Flammeovirga yaeyamensis: KMW28_25950
Help
Entry
KMW28_25950 CDS
T07356
Name
(GenBank) gliding motility-associated C-terminal domain-containing protein
Organism
fya
Flammeovirga yaeyamensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
CHU_C
DUF4114
Cadherin_5
Cadherin_4
FlgD_ig
Aida_C2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QWG04341
UniProt:
A0AAX1NBI8
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(1543386..1546574)
Genome browser
AA seq
1062 aa
AA seq
DB search
MKKKQKIVILLLVTLSCVVMGFGIMAAYTYKVLGDNPNALESWNDQGRPEGTYVVGTATT
PIAETIALQTLVMDTIASGSTTFLQENNNNFIVLDDGDVYLTLSYEDAEWFNTLGFYTYN
YLNPPTVPADIENTKTIIFPKLDTENTINNGFRLHLGYFTKGTVIGFFIVSQGWDPFAGN
KIDAITSGRYTLHSNENLNANVVSPGGLHINFLQHFVIFDYKETPENDYILCVEDNMEEP
DYDYNDAVFYVRSNPIPNITTWDGIINTPIVARDTIIGALSNVTLPFNLQDLITDEDPSG
VTYTILEKTNNNFTVAEGFPNINITTPSLVWVSDTVKYIACDQGFPSACDTANIVIQYSN
TNVPPIAVDNYAIPLTQNIIDNGVPITTLGVDPDNNLDPNSITIISNSDLTLPVTSDGAS
LQINPSDTWTGSATVAFQICDTEGACDNGSVVITRAEINQQIVARDTIINVQPNVVSNFL
VTNLVEDDGDIADVTIRVDSLSNPNMFINTFNVPTIKVMGILGYMELDTVYYTACDNGSP
QTCDNGIIVVRTQSENNNPPVAQDNLLIPLSPDILLNGIPVTTLGTDPDGNLNIRLIEVL
NTPDVGLNLVNNNGIISLSPNGDYLGSDTIEFRICDSGSPALCDEGSFIVQTLETPPTAN
PDVINTFPNEGVIINPLINDTEGSDPISPATLTIIQQPLSDTAIVRIVDGKVENITDPDF
IGSYQIIYQICDNTIPALCDTSTITVNVQDPAGPNLITSTNTPPLALNDTVDVPFNSTVN
IVVLPNDSDSDGEIDSIRTSIVVPPISGSASLNYFNNTPIITYTPNDGFTGVDVLTYRIY
DKDNPQLSDVALVIIHVADESGVITSVNTDFWIDTVTVNQGATYCMPIQDRLDENSLTWN
PINADPLVNGKVENSLTAIDNSNVCYTVPQELIENDTIDHVYYTVCNNEGDCRNGLLVIN
INQCENCVDSEEPNLSFYSGFSPNGDNINETFVIEGVTNYQDTDLIIYNRWGQPVYNTSP
YQNQWEGNNNDGQPLPDGTYYYILKVRVPKEYSYNGFVVIKR
NT seq
3189 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagaaacaaaaaatagtgattcttcttttggtaaccttaagttgtgtggtcatg
ggatttggtataatggcagcttacacatataaagtactgggtgataatccaaatgcatta
gaatcttggaatgatcagggtcgacccgaaggcacttatgttgtgggtacagccacaaca
ccaattgcagaaactatagcgttacagactttagttatggataccatcgcaagtggaagt
acaacatttttacaagaaaataataacaactttatcgtattggacgatggagatgtatat
cttactctatcatatgaagatgctgaatggtttaatacacttggattttatacttataat
tacttaaacccaccaacagtacctgctgatatagaaaataccaaaaccattattttccca
aaattggatactgaaaacactatcaataatggttttagactacatttaggatatttcaca
aaaggtacagtaataggattcttcattgtctcccaaggttgggatccttttgcgggtaat
aagattgatgcaatcacatcaggtcgttatactctacattctaatgaaaatctaaatgct
aatgttgtttcaccaggaggtttacatattaatttcctgcaacattttgtcatatttgat
tataaggaaactcctgaaaatgattatattctttgtgtggaggataatatggaagaacct
gattacgactataatgatgctgtattttatgtgagatctaacccaattcctaacataact
acttgggatggtataattaatacacctatcgttgctagagatactattattggtgcatta
