Fusobacterium varium: FV113G1_15670
Help
Entry
FV113G1_15670 CDS
T05280
Name
(GenBank) autotransporter
Organism
fva
Fusobacterium varium
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
WZC_N
ATP-synt_ab_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBA51218
LinkDB
All DBs
Position
1783840..1793802
Genome browser
AA seq
3320 aa
AA seq
DB search
MKKSDIEKSLKRFLKRKIGYSLSLLIAFLITGEISLSAGITAEEIQETKSDLLIKIQTER
EEIKRKIAENEKLIKEYNSNFVELLRKGNFYSKPTFKSTQLFFTYQYLDNGKMKNRTNKE
FSETINAVNKYYKTGKNSGTDKILEGNGFAVDDTVFRETIEVGANIKLIQPDLPIVNPNI
SVTASAPEVNLGVLPKTINPAIASVPTVTAPVIAAPVPPGGVSVTVSTPSAVEKITVTAP
VIAAPTAPTEKNVKISNPTLPEGYDPTIIKLPAAPSLPVVVPVNVSSPSIAGSGANPTTA
YYWWNGNKGAISQISLVSGTYIVNGSSNNYNINVTNYNAEAFNGITPQGSKPTENKIYNV
SQQFFHTLLNVPYSYYGENTKIVFNSNNAMLINLETEGTVNGNLNDRLTENLITSDTYNR
LRQYQTYTGIKGADSTELLFTNKGKVEINGNKSAYLFTTTHSNGRLRTNYLDNEGTITVN
GNNSVVYMHSPDTTEKTAYIYSNGPTGKIYVDGVGASLMQWVYHNLAHNKAAFVNDGTVE
IRGAEAIALYMSDDVNNATFNNEHAAYIKKPIELLGDKSVGLVAQNTNITNEKNIVKFNI
GNKKQTIAKGNSVNNIFTGRTNDPNLVEQAIGILMDNSSTTKTAAQIEIGEYSYGGIGIF
GKNGTIEILKPYGAPAENSSIKISGGEGNIGIIAQGGDVKFDGDISIESGKNNQIAIAQN
GKTITINGNVTAGDNTKKIENSVALYAKDSGTVINIAKDKLNLNLSGNSTGIFATSQGSI
TADRTSLTLSQPDGNGNIPEPTTPANIYIEGKIQADGSTSGLGIYASDGGKISVKNTYVK
VKDGTVGAVATGANSNIDLSGGIVDYSGDGYAVYTSNGGTVNLSNGEIILRGKATALELD
LSTPSSNPITLTGAKIVVMSNDAVGVNLKNIGTLNIGTLKTDIENKLGGVNIVAGTDGTQ
VFDKYKIAAVDGGILNINANMDKSDTSTTSPGFFYYRRFLGQRLNLNVLNGIKVKSEINS
SDAAAYFKGQVVGLEMSSSKAAASASDAQINLAAGSKVIADRTDAGAGAIGLYMNFGKID
IAATAGVEVEKGANTVNDKAVGVYAVNGSTVSNAGNIEVKGNQAIGILGMAYREQPAGTP
VVNEFGTGGIFADQGKINITNSGYVALGGTGTIGIYAYNNNAAGTRADAKVTNNAAGIVD
VGNSTAANAAIGIYGEKTTISNLGIISVGSNGIAIYAKNNSEVTNLGTLNLGADGIGVML
DSTSDLTAPNVSVTSNGTGTSGKTVIFYKGTGAGHKIINTAIDASALNKGTAVYAEDMSI
TSQGALNIGASGIGIFVKGTGVNLGYNEGNIILGAGKTGAVGMYTKTANIVNKTTGVINV
NDSSQIGMYAEGTDNQAINRGTINLNVDGATGIYLKSGAYTELDSTSNIVFGGKSSIGVF
AEKARVEFGDNMTLSNTNENKNIFVYGKDSKVEIAAGKTVTVDGVTAAVTPGNKAVGIYL
ENAGTGSRFVSNTTGKLDVVNEAVGLYSKGNNNLNVNVTATGDKTTGVFIDGASEITGTV
TARGNAVGVYGSGGAVTVGAAGLTLNTDTARGTGMYLTDGASATGGIITVNNTAAGTKNI
GVYYSKGTASGTVTNSSDISLAGSESIGIYAADGINLVNNSNITSTAGKSENIGSYVGGG
SQLTSAGTITMNDSDSIGMYTEEGKGINSGNILMNGASSAPNKSVVGMVAEAQAGKTAAV
ENSGTISAGANLGMYIGGLGTSSGKNAGTITTTTGTGVYVDGAANTFDGTGGTINSNKVG
IYLKNTGANKITTGTLNIASGGVGVFGENANIDFTVDTSNSAEAVGVAAKGTSVISGNIT
TGQDSVGVYVLDNNVSFNGANITTGSRSGAPLKSSIGILLNKALGAYTMSNVTVNAQNGV
