Frieseomelitta varia: 122532449 Help Entry 122532449         CDS       T09482                                  Name (RefSeq) spatacsin isoform X1   KO K19026   spatacsin Organism fvi  Frieseomelitta varia Brite KEGG Orthology (KO) [BR:fvi00001]  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03400 DNA repair and recombination proteins [BR:fvi03400]     122532449 DNA repair and recombination proteins [BR:fvi03400]  Eukaryotic type   DSBR (double strand breaks repair)    HR (homologous recombination)     Other HR factors      122532449 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  Spatacsin_C Motif Other DBs NCBI-GeneID:  122532449 NCBI-ProteinID:  XP_043517150 LinkDB All DBs Position Unknown AA seq 1797 aa AA seqDB search MTEKTTVGGIPIECLTGEPAAIWSGWRTLADRELVREASAKGTHINLAYKCLAHRRRCSI EDARYYFNKEVETWITELLKKHQIYRASHILNNMKKNPVEYIFEVCINCKDFTLRNYLSE YLISVAHFEDEYINSWNIVKSIVEYEQKYMIEEGLSSSLCIEDIMKLPEDIKRALCTELY FSTSQQSLSTNIINIILWDYLLSNNKIELLKFWIDTYYGNSTLEVNEINEKHKSLFNTLD IVPNMIEAIDSSNASILIKDLVKNHLCRYGIFIEKEQRDVKLLLARIFGSAMTISEFNTI LSYKSCNINKTEFMKKIDKELCLAHCLSETNTEKDKTKIAELYDALTKMCECQEEFQDIL IDGIFKTIYYFSDDVAEYLEQNYLIVLVLILLYLSRESTIYNKNKNTVPKESILKNIFTD KTDLQLCGYSISNEVLRNTLKQVPILESIIEKKPKKEVTVYELLDGYENLNVKQLYKWRF NNEPMPHFSNEILVKMYGYTEVLTYEYYLNQARPNMAIFSLKHSQGKLIGNVSSRRKCKA ALYAHILALRNLNKPEILRTCIAFMEMLGIDSENLRLHITVANYIHKEINVPIGNLLENI MYRNEDDLKTVISYLESSFQTNCTENLINNSQQFIKILKIWDIIVRFAKAHNFPLPISLL KFLASQNHWFEFVLVCHIFNYPLNQVLENTKYFEDTVLREHLLTCLCNIQLTKSQLAAHS EQKIKSRDVRQSLYYKIGVKQSGSPTYDSSISADSASTSDSHSVGDYIVNDNICSLDDDL WLIILKCHQSPDPPGALINSSRLTSRPFLTVLASCYEPSSIPGYCYSWMIISTTDEEILS NYKECLEQQVWTANQVSNLLDQMVTRGYLSILNKAYRIFMPENVFNLFFEFLAQCVIYGD FKGCQQKLLDFKAQCINLKCNEATDWNSSDTTYLNNLYWIAIVVIKCVIATLAHALKSTH LQIKFLEILIKCDFYTNFPVSIPKFQFLLQVTKILQKTNIALNFAIFTVSDNVYNFDTEI HRCIGALIRNENYANALELSNLAGLDSSEIILAQYRSKFKYYIHKNDKIEDNFWNECALN FKKYNISHEKAAEFFVEHAEKVNSHKERYDILKTAFESLKDIKTEQQNIDALETAMWKSC ILAGPENVQLDDGPYIFNKLKTELLSGLNNLKFSYTLSNIQEKYATETLINKLIDVGKLD TALRISTIFNYKHKDLQVLMLCLSLAEGEILPNNLTTEQQSLLQEVNKNKQQKYSALKNR GLQRFSSSSLIASINTTKISKTKDENVHKIQMECISILQKLLDILEHGVDICLRIVLCYK LAMQLEKNYQFLLILNNPIQFLQNITESDIENKSEIVNDIIIAYKISSDSVATFLAENIT LNITRAVEDEYENNVYLWGYSLNTNFRVIMELCNDVSLVGWKLLKTANKLLGYSQGEKTN ALTLKTIAELLIRAHDCFTTSCNMEGIASVLCKCQIFANVLQNLKCWTLLVRLVTGVGRF TEMNYVFQILKENDQFEFLLGKGLNKVTGLEIAILEFLKRHCPENKELFTLVALHFRLYH ELAFMWENEAKDIIKAIISDATKDHNKLQNTVQHEIKFIKTENILKQLHLIVTNYTHATE YYLQANKLNLANQCSDQVQLVALQLSLFNTVSYNQQVICILNLKSEDIDKVLCHNLSFSQ AFIVIHAYDHHVDWVNLIYNHCILNGETKYLKDFIAANKLSSALVQDCARRYRLEKSITH TMTDNMKILISELLDVECKYVLASQLGFKDIVEIMLNNPMIGAYLKDTVWKKGYNSL NT seq 5394 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgactgagaaaacaacagttggtggtattccaattgaatgtttaactggtgaacctgca