Fragaria vesca (woodland strawberry): 101296572
Help
Entry
101296572 CDS
T02666
Name
(RefSeq) glutamate receptor 3.3
KO
K05387
glutamate receptor, ionotropic, plant
Organism
fve
Fragaria vesca (woodland strawberry)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fve00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
fve04040
]
101296572
Ion channels [BR:
fve04040
]
Ligand-gated channels
Glutamate (ionotropic)
101296572
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ANF_receptor
Lig_chan
Peripla_BP_6
SBP_bac_3
Lig_chan-Glu_bd
TssN
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
101296572
NCBI-ProteinID:
XP_011465033
LinkDB
All DBs
Position
LG5:complement(19556208..19562263)
Genome browser
AA seq
942 aa
AA seq
DB search
MLSFKMELVWVCPLVVLYLGVFSFGSSKNVSSRPAVVNIGALFTMDSTIGKVAKIAIEEA
VKDVNSNFSILHGTKLVVKMQNTNCSGFLGMVEALQFMETDIVAIIGPQSSVVAHIVSHV
ANELQVPLLSFAATDPTLSSLQFPYFIRTTQSDLYQMTAVAQIVDHYGWRDVIAIFVDDD
YGRNGISALDDKLAERRCKISYKLAIPPGPAANRSDIMDLLIKVALLESRVIVLHVNADS
GFMVLAVAQYLKMTGDGFVWIATDWLSSVLDSAFPLPSEIMDTLQGVLVLRLHTPDSDRK
RAFFSKWNKITGGSLGLHTYGLHAYDSVWLVAHAIDAFFNQGGVISFSNDSRIEAVEQGG
SLHLDAMSIFDDGPLLLKNILQSNLVGLTGPIKFDSERALALPAYDIINVVGTGFRRIGY
WSNYSGLSTVPPETLYSKPANRSSANQQLYSVVWPGETLTKPRGWVFPNDGKLLRIGVPI
RVSYREFVMPVQGTDTFKGFCIDVFNAAVNLLPYAVPCKFIPFGDGLKNPSYTELVISIT
TGVFDAAIGDIAIVTNRTKIVDFTQPYAASGLVVVAPFKKMNSGAWAFLRPFTAHMWIVT
AASFLVIGIVVWILEHRMNDEFRGPPKKQLITILWFSLSTLFFAHRENTVSTLGRVVLLI
WLFVVLIINSSYTASLTSILTVQQLSSPIKGIESLKNSGEPIGYQVGSFAEHYLSEELGI
SKSRLIALGSPLAYAEALQLGPKKGGVAAVVDERPYVELFLSTQCKFRVVGQEFTKSGWG
FAFPRDSPLAVDISTAILQLSENGDLQRIHDKWLMQSSCSFESTEIESDQLQLRSFWGLF
LICGIACFIALLVYFLQIMNKLRHADPPQSVLTSPGVSQSGRLRRFLSIIDKKADQSNSG
SKKGKLXRSLSDNDKDGKLGWTPKKKQAEMTDMGEGDIKSSS
NT seq
2829 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgtcatttaagatggaattggtttgggtttgtcccttggtggttctttatcttggg
gtgttctcatttgggtctagtaagaatgtttcttcaagaccagctgtggtcaacattgga
gctcttttcacgatggactctacgattggtaaagttgccaagattgctattgaggaagcg
gtgaaagatgtgaactccaatttcagcattctccatgggaccaaacttgttgtgaaaatg
cagaataccaattgcagtgggtttcttggaatggttgaagctttgcaattcatggagact
gatatcgtcgccattataggcccacaatcttctgtagttgcacatattgtatcccatgtt
gcaaatgaactccaagtaccactattgtcatttgcagccacagacccaactctctcatcc
cttcagttcccatattttattaggacaacacagagtgatttgtatcaaatgactgcagtt
gcacaaattgttgatcattatgggtggagagatgttattgccatttttgtagacgatgat
tacggccgtaatggcatatcagctttagatgataaacttgctgagagacgctgtaaaatt
tcatacaagttggcaattccccctggaccggcagctaatcggagtgacatcatggatctg
cttattaaggttgccttattggaatctcgagttatagttcttcatgtgaatgctgattca
ggtttcatggttcttgctgtggcacagtatcttaaaatgacgggtgatggttttgtatgg
atagctacagattggctttcatctgttttagattctgcttttcctcttccttctgaaatt
atggatacattgcaaggagttcttgttttgcggctacatacaccagattcagatagaaag
agggccttcttttctaagtggaacaagataactggtggttctctgggactgcatacttat
gggcttcatgcttatgattctgtttggctggtagctcatgctattgatgcttttttcaac
cagggtggggttatttcattctctaatgattctaggatagaagctgtagaacaaggtggt
agccttcaccttgacgcaatgagcatttttgatgatggaccactcctgttgaagaacata
ttgcaaagtaaccttgttggtttgacaggtcccatcaagtttgattcagaaagggctctt
gctcttccagcatatgatattattaatgtggttggaactgggtttcgacgaattggttac
tggtccaactattctgggttatcaactgtacctcctgagactctctattcaaagccagct
aatcgttccagtgcaaatcaacagttatatagtgttgtctggccaggggagacattaacg
aagccccgtggttgggttttcccaaacgatgggaaactcttgagaattggtgtgcctatt
cgggtcagttaccgggaatttgtaatgccagttcagggaactgatactttcaagggtttc
tgcatagatgtattcaatgctgctgtaaacttgttgccatatgctgttccatgcaagttt
atcccttttggagatggtctgaaaaatccaagctacacagagcttgtgatatctatcaca
actggggtctttgatgctgctattggtgacattgccattgttacaaatcgaacgaagatt
gtggattttacacagccatatgctgcatctggacttgttgttgtggccccctttaaaaaa
atgaattctggtgcttgggccttccttcgaccatttacggcacacatgtggatagtcact
gctgcttcctttcttgttattggtatagttgtatggattttggagcataggatgaatgat
gaattcaggggtccacctaagaagcaacttataactatcttgtggtttagcctctcaact
ctattctttgcccatagagagaacactgtgagcacccttggtcgagtagtgctacttata
tggctatttgtggttttgataatcaactctagctacactgctagtctgacatcaatcctc
acagtacagcagctatcttctcctatcaaaggaattgaaagtttgaaaaacagtggtgag
ccaatcgggtatcaagtgggttcctttgctgagcattatttgagtgaggagctcggcata
tccaagtccaggctcattgcccttggctctcctctagcctatgctgaggcacttcagctt
ggtcctaaaaagggaggtgttgctgcggtggttgatgaacgtccttatgttgagctattc
ctctcaacacagtgcaagtttcgggttgtaggtcaagagttcacgaaaagcggctggggt
tttgcatttccacgagattctcctttagctgttgacatttcaactgcaattctacaatta
tcggagaatggtgatctgcaacggatccatgataaatggttgatgcaaagctcttgcagt
tttgagagcactgaaattgaatcagaccagcttcaactcagaagcttttggggcctcttt
ctcatatgtggaattgcttgcttcattgctctccttgtatattttttgcaaattatgaac
aagctacgtcatgctgacccacctcagagtgttttaactagtcctggtgtctcacaatct
gggcgactccggcgatttttatcaataattgataaaaaggctgaccagtccaatagtgga
agtaaaaaaggaaagttanttagatcactatccgacaacgataaagatggtaagttgggt
tggactcccaagaagaaacaagcagaaatgactgatatgggcgagggtgacatcaagtcc
agcagttaa
DBGET
integrated database retrieval system