Flammeovirga yaeyamensis: KMW28_08170
Help
Entry
KMW28_08170 CDS
T07356
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
fya
Flammeovirga yaeyamensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_13
Ig_7
PKD_4
Por_Secre_tail
PKD_5
PKD
Reelin_subrepeat-B
CHB_HEX_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QWG03543
UniProt:
A0AAX1NBY9
LinkDB
All DBs
Position
1:2080578..2089361
Genome browser
AA seq
2927 aa
AA seq
DB search
MNNIYSQTIVKLFITCFFLISSALINAQTVSSFDIKSGASATTNSAVIPYHLQGTGLDTS
AGTFTVERNGSDITSSVDIVVNPDGSGDFYVYVILGDAYLDGATYDINYKEAPANEDAAT
TVTIDDAASNSTPVSIPTLSPTVDLGYSNSDLITNVDPLLFSVTATTGETVYIKNNLTTI
GTAISTGTDLIVTSSLGEGTHTIYAYSIDSDGDISFTSTPVTITIDKTDPSIGSTAIAWA
ANPTNDTGTSSSDQITSNTSPEVTVNNLPTTDVYNVIVESNIDGQVGSTVISGTTETVNL
SGLSNGVHTLVAKVIDDAGNESGASTSLEITIDTIAPDAPTITLKSSSDTGRSDSDKNTN
DTTPTFSVFAEVGSSIEIRENSATNGTATSVGTTDVTVGSAYSINGTYTFTARATDLAGN
TSLESTTPEVVVIKNVTLSGITAPTLDASTNSGNTGDWITNFSSPILNFTGLNTDDSKYI
TVTSNLDALNVNHFVDPVNSGNEDVTVSPALATQGVHRLTYFVEDIYGNKTTDAYVDLEF
DNVAPNVPSLSLSPSSDTGDSNSDLKTTDTTPTFDITSDFGTTITLYEGSTAKGSITSTG
SDQVTSSVIASGSTYNYSATATDVAGNESANSSPTIDVELLVDNSISGIVGVLNSGTDSG
VTGDHKTNNQTPSIDFTSISTTNNPDIIVESDIDGQVARVDVTGATQTVALSTLSEGNHV
LTFYLEDEYGNQGASATYNLEIDISAPTLTSVTIASDNTDPTVGENNDIVTLDFTSNEDL
ITTNIVTLDGSAITPTNVGLDYTATKTLSVNGMSTYADVVFNISVLDAAGNSGTLVAATT
DASFVKIFPPIVNTINNPSTTEFCTGSNTFSINGDTPTGGDGSTYTFDWQRNFNGGSFAS
LNYTGEDYTENATLAAGTYIYRRVVSSGGVTVNSSTDVTITINTDISNNVLTGPAQTQYC
GSITGGTLTFSGSTPSGGNSTYSYQWEKSTDNGGTWSTIGGSTINYTESSNITLSGTTLY
RRVVNSGQCSNTSNQIAIELSPSVTGINITNVSGGTVCINDAVVLIGGAPSGGTGSYSYQ
WQQQVNNGGYSNIMGATSQSYFISNIASSGNYDFKRITTSGNCIVESNVASVTVPVEPSS
YVTLPSTTNYSDLQSTPVNLTMTGLGSATFYCSGPGVVSNGNGNSSNRFIPSIAGQGNHN
INYHIVYGSCEKVETVSFTVYDGSSTFNLDPQYCRDDPTVTIQAINPASLTGSPAQSDIS
YSGTGVVGGTTFDPDVACAALGLNPGQSADVVVTGSYTASLVNYSFDQSVTVTESHTARI
NIASTSYCLTDADFQIDVILDNVQNATDGSFRVNGGSLRPNPITISPSSLGDGSYYIIYT
YSDANGCDVTTDTTITINPLPQVSYDYVNPSDNGDFCFNQTPITIQGKVGGMNVSSGTFS
GNPGLVDNGDGTATFNPTLAGGELYDEDEDFIINFEYTDPVTGCTNDSDSMVTVYGFDEV
FLATDADDSVCYSAPIVTFTAMEGLAQYAPGGSYSINTGGLTDNGDGTASFDPEAAATAA
GEISTGDYSQHIVTFTYNNSLGCTYSINDTIYVKPLPVKPALVSSVPEYCSDDTGLGNIQ
VSGETGASFVWYSDDALTLVESTTNILTPNDAPTVSSTQVVTYYVTQTSVDGCTSDTLQV
HITINPKPLAPVLSTANVTSYCSGETVGQMSVQNPGVNIKWYTSTNTITPVGLGDDFTPV
INTNVPRDTTFVYYVTETTNGCEGPGTTLNISVFKSPDAPTFNPVAEICSGGALPTISVA
TGQNVNWYDDAAKTNPPLNPAYTLGYTPSFNTNVQNDSIVSFYATSTASGCESVTAQVDI
IIRALPASPSLSAIPIYCEGETIASITATGEVGASYEWFSDETLTSSVSTSQTYDPMISA
PSYPTLDTLNYWVVQVVDGCVSLPTKVDIPVYPNAAKPTVDTNYFVYCSGETISTVNVTT
GSNVKWYNEPTLSTVISTSTTFTPIDPNSATDYSQVYYVTQTVNGCESDTTQVTVIINKT
