Fusobacterium varium: FV113G1_11230
Help
Entry
FV113G1_11230 CDS
T05280
Name
(GenBank) putative autotransporter
Organism
fva
Fusobacterium varium
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Beta_helix
WZC_N
ATP-synt_ab_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBA50774
LinkDB
All DBs
Position
1278508..1288554
Genome browser
AA seq
3348 aa
AA seq
DB search
MKKIDIEKSLKRFLKKKVSYSLSLLIAFMITGGISLGAGITAEEIQETKNELLTRIQTER
EEIKRKIAENERLIKEYNSDFVELVRKGDFYSKPLMPSTQVFFSYQYLDNGKMKDVTDKE
FAKTIDAVNKYYGTSNGGSLLESKDKVIAGNGVAINNEVFRETIEVGANIKPIAPVLPTI
NPNVSVNVSVPVVNLGVLPGTVRPTIPTIATITAPVVSIPSTPNGVNVSVATPGAVDKIT
VTVPTMIAPTAPTINISPVTVNISLNVKTPGSITSPTPKEPDRVLNIVDPDASPFSDFSW
AWMSGNNPVANTNSSGSSEYSLGDNINVTGGTFWSGVKTDGTIANTAGYTGATQEPYNGQ
TASNFDGNRTYDKRHLSIINSYNGRWTGRTGNRITGGTFYVAGDVNGISYSPYATGTEAF
HLVADVHLENVTANLYGKAAFINAEAFRGGQTTMKNVTINVLRDENTVFHLKGSRPGQED
TSFEGSQFATKFAGNANITIDTKKNSVYAVRNFAGGLKIENTGKIVFNGASNIGVSFLTW
VPDKSKYIGKPGAGTLGEGSVDAYIPYVKLASNTPMEMYGDENVGIFFNKKISGYDVGIH
QGYFDLYFNIGTKLNSSGGATQTTGGQLGKDGYTAATVDGNVGVYAISGQRNGVDVTQLA
SQSYFINDPIHNLIMDKFDIKFGKYSKNGFMFLAKNGTVIDIQGIKTTSFSDGINGTNTA
EADTGMGTIIAFAEGKWTAAGTSLVGNGLEGKPTEIIVDKNLNMMSKEGIAFFAKDGGLI
TVKKGAEGYGYGSIIGYADNGTVNINADIKAIDGGVATENKKYNNIGGYAIANGTITVTG
NAEINGLGAFANGANAKVYLRGTGNKIKTGVSGGLASLKGGYVEFGGGIIEHKDITPGDH
NQKLPFFADDISKINFTGATTITMYNGAVFSGEASDYVGTVGTSAKYNGMGNVTISLQAN
GINLGVFKNQNIIWNGEAGYLAHLAGIPKVAAIEENGHWYNSYLEGGTMAINKNVDLDAK
SDGNTKGGDAFNDIGMEREKITINSGIKITSTDGNGLVLGSNVTANTSGKNADSGYTNNG
EIKISGGNQAGVYVSYGHIKNNGLIETDGGSGAVGVNGSKIENTSTGKVNIGTVATANGV
GIVGLATKIKADGTPDTPESYGTDGGDTTTKVLEISNKGAITVNGISGIGIYAENNVASA
GKERAFVENIGSITVGGSKTSAVAIGMYGKKTTISNTGTITVGAGGVAIYAENGSNITNL
GTLKLGSDAIGIMADGTSTITATNVTLESNTGTDTDGKTAVYYKGSTSGTDDKSISLNID
AESFDKGTAIYAENMNLASSGALKVGTSGVGIFVKGTVANTGKNTGSIELGTKEGAVGMY
TKTSTISNESNIKVGHSSQIGMYAEGTDSKVLNTGNINLSTDNAKGIYVKSGATTEISGD
KITFAGKSSIGVFAEDGAKVKLTENLNFANDNANKNIYIYGKNGSSVTLNTGKSVAVNGI
ASNFSGEKTVGIYLENNGTANNFSGSDGTLNVLNEAVGIYSKGNNILNVNISAEGKNTTG
IFIDGPSTLTGIVTAKGTASTAGTPGTGAIGVYGSGGAVTIGAGGLTLNMNSGKGTGMYL
TDGAFATGEKIIVNNTTANENNIGLYYSKGNTSGIVNNEVDIELQGNSSIGIYAADSINL
GNEKNIESAGTENIASFVGGSSTLTSGGNITMSGTDNIGIYTGSGVGKNTGIIDITGAAG
TSAGMVANTTADIASIENSGDIKAGTNLGMYITGTGTSSGKNTGNITVTGNGTGVYVDGA
NNSFNGTGGTITSEKVGIYLKNTTAGKITTGNLTIAQGGVGVFGENSVVDFSVDTSSSTE
AIGVVAKGTSLISGNIITGEGSVGVYAVDNSVVFNGANIITGANTTGAVPKTSVGVLLKA
