Flammeovirga yaeyamensis: KMW28_22110
Help
Entry
KMW28_22110 CDS
T07356
Name
(GenBank) Ig-like domain-containing protein
Organism
fya
Flammeovirga yaeyamensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_2
CBM_6
BPA_C
Porphyrn_cat_1
Por_Secre_tail
Big-like
CBM_35_2
HL_N-beta
CBM_35
Invasin_D4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QWG05121
UniProt:
A0AAX1NDQ3
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(460520..466504)
Genome browser
AA seq
1994 aa
AA seq
DB search
MNYFTMFRRRFYLILLLVSCVFATNAQDVNVDVNLNIKHSVNGASEFNRENYMTLHATAF
ETDWDGEEDKLDYLLNDLDTYFGRDNGSATWKFSATEEDPNRPNWPSEDHMVELGTWLRG
EYDKDFNSHQFEARSKEMIMGTNPHPTYPTLSWNGDGNTWTGWQPYDVDVSAEWVVNYLD
YFFRKADGSPGEPLPYYWEVINEPDMPMMTGHMTCTSQEKIWEYHNLVALGIRERFGVNN
PNRPKVGGMTWGLHDFHLADGISRYDENYLDQYLDGEGLITYHNMMDSEANDYRTTPWYQ
WDVMWQGFMDTCGENMDFYSIHIYDWPGWDLNGDDKPSATRAGGHTEAMLDILEWYDLYK
TGTRKEMIVSEFGAVNGGYNTQNTPGRFDSKRIDWECLKPFNSMFMQFLERPDYITKSMP
FTPTKAIWGDTPDQNLRYPYAMMQPDANGVWQWSEYIKFFELWSNVKGTRIETKASNPDV
QVNAYADGNKLYLILNNLEDNEKTINLAMYDDFANPVQNVMIKNLYLDMNKGTAGQPALD
VINVKTAPGSVKLLNDATMVLEYTFTNPVNLSETLNETKFMGDKIGDGFHPFGSELIHKN
STTLTTQVNNVVVPSGAYEATLRVSGAFFKAHLSSVKVSINGVEIQHDGNWRGAMEDLRN
QWLGVLELDIPAGLLQANNTIECQSNAPVDWATTQIQVFDFSKEPGRSGVNTVALTSVSL
SGDQELMQGKETSLATTFAPENATNKALTWTSSNPSVATVDEFGVITAVATSGSATITAT
SADGSVSAAHTINAIPFSATPVASVSINEGTSVDAEFYVYTPLTVTITPEDATDQEVVWS
SSNPEAVAVNASTGKIQGLIIGESAVITATVGGKSTSTTVNVGIVGDEEIYCDALPSEVT
GNTNYTFDVSVNLLGSREVKVELLSGATVLGSGSTVADVKGKEFISVDLALSNVPSIGNY
TLRVTALNGGQTVAQCTSTLSILDRIRPSSITLVDWLREVEVGQTLPIAAEVLPVDAYDK
TVLWTSSNPAVASVSVDGTITGAALGSTVIRGTLQDGGLYQEVTVQVKNQVVVQPTSIQI
PSDITVFPGGNFQVTPVFVPEWTTEKDINWSIDGSIASVDANGVITATTTQGTVTLTATS
STSPAVSTTSAVTVGTTLTVEAESFSAMGGAVGEIGIYDLASASKGQAINNVQAGDFVEF
EVFVPQAGQYRATFFAGTGLEDGVIEMYVNGSSQGSKQVPMNDWDAFAAVTLDQDVTLPQ
GTVTIGLVASGTSDWQWNMDYFQLAFQGGDCGAVTGVTINASSTTITIGNNLTLGANLQT
AGGAIPCNNSIVWTSSNTNVATVNNSGQVTGVAAGNVTITATASGFTATQNLTVQEVLVT
GVVVSPSDVQLNVGGSQQLTATVAPTNASNKSVVWSSSNPAVATVSNTGLVSAVTNGSAV
ISATTVSGTFVASANVEVSTVITGVTGVSLNTTSLNLVVGNTGQLVETVLPANASNKAVT
WSSSNTSIATVANGIVTAVSQGEATITVTTEDGNHIASATVNVTEVGDPEQLIIEAEDFV
ATGGNYNDGFVPFGANKVDGLGINYVNSGDYVEYTVTGNGVYGVDYYISTPLDNAAIEIQ
LDGQSIGSDNVPNNGEWDNYTLLTSAHQLTLSGTHTIRLVASGSNAWQWNLDKIVLNPVS
GGGDVNVTGVTLSATSLTLDPSQTASLVADVQPANATNQSVTWTSDNTSVATVDNNGLVT
AVSAGATTITVSTVDGNYQASASVTVNGGSATLVIEAEDFVSTGGTYNDGFVPFGVNKVN
DLGINWVNSGDYAEYTVNVATAGVYDINYMISTPTDNAQIQVLVDGNVVTTDNVPNNGQW
DAYTSLMASNTVNLSVGTHTVRFVASGSNAWQWNLDKVILSTGSSSSRQIGQELVGPKMN
IYPNPSSEVINLGGIANGTYMVALYNVNGQEIYNTKIDFRYSHQFNVSTLPAGIYLIRIV
GEGVDLKQRISVKK
NT seq
5985 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaactattttacaatgttccgcagaagattttatctcattcttctgttggtttcttgt
gtgttcgcaaccaatgcacaagacgtcaatgtagacgtaaacttgaacatcaaacactcc
gtaaatggagcctctgaatttaacagagaaaattacatgacacttcacgcgaccgctttc
gaaacagattgggacggtgaagaagacaagttggattatcttttgaatgaccttgatacc
tattttggtcgtgataacggttctgctacttggaagttctcagcaacagaagaagatcct