PDAPIVNGDFEICSGDTFTQFAVTNSVDNDVTWYSDAGLTSVISNNLAYTPTVGTSVTTE
TTYTYYVTDTHLGCEGPATPVTITIHPLPELTMVGSLVEDSVYCQSEGLVGVGGSPTGGS
FTSPTGAIISQTGSNFSINMADSPLGNHVVKYIYTNANNCLDSTDYAFTIVDVPEVDFGT
QVLCDTREVVLTDSTIIRDASQITRWVYNFGDEGSHTITDPALAQTYTHQFATAGEKNIT
LTIFTDQGCSDVSVTKRIFIGSPPTADFNWSVSEHQSNMIFDDISMPADRDTIASWDWDF
GDGNSQTILADLSDLSVNGSTLHQYQNPGTYNVVLTVNTLKGCSKIFTKEAFVVPRISLV
DTDDEYFENFDLDNGQWVPMGDLSSWEYGQAAGENLISTSNAWVTDLTSNYHPLEDSYLN
SPSFDISGLDRPMVTFDMQLDCETGIDGVAFQYSIDSGQTWQVLGDTNDPINWYNSSNIR
SNPGNQPSTIAQPDPVGWTGSTEEEGGIFRETISIRHSLDQFRGVDKEHLRFRFAFKSNS
DLEDEGVLIDNFWVGNRRKAVVIETMTNAGEASVNNNTYRLDSVLVNEFSTDVIAINYHV
RQDGRSDSLNIDNPEPPSGRTFQYGVSDAPTTIVDGNAFLGYTFDFINNKNYSRPIMSRI
LLDPEFDISLSLPDVGDPDEIEVTITANKDFSSEDTEIIVHLITVEREINGIEVSEGLYT
HKNVMKSMSPAPGAEGTSFLGRSWTNGSSETFTVQWDNPQVYDTSQAEVIALVQNNVNME
IFQAIRVPVSHLVSTDPKDVTSIDYNDLEWSLYPNPASDVVTIKAPQNLSNCEWVLTNAE
GRKVTEGVFTGNTYKIDVDDLPSGIYILRHTQGDNAVGNPIKFVVGR
NT seq
8784 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataacatctactcccaaacgatagtcaaactatttattacttgcttttttctaatt
tcaagtgcattaatcaatgctcagacagtttcctcttttgatattaaatcaggagcttct
gcaaccacaaatagtgctgttataccttatcatttacaaggaaccggtttagacacaagt
gcaggtacttttactgtggaaagaaatggatctgatattacttcatctgtagatatagtt
gtaaatccagatggatctggagatttttatgtttatgtaattttaggggatgcctatttg
gatggagcaacttatgatatcaattataaagaggctcctgcaaatgaagatgcagccaca
actgtaaccattgatgacgcagcttcaaattctacacctgtttcaatacctactttatct
cccaccgtagatttaggttattctaattccgatttaataacaaatgtagatcctttattg
ttttctgtgacggcaaccacaggagagacggtttacatcaaaaataatttaactactatt
ggtaccgcaatttctactggtactgatttaattgtaacatcctctttgggagaggggaca
catacaatttatgcttattctattgattcagatggtgatatttcttttacctctacaccg
gttactattactattgataaaacagaccctagtattggctcaactgccattgcttgggca
gccaatcctactaatgatactggtacttcttcttctgaccaaataactagtaacacttct
cctgaagtgaccgtgaacaaccttccaacaactgatgtctataacgtgattgtagaaagt
aatattgatggtcaggtggggtcgacagttatttcaggaacaacagaaacagtaaattta
agtggtttatcaaatggagttcacactcttgtagctaaagtgatagatgatgctggtaat
gaaagtggagcatcaacttcattagaaattacaatagatacaatagctcctgatgctcca
actattacattaaagagtagttcggatactggtagatcagatagcgataaaaatacaaac
gacacaactcctactttttctgtttttgctgaagtaggttcatcaattgaaattagagaa
aatagtgctacaaatggaacagcaacaagtgttggcacaaccgatgttactgttgggtct
gcatattctataaatggtacctatacttttacagctagagcaactgatttagctggtaat
acatcattagaatcaaccactcctgaagttgttgtgatcaaaaatgtgacactttcaggt
ataacagcaccaactttagatgcttctactaattcgggaaatactggtgattggattaca
aatttcagttcgcctatcttaaattttacagggttaaatactgatgattcaaaatatatt
actgttacaagtaatttagatgctctaaacgtgaaccactttgtggatccagttaattct