AGTYTMDNVSVNAKNGVGIYLEDSTQVKTLTYSGSVTTENGIGIYVTDGSTITTETAAIN
INGGTGVYINGGTANLGTTSNTLAINFLENGGIGIYNKGGVLNLGSNITVTGAGSLAATL
NGSLNSAGNITVGDGGAGLYGTYDSGTTTTQEVASSGTITAQNGGIGLAATKGATTPTGT
VTVKNTGTINVAGKSNATNSPSVAIYTDIANIENAANINVGNNGIGIYSKYNGVTTSIKN
DNMTITGNDAIGIYINGATNGITANNITSTGAGNTGVLLERATSISNINVGTVALGNASV
GVMATANTISIIEGTISVGKSSDSKSAIGIAANAGSNITLAGTASITTGEKGIGVYAEGA
GTIIDVQDASIINVGDNGIYLYSKDAALSFSGNITANNQIGIVAEGGTVITAGPASITAQ
NGGIGVYIKNAVPTLTSAAITVKDGSTSNHSIGIYYQNAVSVGTIPVITQIGNKTIGVVL
DNSAGNTPASGINLASANEQVGVMAKNSSTLTVAGGISISGGNNNVGVYGTDNSTVTLSG
NMIVAAPAVIDSTNPMKYSSVGVFLKNSGYTGNGDISIRNYSIGIYGKELNGKSISHTGT
TMAVGNHGVGIYGTGTGAEKITLAMTSGIILGKDNSIGVFADGMNSTVIGNIAIGANTSI
GIASKGTGNVDYTGDMTIADKVDTGSVGIYKLDGAGTIATSAGNWNVGNSGYGIYVKQTT
GKEAEIYNSANMVLGMSAVGIYSEGKNKVLNTGNIEVGETDIKGDHNKISDHLNSVGIYA
TRGSEVENAVGATIKVHHDHSVGVYVDGANTSFKNYGTIDVDYAGVGVIVRNGAIAVNEV
GANIILGSNIVAGCNAVTVGMSASGTGSKIVNNGTITINAGVGMNINEFATVVNTGTLNV
NNGVGIEGTGTVINTGTMNVAPGAVGENAGERPTASVGAVVIKPDGTIYINDQYTAIGGT
FETAGDIVVNGAHVDITTGTPMFNANSVSGEVKILSNFASTGNGISYKIENFVNTAIGTI
TGNKLTPVTSPLFVAKVTNSGDLVIVKRPYADLTIGDQFDALDKGLDNILVNSGGSGKDA
EILKGLNEYLDGLPSDKFETETARTLAETRGDIYATIQGRMQDINRAFDNSFYELESSYN
LTKDSSKYSVIYTDGNYKDSTLGIDDYDYKVMGLLYMKEKEGTEYGSKYGYTLGFAGSKF
DFDDGGSKEDVYSLRVGAHRVKNLSEEHKVSWLSRIELGYNRHIAKRKLELDKTYENKGE
YNTYSVAFDNRLTKVMYTDLSRQLEVYASLDLEYGKVDDFKESAGSKGGLEVQIKDNDYL
SAQAAAGAKASQRIYAGNDISVKITADVKYAYEFGDNYDGNKARLKNGGEGYYSLITPEE
REGKLSGKVGLTVEKANHMGVTFEVEAADESNKKDSSIKYGVRFNYKF
NT seq
10047 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaattgatattgaaaaatctttgaagagatttttaaagaaaaaagtaagttat
tctttatcacttttaatagctttcatgataacaggaggaatatctttaggtgcaggaata
acagcagaggagatacaggaaactaaaaatgagcttttaactagaattcagacagagcgc
gaagaaataaaaagaaaaatagcagaaaatgaaagattaataaaagaatataattcggac
tttgtggaacttgtaagaaagggagatttttactctaagcctttgatgccaagtacacaa
gtttttttcagttatcaatatttagataatggaaagatgaaagatgtaacagataaggag
tttgcaaaaactattgatgcagttaataaatattatggaacatcaaatggcggcagttta
ctggaatcaaaagataaagtgatagctggaaatggagtggcaattaataatgaagtcttt
agagagacaatagaagtgggagccaatataaaacctattgccccagtattaccaactatt
aatccaaatgtgtcagtaaatgtatctgtacctgtagtaaatttaggagtgttgccagga
acagtaagaccaacaataccaacaatagcaaccattacagcacctgtagtttcaatacca
tcaacaccaaatggagtgaatgtatctgttgcaaccccaggggctgttgataagataaca
gtaacagtaccaacaatgatagcaccaacagcaccaacaataaatataagcccagtaact
gttaatatatcattaaatgtaaaaacacctggttctataacttctccaactcctaaagaa