aatcgtccaaattggccctcagaggatcatatggttgaattgggaacttggttaagaggt
gagtacgacaaggacttcaactctcaccaattcgaagcaagatcgaaagaaatgattatg
ggtacgaaccctcacccgacttatccaacgctaagctggaatggtgatggtaatacttgg
acaggttggcaaccttatgatgttgatgtatcagcagagtgggtagtaaactatttagat
tactttttccgtaaagcggatggttctccgggtgagccactgccttactattgggaggta
attaacgagccggatatgccgatgatgacaggtcatatgacgtgtacatcacaagaaaaa
atttgggagtatcataatcttgtggctttaggtatcagagagcgttttggtgtaaataac
cctaatcgccctaaggtaggtggtatgacttggggacttcatgatttccatttagcagat
ggtatttctcgttacgacgaaaattacttggatcaatacttagatggagaaggtttaatt
acttaccacaacatgatggattcagaagccaacgattacagaacaactccttggtatcaa
tgggatgtaatgtggcagggttttatggatacttgtggtgagaacatggacttctattct
atccatatttacgactggccaggttgggatttaaatggtgatgataagccttcggcaact
agagcaggtggacatacagaagccatgttggatatcttggaatggtatgatttatataaa
acaggtacaagaaaagaaatgattgtatctgaatttggtgctgtaaacggtgggtataac
actcaaaatacaccaggtagatttgattcgaaaagaattgattgggagtgtttaaagcct
ttcaactcaatgttcatgcaattcttggagcgtccggattacattacaaaatcgatgcct
tttacacctacaaaagcgatttggggtgatacgccagatcaaaacttacgttatccatat
gcgatgatgcagccggatgcaaatggtgtttggcaatggtcggagtacatcaaattcttt
gagctgtggagtaatgtaaagggaacaagaatcgagacaaaagcttcgaaccctgatgtt
caggtaaatgcttacgcggatggaaataagttgtatttaattttgaataacttagaggac
aacgaaaagacgatcaacttagcgatgtatgatgatttcgctaacccagtacagaatgtc
atgattaagaacttatatcttgatatgaacaaagggactgcaggtcaacctgcattggat
gtgattaatgtgaaaacggctccaggttcagttaaattattgaacgatgcaacaatggta
ttggagtacacttttaccaacccagtgaacttgagcgagacattaaacgaaacgaagttt
atgggtgataaaatcggtgacggtttccatccattcggtagcgagttgattcataaaaac
agtactacattaacgactcaagtaaacaatgtagtggtgccaagtggtgcttacgaagca
acattaagagtttctggtgcgttcttcaaggcgcatttaagctctgtaaaagtatcaata
aacggtgttgaaattcagcacgatggcaactggagaggtgcaatggaagatttaagaaac
caatggttaggtgtacttgaattggatatccctgcaggtcttttacaagcaaataatacg
attgagtgtcaatcaaatgctccggtagattgggcaacaacccaaatccaagtatttgat
ttctcaaaagagccaggtcgtagtggtgtcaatacagtggcattaacttcagtatcatta
agtggtgatcaagaattaatgcaaggtaaagaaacttctttagctactactttcgctcca
gagaatgcgacgaataaagcgttaacatggacatcaagtaatccttctgtagcaacagta
gacgaatttggtgtaattacagcggtagcaacatcaggttcagcaacaattacagcaact
agtgcagacggtagtgtatcagcagcacatacaatcaatgctattccattctctgccact
ccagtggcatcggtaagtattaacgaaggtacttctgtagatgcggagttttatgtatat
actccattaacggtgacgattactcctgaagatgcaacagatcaggaagtagtttggtca
agttcaaatcctgaagcagtagcagtaaatgcttctactggtaaaattcaaggtttaatt
attggtgagtctgcggtgattacagcaactgtaggaggaaaatcgacttcgacgactgta
aatgtaggtattgttggtgatgaagaaatctattgtgatgctttaccatcagaggtaaca
gggaatacaaactatacatttgatgtatctgtgaacttattaggttctagagaagtgaaa
gtagaattattatcaggtgcaacggtattaggtagtggttcgactgtagcagacgtgaaa
ggtaaagagtttatttctgtggatttagcattatcgaatgttccatcaattggtaattat
acattaagagtaacagcattaaacggtggtcagacagtcgctcaatgtacgtcgacttta
tctattttagatagaatcagaccatcaagcatcactttagtggattggttaagagaagtg
gaagtaggacaaacgttacctattgctgctgaagtattacctgttgatgcctacgataaa
acagtactttggacttcgtctaatcctgcagttgcctctgtttcagtggatggtacaatt
acaggtgctgctttaggttctacagttattagaggtactttacaagatggtggtttgtat
