Fulvivirga lutea: JR347_05505
Help
Entry
JR347_05505 CDS
T07076
Name
(GenBank) BamA/TamA family outer membrane protein
Organism
fuv
Fulvivirga lutea
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Omp85
Metallophos
ShlB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QSE98536
UniProt:
A0A974WHM2
LinkDB
All DBs
Position
1196735..1200379
Genome browser
AA seq
1214 aa
AA seq
DB search
MKAFSVIFCVFLGVFTFIQSTAQKQVSYTLYLVGDAGKVTDGQTSNFQVISEQINGQNEG
LVFLGDNIYQQGMPTAQSESRIAAEEAINAQIELAKKFNGNAYFIPGNHDWAQGRKIGWD
QVQRQEDYVEDRLDSANVFIPNDGCPGPVEVNLSDELLLVIIDTQWFLHGWDKPTNEIGG
CDFNTPLDVLLALDQILALNTHRKVVVATHHPMYTYGEHGGVFPFKHFLMPPVVGAFYPF
YRAVFGSVQDIPNPKYKGMRNALVETLEQYPNVIHVAGHEHSLQYSFNNSIHYIVSGSGS
KTTYVKKKGFAEYAESVNGFAKLLFYSDGEVKVEYWRHDGSKAFSKSLMNKPYAPKLTGE
EFAKKYDLEDSVYVTHASDQYEAGKGHKRLFGANYRDVWQQDLEVPVFDIGTEHGGLKIV
QRGGGQQTKSLRLEAKDGKQYVLRSIEKFAAGAIPPFLRNTFAQDLVQDQISASHPYGAF
VVPYLAEAAGIYHTNPQLVFIPDDPRFGKYQATFANTLALYEERPSKDWSDADFFGNSPD
IESTSKVLENLQEDNDHYVDQKFVVKSRLFDMIIGDWDRHDDQWRWSEIDEGKGNRYRPI
PRDRDQVFFVNEGFFPGIWKRKWALPKFEGFDEDIDWPSGLSFNARYFDRSFLTGLERED
WIEAAEQLKRDLTDEKIESAIKKWPKPIYDLHGERVIRRLKARRDNITESAISHYLFLAK
EVDVVGSDKHENFVATRLPNGDVHVQVRKMKKDGDKKHTIFERTFKYDETKEIRLYALGG
DDEIEIEGESPKGIKIRVIGGDGDDELDDDSKVGGFGKKNIFYDTKEGNKLKLNSESKNR
LSNNEDVNNYNRKAFQYNVLMPLLTGNFNPDDGVYLGGGFVYTNHGFRKEPFKSKHKVLG
SYAINTQAYNFNYLGQFTDVIRKWDLETNVSFLVPNFVNNFFGYGNESKFDQDIDETVDV
NRAIDYYRLRFEEISYEVGFFRPIGSLARIGITHDFVSWELDQGANENRFVTDVFLPNTN
LENEQTVNYMGGGLRLDVDTRKNIKNPVSGLLWTNKINTLYGIDDATDDFHQYNTELSVY
HSFKIPAKLTFAARVGWGINFGDYPFFRGQTLGGREQIRGYRKTRFYGDEAFFSNVEARL
KLFSVKGYILPATVGILGFHDVGRVWVDGENSDKWHRGIGGGIWIEPFNLTVLSFEVGAS
EEETLAYVRMGFLF
NT seq
3645 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagcattttcagtaattttttgtgtttttcttggtgtttttacattcattcaatct
accgcacagaaacaggtttcttatactttgtaccttgtgggtgatgcgggtaaagttact
gatggccagacaagcaactttcaggttatttccgaacagataaatggccaaaacgagggc
cttgtttttcttggtgataacatttatcagcaaggcatgccaactgctcaaagtgagtca
aggatagcagctgaagaggccattaatgctcagattgaactggcaaaaaaattcaatgga
aatgcctattttattccgggtaatcacgattgggctcaaggccgaaaaatcggttgggat
caggtgcagcgtcaagaagattatgtagaagaccgattggacagtgccaatgtgtttatt
ccaaatgatggctgtcccgggcctgtggaggtgaatctttctgatgaattattattggta
attatcgatacgcaatggtttcttcatgggtgggataaaccaacgaatgaaataggtggc
tgcgatttcaatactccgcttgatgtgctattggcactcgatcagatattagcattaaat
acacaccgaaaagtagtcgtggcaacgcatcatccaatgtatacctatggcgagcatggt
ggagtttttccattcaaacattttttaatgccacctgtagttggcgctttttatccattt
tatcgggcagtttttggtagcgtgcaggatataccgaatcctaaatataaaggcatgcga
aatgccttggtagaaacattggaacaataccctaatgttatccatgtcgcaggtcatgaa
cattctttacaatattcattcaacaattcgatccactatatagtcagtggttctggcagc
aagacaacttatgtgaagaaaaaaggctttgccgagtatgctgaatctgttaatggcttt
gctaagttgctgttctactctgatggggaagtaaaggttgagtattggaggcatgatggt
