Flammeovirga yaeyamensis: KMW28_13165
Help
Entry
KMW28_13165 CDS
T07356
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
fya
Flammeovirga yaeyamensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fya00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fya02000
]
KMW28_13165
Transporters [BR:
fya02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
KMW28_13165
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
CooC_C
Big_1
TTR_TEN1-4
CILP
DUF7382
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QWG00601
UniProt:
A0AAX1MZA5
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(3364868..3367855)
Genome browser
AA seq
995 aa
AA seq
DB search
MSINSTKQFAATMLLLLFSLVAFAQERSVSGTVVDENGDPLPGVAVLVKGTTKGGTTDFD
GKFKITLADGEDVLVVSYIGYKAQEISVGTSTNLDVAMEVDAEQLEEVVVIGYGSVKKED
ATGSVQAINASDFNQGAITSPQEQLQGKVAGVAITTAGGAPGAGADIRIRGGSSLSASND
PLIVIDGVPVDNDGIQGMQNPLSAINPADIETFTVLKDASATAIYGSRASNGVVLITTKK
GSSGKMKIDYTGNVSIATVPKTVDVYNADGFRNLIRTRWGENSKAESFMGNTNTDWQDQI
FSSAVSTDHNVSVSGSVKDKLPYRVSVGYTWNDGILNTSHMDRTTGNLSLTPKFFDDHLS
VNVNVKGMYIQNRFADTGAIGSAIAMDPSHQPKYDSDEFKPYGGYFTWLDGDGNPITIAP
SNPLALLEQKRDESTVKRSIGNMQLDYKFHFLPELRANLNVGYDYSESEGTVKAGTDAAF
VGNQAGLDNRYTQSKKNELLDFYLQYNKDLPSIDSKIDVMAGYSWQHFWREEYNRDATAA
GFVNNEKLFRTENYLVSFFGRLNYTFKDRYLLTATVRSDGTSRFSPDTRWGVFPSLAAAW
NIKKEGFLATNDLVSTLKLRAGYGITGQQNINTNDYPYLPQYTFSQNERAQAEFYVKDGN
GNWVPEHLPTLRPEGYDSKIKWEETTTYNLGVDFGFKDDRTTGSIDVYKRTTDDLLNTIP
VPAGSNLVDQLLTNVGSLENQGIEIALNHKIINTSDLFWDFGVNVTYATYKITKLTQVED
EDYRGVLTGGIAGGTGNTVQIHSVGHPRQAFYVWEQIYGSDGNPLDGAYVDRNNDGRVTE
DDKYQYNNPDPKWMFGFTTKASYKNWDFSMAGRMNLGNYVYNNLASGASLTGTFTDVGYT
NNQPTALGSTMFNQPQYFSNHFVENASFFRLDNISVGYNFNNLKNGAVHLRVNATVNNAF
VITNYSGLDPEIFGGIDNNVYPRPRTFLLGVNVGF
NT seq
2988 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcattaactctacaaagcaatttgctgcgacgatgctacttcttttattctcttta
gttgcttttgcacaagagagatctgtaagtggtactgtagtagatgagaatggcgaccca
ctacctggtgtggctgttttggtaaaaggtacaactaaaggtggtacaactgattttgat
ggtaaattcaaaattactttggccgacggtgaggatgtactagttgtctcttacattggt
tacaaagcacaagaaatttcagtaggtacttctactaatcttgatgtggcaatggaagtg
gacgcggaacaacttgaagaagttgtagttattggttatggtagtgtaaagaaagaagat
gctactggttcggttcaagcaattaacgcatcagattttaatcaaggtgcaattacttcc
ccacaagaacaattacaaggtaaagttgctggtgtagcaattacaacagcaggtggtgct
ccaggtgctggtgctgatatccgtattcgtggtggttcatctttatctgcttctaacgac
ccactaattgtaattgatggtgtacctgttgataacgacggtatccaaggtatgcaaaac
ccattgtcagcaattaaccctgctgatatcgagacatttacagtattaaaagatgcctct
