Fragaria vesca (woodland strawberry): 101305259
Help
Entry
101305259 CDS
T02666
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At3g14730
Organism
fve
Fragaria vesca (woodland strawberry)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
PPR_1
E_motif
PPR_3
PPR_long
Eplus_motif
ECSIT_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
101305259
NCBI-ProteinID:
XP_011462686
LinkDB
All DBs
Position
LG4:10192891..10194783
Genome browser
AA seq
630 aa
AA seq
DB search
MNRTTNFINKPSFSLCFRYPFSCSATQPVQPVYDLSTCIASLQACARYKSLRKGKQIHAY
MLTNGFLCSPLSITSLINMYSKCNQMGDAVSTFYYRFHDHNVFAYNAVIAGFTANGLARN
AFEFYNRMRLTYVVPDKFTFPCVIRACCSIREVMKIHSLVIKLGLELDVYVGSALVNTYL
KFLLVKEAQKVFEELPSRDIVLWNAMVNGFAQIGRFDEALVVFRTMGEEGVMPSRFTVTG
VLSIFAMMGDFDHGRAIHAIALKMGYDSHFEVANALIDMYGKCKFTEDALDIFDMMIEKD
IYSWNSIIAVHEQCGYHDETLRLFYRMLGAGILPDLVTITIVVPACSHLSALMHGREIHG
YMIKNGVGKGDVNKEDVNDVLMANAIMDMYAKCGSMRNAYMVFDKMKNKDIASWNIMITG
YGMHGNANEALDMFSRMCETQIEVDEVTLVGVLSACSHAGLVSEGRELLRQMRSKYGVIP
TIEHYTCVVDMLGRAGHVVEAFELVQNMPIQANAVVWRALLAACRLHRNSDIAKVAAQKL
MEIDPGHSGNYVLTSNIFVDTGQYEEVSEVRQTMRQHNVQKAPGCSWTELKDGMHAFVNG
DRSHPKANFIYAQLDSLTARLREHGYVPQL
NT seq
1893 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataggaccaccaatttcatcaacaaaccttccttctctttgtgttttcgctaccct
ttttcatgttctgctacccaacctgttcagcctgtgtatgacctcagcacctgcatagcc
tcattgcaagcatgtgctcgctacaagagcctccgaaaaggcaagcaaatacacgcatat
atgctcacaaatggcttcctttgctcccctctatccataaccagccttatcaacatgtac
tccaagtgcaaccaaatgggtgatgccgtctctaccttttactataggttccatgatcac
aatgtatttgcttacaatgcagtcattgctgggttcactgcaaacgggttggctagaaat
gcatttgaattctataacagaatgcggttgacatatgtcgtgccagataagtttacgttt
ccatgtgtgatcagagcttgttgtagcatacgggaggttatgaaaattcattccttggtg
attaaacttgggttggaattggatgtatatgttggtagtgctttggtgaatacatacttg
aaattcctgttagtaaaggaggcacagaaagtgtttgaggagttgccttctagagatatt
gtgctttggaatgcaatggttaatgggtttgcacagattggacgttttgatgaagcttta
gttgtctttaggacaatgggtgaggaaggggtcatgccaagtaggtttacggtaactggg
gtcctgtcgatattcgccatgatgggagattttgaccatgggagagcaattcatgcgatt
gcattgaaaatggggtatgattcacattttgaggttgcaaatgctttgattgacatgtat
ggaaaatgcaagtttacagaagatgcattggatatttttgacatgatgattgagaaggat
atatattcttggaactcaattatagcagtgcatgaacagtgtggttatcatgatgaaact
ctcaggctgttctacagaatgttaggtgctggaattctacctgatttggtgaccatcaca
atagttgttccagcttgctctcatctatcagcattgatgcatggtagagaaattcatgga
tatatgattaaaaatggggtaggcaagggggatgtgaataaggaagatgtcaatgatgtg
ctaatggccaatgcgatcatggacatgtacgcaaaatgtgggagcatgagaaatgcttat
atggttttcgataagatgaaaaataaggatatagcgtcatggaacatcatgatcacaggt
tatggcatgcacggcaatgctaacgaggcattagatatgttctctcgcatgtgtgagaca
cagattgaggttgatgaggtcacattggttggggttctatctgcatgcagccatgcaggg
ttagtgagtgaagggcgtgaattattgagacaaatgaggtcaaaatatggtgtaattcca
accattgagcattatacatgtgtagttgacatgcttggtcgagctggacatgtagtggag
gcatttgaattggtgcaaaacatgcctattcaagccaatgctgtggtgtggagggcattg
ttagcagcatgtcgacttcataggaattcggacattgcaaaagtagctgcacagaagctt
atggaaattgaccctgggcactctggtaattatgtgttaacgtccaatattttcgtagat
actggtcagtatgaagaggtatcagaagttagacagacaatgaggcaacataatgtccag
aaggcaccaggctgtagctggactgagttgaaggatggcatgcatgcttttgtcaatggt
gataggtcccatccgaaagccaactttatttatgctcaattggactcattgactgctcga
cttcgtgagcatggatatgtgccccagctgtag
DBGET
integrated database retrieval system
