Fusobacterium varium: FV113G1_03640
Help
Entry
FV113G1_03640 CDS
T05280
Name
(GenBank) autotransporter
Organism
fva
Fusobacterium varium
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Ntox22
DUF3060
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBA50017
LinkDB
All DBs
Position
418040..421348
Genome browser
AA seq
1102 aa
AA seq
DB search
MIRRFFYLTILYLLSFFNLSAIEDQLILDKNGKELFNLRFFDEGEKIKLEDLEEISTYSL
NSEEKKAILGAGKYWKDILNTNNNSLSKIFIYTSNVENASAYSPNIEDGIAKGMTQLQAK
ILGKPFDYTSGEPVALIEIGKMNFKTGVPSVLPNVVGADLYGTMVHELGHALGISGTAIF
DKDTNQAKFEDIPSIFDKGLIDNRGRKISETTGIISYIDNDRNTIGNPNTDFDASGNVYF
TGKNVAEVLKDSSLKGVPINVRLEGDTPIPELSHLEMDRGLMSHQPYSNYSTFMEAELAV
LQDIGYSIDRRNFFGYSVYGDNLNINNYNGYFLRDEKGEKYIIGRANTASYGVGLHVYGS
NNEIVQKADILTSGMAGTGIRVDGVKNKITVDKNIKINVDGDYGTGILIAYGKEHNITNN
GEIRARGNQGIGVRFDFGTGSNGKHTAYLGSYILSAEGKDFSNSLALIDNESLKVNEVDG
ALVENFNTSGYIEGKNASLYMSDNVYVKNINIFDGAVLKGNIVSMYNPKTLFNNNNIATE
TNLNLGVDKNNLNKGDSNFSFRFDDNIIGKNIVLNIKGGKSSLNGNNEILRAVINDGAIL
SGNAQYTLDENENFINKGTISPGNMIGKIVIKGNYKQENDGKINIDFDGNGNHDILEIIG
NAYFSTNSSMKLTPQKSYYSKSLKIDKNEFLKVVGIKNGEINNLIFDDNIFTSSPTIKSA
AFDSSSSQMTVLRNENPYSRFSQNRNTKDFAKAIDRISDQASGPIKDLIGALDFSSSAAI
SSALSQATPNIYGNNIIATFEAEKEYSAYMRNQLMTENNYEKNKSYAFGKLFYKDSWQKG
TGYLMGYDYRDQGVITGIEKAYDDNLILGTHLLFSQSILKGHTVNTPKIKSKNILLGVHG
KYYPDYGKTGYLYGIIRGGIQENKLSNNIKFDEYKNNTNSDWKVINGSSVLGFGKDIEYK
RFTVTPLIELGYGILKTENTKDSNLGINIDSKTYHSVYSKVGGKLSSSKILIGENTKVSG
NILMTYNHDYINDYYVTGNIDKNKNSNFKIQTKRPDKDYITIQGGTTFSVKDNFDITLEI
GTDLFKHKSTSVNTSLTFELGL
NT seq
3309 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgataagaagatttttttatttaactattttatatttactttctttttttaatctttca
gcaattgaagatcagcttattttagataagaatggaaaagagttatttaatttaagattt
tttgatgaaggagaaaaaataaaacttgaagatttggaagaaatatcaacttattcatta
aattcagaagaaaaaaaagcaattttaggtgctggtaaatattggaaagatattttaaat
actaataacaactctctttcaaaaatatttatatatacaagtaatgttgaaaatgcctca
gcatatagtcctaatatagaagatggaatagctaagggaatgacacagctacaagcaaaa
atactaggaaaaccatttgattatacttctggcgagccagttgctcttatagaaatcgga
aaaatgaattttaaaactggagtaccttcagtcttacctaatgtggtaggagctgatttg
tatggaacaatggtacatgaactgggacatgcattgggaatctctggaactgctattttt
gataaagatacaaatcaagcaaaatttgaagatattccctcaatttttgacaaaggttta
attgataacagaggaagaaaaatatctgagactacaggaattatttcatatattgataat
gatagaaatacaataggaaatccaaatacagattttgatgcttctggaaatgtatacttt
actggaaaaaatgtagctgaagttttaaaagatagttcattaaaaggagttcctataaat
gtaagattagaaggagatactccaattcctgaactttctcatttagaaatggatagaggc
ttaatgagtcatcaaccgtattcaaattattcaacatttatggaagcagaattagctgta
