KEGG   Flammeovirga yaeyamensis: KMW28_18495
Entry
KMW28_18495       CDS       T07356                                 
Name
(GenBank) PAS domain S-box protein
Organism
fya  Flammeovirga yaeyamensis
SSDB
Motif
Pfam: PAS_3 PAS_9 PAS_4 PAS MCPsignal PAS_8 HAMP_2 PAS_11 HAMP YNR034W-A-like ATG17_like TMP_3 NUP120_helical
Other DBs
NCBI-ProteinID: QWG01617
LinkDB
Position
1:complement(4638620..4644874)
AA seq 2084 aa
MALGDNIKKDRLLSKDDASAGNGRPKKFFEGAAELQKEIHQLKAKLKAFDKAALLAETAP
DGTIVSCNNHFASTFGYSSKELLNEPLSKLLSPDTPQNFAESVLSILGKGETYTGTLNNV
TKEGDPVWLEVTISPILDDEKRIIRYLMLGMDVTEVMSKEKEFANIQSELDSRVNIFNTA
ALVSETDLYGTITFANETFAKLSGYTPEELIGKPHSIVRHPANPKSLFKELWDKVQNGQI
FQGTYRNLAKDGSHYWVQATIAPVLDNNGKPVKYIGVRFDVTKQIDQENEMQAVQEVISE
STGVLTLDLDENIIEANDHISKILGYSSVEDIIGKQHSSLVPNEPEHLGIEKDRKKSLKR
GEFYKNTFKRLDAQGRTKWLEGTYNVIKDFDGNNTKIIAYLQDVTARRLANSDNRGKIAA
IDESYMRVEFDLDKTILDCNDLFAEGTGYPKEQLIGASHKMLVEESYGNSKEYEDFWAKL
GRGESDKNVYKRVVAGGKEVFLQATYSPVRDHDGNIYKIVKIAEDVTARRLTNADNRGKI
AAIDNSYMRVEFDLERHILDCNDLFAEGVGFSKDELIGLDHINLVDEEYGKSKEYADFWN
NLRKGQFDKNVYKRKIAGGKEIWLQATYNPIKDADGNVYKVVKICEDVTERRTNNADNRG
KIAAIDNSYMRVEFDLERHILDCNDLFAEGVGFTKEELIGLDHINLVDEEYGKSKDYADF
WNKLRRGEFDKNVYKRKVAGGREIWLQATYNPIKDAEGNVYKIVKICEDVTERRTNNADN
RGKIAAIDNSYMRVEFDLERHILDCNDLFAEGVGFSKDELIGLDHINLVDETYGKSKEYA
DFWDKLRKGQFDKNIYKRKVAGGKEIWLQATYNPIKDAEGNVYKVVKICEDVTERRLANA
DNRGKIAAIDVSYMRVEFDLNRRIIECNDMFAEVVGFSKDQLIGIDHKELVGDSYGNSQE
YENFWKKLRNGNFEKGVFKRFANGGAEVWLQATYNPIRDQEGNIYKIVKIAEDVTERRLN
NSENRAKIKAINEVQAVVEFDLNGYIQDCNDLFIQTTQYSKDELLGKHHRMLVEESYAKS
IEYERLWEKLNQGVNDEGVYRRVRKDGSIMWLQANYNPIFDLNNQAYKVIKYATDITDQV
ETQRRADALKNELESRVNAFNSAALMSETDLHGTITFANETFASLSGYTVDELIGKPHNI
VRHPSTPKEVFKDLWETIQSGRVFKVQYRNKKKNGGYYWVDATIAPVLDIDGKPIKFIGI
RFDITEQMDNKVEKDGVDEAISKSSGVLELSMDGDVISANDTILENLEYNEGELLGVPHD
TLVPVDQDATLKNKELWAKLQKGQYVVDSFKRVTKEGKEVWLEGSYNPIQDYDGNYVKIV
AYLQDITQRRIQNADNRGKIAAIDASYMRVEFDLTGNIMDCNDIFSRNTEYSREELIGSH
HSMFVDKVYGDSQEYKQFWEKLGRGEFDRNVYKRYTKSGKEVWLQATYNPVRDHDGNFYK
VVKIAEDVTQRRLANAENRGKINAILKAQGVVEFDMNGNILTANDNFLSLTGYTLEEVQG
KHHRMFVSNEDANSFEYKQFWEKLRNGEHDAGEYQRVSKTGDPVWLQATYNPIMDDDGNL
FKVVKYASDVTEFKSAYVALSEFLDELAKGNFDAKIDIGNINMDSDIGRMIDNNRSLRDN
LKKFINEINRVVHIAGNQGRLDERLEIAGAQGAWHELTEAFNNLLSSISEPILEFQSLTK
SLSKGDLSQRFVGKSAGDIKQMADGLNDALDNLQTLLLEIEGMSNTVAGSSEAMKDKFGI
