Fructilactobacillus vespulae: R4B61_05360
Help
Entry
R4B61_05360 CDS
T11124
Name
(GenBank) penicillin-binding protein 2
KO
K21465
penicillin-binding protein A
Organism
fvs Fructilactobacillus vespulae
Pathway
fvs00550
Peptidoglycan biosynthesis
fvs01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fvs00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00550 Peptidoglycan biosynthesis
R4B61_05360
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01011 Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:
fvs01011
]
R4B61_05360
Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:
fvs01011
]
Peptidoglycan biosynthesis and degradation
DD-Transpeptidase (Class B PBP)
R4B61_05360
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Transpeptidase
PBP_dimer
Spore_GerAC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XNW44338
LinkDB
All DBs
Position
1082286..1084349
Genome browser
AA seq
687 aa
AA seq
DB search
MGNFFGKFFKRRTRSSRQKSEANVIPFRLNLIFIIVGLLFVVLIWKLADLQIIQGKYFQS
VVNNSNNATKYGNVERGMIYDSTGKLISGNQAQRAITYTRLPNVNPSDMYDDATKLGSYI
KVPTKKLTDRQIADYYLANPTNSKNVAKTIKNYENMSVDNQQTAKLKKVMNGGVISFNDK
IKNNAAIYNSMSGAYKLSTTFVKYNDVSNEEMSLVGEHASEMPGVAVGTNWARNYPDGEN
IKMLTGGVSSNEAGLPENEVNKLLAQGYSQNESVGTSNLESKYEPILKGSKSQTNVKMNS
DGQIISQVKKYAGKRGDNLQLTVNSKFQKDLEDLVKSNQAGGNATGTYAVAMNPKTGAVI
GMAGVDRDPKTGKVTENDLGTMATSITMGSVVKGATVAGALMDKVITPESSVLTDMPIKN
GGGTKSSWFNKNGEANMAVNAAGALEVSSNSYMMQLAMKEANFHYVEGGQLNMNPAVFNT
LRSYFNQFGLGIKTGIDIPGESKGIQGPGGFANIGKALDESYGNYDGYTTMQLAQYMSTI
ANGGYRLQPYLVQNIRETNEKNGKLGRIKNSTKPRVLNKVPISTEQLDVIKQGFYQVVHG
SNKYKTGGALQDISPEVSAKTGTAQTFYNGQETVTLSLVSYAPSDDPQVVIALAMPNLPA
DASVNNTTLAKQIYQAYWKDVQNAPGK
NT seq
2064 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgggtaatttttttggaaaattcttcaaaagaagaacacgatctagtcgacaaaagagc
gaggcaaacgtaattcctttccgattaaatttaatttttataatcgtcgggttattattt
gttgttttgatctggaagttggcagatttacaaattatacaaggtaagtactttcaatca
gttgttaataatagtaataatgccactaaatacggtaatgttgaacgtggaatgatttat
gattctaccggtaaattaatttcaggtaatcaggcccaaagagccattacttatacgaga
ttacctaatgttaatcctagtgatatgtacgacgacgctactaagttgggaagctatata
aaagttcccaccaaaaagctaactgatagacaaattgctgattactatttagctaatcct
actaatagtaagaacgttgctaaaaccatcaaaaattatgaaaatatgagtgttgataat
caacaaactgctaaattgaaaaaggtcatgaatggtggcgtgatttcgtttaacgataaa
attaaaaataacgcagctatttataactcaatgagtggtgcttataagctttcaacaact
tttgttaagtataatgatgtatcaaatgaagaaatgtcattagttggtgaacatgctagt
gaaatgcctggagtagcagtaggaacaaactgggcaagaaattatccggatggagaaaat
atcaaaatgttaacgggtggagtttcttcaaatgaagctgggttacctgaaaacgaagtg
aacaaattattagcccaaggatattcacaaaatgaatcagttggtactagtaatttggaa
tcgaaatatgagcccatcttaaagggatctaagtcgcaaactaacgtgaaaatgaatagt
gacggacaaattatttctcaagtaaagaaatatgctggtaaacgtggtgataacctccaa
ctaactgtaaattctaaattccaaaaagatttagaagatttggttaagagtaatcaagcc
ggtggtaatgcaacgggaacttatgcagtggctatgaatcctaagactggtgcagttatc
gggatggccggagttgatcgtgatcccaagaccggaaaggttaccgaaaacgatctagga
accatggcaacttcgattacaatgggatccgttgttaagggtgcgacggttgctggagct
ctaatggataaagttattacaccagaaagcagtgtcttaactgatatgcctattaaaaat
ggtggcggtactaagagttcttggttcaataaaaatggtgaagcaaacatggcggttaat
gcagccggtgcgctggaggtttcttctaactcgtacatgatgcaattggccatgaaagaa
gctaacttccattacgttgaaggtggtcaattaaatatgaatccagctgtatttaatacc
cttcgcagttactttaaccagtttggtttgggaatcaaaactgggattgatattcctggt
gagtcaaagggaattcaaggtcctggtggatttgcaaacattggtaaagcgctggatgag
tcatacggaaactacgatggttatacaaccatgcaacttgctcagtatatgtctaccatt
gctaatggtggttatcgtttacaaccttatctcgttcaaaatattagagaaacaaacgaa
aagaacggtaaattgggtagaattaagaactcaacgaaacctcgagttcttaacaaagtt
ccaattagtactgaacaattagatgttattaaacaaggattctatcaagttgttcatggt
agcaataaatataaaactggtggtgcattacaggatatttcacctgaagtatcagccaaa
actggtacagcacaaacattctataatggacaagaaactgtaacgcttagtttagtttca
tatgcaccatcagatgacccacaagtggtaattgcactggcaatgcctaatttaccggct
gatgcctcggttaacaatactactttggcaaaacaaatttatcaggcttattggaaagat
gttcaaaatgctcccggaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