ccagacagagttttaaatatagtagacccagatgcaagtccattttcagatttttcatgg
gcatggatgagtggtaataatccagtagctaacactaattcatcaggttccagtgagtac
tcattaggagataatattaatgttacagggggaacattttggtcaggagttaaaactgat
ggaacaatagctaatacagcaggatatacaggggctacacaagagccatataatggacag
actgcttcaaactttgatggaaatagaacttatgataaaagacacttaagtataattaat
tcatataatggaagatggactggaaggacaggaaataggataactggaggaactttctat
gtagcaggtgatgttaatggaatatcatatagcccctatgctacaggaacagaagcattt
catttagttgctgacgttcatttggaaaatgtaactgccaacttatatggtaaagctgcc
tttataaatgctgaagcttttagaggtgggcaaactacaatgaaaaatgtaacaatcaat
gtattaagagatgaaaatacagtttttcatttgaaaggaagtagaccaggtcaagaagat
acaagttttgaaggaagtcaatttgctacaaaatttgctggaaatgcaaatataactatt
gatactaagaaaaatagcgtttatgcagtaagaaattttgctggtggattaaaaatagaa
aatacaggaaagattgtatttaatggagcatctaacataggagtttcatttcttacatgg
gttcctgataaatctaaatatattggaaaaccaggtgcaggtacattgggagaaggatca
gtagatgcttatattccttatgttaaattagcttctaacacacctatggagatgtatgga
gatgaaaatgttggaatctttttcaataaaaagatatcagggtatgatgtaggaattcat
cagggatattttgatctatattttaatattggaacaaaattaaactcatctgggggagct
acacaaacaactggagggcagcttggaaaagatggatatacagctgcaactgttgatgga
aatgttggggtctatgctatctctggacaaagaaatggagtagatgttactcaattagca
tctcaatcatattttataaatgatcctattcataacttaataatggataaatttgatata
aaatttggaaaatattctaaaaatggatttatgtttcttgctaaaaatggaactgttata
gacatacaaggaataaaaactacttctttttctgatggaataaatggaacaaatacagca
gaagctgatacaggaatgggaactattattgcctttgcagaaggaaaatggacagctgca
ggaacatcattagttggaaatggtttagaaggaaaacctactgaaataatagtggacaaa
aatctcaatatgatgagtaaagaggggatagcattttttgcaaaagatgggggactaatc
actgtaaaaaaaggtgctgaaggatatggatatggctctataataggctatgcagataat
ggaactgtaaatatcaatgcagatataaaagctatagatggtggagtagctactgaaaat
aaaaagtataataatattggaggatatgctattgcaaatggaaccattacagttacagga
aatgctgaaataaatggattgggagcttttgcaaatggagcaaatgccaaagtttattta
agaggaacaggaaataagataaaaacaggagtcagtggtggacttgcaagtcttaaagga
ggatatgttgaatttggtggaggaattattgaacataaggatattacaccaggggatcat
aatcagaaacttcctttttttgctgatgatatttcaaagataaattttacaggagcaact
acaataacaatgtataatggagcagtattttctggagaggctagtgattatgtagggaca
gtaggaacttcggctaaatacaatggaatgggaaatgttacaataagtttacaagcaaat
ggaattaatctaggtgtatttaaaaatcaaaatataatatggaatggagaagcaggatat
ctagcacatttagcaggtattcctaaagttgcagctattgaagaaaatgggcattggtat
aatagttatcttgaaggtggaacaatggcaataaataaaaatgtagatttagatgctaaa
tctgatggaaacaccaaagggggagacgcctttaatgatattggaatggaaagagaaaaa
ataactattaattctggtattaaaataacttctacagatggtaatggattagtgcttggg