gcaacagcaatttatggttcaagagcttctaacggtgtcgttttgattactaccaagaaa
ggttcttcaggaaaaatgaaaattgattacacaggtaacgtttcaattgcaacagtacca
aaaactgttgatgtgtacaatgcagatggatttagaaacctaattagaactagatggggt
gaaaactccaaagcggagtctttcatgggtaatacaaatactgattggcaagatcaaatc
tttagttcagcagtaagtacagaccacaatgtttccgtttcaggttcagtaaaagataag
cttccataccgtgtatcagttggttatacttggaatgacggtatcttgaacacttcacac
atggatagaactactggtaaccttagtttaactccgaaattcttcgatgatcacctatca
gtgaacgtaaatgtgaaagggatgtatatccaaaacagatttgctgatacaggtgcaatc
ggttctgcaatcgctatggatccttctcatcaacctaaatatgatagtgatgagtttaag
ccatatggtggatactttacatggttggacggtgatggtaacccaattactattgctcct
tcaaatccattagctttattagagcaaaaaagagatgaatctactgtaaagcgaagcatc
ggtaacatgcaattggattataaattccacttcttaccagaattaagagcgaacttaaac
gtaggttatgactattctgagtctgaaggtactgtaaaagcaggtactgatgcagctttt
gttggtaatcaagcaggtttagataacagatatacgcagagtaaaaagaatgaattatta
gacttctatttacaatataacaaagatctaccttctattgattcaaaaattgatgtgatg
gcaggttattcttggcagcatttctggagagaggagtacaatagagacgcaacagctgca
ggttttgttaataacgaaaagctatttagaactgaaaactatttagtttcattctttggt
cgtttgaactatacattcaaagatagatacttattaactgctactgtaagaagtgatggt
acttcaagattctctcctgatacaagatggggtgttttcccttcattagctgcagcatgg
aacatcaagaaagaaggtttcttagcaacgaatgatttagtaagtactttaaaattaaga
gcaggttacggtattactggtcaacaaaacattaatacgaatgattacccttatttacca
caatatactttctctcaaaatgaaagagcgcaagctgaattctatgtgaaagatggaaat
ggtaactgggttcctgaacatttaccaactttaagacctgaaggatacgattctaaaatt
aagtgggaggaaacaactacttataacctaggtgttgattttggtttcaaagatgataga
actacaggttcaatcgatgtttacaagagaactacagatgatctattgaatactattcca
gtacctgcaggttcaaacctagtggatcagttattaactaacgttggtagcttagaaaac
caaggtattgagattgctttaaatcataaaattatcaatacaagtgatttattctgggat
tttggagtaaacgttacatatgcaacgtataagatcacaaaacttacacaagttgaagac
gaagattacagaggtgtattgactggtggtattgcgggtggtactggtaacacagttcaa
attcactcagtaggtcatccaagacaagcattctatgtttgggaacaaatttatggttca
gacggtaatcctttagatggtgcttatgttgatagaaacaacgatggtagagtaacagaa
gatgataaataccaatataacaatccagatccaaaatggatgtttggtttcactactaaa
gcttcttataaaaactgggactttagtatggcaggtcgtatgaacttgggtaactatgtg
tataacaacttagcatcaggtgcttctttaacaggtacatttactgatgttggatacact
aacaaccaaccaacagcgttaggttctacaatgttcaatcaaccacaatatttctcaaat
cactttgttgagaacgctagcttcttccgtttagataacatctctgtaggttacaacttc
aataacttaaagaatggtgctgtccacttaagagtgaatgcaacagtgaacaacgcattt
gtaattacaaattacagtggtttagatcctgaaatcttcggcggtattgataacaatgtt
tatcctcgtccaagaacattcttattaggtgtaaatgttggattctaa
DBGET
integrated database retrieval system