cttcaagatattggttacagcatagacagaagaaatttctttggttattctgtatatgga
gataatttaaatattaataattataatggttatttccttagagatgaaaaaggagaaaaa
tatattataggaagggctaatacagcttcttatggagtagggcttcatgtttatggaagc
aataatgaaatagtccaaaaggcagatatattaacttctggtatggcaggaacagggata
cgtgttgatggagtaaaaaataaaataactgtagataaaaatattaaaattaatgttgat
ggtgattatggaactggaatacttatcgcatatggaaaagaacataatattactaataat
ggggaaattagagccagaggaaatcaaggaataggtgtaagatttgattttggtactgga
agtaatggaaagcatacagcttatttaggatcatatattttatcagctgagggaaaagat
ttttctaactctttagctcttatagataatgagagtttaaaggttaatgaagtagacgga
gctctggttgaaaactttaatacttcaggttatatagaaggtaagaatgcttctttgtat
atgtctgataatgtttatgtaaaaaatataaatatttttgatggagctgtattgaaaggg
aatatagtttctatgtacaaccctaaaacattatttaataataacaatattgcaactgaa
acgaatttaaatttaggtgttgataaaaataatcttaataaaggtgacagtaatttttct
tttagatttgatgataatatcataggaaaaaatattgttttgaatataaaaggaggaaaa
tcttctcttaatggtaataacgaaattttaagggctgtaataaatgatggtgctatatta
tctggaaatgctcaatatactttagatgaaaatgaaaattttattaataaggggactatt
tctcctggaaatatgatagggaaaattgtgattaaaggaaactataagcaggaaaatgat
ggaaaaataaatattgattttgatggtaatggaaatcatgatattcttgaaataatagga
aatgcatatttttcaacaaattcatcaatgaaattaactccccaaaaatcttattacagt
aaatcattaaaaattgataaaaatgaatttttaaaagtagtaggaataaaaaatggagag
ataaataatttaatatttgatgataacatttttacttcatcacctactataaaaagtgca
gcttttgattcatcttcttcacaaatgacagttttaagaaatgaaaatccctatagcaga
ttttctcaaaatagaaatacaaaagattttgctaaagcaatagacagaatatcagatcaa
gcttctggaccaataaaagatttaataggagcattggatttttcttcatctgcagcgatt
tcttctgccctttctcaagcaacacctaatatatatgggaataatattattgctacattt
gaagcagaaaaagagtattcagcttatatgagaaatcaattaatgacagaaaataattat
gaaaaaaataaatcttatgcttttggaaaacttttttataaagacagctggcagaaagga
acaggatatctcatgggatatgattacagagatcagggtgttattacaggaatagaaaaa
gcctatgatgataatttaattttaggaactcatttattatttagccaaagtattttaaaa
gggcatactgtaaatactcctaaaataaaaagtaaaaatattcttttaggggtacatgga
aaatattaccctgattatggaaaaactggttatttatatggaataattcgtggaggaatt
caagaaaataaattgagtaacaatattaaatttgatgaatataaaaataatacaaatagt
gattggaaggtaattaatggttcaagtgtattaggatttggaaaagatattgaatataaa
agatttactgttactccattaatagaattaggatatggtattttaaaaacagaaaataca
aaagacagtaacttaggaattaatatagattccaaaacatatcattcagtttattctaaa
gtaggaggaaaactttcaagcagtaaaatacttattggagaaaatacaaaagtaagtgga
aatattcttatgacatataatcatgactatataaatgattattatgttactggaaatatt
gataaaaataaaaattctaattttaaaatacaaactaaaagaccagataaagattatata
actattcagggaggaacaacattttctgtaaaagacaattttgatattacacttgaaata
ggaacagatttattcaagcataaatctacttctgtcaatacttcattgacatttgaattg
ggattgtaa
DBGET
integrated database retrieval system