MDKSTTTVVDAIQGINAGMLEQVSRTDESSQLVDQILKAADDTGNKAHVINRSAESGMES
CQNGMQIVKHLVENMNAIENSAGSTSNSIEVLAKRSEEISRALTVITDIASQTNLLALNA
AIEAARAGEAGRGFAVVAEEIRKLAEDSRQSAGGIEKVIQDVQKDVGLATKAIDKMEEAV
KVGNGATKDASEVFKTILDSSEETLNLSKDVLEATETQKSSIDSVVQNIDKIVVVSEDTA
AGTKNVAGVADEMSESVKEMGETSEQLNEVAAQLKSGVSKFKLK
NT seq 6255 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcacttggagataacatcaagaaagatcgtctattaagtaaagacgatgcctctgca
ggtaacggacgtcctaagaaattctttgaaggagctgcagaattacaaaaagaaatacat
caacttaaagcaaaattaaaagcatttgataaagctgctttacttgcagaaacagccccc
gatggcacaatcgtttcctgtaataatcattttgcaagtacttttggatactcttccaag
gagcttttaaatgaaccattatcaaaattactgtcaccagatacaccacagaattttgca
gaaagtgttttatctattcttggtaaaggagaaacctatacaggtacgctcaataatgta
acaaaagagggtgaccctgtatggttggaggtgactatctctccaatcttagacgatgaa
aaacgtatcatacgctacctgatgttaggtatggatgttactgaggtgatgtctaaggaa
aaagagtttgccaacattcaatccgaattggattcaagagtaaatatttttaatactgca
gctttggtatcagaaactgatttatatggtaccatcacttttgctaatgagacctttgca
aaattatcaggttatactccagaagaattaataggtaaaccacactccattgttcgtcac
cctgcaaatccaaaatcactatttaaagaattatgggataaagttcagaatggacagatt
ttccaagggacgtatagaaatttggccaaagatggatctcactattgggtacaagctacc
attgctccagtgcttgataataatggaaaacctgtaaaatatattggggtacgtttcgat
gtaaccaaacaaattgatcaggaaaatgaaatgcaagctgttcaggaagtaatttctgaa
tcaactggcgtgctaaccttagatctagatgaaaacattattgaggccaacgatcatatt
tctaaaatcttaggttattcaagtgttgaagatatcataggtaaacaacattcctcatta
gtaccgaatgaacctgaacacctaggtattgagaaagacagaaagaaaagtttaaaaaga
ggtgagttttataaaaatacctttaaaagattagatgctcaaggaagaacaaaatggttg
gaaggtacttataatgtaattaaagatttcgatggcaataacacaaagatcatcgcttac
cttcaagatgtaaccgctcgtcgtttagccaattcagataatcgcggtaaaatcgcagcg
attgatgaatcatacatgagagtagagtttgatttagataaaaccattctcgattgtaac
gatctctttgctgagggtaccggttatcctaaagagcaattaataggggcttctcataaa
atgcttgttgaagaaagctacggaaattctaaagagtatgaagatttctgggcaaagcta
ggaagaggtgaatccgataaaaacgtttacaaaagagtagtagctggtggtaaagaagta
tttttacaagcaacttattcaccagtaagagatcatgatggtaatatttacaagattgtg
aaaattgctgaagatgtaactgcaagaagattgactaacgcagataaccgtggtaagatt
gcggctatcgataacagttatatgagagtagaatttgatttagaacgtcatattctagat
tgtaacgatctttttgcagaaggggtaggcttctctaaagatgaacttattggacttgat
catatcaacttagttgatgaagaatacggcaaatcaaaagaatatgccgatttctggaat
aatctaaggaaaggacaatttgataagaacgtctataaacgtaagatagcaggcggtaag