tcaaatgtgactgctaatactagtggaaaaaatgcagactctggatatacaaataatggt
gaaataaaaataagtggaggaaatcaagcaggagtatatgtaagttatggacatataaaa
aataatggtcttatagaaactgatggtggaagcggagctgtaggagtaaatggaagtaaa
atagaaaatacaagtacaggaaaggttaatattggaactgttgcaactgcaaatggagta
ggaatagttggattagcaacaaaaataaaagcagatggaactccagacacaccagaatct
tatggaacagatggaggagatacaactactaaagttttagaaatttctaacaaaggagct
ataactgtaaatggaatttcaggaataggtatttatgctgaaaataatgtagcttctgct
ggaaaagagagggcttttgttgaaaatataggaagtataacagttggaggttcaaaaact
tcggcagtagctataggtatgtatggaaagaaaactacaatctcaaatacaggaacaatt
acagtaggagctggaggagtagctatctatgcagaaaatggaagtaatattacaaatctt
ggaactttaaaacttggttctgatgctataggaattatggctgatggaacttctactatt
acagctaccaatgttacacttgaaagtaatactggaacagatactgatgggaaaactgct
gtttactataaaggttcaacaagtggaactgatgataaaagtataagtttaaatatagat
gctgaaagtttcgataagggaactgctatatatgcagaaaatatgaatcttgcttcttca
ggagcattgaaggtgggaacatctggagttggaatatttgttaagggtactgtagcaaat
acaggaaaaaatactggatctattgagttaggaacaaaagaaggagcagtaggtatgtat
actaaaacttctactatttctaacgaaagcaatattaaagtaggtcattcttcacaaata
ggaatgtatgctgaaggaacagacagtaaagttcttaatacaggaaatattaatctatca
acagataatgctaaaggtatctatgtaaaatctggtgcaacaactgaaatcagcggagat
aagataacttttgctggaaaatcaagtataggtgtttttgcagaagatggtgcaaaagta
aaacttactgaaaatctgaattttgcaaatgataatgctaataaaaatatctatatttat
ggtaaaaatggttcttctgtaacattaaatacaggaaaatcagtagctgttaatggaata
gcttctaatttttctggagaaaaaactgttggaatatatcttgaaaacaatggaactgct
aataatttcagtggttctgatggaactttaaatgtcctaaatgaagcagttggtatctat
tctaaaggaaataatattttaaatgtaaatatatcagctgaagggaaaaatactacagga
atatttattgatggaccatcaactcttacaggaattgtaacggctaaaggaactgcaagt
acagcaggaacacctggaacaggagcaattggagtatatggaagtggaggagctgtaaca
ataggtgcaggaggactcactcttaatatgaactctggaaagggaactggaatgtacctt
acagacggtgcctttgcaactggagaaaaaataattgtaaataatacaactgcaaatgaa
aataacataggactatactacagtaaaggaaatacttctggaattgtaaataatgaagta
gatattgaacttcaaggcaacagcagtattggaatatatgcagctgacagcattaatctt
ggtaatgaaaaaaatattgaatcagctggaacggaaaatatagcttcatttgtaggagga
agctcaactttgacttcaggcggaaatataactatgtctggaactgataacattggtatc
tatactggttcaggagttggaaagaatactggaatcattgatattactggagcagcaggt
acatcagcaggaatggttgctaatacaactgctgatattgcttctattgaaaactctgga
gatataaaagctggaactaatcttggaatgtatattacaggaactggaacaagctcaggg
aaaaatactggtaatataactgttactggaaatggaactggagtatatgttgatggtgca
aacaacagttttaatggaactggaggaactatcacatcagaaaaagttggaatttattta
