Frieseomelitta varia: 122530484
Help
Entry
122530484 CDS
T09482
Name
(RefSeq) probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 isoform X1
KO
K10615
E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 [EC:
2.3.2.26
]
Organism
fvi
Frieseomelitta varia
Pathway
fvi04120
Ubiquitin mediated proteolysis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fvi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
04120 Ubiquitin mediated proteolysis
122530484
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
fvi04121
]
122530484
Enzymes [BR:
fvi01000
]
2. Transferases
2.3 Acyltransferases
2.3.2 Aminoacyltransferases
2.3.2.26 HECT-type E3 ubiquitin transferase
122530484
Ubiquitin system [BR:
fvi04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
HECT type E3
122530484
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
HECT
RCC1
RCC1_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122530484
NCBI-ProteinID:
XP_043513427
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1085 aa
AA seq
DB search
MANWNKKRRLACEPAIAVETSLHKNMFCWGSTIHGELGLGGIEDENILIPREVDFKKASK
IQHIACGENYTVIITQDGEIYSCGNNDYGQLGHKQGTKRFQLISGLDAFVFKKAACGAYH
TLAVNEWGQLFSWGSNTEGQLGLNSRNFMECSPRMVKTLGTSIVIQVACGMKHALALTNN
GELYSWGSNSEGQLGLGVDNKYEIKPKLISSLIGIPIVFIACGGYHTIAVSKSGAVFGWG
KNTFGQLGLNDTQDRNLPYQLQTLQNAKICYAACGEEFSAFLTVDGGVFTCGAGMYGQLG
HGNNSNEILPRQVMELMGSTVTQISCGKRHTLALVPSRGRVYAWGLGGTGQLGNHSTRSI
TTPQVVHGPWIAPNGSSIMDLDKQHSSCTIGYVVKHIFTGGDHCFATVVLQNDNIKPDDC
RIIESSFQILTITEKQLMACQRVPANSPVDHELMTYLETVFKSLSCVTGSFLLENDARYG
CSNKHHGVNIDQASKLFGIIRELDNSTIQELIFTCISDSLIPSLVNLPPKIICPESLRVY
LILPLYHGFLNPLNCNVLHKPFCKAVLALKPEVLEIVANWWLKAPPYYFERLVRVHKSVV
LHYVKQSKPNKVLLWDVTLQVALDSLHLLNKLNNEGDEGHKVPYSTFHLPELIELIDIRA
DYIKWISENESSSVRYYQKVFCNYPFLLDANAKIILLETDQAIQMQSAMNEAATRASIIH
QIFFDPFSIDARHHTQFVILNVSRENIVADTLRELAQYDSSDLKKPLRVKFHGEEAEDAG
GVKKEFFMLLLREILDPKYGMFKQYEETRVIWFSEDSLEDENMYFLIGILCGLVIYNFII
IDLPFPLALYKKLLHEPVGLNDIKDMSPIFAKSMQNILDYEEADFEEVFGLHFEVVREVF
GEKKIYELIPNGTKVPVTLKNKKQFVDLYVDYTLNKSVDPHFQAFYKGFHKVCGGRVLEL
FHSYELMAVVVGNEDYDWEELQKNTVYKNGYTKDNSTIVLFWQVFRELTLEDKKKFLLFL
TGSDRIPIQGMKAIKITIQPVNDERLLPVAHTCFNLLDLPRYQTRERLRYKLLQAIQQTQ
GFSLV
NT seq
3258 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaactggaataaaaaacgacgtttggcctgtgagcctgctatagcagtggaaaca
tctttacataaaaatatgttttgttggggcagtaccattcatggtgaactaggtttaggt
ggtatagaggatgaaaatattttaattcctcgtgaagtcgattttaaaaaagcttcaaaa
attcaacatattgcttgtggtgaaaattatacagtaattattactcaagatggtgaaata
tattcatgtggaaacaatgactatggacaacttggtcataaacaaggaacaaaaagattt
caattgatatctggactagatgcatttgtatttaagaaagcagcttgtggagcataccat
actttagcagtaaatgaatggggtcaattgttcagttggggatctaatacagaaggtcaa
ttaggtttgaattcaagaaattttatggaatgttcaccacgtatggtaaaaacattaggt
acaagtatagtaatacaagtagcttgtggcatgaaacatgcacttgcattaacaaataat
ggagaattatatagttggggttctaatagtgaaggacaacttggcttaggtgttgataat
