Flammeovirga yaeyamensis: KMW28_27995
Help
Entry
KMW28_27995 CDS
T07356
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
fya
Flammeovirga yaeyamensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fya00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fya02000
]
KMW28_27995
Transporters [BR:
fya02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
KMW28_27995
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
TTR_TEN1-4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QWG04744
UniProt:
A0AAX1NB83
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(2084146..2087244)
Genome browser
AA seq
1032 aa
AA seq
DB search
MNTRLLLLSFTLLLVLFSGQTFAQDSERVLKGKVVDQDNNSLPGVSIILKGGKGNKGTIT
DFDGNYSLLVKSTDILMFSFIGCKTQEVAVGNQTTLDVQLMEEASQLDEIVVVGYGSVKK
SHLTGAVSKVKNENLDQIPTARIDDALSGQVSGVNIQQTNPTAGEAPTIRVRGVGSITSF
PSPLIVVDGIVVDQDYLATLDMNDVESIEILKDASSAAIYGSRGANGVIMITNKQGKEGK
AKFSYNGYFGVKSVPKNDVLKTVGEWTSFVQDNNNGELTDRMKYIQQLGTETAWDDVVMD
GGTIQSHSLSARGGTERTKYSISGNYLKDEGVLLTDSYDRINFRLNVQTKVNKRLTFGLN
VNPSYSNQREFPIGLHDAIRQSPWLPQYIDENSINYVNRLRESGRWADTQVGDYAMERMF
DDYDLTNGMPVESGGTDISTTSNVSPISKILERERRKYKTKIFSNIFLKYKIADGLNFKS
SFGGDYRNQRDARFVGLKATRNAEAGTEAYDRRQNEFHLVTEQTLDWNKSFGHHSFSAVG
GFAFEFWDYNSSTIEAAGYNFDYVKTIPQTNVTAAETYANQKSLVSFFGRANYAYNDKYL
VSLSVRSDGSSKFGDNYKYGVFPAASVGWRISQENFLKDSELISNLKVRMSYGVSGTDGD
DRIIGRYPAIGLVSPVGSVLDGNIYSGFNQTSLSNPELRWERSIEINPGIDIGLFKDRLS
VSVDLYKKNSDDLLLRRPIASASGFEEAIVNLGEVENRGVEFEVRTTNIVTKDLKWSTTA
NMSLNENKIVSMAGADGIISTVDPKRPAEWIAKEGHPVSSFYGYVVEKEIPLENIKNPFY
PINGQSQDIYVKDLNGDGIIDPDDRTILGSPYPKLIWSVTNSVNYKSFDLSFMFQGSHGA
KVRNMDPQYVNNQFSSNQDYITDETDPNFFQDADKVVQRIFTDDIVMDASYITLRNLNVG
YTLPKGPLNKVGISSMRVYVAAQNLIYIMGSDYRGYNPEGINQGLDSPLTYGYQRGAAPI
HRTFSAGINLNF
NT seq
3099 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacacaagattattacttttatcatttactctcttgctagtacttttttcaggacaa
acattcgcacaagatagcgagcgtgtcttaaaaggcaaggtagtcgatcaggacaacaat
tcacttcctggcgtttctattattctcaaaggaggtaaaggaaacaaaggtacaattaca
gattttgatggaaattattcacttctagtaaaatcaacagacattttaatgttttctttt
atcggttgcaaaacacaagaagttgcagtgggtaatcaaactacattagatgtacagttg
atggaagaagcaagtcaactggatgaaattgttgtcgttggttatgggtcagttaaaaag
tcacatttaacaggagcagtttctaaagttaagaatgaaaacttagatcagattcctact
gccagaattgatgacgctctttctggacaagtttctggtgtaaacattcagcaaactaac
cctacagcaggtgaggcaccaacaattagagtgaggggtgttggttcaatcacttcattt
ccaagtccactaattgtagtagacgggattgttgtagatcaggattacttggccactttg
gatatgaacgatgtagaatcgattgagattttaaaagatgcatcttcagcagccatctat
ggatcaagaggtgcaaacggtgtgatcatgattaccaataagcaaggtaaagaaggtaag