GIYLDGTAPGTHLTHNGTVNTVGGIGIYVDNGTTLTTGTTVLNINGGTGVYIKGGTANLG
TGGNLTFNFLAGGGIGVFNNGGTMNLGANITVTGSGSLAATTNGSLSSSGNLNIGEGGTG
LMGLYDAGLTAAHSVNNSGTITAVSGGIGLAAVKGTTNPAFSVTVNNTGIINASGVSTTD
TPSIGIYTNAADTVNTGNINVGNKGIGIYSAHSGILTSVQNNNMTMTGTDGIGVYIKGAT
NGLTANNITSTGSRNTGVVLEGTAGNINVGAITLGNESVGTFVTGAAASTIDGTITVGNG
STSKSAIGIVAQNGANTTLAGTAAVTTGAKGIGVYAEGAGTTVTVGNTANITVGAEGIYM
YSKDAALYFSGNITADNQIGIVADGGSINVVGASAITVQNGGIGAYVKNAAPAFGATAIN
VQAGTSSKYSMGVYYDGVAALGAAPVVTQTGSYTIGMVLNNSTGTTAGGISLGSAADNNQ
VGVMAKGNSNLTIAGNISVDGDKNIGVYGESSQITANGNLSVGNSSASGNKSTSSIGVSL
NGRTYTGAGDISVGDYSIGVFGKGMTAGSTITQGTGAQTMTVGKDGLGIYGAGTGGTISA
AMSSITVGTDNAIGVYAKGMDSIVTGNMNIGANTSIGIVSEGNGDVTYTGAMAVANKAST
ASVGIYKANGAGTISTSAGNWSVGNSGYGIFLNQNAGQSAAINNNADMNLGMSAVGIYSN
GNNTVANSGNITVGSTNVNGDHNDTTKHENSIGMYLSGGTAATNSGMITVNHDHSVGVYG
AGAGTRFTNTGTMNIDNGGVGVLVRDGAVAINEAGGNINLGGTLASSGGKTVGMAAYTGA
TIENRGTITVNEGIGMLVGNQANLINRGTIHVNNGTGIEGTGNITNTGNIVVTGSGKKEE
TSGLTAARVGAVIIQPDGTIKINDKYTAIGGTLSTAGNIVVNGAYVDATTKTPLFNAHSV
SGDVRILPNFALTGNGISYKIKGFVNTAASTITGTKLTPVTSPLFIAKVTNKGDLVIAKR
PYADLTIGKQFDAMDKGLDNILKNSGGKGRDADILKGLNHYLEGTAKNKFTGEASKKLAE
FRGDIYATIQGRMQDINRAFDNSFYELETSYNLTKDSSKYSVIYTDGNYRDSTLGIDDYD
YKVMGLLYMKEKEGIEYGSKYGYTLGFAGSKFDFDDGGSKEDVYSLRAGVHRVKNLSDEH
KVSWLSRIELGYNRHIAKRKLNLHKTYENKGEYNTYSVAFDNRLTKVIYTDLSRQLDVYA
DLDLEYGKVDDFKESAGSKGGLEVQIKDNDYFSAQAGAGVKASQRIYAGNDVSVKVTADV
KYAYELGDNYDGNKARLKNGGEGYYSLITPEEKEGKLTGKIGLTVEKANHMGVTFEVEAA
DEGNRKDSSIKYGVRFNYKF
NT seq
9963 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaagtgatattgaaaaatctttaaaaaggtttttaaaaagaaaaattggttat
tctttatcactgttaatagcctttttgataacaggagaaatatcattaagtgcaggaata
acagcagaggagatacaggaaacaaaaagtgatctgttgataaaaatacaaacagaaaga
gaagaaataaaaagaaagatagcggaaaatgaaaaattaataaaagaatataactcaaat
tttgtggaactgttaaggaaaggcaatttttattccaagccaacatttaagagtacacag
ctttttttcacttatcagtatttagataatggaaagatgaaaaatagaactaataaagag
ttttcagaaacaataaatgcggttaataagtattataaaacgggtaaaaattcaggaact
gataaaatattggaaggaaatggttttgctgtagatgatactgtatttagagagacaata
gaagtaggagcaaatataaaactaatacagccagatttaccaatagtaaatccaaatata
tcagtaacagcatcggcaccagaagttaatctgggagtcttgcctaaaacaataaatcca
gcgatagcttcagtgccgacagtaacagcgccggtaattgcagctccagtaccgccaggt
ggagtatcagtaactgtatcaacaccaagtgcagtggaaaaaataacagtgacagcacct
gttattgcagcaccaacagcaccaacagaaaagaatgtgaaaataagtaatccaactttg
cctgaagggtatgatccaacaataataaagcttccagcagcaccttcactaccagtagta