ggaaatgaggatgtaaccgtttctcctgctttagctactcaaggtgttcatcgtctaact
tatttcgtagaggatatttatggtaataaaactactgatgcctatgttgatttagaattt
gataatgtagctccaaatgtaccttcattatcattatcaccatcatcagataccggagat
agtaattcagatcttaaaactacagataccacacctacatttgatattacttctgatttc
ggaacaacaattactttatatgaaggatcaacagctaagggttcaataacatctacggga
tcagatcaggtgacctcttcagtaatagcctcagggtctacttataattattcagcaact
gcaacagatgtagctggtaacgagtcggcaaattcaagtcctactatagatgtggaactt
cttgtagataattctatttctggcattgttggtgtattaaatagcggaactgattctgga
gtaaccggggatcataagaccaataatcaaacaccaagtattgatttcacaagtatttca
acgaccaataatcctgatattattgttgaaagtgatatagacggtcaagtggcaagggta
gatgttacaggtgcaacacaaacagtagcattatctactctttcagaaggtaatcatgta
ttgacattttatttagaagacgaatatggtaatcaaggagcaagtgcaacgtataattta
gaaattgatatttccgctccaactttaacttcagtaactattgcttctgataacactgac
ccaacagttggggagaacaatgatattgtcactcttgattttacttcaaacgaagatttg
atcactaccaatattgttacgttagatggatctgctattactccaacaaatgtaggttta
gattatactgcaactaaaacattatcggtgaatggaatgtcgacttatgcagatgtagta
tttaatattagtgtacttgatgctgctggaaacagtggaactttagtagctgcgacaaca
gatgctagttttgtgaaaatttttccaccgatcgttaatacaataaataatccttcaaca
acagaattttgtacaggaagtaataccttttctatcaatggtgatacacctactggggga
gatggaagtacttacacattcgattggcaaagaaacttcaatggaggatcttttgcttct
ttaaattatacaggtgaagattatacagaaaatgctactctagcagctggtacttacatt
tatagaagagttgtaagtagtgggggagtgactgttaattcatctacagatgtaaccata
actataaatactgatatttctaataatgtacttactggacctgcacaaacacaatattgt
ggatcaattactggaggtacactaactttttcagggtcaactccaagtggaggtaatagt
acttactcttatcaatgggaaaaaagtacggataatggcgggacatggtcaactattggt
ggttctacaattaactatacagagtcttctaacattaccttaagtggtacaacattgtat
cgacgagtggtaaatagtggtcaatgtagtaatacatcaaatcagatagctatagaatta
tcaccttctgtaacaggaataaacataaccaatgtttctggaggaacagtttgtattaat
gatgctgttgttcttattggtggtgccccttcgggaggtacaggttcttattcttaccaa
tggcaacaacaagtgaataatggaggctactcaaatataatgggagcaacctctcaaagt
tattttattagtaatatagctagttctgggaattatgattttaagagaatcacaacttca
ggaaattgtattgtagaatcaaatgtagcttctgtaactgttccagtggaaccatcatct
tatgttacattacctagtactactaactattctgatttacagtctactcctgtgaattta
acaatgacaggtcttggaagtgcaactttttactgttctggtccaggtgttgtaagtaac
ggaaatggtaactcttcaaatagatttatcccaagtattgctggacaaggtaatcataat
atcaattatcatattgtttatggttcttgtgaaaaggtggaaacagtatcctttacggtt
tacgatggttctagtacatttaatttagatccacaatattgtagagatgatcctacagtt
actattcaagctattaaccctgcatcacttacaggtagtccagctcaatcagatatttcc
tactcaggtactggtgttgtgggtggaactacttttgatcctgatgtggcttgtgcagca
ttaggtttaaatcctgggcaaagtgccgatgttgtagtaactggtagttatactgcttcc
ttagtaaattatagttttgatcaatcagttacagtcacagaaagtcacacagcacgaatc
