatccaaaaaacaaattctccacgcaattaacagcaaatttcataaacagtaggccagat
gtagtttacgatccatcattagggccatttggtgctttgggcacctcggaggtggatgat
tatctgttgtttgatctatctggcacttaccaattaaaagaaaacatgactcttacaggg
cgtatcgaaaatttgttggatgaagattattttgagattaatggttttaattctcgtggt
agaagcttttatattaaattgagctataatttttag
DBGET
integrated database retrieval system