gtgccagtgaatgtctcatctccatcaatagctggaagcggagcaaatcctactactgct
tattactggtggaatgggaataagggagctatttctcaaataagtctagtttctggaaca
tatattgtgaatggatcttctaataattacaatataaatgtaacaaattataatgctgaa
gcttttaatggaataacaccacaaggtagtaaaccaacagaaaataagatttataatgtt
tctcaacaattttttcatactttattaaatgtaccatattcatattatggagaaaataca
aaaatagtttttaattcaaataatgctatgcttataaacttggaaactgaaggaacagtt
aatggaaatttaaatgataggttaacagagaatcttataacatctgacacttataacagg
cttagacaatatcaaacatacacaggtattaaaggtgcagatagtacagaacttttgttc
actaataagggtaaagttgaaataaatggaaataaatcagcatatctatttacaacaact
catagtaatggaagactcagaactaactatcttgataatgaaggaacaattactgttaat
ggaaataattctgttgtatatatgcactctcctgatacgactgaaaaaacagcatatatt
tattcaaatggcccaactggaaaaatatatgtagatggtgtgggagcttctctaatgcaa
tgggtatatcataatttggctcataacaaagcagcatttgtaaatgatggaactgttgaa
attagaggagctgaagctattgcattatatatgtcagatgatgtaaataatgcaacgttt
aataatgaacatgcagcatatataaaaaaaccaatcgaattattaggagataagagtgtt
ggtttagttgcacaaaataccaatataacaaatgaaaaaaatattgtgaagtttaatatt
ggaaataaaaaacaaactatagcaaaaggaaattctgtaaataatatttttacaggaaga
actaatgatcctaatttagtagagcaagctattggaatactgatggacaattcaagtaca
acaaaaacagcagctcaaatagaaataggagagtattcatatggtggaataggaatattt
ggaaaaaatggaacaattgaaattttaaaaccatatggagctccagcagaaaacagcagt
ataaaaatatctggtggagaaggaaatattggaataattgctcaaggaggagatgtaaag
tttgatggagatatttcaatagaaagtggaaaaaacaaccagatagcaattgcccaaaat
ggaaaaacaataacaataaatggtaatgtgacagctggagataatactaagaaaattgag
aatagtgttgctctatatgctaaagacagcggaacagtgataaatatagcaaaagataag
ttgaatttgaatttatcaggaaatagcacaggtatatttgcaacaagtcagggaagtatt
acagcagacagaacttctttgacactttctcagcctgatggtaatgggaatattccagag
ccaactactccagcaaatatatatatagaaggaaaaatacaagctgatggaagtacatca
ggtttaggaatttatgcaagtgatggcggaaaaatcagtgttaaaaatacttatgttaaa
gtaaaagatggaacagtaggagcagtagcaacaggagctaattcaaatatagacttgtca
ggaggtatagttgattatagtggagatggatatgctgtttatacttcaaatggaggaact
gttaatttatcaaatggagaaataattctgagaggaaaggccacagctcttgaattggat
ttaagcactccttcttctaatccaataacattaacaggggctaaaattgtagtaatgtct
aatgatgcagtaggtgttaatcttaagaatataggaactttaaatataggaacacttaaa
acagatatagaaaataagttaggtggagtaaatatagttgctggaacagatggaactcaa
gtatttgacaagtataagatagcagctgtagatggaggaattttaaacattaatgccaat
atggataaatcagatacttctactacctcaccaggatttttctattatagaagattttta
ggtcagagacttaatcttaatgttcttaatggaataaaagtaaaatcagaaatcaatagt
tctgatgcagcagcatattttaaaggacaggtagtaggacttgaaatgagttcaagtaaa