aatattgcatcaacaagttactgtttaactgatgctgattttcagattgatgtaatattg
gataatgttcaaaatgctacagatggttcatttagagtaaatggcggatctttaaggcca
aaccctattacaatcagtccgtcgtctttaggagatggatcatattatattatatacact
tattctgatgcaaatggttgtgatgttactactgataccacaattaccattaatcctttg
cctcaagtaagttatgattatgttaatccttctgataatggagacttttgtttcaatcaa
acaccaataactattcaaggtaaagtaggaggaatgaatgtatcatcaggtacctttagt
ggtaatcctggtttagtagataatggagatggtacggctacatttaatccaactttagct
ggaggagaattatatgatgaagatgaagattttattatcaattttgaatatactgatcca
gtaacaggttgtacaaatgattcagattctatggtgactgtttatgggtttgatgaagtg
tttttagctacagatgcagatgactctgtttgttattctgctccaatagttacatttaca
gctatggagggtttagctcaatacgcacccggtggaagttattcaataaataccggggga
ttaactgataatggagatggtacggcctcttttgatcctgaagcggcagcaactgctgca
ggagagattagtacaggagattattctcaacatatagtaacatttacatacaataattca
ttaggttgtacttatagtattaatgacacaatctatgtgaaaccactacctgtaaaacca
gctttggtgtcttcagttccagaatattgttctgatgatactggtttaggaaatatccaa
gtttctggagaaacaggagcttcttttgtatggtattctgatgatgctttaactttagtc
gagagtacaacgaatatcctaactccaaacgatgcaccaactgtaagtagtactcaagtt
gttacttattatgttacacaaactagtgtagatgggtgtacaagtgatacacttcaagta
catattactattaatcctaaaccattagcacctgtactttcaactgctaatgtaacatca
tattgttctggtgaaaccgttggacaaatgtcagttcaaaatcctggagtgaatattaaa
tggtatacctctaccaatacaataacacctgttggtttgggagatgattttactccagtt
attaatactaatgtacctagagatactacttttgtttattatgttactgaaactaccaat
ggatgtgaagggcctggcacaacattaaatattagtgtatttaaatctcctgatgctcca
acatttaaccctgttgctgagatatgttcaggaggggcactacctacaattagtgttgcc
actggccaaaatgtgaattggtacgatgatgctgctaaaacaaacccaccattaaatcca
gcttatacattagggtatacaccttctttcaatacaaatgttcaaaatgattcaatagtt
agtttctatgcaacatctacagcaagtggatgtgaaagtgtaactgcacaagtggatatt
attattagagctttaccagcttcgccttcattgagtgctattcctatttattgtgaagga
gaaacaatcgcatcgattacagcaactggagaagtaggagcctcttatgaatggttctct
gatgaaacattgacatcttcagtatctacaagtcaaacatatgatccaatgattagtgca
cctagttatcctaccttagatactcttaattattgggttgttcaagtagttgatggatgt
gtttccttaccaactaaggtagatatccctgtttatccaaatgcagcaaaaccaacggta
gatactaactattttgtatattgttcaggtgaaaccatcagtactgtaaatgttactaca
ggaagtaatgtaaaatggtataatgaacctacattgtcgactgtaatttctacaagtaca
actttcacgcctatagatccaaattctgcaactgattactcacaggtatattacgttact
caaacggtcaatggttgtgagagtgatactactcaagtaacagttattattaataaaaca
cctgatgctcctattgtgaatggagattttgaaatatgttcaggtgatacctttacacag
tttgcggttacaaattctgtcgataatgatgttacttggtactcagatgctggtttaact
tctgtaatcagtaataacctagcatatactccaacagttggtacatcagtaactacggaa
acaacttatacatattatgtaacagatacgcatttaggttgtgaaggtccagctacacca