gccaaatttagctataatggttactttggtgtgaaatcagtaccaaaaaatgatgtattg
aaaacagtaggtgaatggacttctttcgttcaagataataataacggagaacttactgac
cgtatgaagtacattcaacaattaggtactgaaacagcatgggacgatgtagtgatggat
ggtggtacgattcaatcgcactcgttatccgcaagagggggaacagaaagaacaaagtat
tctatctctggtaactatttaaaagacgagggtgttttacttacagatagctatgacaga
atcaacttccgtttgaacgtacaaacgaaagtaaacaaaagattaacgttcggtttgaac
gtgaacccttcttacagtaaccaaagagaattccctatcggattacacgatgcaattaga
caatcaccttggttgcctcagtatattgacgaaaactctatcaactatgtaaatagatta
agagaaagtggtcgttgggcagatacacaagtaggagattacgctatggaaagaatgttt
gatgactacgatttaacaaacggtatgcccgtagaaagtggtggaactgacattagtaca
acatcaaatgtatctccaatatcaaaaattttagaaagagaaagacgtaaatacaagacg
aagatcttctcaaatatctttttgaaatataaaatcgcagatggcttaaactttaaatca
tctttcggtggagattacagaaaccaaagagatgcaagatttgtaggcttaaaagccaca
agaaatgctgaggcaggtacggaagcttacgatcgtcgtcaaaatgaatttcaccttgta
acagaacaaactttagattggaataaatcatttggtcatcattcttttagcgcagttggt
ggatttgccttcgagttctgggattataatagtagcacaatcgaagctgcaggatataac
tttgattatgtgaaaactatcccacaaacaaacgtaactgcagcggaaacatatgctaat
caaaagtcattagtttcattctttggtcgtgccaattatgcttacaacgataagtattta
gtttcattaagtgttcgttcagatggtagttcaaaatttggtgataactacaagtatggt
gttttcccagcagcttctgtgggttggagaatttcacaagaaaacttcttaaaggatagt
gaattgatcagtaacctaaaagtgagaatgagttatggtgtttctggtactgatggtgat
gacagaattattggtcgttaccctgcaattggtttggtttctccagtaggttctgtatta
gatggcaatatttattcaggttttaaccagacttcattatctaatcctgaattaagatgg
gaacgctcgattgaaatcaaccctggtattgatattggattatttaaagatcgtttaagc
gtaagtgtagatctttacaaaaagaattcagatgatctattattacgtcgacctattgct
tcagcttctggatttgaagaagcaattgtaaacttaggtgaagtagaaaatagaggtgtt
gaatttgaggtaagaacaacgaacatagttactaaagatctaaaatggtcaactacagca
aatatgtcattaaacgaaaataaaatcgtaagcatggcaggtgcagatggtattatttca
actgtagatcctaaacgaccagcagaatggattgcaaaagaaggtcaccctgtatcatct
ttctatggttatgtggttgaaaaagagattccattagaaaatatcaaaaatcctttctat
ccaatcaatggacaatcgcaagatatttatgtgaaggatttgaatggtgatggtattatc
gatccagatgatagaacaatcttaggatcaccttatcctaaattaatttggtcggtaacg
aactcagtaaactacaagagttttgatttaagcttcatgttccaaggttcacatggtgct
aaagttagaaatatggatcctcaatatgtaaacaatcagtttagttctaatcaggattat
attactgatgaaacagatccaaacttcttccaggatgcagataaagtggttcaaagaatc
tttactgacgatatcgttatggatgcttcatacatcacattaagaaacttaaatgttgga
tatacgttgccgaaaggacctttaaataaagtgggtatttcttccatgagagtatatgta
gcagcacaaaacttaatttatatcatgggtagcgattatagaggttacaatcctgaaggt
attaaccaaggattagattcaccactaacttatggctaccaaagaggtgcagctccaatt
catagaacattttcagcaggtatcaacttaaacttctaa
DBGET
integrated database retrieval system