gcagcagcaagtgcatcagatgctcagataaatcttgcagcaggttctaaagtaatagca
gacagaacagatgcaggggcaggagcaattggtctatatatgaactttggtaaaatagat
attgcagcaactgctggagtggaagttgaaaaaggtgctaatactgttaatgataaagca
gtaggagtatatgcagtaaatggaagtacagtgtcaaatgctggaaatatagaagtaaaa
ggaaatcaggctataggtattttaggaatggcatatagagaacagcctgcaggaacacct
gttgttaatgagtttggaacaggaggaatttttgcagatcaaggaaaaataaatattact
aacagtggatatgtggctttaggtggaactggaactataggaatatatgcatataataac
aatgcagctggaacaagagcagatgctaaagttactaataatgcagctggaatagttgat
gtaggaaattcgacagctgcaaatgcagctattggaatatatggtgaaaaaactacaata
tctaaccttggaataatttcagtaggaagtaatggaattgcaatatatgctaaaaataat
tctgaagtgacaaatcttggaactcttaatcttggagcagatggaattggagtaatgctt
gacagtacatcagatcttacagcaccaaatgtatcagttacttcaaatggtactggaaca
tctggaaaaactgtgatcttctataaaggaacaggagcagggcataaaataataaataca
gctattgatgcatcagctttaaataaaggaacagctgtatatgctgaagatatgagcatc
acttcacaaggagcattaaatattggagcttctggaattggtatatttgttaaaggaaca
ggagttaatcttggatataatgagggaaacattatcttaggtgcaggtaaaactggagct
gttggtatgtatactaaaacagctaatattgttaataagacaactggggttattaacgta
aatgattcttctcaaataggaatgtatgctgaaggaactgataatcaggctataaataga
ggaactattaaccttaatgtagatggagctacaggaatctatctaaaatcaggcgcatat
actgaacttgatagtacaagtaatattgtattcggtggaaaatcaagtataggagtattt
gctgaaaaagctagagtagaatttggggataatatgactctatcaaatacaaatgaaaat
aaaaatatatttgtatatggaaaagatagtaaagtagaaattgctgctggtaaaacagta
actgtagatggagtaacagcagcagtaactcctggaaataaagcagtgggaatctatctt
gaaaatgccggaacaggaagcagatttgtaagtaatacaacaggaaagctggatgttgta
aatgaggcagtgggactttattctaaaggaaataataatctgaatgtgaatgtaacagca
actggagataagactacaggggtatttatagatggtgcttctgaaataacaggaactgta
acagcaagaggaaatgcagtaggagtatatggaagcggaggggctgtaactgtaggtgca
gctggacttactcttaatactgacacagcaagaggaacaggaatgtatctgacagatgga
gcttcagcaactggaggaataataactgtaaataatacagcagcaggaactaaaaatata
ggagtatattacagcaaaggaactgcatcaggtactgtaacaaatagctcagatatttct
ctggctggaagtgaaagcattggaatatatgcagcagatggaataaatttagtaaataat
tctaatattacatcaacagcaggaaaatcagagaatattggttcatatgtaggaggaggt
tcccagttaacttcagcaggaactatcacaatgaatgacagtgacagcataggaatgtat
acagaagaaggtaagggaatcaattcaggaaatattttaatgaatggagcatcaagcgca
ccaaataaatcagttgtaggtatggtggctgaagctcaagctggaaaaactgcagcagta
gaaaatagtggaacaatatcagcaggggctaatcttggaatgtatataggaggattaggt
acaagctcaggtaaaaatgcaggaacaataacaacgactacaggaactggagtatatgta
gatggtgcagcaaatacttttgatggaacaggtggaactatcaattcaaataaggttgga