aaaaatacaactgctggaaaaataactactggaaatttaacaatagcacaaggaggagta
ggagtatttggagaaaattctgtagttgacttctcagtggatacatcttcttctactgaa
gcaataggggttgtagctaaaggaacatcgctaatttcaggaaatattattactggagaa
ggttcagttggtgtttatgctgttgataatagtgttgtatttaatggagctaatatcatt
actggagcaaatactactggcgctgtgccaaaaacatctgtaggtgtccttttaaaagct
gctgggacttatacaatggataatgttagtgttaatgctaaaaatggtgttggaatatat
cttgaagattcaacacaagtaaagactttaacatatagtggaagtgtaactactgaaaat
ggaataggtatatatgtaacagatggaagtactattacaacagaaacagctgctattaat
atcaatggaggaacaggagtatatattaatggtggtacagctaatcttggtactacatct
aatactctggcaataaacttcctagagaacggtggaataggaatatacaataaaggcgga
gtacttaatcttggaagtaatataactgtcacaggagcaggttctctggcagctacttta
aatggtagtctaaattcagctgggaacattactgttggtgatgggggagctggactttat
ggaacatatgattctggcacaacaacgactcaagaagttgcatcttctggaactattaca
gctcaaaatggtggaataggtcttgcagcaacaaaaggagcaacaactcctactggaaca
gtaacagtaaaaaatactggaacaattaatgtagctggaaaatcaaatgctactaactct
ccttctgttgcaatatatacagatatagcaaatatagaaaatgcagcaaatataaatgta
ggaaataatggaataggtatatattctaaatataatggtgtaactacatctatcaaaaat
gataatatgactattacaggaaatgatgcaataggaatatatatcaatggtgctacaaat
ggcattactgcaaataatataacatctactggggcaggtaatacaggagtacttcttgag
agagcaacatcaatttcaaatataaatgtaggaactgttgctttaggtaatgcaagtgtt
ggagtaatggcaacagctaatacaatttctataattgaaggaactattagtgtaggtaaa
tcaagtgattctaagagtgcaataggaatagcagcaaatgctggttctaatataacttta
gcaggaactgcatcgatcacaactggagaaaaaggaataggagtatatgctgagggagct
ggcactattattgatgttcaagatgcttctataatcaatgtaggagataatggaatatat
ctatattctaaagatgctgcactaagtttcagtggaaatattacagctaacaaccaaata
ggaatagtagctgagggtggaacagtaattactgctgggccagcaagtattacagctcaa
aatggtggaataggggtatatataaaaaatgctgtacctactttgacttcagcagcaata
acagtaaaagatggttctacaagcaatcattctattggaatttactatcaaaatgcagtt
tcagtaggaacaattccagtaattactcaaataggaaacaaaactataggagttgtactg
gataattcagctggaaatactcctgcaagtggaataaaccttgctagtgcaaatgaacag
gtaggggtaatggcaaaaaatagttctactcttacagtagcagggggtataagtatctct
ggaggaaacaacaatgttggggtatacggaactgataacagtacagttacacttagtgga
aatatgattgtagctgcacctgctgttatagattcaactaatccaatgaagtattcatca
gttggagtattcttgaaaaatagtggatatacaggaaatggagatatttctattagaaac
tatagtattggaatctatggaaaagaattaaatggtaaatctatttcacatactggaact
actatggcagtaggaaatcacggagttggaatctatggaactggtactggagcagaaaaa
ataacactagcaatgacttctggtataatacttggaaaagataattctattggagtattt
gctgatggaatgaattcaacagtaattgggaacatagctattggggctaatacaagtata
ggtatagcaagtaaaggaacaggaaatgttgactatactggagatatgactattgcagat
