KEGG   Fusobacterium varium: FV113G1_02680
Entry
FV113G1_02680     CDS       T05280                                 
Name
(GenBank) putative autotransporter
Organism
fva  Fusobacterium varium
SSDB
Motif
Pfam: WZC_N ATP-synt_ab_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: BBA49921
LinkDB
Position
complement(307064..316471)
AA seq 3135 aa
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DBGET integrated database retrieval system