atataccttaaaaatactggagcaaataaaataacaacaggaactttaaatatagcttca
ggaggagttggagtatttggagaaaatgctaatatagatttcacagttgatacatcaaat
tctgcagaagcagtgggagttgcagctaaaggtacttcagtaatatctggaaatataaca
acaggacaggattcagttggagtatatgttcttgataataatgtatcatttaatggggca
aatataacaacaggttcaagatcaggagctccattaaagtcttcaataggaatactttta
aataaagcattaggtgcatatacaatgagcaatgttacagtaaatgcacaaaacggagtg
ggaatctatttagatggaactgcaccaggaacacatttgacacacaatggaactgtaaat
acagttggaggaataggtatctatgtagataatggaactactcttacaactggaacaaca
gttcttaatataaatggtggaacaggggtatatataaaaggaggaacagccaacttagga
actggaggaaaccttacattcaacttccttgcaggtggtggaataggagtattcaataat
ggcggtacaatgaatcttggagcaaatataactgtaacaggatcaggttcacttgcagca
acaacaaatggaagtttgagctcttctggaaatctaaatataggagaaggcggaacaggg
cttatgggtctgtatgatgctggacttactgcagcacacagcgtaaataactctggaaca
ataacagctgtatcaggaggaataggattagcagcagtaaaaggaacaactaatcctgca
ttctcagtgacagtaaataatacaggaataattaatgcatctggagtatcaactactgat
acaccatcaataggaatctatacaaatgcagctgatacggtaaatactggaaacattaat
gtaggaaataaaggaataggaatatattctgctcacagtggaatacttacttctgtacaa
aataataatatgactatgacgggaacagatggaataggagtatatattaaaggtgcaact
aatggacttactgcaaataatataacttcaacaggttcaagaaatactggagtagttctt
gaaggaacagcaggaaatataaatgtaggagcaattactctaggaaatgaaagtgtagga
acatttgtgacaggagcagcagcttcaacaatagatggaacaataacagtaggaaatgga
agcacatctaagagtgcaataggaatagtagctcaaaatggagctaatacgactcttgca
ggaacagctgcagttacaacaggtgctaaaggaataggagtatatgctgagggagcagga
acaacagtaacagttggcaatacagctaatattacagtaggagcagaaggaatatatatg
tattctaaagatgctgcattatatttcagtggaaatattacagctgataatcaaatagga
atagtagcagatggtggaagtatcaatgttgtaggagcatcagctataacagttcaaaat
ggtggaataggagcatatgtaaaaaatgcagcgccagcatttggagcaactgcaataaat
gtacaggcaggaacatcatctaaatattctatgggagtttactatgatggagtggcagca
cttggggcagcaccagtagtaactcaaacaggaagctatacaataggaatggtacttaat
aactcaacaggaactacagcaggaggaatttctttaggaagtgctgctgataataaccaa
gtgggagtaatggcaaaaggaaattctaatcttactatagctggaaacatctcagtagat
ggtgataaaaatattggtgtatatggagagagcagtcagattacagcaaatggtaatctt
tcagttggaaattcttcagcatcaggaaataaatcaacttcatcaataggagtttcttta
aatggcagaacatatacaggagctggagatatttcagtaggtgattacagtataggagta
tttggaaagggaatgacagctggaagtacaattactcagggaacaggggctcaaacaatg
actgttggaaaagatggtcttggaatctatggagcaggaactggaggaactatatctgct
gctatgtcaagtattacagtaggaacagacaatgcaataggagtatatgcgaaaggaatg
gactcaatagtaacaggaaatatgaatatcggcgcaaatacaagtataggtattgtaagt
gaaggtaatggagatgtaacatatacaggagccatggcagtagcaaataaggcttcaaca