agtaaagctttctcaaaatctttgatgaacaaaccgtatgcaccaaaacttacgggagaa
gaatttgccaaaaagtacgatttggaagatagcgtgtatgtgactcatgcaagcgaccag
tatgaagctggaaaaggacataaacgtctctttggggctaattacagagatgtttggcag
caggatttagaagttcctgtttttgatataggtacagagcatggcgggctaaagatcgta
caacgaggtggtgggcagcaaacaaaatcgctccgtttagaagcaaaagacggtaaacag
tatgtacttaggtccatagaaaaatttgctgctggtgccatccctccttttttgagaaat
acttttgctcaggatttggtgcaagaccagatttctgcatcgcacccatatggcgcattt
gtagtaccatatcttgccgaagccgcaggaatttatcatactaacccacaattggttttc
atcccggatgatcctcgttttggaaagtaccaggcaacattcgccaacacgttggctctc
tatgaagagcggccatccaaagactggtcagatgccgacttttttggaaactcaccagat
attgaaagtacttctaaggtattggagaacctgcaggaagacaatgatcattatgtggat
cagaagtttgttgtgaagtcgaggttatttgatatgatcattggtgattgggacaggcac
gatgatcagtggcgctggtcagaaattgatgaaggtaagggtaataggtatcgtccaatt
ccgcgtgatagagatcaggtatttttcgtaaatgaggggtttttcccaggtatttggaaa
cgcaaatgggcactgccaaagtttgaaggcttcgatgaagatattgattggccctcgggt
ctttcctttaacgccagatacttcgataggtctttcctgaccggattggaaagggaagat
tggattgaagctgctgaacaattgaaaagagatttaaccgatgaaaaaattgaatccgct
attaaaaaatggcctaaacctatttatgatttgcatggtgaaagggttatcagaagacta
aaggcaagaagagataatatcactgaatctgccattagccattatctttttcttgccaaa
gaagtggatgtggttgggagcgacaagcatgagaattttgtggccacgcgattaccaaat
ggcgatgtgcatgttcaagtaagaaaaatgaaaaaagatggtgataagaagcataccatc
tttgagcgcacttttaagtatgacgaaacaaaggaaatccgactttatgccttgggaggt
gatgacgaaattgaaattgagggtgaaagtcctaaaggaataaagatcagagtaattggt
ggtgatggtgatgatgaactggatgatgactccaaagtgggcggatttggtaagaaaaat
atcttttatgacaccaaagagggtaataagttaaagttgaactcagaaagtaaaaacaga
ttatctaacaatgaggatgttaataactataaccgtaaggcatttcagtataatgtattg
atgccattgctcactggtaattttaaccccgatgacggtgtttatctaggtggaggattc
gtttacactaatcatggttttagaaaagagccatttaaatcgaagcacaaagtattaggt
agctatgctataaatacccaggcctataattttaattacctgggacagtttactgatgtt
attcgtaagtgggacctggaaacaaacgtaagttttttggtgcctaattttgttaataac
ttctttggttatggaaatgaatccaagtttgatcaagatatagatgaaaccgttgatgta
aacagagctattgactattatcgactaagatttgaggaaatatcctatgaagttggcttt
ttccgccccattggttctctcgccagaataggaataactcatgactttgtcagctgggaa
ttagatcagggtgccaatgaaaatcgctttgtaaccgatgtttttctccctaataccaat
ttagagaacgagcaaacggttaattacatgggtggtggtttgagattagatgttgatact
cggaagaatataaagaaccccgtttcaggccttttatggactaataaaatcaatacactc
tatggtatcgatgatgctacagatgatttccatcagtataataccgagttgtcggtttat
catagttttaaaatacccgctaagctcacttttgcagcacgagttggctggggtattaac
tttggcgactatccatttttcagagggcaaacgttaggtggtagagagcaaataagaggg
tatcgaaaaactagattttacggtgatgaagcatttttctccaatgtagaggctcgattg
aaactgtttagtgtgaaaggctacatcctaccggctacggttggtattctcggctttcat
gatgttggtagagtttgggtggatggagagaactcagacaaatggcatcgtggcataggt
ggtggaatatggattgaacctttcaacttaacagtattgtcattcgaagtaggcgcatcc
gaagaagagacattggcttatgtaagaatgggattcctattttaa
DBGET
integrated database retrieval system