KEGG   Fusobacterium varium: FV113G1_03640
Entry
FV113G1_03640     CDS       T05280                                 
Name
(GenBank) autotransporter
Organism
fva  Fusobacterium varium
SSDB
Motif
Pfam: Autotransporter Ntox22 DUF3060
Other DBs
NCBI-ProteinID: BBA50017
LinkDB
Position
418040..421348
AA seq 1102 aa
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NT seq 3309 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system