gccatttggtctggttggcgtacattagcagacagagaacttgttagagaagcatctgcg aagggtactcacattaaccttgcttataaatgtctagcccacagaagaagatgttccatt gaagatgctcgatattattttaataaagaagtagaaacttggattacagaactcttaaag aaacatcaaatttatagagcttctcatattttaaataatatgaagaaaaatccagtagaa tatatatttgaagtttgtataaactgcaaagattttacattaagaaattatttatcagaa tatttaataagtgttgcgcattttgaggatgaatacatcaattcatggaatatagtaaaa agtattgtagaatatgaacaaaaatatatgattgaggagggcttaagttcttctttatgt atagaggatattatgaaattaccagaagatataaaacgcgcattgtgcactgaattatat ttttccacatctcaacagtccctttcaacaaatataattaatattatattatgggattat ttgctatcaaataataaaattgagctactaaaattttggattgacacttattatggtaac agtactttagaagtaaacgaaattaatgaaaaacataaatctttattcaatactttagat atagtaccaaatatgattgaagctattgattcttcaaatgccagtattcttataaaagat ctagttaaaaatcatctatgtagatacggcatatttatagaaaaagaacaacgtgatgtt aaattattactggcacgtatatttggcagtgcaatgacaatatcagaatttaacacaata ttatcttataaatcttgcaatattaataaaactgaatttatgaagaaaattgacaaagaa ttgtgtcttgcacattgcttaagtgaaacaaatactgaaaaagataaaaccaagattgct gaattatatgatgctttgacaaaaatgtgtgaatgccaagaagagtttcaagatatatta atagatggaatttttaagacaatttattatttttctgacgatgttgctgaatatttagaa caaaattatttaatagttttagtattgatacttttatatctatctagagaaagtacaata tacaataagaataaaaatacagtaccgaaagaaagtattctaaaaaatatatttacagat aaaactgatcttcagttatgtggttatagtatttcaaacgaagttcttcgaaatacatta aaacaggttccaattcttgaatctatcatagaaaaaaaaccaaagaaagaagttacagta tatgaattattggatggttacgaaaatttaaacgtaaaacaattatataaatggcgtttt aataatgaaccaatgcctcacttctctaatgaaattcttgttaaaatgtatggatataca gaagtattaacatatgaatactatttgaaccaagctcgtcctaatatggctatatttagt ttaaaacattctcaaggaaaactaattggaaatgtttcttctagaaggaaatgtaaagca gctctatatgcgcatattcttgccttacgaaatttaaacaaacccgaaattttacgtact tgtatcgctttcatggaaatgttaggtattgattcggaaaatttaaggctgcatataact gtggctaattacatacataaggagattaatgttcctattgggaacttattagaaaatata atgtacagaaatgaagatgatttaaaaactgtaatatcttatcttgaaagtagttttcaa acaaattgtactgaaaacttaattaataatagtcaacagttcataaaaatattaaaaata tgggatattattgtacgatttgcaaaagcacataattttcctttaccaattagtttatta aaatttttagcaagtcagaatcattggtttgaattcgtattagtttgtcatatcttcaat tatccattgaatcaggtattggaaaatacaaaatattttgaagatactgttctcagagaa catttattaacttgtttgtgtaatattcaacttacaaaatctcaattagctgcacatagt gaacaaaagataaaatcacgagatgttagacaatcactatattacaaaattggagttaaa caaagtggatcacctacttatgattcttcaatatcagcagattcagcaagcacttctgat tctcatagtgtaggcgattatattgtcaatgataacatttgttctttggatgatgatttg tggttgattattttaaaatgtcaccaaagtccagatccacctggtgctttaatcaattca tccagattaacttcaagaccttttcttacagttttagcatcctgttatgagccatcttca ataccaggatattgttattcatggatgataatatctactacagatgaagaaatcctttct aattataaagaatgtttagaacaacaagtatggacagccaatcaagtttctaatttatta gatcaaatggtaacacgtggatatcttagtatccttaataaggcttacagaatttttatg ccagaaaacgtcttcaatttattttttgaatttcttgcacaatgtgtaatttatggtgat ttcaaaggttgccagcaaaagttattggatttcaaagcacaatgcataaatctcaaatgt