aaatatgaaataaaacctaaacttatcagtagtttaattggtatccctattgtctttatt
gcttgtggaggatatcataccatagctgtatcaaaatcaggagctgtatttggatgggga
aagaatacatttggtcaattgggattaaatgatacacaagatagaaatttaccataccaa
ctgcaaacattacaaaatgcaaagatatgttatgcagcttgtggagaagaattttctgca
tttttaacagttgatggaggtgtgtttacatgtggtgcaggaatgtatggtcagttaggc
catggaaacaatagtaatgaaattttacctcgtcaagttatggaacttatgggcagcaca
gttacacagatctcatgcggcaaaagacatactttggcattggtaccttcacgaggtaga
gtttatgcatggggtttgggtggtacaggtcaattaggtaatcattctactcgaagcata
acaactccacaagtagtacatggtccatggattgcaccaaatggttcttcaataatggat
cttgataaacaacatagttcttgtacaattggctatgtcgttaaacatatttttactggt
ggagatcactgtttcgctacagtagttctacaaaatgataatataaaaccagatgactgt
agaataatagaaagctcctttcaaattcttacaataaccgaaaaacaattaatggcatgt
caacgagtacctgcaaattcacctgttgatcatgaacttatgacatatttagaaacggta
tttaaaagtctatcctgtgtaactggatcgtttttacttgaaaatgatgctcgttatgga
tgttcaaataagcatcatggggtgaatattgatcaagcaagtaaattgttcggaattatt
agagaattggataacagcacaattcaagaactgatatttacttgcatatcagacagcttg
attccttctcttgttaatctaccgcctaagataatttgtccggaatctttaagagtctat
ttaatattacctttgtatcacggttttttaaatccacttaattgtaatgtattacataaa
ccattctgcaaagctgttttagcattaaaaccagaggttcttgaaattgttgcaaattgg
tggcttaaagcaccaccttattattttgagagattagttagagttcataaatcagttgtt
ctacattatgtaaaacaatctaagccgaataaggttttattatgggatgtgacattacaa
gttgccttagattctttacacttgctaaataaattgaacaatgaaggtgacgaaggccac
aaagtaccttattctacatttcatttgccagaattaatagaacttatagatataagggcc
gattacataaaatggatttcagaaaatgaatcttcttcagtacgttattatcaaaaagtg
ttctgtaattatccgtttcttcttgacgcaaatgctaaaattatactgcttgaaacagac
caagctatccagatgcaatcagcaatgaacgaggcagcaacccgtgcatccattatccat
caaatattttttgatccattttctatagacgcacgacatcatactcagtttgtaatatta
aacgtttcacgggaaaacatagttgctgatactttacgagaattggcacaatacgattct
agtgatttaaaaaagcctcttcgagtaaaatttcacggtgaagaagcagaagatgcaggt
ggagttaaaaaggaattttttatgctgttattaagagaaattctagaccctaaatatggc
atgtttaaacaatatgaagaaaccagagttatctggttcagtgaagattctcttgaagac
gaaaacatgtattttttaattggaattctttgtggtttagttatttataattttattatt
attgacttaccattcccgttagctctatacaaaaaattgttacatgaaccagttggttta
aatgatattaaagatatgtcaccaatatttgccaagagtatgcaaaatatacttgattat
gaagaagcagattttgaggaagtttttggtttacattttgaagtggttagagaagtgttt
ggcgaaaaaaaaatatatgaacttataccaaatggtactaaagttcctgttacattgaaa
aataagaaacaatttgttgatttgtacgtagattatacattaaacaaatctgtagatcct
cattttcaagcattttataaaggttttcataaagtttgcggtggtcgtgtattggaatta
tttcacagttatgaacttatggccgtagtagtaggaaatgaagattacgattgggaagaa
ttacaaaagaatacagtttataaaaatggatacacaaaagataactctactattgtgctc
ttttggcaagtgtttcgcgaacttacattagaagacaagaaaaaatttttgttatttttg
acaggaagtgataggatacctatacaaggcatgaaagcgatcaagattacaatacaacca
gtgaatgatgaacgtttattacctgttgctcatacatgttttaatttgcttgatctacca
cgatatcaaacgcgagaaagattacgatataaattactgcaagcaatccaacaaacccaa
ggcttttctctagtataa
DBGET
integrated database retrieval system