Fusobacterium varium: FV113G1_31120
Help
Entry
FV113G1_31120 CDS
T05280
Name
(GenBank) short chain fatty acids transporter
KO
K02106
short-chain fatty acids transporter
Organism
fva
Fusobacterium varium
Pathway
fva02020
Two-component system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fva00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
FV113G1_31120
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SCFA_trans
ABG_transport
DcuC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBA52761
LinkDB
All DBs
Position
3455396..3456751
Genome browser
AA seq
451 aa
AA seq
DB search
MIKKLTNFCTAMVQAFLPDPFIFALILSAIVFILGVFTNGETPYQMVLHWGNGFWGFLGF
SMQMVLVIIFGNCLATAPIFHKLVKRLALIPKTPKQAVAFVTFAAAIATLIQWGFGLVIG
AILAKEVAKTVKKVDYPLLIASAYSTFMLSVLTSSITLKAASNVDELVKITGGTVKNLIP
LGATSYHITTLIALLIMLITLPLLNAAMHPNEENTKSIDVNLLKEETVVMERPEKPTVAQ
RLEYSKIIPVLIFIAGMTFVINHFFILGKSLNIDIMNFILLIFGILLHKTPINYIQAVGN
AARNSAGIILQFPFYAGIMGMMTGLNQSGVSIAGLISEKMVALSTVNTFPMLSFGSAAIV
NMFVPSAGGQWAVQAPVLFPAGHALGVDPALTTMSLCWGDTWTNMIQPFWALPGLGIAKL
GVRDIMGYCVMVFLWTGIIIFIAMLAWTYLF
NT seq
1356 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaaaaaattaacaaatttctgtactgctatggtacaggcatttttacctgatcct
tttatttttgcattgatattatctgcaatagtattcatattgggagtatttacaaatggg
gaaacaccatatcaaatggtactgcattggggaaatggattctgggggtttttaggtttc
tctatgcagatggtccttgtaataatatttggaaattgtttggctactgctcctatattt
cataaattagtaaaaagattagctttgattccaaaaactccaaaacaggcagtagccttt
gttacttttgcagcagcaatagctacattaatccagtggggatttggattagtaatagga
gctatcttagctaaagaagtagcaaaaacagtaaaaaaagtggactatcctcttttaatt
gcttcagcatattctacttttatgttgtctgttttgactagttcaattacactgaaagca
gccagtaatgtagatgaacttgttaaaataactggaggaacagttaaaaatcttattcct
ttaggtgctacaagttatcatattactactttaatagcacttttaataatgttgataact
cttccattgttaaatgcagctatgcatccaaatgaagaaaatacaaaaagtattgatgta
aatttattaaaagaagaaacagtagttatggaaagacctgaaaaacctactgtagcccaa
cgtcttgaatatagcaaaatcatccctgtattgatatttatagctggaatgacttttgta
ataaatcatttctttattcttggtaaaagtcttaatattgatataatgaactttattctt
ttaatatttggaatcttactccataaaacacctattaattatattcaggcagttggaaat
gctgcaagaaattcagctggaatcatcttacaattccctttctatgcaggaatcatgggt
atgatgacaggattaaatcaatccggggtatcaatagcagggcttatttcagaaaaaatg
gtggcattatctactgttaatacatttccaatgctatcttttggaagtgcggcaatagtt
aatatgtttgttccatcagcaggaggacagtgggcagtacaagctccagtattatttcca
gcaggacatgctttaggtgttgatcctgccttgactactatgtctttgtgctggggagat
acatggacaaatatgattcagccattctgggctcttcctggtttaggtatagcaaagctt
ggtgttagagatattatgggatattgtgtcatggtattcttatggacaggtattattatc
tttatagctatgctggcatggacatatctattttaa
DBGET
integrated database retrieval system