gcatcagtaggaatctataaggcaaatggagcaggaacaatttcaacatcagcagggaac
tggtctgtgggaaacagtggatatggaatattcctgaatcaaaatgcaggacagtcagct
gcaataaataacaatgctgatatgaatcttggaatgtcagcagtaggaatctactcaaat
ggaaataacacagtggcaaattcaggaaatataactgtaggaagtacaaatgtaaatgga
gatcataatgatacaacaaaacatgaaaactcaataggaatgtatttgtcaggaggaact
gcagcaacaaattctggaatgataacagtaaatcatgatcactcagtaggagtatatgga
gcaggagctggaacaagatttacaaatactggaacaatgaatatagataatggaggagta
ggagttctggtaagagatggagctgtagcaataaatgaagctggaggtaatattaattta
ggtggaacactggcatctagcggaggaaaaacagtaggaatggcagcttatacaggagct
acaatagaaaacagaggaacaataactgttaatgaaggtataggtatgctggtaggaaac
caggcaaatttaattaacagaggaacaatacatgtaaataatggaactggtattgaagga
acaggaaatataacaaatacaggaaatatagtagtaacaggaagtgggaaaaaagaggaa
acaagcggacttacagcagcaagagtgggagcagtaataatacagccagatggaacaata
aagataaatgataagtatacagcaataggaggaacactatcaacagcaggaaatatagtt
gttaatggagcctatgtagatgcaacaacaaaaacaccgctgtttaatgcacatagtgta
agtggagatgtaagaatactgcctaattttgcgttgacaggaaatggtatttcatataag
ataaaaggatttgtaaataccgctgccagcacaataacaggaacaaaacttactccagtg
acatccccgttatttatagcaaaagtaacaaataaaggagatcttgtaatagctaagaga
ccatatgctgacctgactataggaaagcagtttgatgcaatggataaagggcttgacaat
attttaaaaaatagtggaggaaaaggcagagatgcagatatactgaaaggcttaaaccac
tatttagaaggaacagcaaaaaataaatttacaggagaagcttcaaaaaaactagcagaa
ttcagaggagatatctatgcaactattcaaggaagaatgcaggatatcaacagagcattt
gataactctttctatgaactggaaacatcatacaatctgactaaagacagcagtaaatac
agtgttatctatactgatggaaactatagagattctactttaggaatagatgattatgat
tacaaagtaatgggacttctgtatatgaaagaaaaagaaggaatagaatacggaagtaaa
tatggatatacattaggatttgccggatctaagtttgactttgatgatggtggatcaaaa
gaggatgtatactcattaagagcaggagtacacagagttaaaaatctaagtgatgagcat
aaagtatcatggctgtcaagaatagaactaggatacaacagacatatcgctaagagaaaa
ctaaatcttcataaaacttatgaaaataaaggagagtataatacttactctgtagcattt
gacaacagacttactaaagttatctatacagacctttccagacaactggatgtatatgct
gatttagacttagaatatggaaaagtggatgattttaaagaaagcgctggaagcaaaggt
ggacttgaagtacaaattaaagataatgactacttcagcgcacaggcaggagcaggagtg
aaagcatcacaaagaatctatgcaggaaatgatgtatcagtaaaggtaacagcagatgta
aaatatgcatatgaacttggagataactatgatggaaacaaagcaagactaaaaaatgga
ggagaaggatattacagtttaatcactccagaagaaaaagaaggaaaacttacaggaaaa
attggacttacagtggagaaagccaaccatatgggagtaacatttgaagtagaggcagca
gatgaaggaaatagaaaagattcatcaattaaatatggtgtaagattcaattataaattt
taa
DBGET
integrated database retrieval system