aatgaagctacggattggaattcttcagataccacgtatttgaataatttatactggatt gcaatcgttgtaattaaatgcgttattgcaacgcttgctcatgctttaaaaagtacacat ctgcaaataaaatttcttgaaattttgataaaatgtgatttttatacgaattttccagtt tccattccaaagtttcagtttttactacaagttacaaaaattcttcaaaaaacaaatatt gcattaaactttgcgatattcacggtatcagataatgtgtacaattttgatacagaaatt catagatgtattggtgctttaataagaaatgaaaattatgccaatgcattagagttatca aatttagcgggattagattcttctgaaataattttagcccagtatcgaagtaaatttaag tattatatacacaaaaatgataaaattgaagataatttttggaatgaatgtgcactaaat tttaaaaaatacaatatttcacatgagaaagcagcagaattttttgttgaacatgctgaa aaagttaattctcataaagaaagatatgatatattaaaaacagcgtttgaaagcttaaaa gatattaaaacagaacaacaaaatattgatgcacttgaaacagcaatgtggaaatcatgt atattagccggtcctgaaaatgtgcaattagatgatggaccttatatcttcaataaatta aaaacagagttattatcgggattaaataatttaaaatttagttatacattaagtaacata caagaaaaatatgcaactgaaactttaattaataaactaattgacgtggggaaattggat actgcattgagaataagtacaatttttaactataaacataaggatttacaagttctgatg ttatgtttgagtttagcagaaggagaaattttgcctaataatttaactactgaacaacaa agtcttttgcaagaagtaaataaaaataagcagcaaaaatacagtgccttaaagaatcgt ggtttgcaaagattttcttcatcttcattaattgcttcaatcaatacaactaaaataagt aaaacaaaagatgaaaacgttcataaaatacaaatggagtgtatatcaattttacaaaaa ttacttgacattctggaacatggagtagacatatgtcttagaattgttttatgttataaa ttagccatgcaattggaaaaaaattatcaattcttgctaatattaaataatccaattcaa tttttgcaaaatattacagaaagtgatattgagaataaatccgaaattgttaatgatata attattgcgtacaaaataagcagtgatagtgtagcaacatttttggctgaaaatattact ctaaatattacccgtgcggtagaagatgaatatgaaaataatgtttatttatggggatat tccttaaatacaaattttcgggttattatggaactatgcaacgatgtttcacttgttggt tggaaacttttaaaaacagcaaataaattacttggatattctcagggtgaaaaaacaaac gcattaaccctgaagacgattgcagaactattaatacgagctcatgattgctttacaact tcttgtaatatggaaggtatagcatcagtattatgtaaatgtcaaattttcgcaaatgtt ttacaaaatcttaagtgttggacgttactggtccgtcttgtaacaggtgttggtcgtttt acagaaatgaattacgtatttcaaattttaaaagaaaatgatcaatttgaatttttactt ggaaaaggattaaataaggtaactggtttagaaatagcaattttggaatttctcaaacga cattgccctgagaataaggaactttttactctggtagccttacattttcgattgtatcat gaattagcatttatgtgggaaaatgaagcgaaagatataattaaagcaataatatcagat gctacgaaagatcataataaattgcaaaataccgttcaacatgaaataaaattcattaaa accgaaaatatcctcaaacaattacatttaattgttactaattatactcatgcaacagag tactatttacaggctaataaactaaaccttgctaatcaatgttctgatcaagtacaatta gttgctcttcaactttcactttttaatacagtgtcttataatcaacaagtaatttgtata cttaatttaaaatctgaagatattgataaagtattatgtcacaatttaagtttctctcaa gcttttattgtcatacatgcttatgatcatcatgtagattgggtgaatctgatttataat cattgtatattaaatggagaaacaaaatatttaaaagattttatagcagcaaataaactc agttctgctcttgtgcaagactgtgcacgcaggtacagattggaaaaaagcattacacat actatgacagataacatgaaaatattaatttctgaattattagatgtggaatgtaaatat gtattagccagtcaattgggatttaaagacatagtagaaataatgctcaataatcctatg attggtgcgtatctaaaagacactgtatggaagaagggatataattctctttga

DBGET integrated database retrieval system