caagaagtaacagtacaagtgaaaaaccaagtggtagttcagcctacatccatccaaatt
ccttctgatattaccgttttccctggagggaacttccaagttactcctgtttttgttccc
gaatggacaacagagaaagatatcaattggtctattgatggttcaattgcaagtgtagat
gctaatggagtgattacagctactactactcaaggtacagtcactttaacagctacttca
tcgactagtccggctgtttctacgacgagtgctgtaactgtaggtacaactttaacggtt
gaagcagaatcgttctcggcaatgggtggtgcagttggtgaaatcggaatttatgattta
gcctcagcttctaaaggtcaggcaatcaataatgttcaagcaggtgattttgtagagttc
gaagtatttgtacctcaagcaggacagtatagagctactttctttgctggtacaggtttg
gaagacggtgttattgagatgtatgtaaacggatcaagtcaaggttcgaaacaagtacca
atgaacgattgggatgcgtttgcagcggtaacacttgatcaagatgttacacttccacaa
ggaacggtaactattggtttagtagcatcaggtacatcagattggcaatggaacatggat
tacttccaattggcattccaaggaggtgattgtggtgcagtaactggagtaactattaac
gcttcgtcaacgacaattactattggaaacaatttaacattaggggctaatctacaaaca
gcgggtggtgcaattccatgtaataactcaattgtttggacttcttctaacacaaatgtg
gctacagtaaataatagtggacaagtaacaggtgttgcagcaggtaatgtaactattacg
gctacggcaagtggttttacagcaacacaaaacttaactgttcaagaggtattagtcact
ggagtagtagtttctccatcagatgtacaacttaatgtaggtggtagccaacaattaacg
gctacagttgctcctacgaatgcttcaaataaatcggtggtatggagttcttctaaccct
gcagtcgctacggtatcaaacactggtcttgtttctgcagttaccaatggatctgctgtg
atttcagcaacaacagtttcaggtacttttgtagcatcagcgaatgttgaagtaagtaca
gtgataactggtgtaacaggagtttcgctaaatacaacatcactaaatctagtagttgga
aatacgggtcagttagtagaaacagtacttcctgcaaatgcgtcgaataaagcagtaact
tggtcatcttctaatacttctatcgcaacagtagctaacggtattgttacagctgtatct
caaggtgaagctacgattacagtaactactgaagatggaaatcacatagcatcagcaaca
gtaaatgtaactgaagtgggggatcctgaacagttgattattgaagcagaagattttgta
gctaccggaggtaattacaacgacggtttcgttcctttcggcgcaaataaagtagatgga
ttaggcattaactatgtcaattcaggtgattatgttgaatatacagtcactggaaatggt
gtttatggagtagattattatatctcaactcctttggataatgctgctatcgaaattcaa
ttagatggtcagtcgataggatctgataatgtgcctaacaatggagaatgggataactat
actttattaacttctgcacatcagttgacattatcgggaactcacacgattcgtttggtg
gcttcaggatcgaatgcttggcaatggaacttggataagattgtgctgaatcctgtttca
ggtggaggagatgttaatgtaacaggggtaacactatcagctacttctttaacattagat
ccatctcaaacagcttctttagttgcagatgttcagcctgcaaatgcaacaaatcaatcg
gtgacttggacttcggataatacatcagtggctacagtagacaataatggtttagttaca
gctgtaagtgcaggtgctactacaattacagtgtctactgtggatggaaattatcaagca
tcagcttctgtaactgtaaatggaggaagtgccactttagtgatcgaagcagaagatttt
gtatcaacaggtggtacgtataacgatggatttgttccgttcggtgtaaataaagtaaat
gatttaggaattaactgggtgaactcaggtgattatgctgaatatactgtaaatgtagca
acggcaggagtgtatgatattaattatatgatctctacgccaacagataacgctcaaatt
caagtacttgttgatggtaatgtagtcactactgataatgtaccaaataacggtcagtgg
gatgcatatacttcattaatggcatcaaatactgtgaatctatctgtaggaacgcatact
gttcgtttcgtagcatcaggttcgaatgcatggcaatggaacttagataaagtgatctta
tcaacaggttcttcttcttcaagacaaattggtcaagagttagttggtcctaagatgaat
atctatcccaacccatcttctgaggtgattaacctaggtggtattgctaatggaacgtat
atggttgcattgtataatgtaaatggtcaagaaatctataacacgaagattgactttaga
tattctcatcaattcaatgtaagtacgttgccagcaggtatctacttaattagaattgtg
ggtgaaggtgttgatttaaaacaaagaatttcggtgaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system