gtaacaataactatacatcctcttccagaattaacaatggtcggatcattagtagaggat
agtgtttattgtcagagtgaaggattagtgggtgtgggaggatcaccaacaggaggttcg
tttacctctccaacaggagcgattattagtcaaacaggttcaaacttctcaataaatatg
gcagattctcctttaggaaatcatgttgtaaaatatatttatacaaacgcaaataactgt
ttggattcaacagattatgcatttacaattgtagatgttcctgaagtagattttggaaca
caagtattgtgtgatactagagaagttgtgttaactgatagtacgattattagagatgct
tcacagatcacacgttgggtctacaattttggtgatgagggttctcataccattacagat
cctgctttagcacaaacatatacacatcaatttgcaactgcaggagaaaagaacattaca
ttgaccatatttacagatcaagggtgttctgatgtatctgtcactaagagaatatttatt
ggatcacctccaactgcagattttaactggtcagtttccgaacatcaatcaaatatgatt
tttgatgatatatcaatgcctgcagatagagatacaattgcaagttgggattgggatttt
ggtgatggaaattcacaaacaattttggccgatttaagtgatttatcagtgaatgggtca
acccttcatcaatatcaaaatccgggtacttataatgttgttttaacagtaaatacatta
aaaggttgttctaaaatctttacaaaagaagcatttgtcgttccaagaatatcattagta
gataccgatgatgaatactttgaaaactttgatttagataatggtcagtgggttcctatg
ggtgatttgagttcgtgggaatatggtcaagcagcaggagaaaatctcatttctacttct
aatgcttgggtaaccgatttgacatcaaattatcatcctttagaagattcttatctaaat
tcaccgtcattcgacatttcagggttagaccgtccaatggtcacttttgatatgcaattg
gattgtgagacaggaattgatggtgtagctttccaatattctatagattctggtcaaaca
tggcaggttttaggagataccaatgacccaatcaattggtacaatagttcgaatattaga
tcaaatccaggtaatcaaccttctactattgctcagcctgacccagtgggttggacaggt
tctacagaggaagaaggtggtatatttagagaaaccatttctatccgacacagtttagat
caattcaggggagtagacaaggaacacttaaggtttagatttgcatttaaatcaaattcg
gatttagaagatgaaggtgttctgatagataatttctgggttggtaatagaagaaaagcg
gtagtgatagaaacaatgacaaacgcaggagaagcatcagtgaataataatacgtatcga
ttagatagtgttcttgttaatgaatttagcactgacgttatcgctattaattatcatgtt
cgccaagatggaagatcagactcattaaatattgataatccagaaccaccaagtggacgt
actttccaatacggagtttctgatgctccaacgacaattgtagatggtaatgcattctta
ggttatacattcgatttcataaataataaaaattacagtcgtccgattatgtcaagaatt
ctattggacccagaatttgatatctcactttcattaccagatgttggagaccctgatgaa
attgaggtgactatcaccgcaaataaagatttttcttcagaggatacagaaattattgtc
catctgataacggtagagagagaaattaatggaatcgaagtttctgaaggtttatataca
cataaaaatgtaatgaaatcgatgtctccagcaccaggtgcagaaggaacaagtttcttg
ggtagatcatggactaatggaagcagtgaaacatttacagtccaatgggataaccctcag
gtatatgatacgtctcaagcagaagtgattgctttggttcagaacaatgtgaatatggag
atattccaagctattcgagtacctgttagccatttagtatcaactgatccaaaagatgtg
acctcaatagattacaatgatttagaatggagtttatatccaaatcctgcttctgatgtt
gttactattaaagctcctcaaaatttatcaaactgcgagtgggtattaacgaatgctgaa
ggtagaaaagtaacagagggtgtctttaccggcaatacctataaaattgatgtagatgat
ttaccatcaggtatatatatattaagacatactcaaggtgacaatgcagttgggaatcca
atcaaatttgttgttggtaggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