tcaaatgtaactttaccttttaacctacaagatctaataacagatgaagacccaagcgga
gtgacttacactattttagaaaaaactaataacaactttactgttgctgaaggttttcct
aatataaatattacaacaccaagtcttgtttgggtatcagacactgttaaatacattgca
tgtgatcagggttttccttcagcatgtgatactgcaaatattgttattcaatactcaaat
actaatgtacctcccatagcagtagataattatgctataccattaactcaaaatataatt
gacaatggtgttcctattactactttaggtgtagatccagataataatttggatccaaat
agtataaccatcattagtaattcggatcttactttaccggttacatcagatggtgcatca
ctacaaataaacccatctgatacatggacgggatcagctacagtagcatttcaaatttgt
gatactgaaggagcatgtgataatggcagtgttgtgatcacaagagcagaaataaatcaa
caaatcgttgcaagagatactataataaacgtacagcccaatgttgtatcaaatttcctg
gtcacaaatttagtagaagacgacggagatatagctgatgtaacaattagagtggattca
ttatcaaacccaaatatgtttatcaatacttttaatgtaccgaccattaaggtaatgggt
atcttgggttatatggaattggatacagtatattacacagcatgtgataacggttctcct
caaacatgtgataatggtattattgtggtaagaacacaatcggaaaataataacccgcca
gttgcacaagataatttattaattccattgtcacccgatattttattaaatggtattcca
gtaactacattaggaactgatcccgatggtaatttaaatattcgattaatagaagtttta
aatacaccagatgtagggttaaacctagtgaataataatggtataatatcgttaagtcct
aacggtgattaccttggtagtgatacaattgagtttagaatttgtgattctggttcgcct
gcattatgtgatgaaggatcgtttattgttcaaacattagaaacgccaccaacagcaaat
ccagatgtaataaatactttccctaatgaaggggtaatcattaaccctttaataaatgat
actgaaggttcagatccaatatcaccagcaaccttaacaataatacaacaacctttatca
gatactgcaatagttcgtattgttgatggaaaagttgaaaatattacagatcctgatttc
atcggttcttatcaaataatctatcaaatttgcgataatactattcctgctttatgtgat
acatctacaattacggttaatgtacaagacccagcaggaccgaatttaatcacatctact
aatacacctccgttggcactaaatgatacagtagatgtaccattcaactctactgtaaat
attgttgtgctaccaaatgacagtgattctgatggagaaatagatagtataagaacaagt
attgtagtgcctccaatttctggttctgcatcactaaattattttaataatactccaata
ataacttatacacctaatgatggatttactggggtagatgttcttacctatagaatttat
gataaggataatcctcaattatcagatgtggcattagtcataattcatgttgcagatgaa
tcaggagtgattacttcagtaaatacagacttttggatagataccgtaacagttaatcaa
ggtgcaacttattgtatgcctatacaagatcgacttgatgaaaacagtttgacttggaat
cctatcaatgctgatccattagtaaacggtaaggtagaaaattcattaactgcaatagat
aatagtaatgtatgttatacagtacctcaagagttaatagaaaatgatacaattgaccat
gtctattatactgtttgtaataacgaaggagactgtcgtaacggcttattggtcattaat
ataaatcaatgtgaaaattgcgttgattccgaagaacctaacctcagtttttattctggt
ttttcaccaaatggagataatattaacgaaacatttgttatagaaggagtgactaattac
caagatactgaccttattatttacaatagatggggacagcctgtttataacacaagtccc
tatcaaaaccaatgggagggaaataataacgatggtcaacccctaccagacggcacttac
tattacatattaaaagtaagagtacctaaagaatatagttataacggctttgttgtcata
aaaagataa
DBGET
integrated database retrieval system