gaaatttggttgcaagctacttataacccaattaaagatgccgatggaaatgtctataaa
gtggtgaaaatctgtgaggatgttactgaaagaagaaccaataacgccgataaccgaggt
aagattgccgctatcgataatagttacatgagagtagaatttgatctggaacgtcatatt
ctcgattgtaatgatctttttgcagaaggtgttggtttcacaaaagaagaattaattggt
ttagaccatattaatttagttgatgaagaatatggtaaatcaaaggattatgccgatttc
tggaacaaattaagaagaggcgaatttgataaaaacgtctacaagcgtaaagtagcaggc
ggaagagaaatttggttacaagccacttataacccaatcaaagatgctgaaggtaatgtg
tacaagattgtaaaaatctgtgaggatgttactgaaagaagaaccaataatgcagataac
cgtggtaagattgcggctatcgataatagttacatgagagtagaatttgatttagaacgt
catattcttgattgtaatgatttgttcgcagaaggagttggtttctctaaagatgaattg
attggtctcgatcatattaatttggtagatgaaacttacggtaaatcaaaagagtacgcc
gatttctgggataagttacgaaaaggtcaatttgataaaaacatctacaaacgtaaagta
gcaggaggaaaagaaatctggctacaggcaacatacaatcctattaaagatgcagagggc
aatgtttataaagtagtaaaaatctgtgaggatgtaaccgaaagacgtttagcgaatgca
gacaacagaggtaaaattgccgcgattgacgtgagttacatgagagttgaatttgattta
aatagaagaataatcgaatgcaacgatatgtttgccgaagtggtaggcttctcaaaagat
caattaataggtattgaccataaagagttagtaggcgacagttacggtaactctcaagaa
tatgaaaacttctggaaaaaattaagaaatggtaattttgaaaaaggggtattcaaacgt
tttgcaaatggaggagctgaagtttggttacaagctacctataacccaattcgagatcag
gaaggaaatatctacaagattgtaaaaattgcggaagatgtaaccgaacgtcgattgaat
aactctgaaaacagagccaagatcaaagcaataaacgaggtgcaagcagtagtagagttt
gatttaaatggatacattcaagattgtaacgatttatttatccaaacaactcaatactct
aaagacgaattgcttggtaaacaccatagaatgttagtagaagaaagctatgctaaatct
atagaatacgaaaggctatgggaaaaactcaaccaaggtgtaaacgatgaaggtgtttat
agaagagttcgaaaagatggatcgatcatgtggttacaagcaaactataatccaatattc
gacttaaataatcaagcatataaagtaatcaaatatgcaactgatattaccgatcaggta
gagacacaaagaagagcagatgccttaaagaacgaattagagtctagagtaaatgccttt
aactctgccgctctaatgtcggaaacagatttgcatggtacgattacttttgccaacgaa
acattcgcttctttatctggatatacggtagatgagttgattggtaaacctcacaacatt
gtacgacatccatctacacctaaagaagtatttaaagatctttgggagaccattcagtca
ggtagagtatttaaagtacaataccgtaacaagaagaaaaatggtggttattactgggta
gatgcaaccattgcaccggtacttgatattgatggaaaaccaattaagtttattggtatt
cgtttcgatattacggaacaaatggacaataaagtcgaaaaagatggtgttgatgaagct
atctcgaaatcatcaggtgtattagaattaagtatggatggcgatgtgatttctgccaac
gacacaattttagaaaacttagaatacaacgaaggagaacttcttggagttcctcacgat
acacttgttccagtagatcaggatgccaccctcaaaaataaagagctgtgggcaaaatta
cagaaaggacaatatgtagtagattcctttaaacgtgtgaccaaagaaggcaaagaagtt