aaagttgatacaggttcagtgggaatatataagcttgatggtgctggaacaattgcaaca
tcagctggaaactggaatgttggaaatagcggttatggaatttatgtaaaacaaacaaca
ggaaaagaagcagaaatctataatagcgctaatatggttcttggaatgtcagctgtaggt
atttattcggaaggaaaaaataaagtacttaatactggaaacatagaagtaggagaaact
gacataaaaggagatcataataaaatatctgatcatctaaactcagtaggtatatatgct
actagaggaagtgaagtggaaaatgctgttggagctacaattaaagtacatcatgatcat
tctgtaggagtatatgttgatggagcaaatacaagctttaaaaactatggaacaatagat
gtagattatgctggagtaggggtcattgttagaaatggagcaatagcagtgaatgaggta
ggagcaaatataatacttggaagcaatattgttgcaggatgtaatgcagttacagtagga
atgtcagcatcaggaacaggaagtaaaatagttaacaatgggacaataacaattaacgca
ggtgtgggaatgaatattaatgaatttgcaactgtagttaatacaggtacattaaatgtt
aataatggtgttggtatagaaggaactggaactgtaatcaatacaggaactatgaatgta
gcccctggtgcagttggagaaaatgcaggtgagcgtcctactgctagtgtaggagctgtt
gtaataaaaccagatggaacaatatatataaatgatcaatatacagctattggtggaact
tttgaaactgctggagatattgtagtaaatggcgcacatgtagatattacaacaggaaca
cctatgtttaatgcaaacagtgtatctggagaagtaaaaatactttcaaactttgcatca
acaggaaatggtatttcatataaaatagagaattttgtaaatacagcaataggaacaata
acaggaaataaacttactcctgttacatcaccattgtttgtagctaaagtaacaaattca
ggagatcttgttattgttaaaagaccatatgctgatttgacaataggagatcagtttgat
gcattagataaaggtttagataacattcttgtcaacagtggaggaagtggaaaagatgct
gaaatattaaaaggtttgaatgaatatttagatggacttccttcagataaatttgaaaca
gaaacagctagaactttagcagaaacaagaggggatatctatgcaactattcaaggaaga
atgcaggacatcaacagagcatttgacaactctttctatgaacttgagtcttcatataat
ctaactaaagacagcagtaaatacagtgtaatttatactgatggaaactacaaagattca
actttaggaatagatgactatgattacaaggtaatgggacttctatacatgaaggaaaaa
gaaggaacagaatatggaagtaaatatggatatacattaggatttgccggatcgaagttt
gactttgatgatggtggttcaaaagaagatgtatactcattgagagtaggagcacacaga
gttaaaaatctaagtgaagagcataaagtatcttggttatcaagaatagaacttggatac
aacagacacattgctaagagaaaacttgaacttgataaaacttatgaaaataagggagag
tacaatacttactctgtagcatttgacaacagacttactaaagttatgtatacagatctt
tctagacaattagaagtatatgctagtttagatttagaatatggaaaagtagatgacttc
aaagaaagcgctggaagtaaaggtggacttgaagtacagattaaggataacgactactta
agcgcacaggcagcagcaggagcaaaagcatcacaaagaatctatgcaggaaatgatata
tctgtaaaaataacagcagatgtaaaatatgcatatgaattcggagataactatgatgga
aacaaagcaaggcttaaaaatggaggagaaggatattatagtttaatcactccagaagaa
agagaaggtaaattaagtggaaaagttggacttacagtagaaaaagccaaccacatggga
gtaacatttgaagtagaggcagcagatgaaagtaataaaaaagattcatcaattaaatat
ggagtaagattcaattataaattctag
DBGET
integrated database retrieval system