tggctggaaggttcttacaatccaattcaagattacgatggaaactacgtgaagattgtc
gcttacttacaggatattactcaaagaagaattcaaaatgcagataaccgtggtaagatt
gcagccattgatgcttcctacatgcgtgtagagtttgatttgactggtaatatcatggac
tgtaacgatatctttagtagaaatacggaatacagtagagaagaattaatcggttctcac
catagtatgtttgttgataaggtctatggcgattctcaagaatacaagcagttctgggag
aaactcggaagaggagagttcgatagaaatgtatataaacgatatactaaatctggaaaa
gaggtatggttacaagccacctataacccagtacgagaccatgatggtaacttctataaa
gtagtaaaaattgcagaggatgtaacacaaagacgtttagccaatgcagaaaaccgaggt
aagattaacgccatcctcaaggcacaaggagtggtagagttcgatatgaatggaaacatt
cttacagccaatgataacttcttatctctaacaggttatactttggaagaggtacaaggt
aaacaccatagaatgtttgtaagtaacgaagatgccaatagcttcgagtacaaacagttc
tgggagaaacttagaaatggtgaacacgatgcgggtgaatatcaaagagtaagtaaaaca
ggagatcctgtttggctacaagctacctataacccaattatggacgatgacggtaactta
ttcaaagtagtaaaatacgcatcagacgtcacagagtttaaatcagcatatgtagcacta
tccgaattcctggatgagctagctaaaggtaatttcgatgcgaagatagatattggtaat
atcaatatggactctgatattggtcgtatgattgataataaccgatcattaagagataac
ctgaagaagtttattaacgagattaaccgagtagtacatattgccggtaatcaaggacga
ttggatgaacgactagagattgctggtgcacaaggagcatggcatgaattgaccgaagcc
tttaacaacttactaagctctatttctgaaccaattttagaattccaatcactaacgaag
agtttatcgaaaggagatctttcacaacgattcgtgggtaaatcagccggtgatattaaa
caaatggctgatggtctaaacgacgccctagacaaccttcagacactactattagaaatt
gaaggaatgtcgaatacggtagcaggatcatcagaggccatgaaagataagttcggtatc
atggataaatcaacaaccacagtggtagacgccattcaaggaattaacgctggtatgttg
gaacaggtatctagaacggacgaatcttctcagttggtagatcagattttgaaagcagcc
gatgatacagggaataaggcacatgtcattaaccgatcggctgaatctggtatggaatct
tgtcagaacggtatgcagattgtcaaacacttggtagaaaacatgaatgcgatagaaaac
tcggcagggtctacatccaattcaattgaagtcttggcaaaacgatcagaagagatctca
agagcactaacagtaattactgatatcgcctcacaaaccaatctactcgccctaaacgca
gcaattgaggccgcaagagccggtgaagcaggtagaggtttcgcagttgtagccgaagag
attaggaaacttgcagaggattcaagacaatcagccggtggtattgagaaggtaattcaa
gacgttcaaaaagacgttggattagcaacgaaagccatagacaaaatggaagaagcagta
aaagtcggaaacggtgcaacgaaagacgcttctgaagtatttaaaacaattcttgattca
tctgaagaaacacttaacctatcaaaagatgtattggaagcgacagaaacgcaaaagtca
tctattgactcagtcgtacaaaacatcgataagattgtagtggtatctgaagacacggca
gcaggaaccaaaaacgtggccggtgttgcagatgaaatgtcagaatctgtaaaagaaatg
ggtgaaacttcggaacaattgaacgaagtggctgctcagctgaaatcaggtgtaagtaaa
tttaaattgaaataa

DBGET integrated database retrieval system