Gossypium arboreum (tree cotton): 108460694
Help
Entry
108460694 CDS
T05776
Name
(RefSeq) pumilio homolog 4
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
gab
Gossypium arboreum (tree cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108460694
NCBI-ProteinID:
XP_017615773
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(805564..813353)
Genome browser
AA seq
1029 aa
AA seq
DB search
MVTGSNIDMLPTMDNGFEIPSGSLEESLTELELLLRARHNQQSVGRDRDLNIYRSGSAPP
TVEGSLSAVGSLFAYPDFGDNNGISGVGDSTTGNNGMLSEDEIRSHPAYLSYYYSHENIN
PRLPPPLLSKEDWRVAQRFQASGSSSGNIGDWRKKKLVDGGDSSSLFSMQPGLYVQQGQN
DLMELRNANARNMSRKMSAEWLDRGPDGLAPLSGTGIGARRKSFADILQGGLDRPAILTG
HLSRPASRNTFSDMLDVASIADPSPPGFGSGAESLEGLPAGVAHLKSHGKTTSHSFASAV
GSSLSRSTTPEQHLVGRSPGSGLPPVGSKVSLVDKKNIVGSNAQNGHSSAVPELAELAAT
ISGLNLSKTRHADENSHMRSHLQADLGNQLNFPLSMPNGHSHSVQQQFIDKSSAEKLSFS
PNYIDFAREKGIAPNINASKISSNGEVRIPKRTSSSADLYAKVHPSGFGSLEGSDVAHPN
VNLLNTDFIGRLPGAYSVNQKLNSAVKNNLSAGSSLTGTGDRQSSNRAGNQGSDLLSPLV
DPRFIQYLQRTSYGTTAASPDSLLAGNHGGTLHGDLDGLQKAYIEAILAQQKQQYELSLL
GKAGGLNQGYYGNSSYGLGMPYAGNPLANSVLANIGSGSIQNDRTARFNSMMRSSSGSWH
SDISSSMDGRYVSSLLDEFKNNKTRSFELLDIVDHVVEFSTDQYGSRFIQQKLETATEEE
KIKIFPKIIPHARALMTDVFGNYVIQKFFEHGTESQRVELATQLTGHVLPLSLQMYGCRV
IQKALEVVNVDQQTRMVAELDGSIMKCVHDQNGNHVIQKCIECVPQDRIQFIISAFYGQV
VALSSHPYGCRVIQRVLEHCNDAKTQQIIMDEIMQSVCTLAQDQYGNYVIQHVLEHGKPH
ERSTIISKLAGQIVKMSQQKFASNVVEKCLTFGGPQERQILVNEMLGSTDENEPLQAMMK
DQFGNYVVQKVLETCDDQNLELILSRIKVHLNGLKRYTYGKHIVSRVEKLIATGERRIGL
LSSLSSLSS
NT seq
3090 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttaccggcagtaacatagatatgctaccaacgatggataatggttttgaaatacct
agtgggagtttggaagagagtttgactgaactagaattgcttttgcgagctcgtcataac
caacaatctgtgggtcgtgacagggatcttaacatatatagaagtggcagtgcgccaccc
acggttgagggatccttgagtgctgttggtagtctttttgcctatcctgattttggagac
aataatggtatcagtggtgttggtgatagtactactggcaataatggaatgctgtctgaa
gatgagatacgctcgcatcctgcatatctttcatactattactcccacgaaaacataaat
ccaaggctgcctccaccattgttatcaaaagaggattggcgagttgcacaaaggttccag
gctagtggctcttccagtgggaacattggggactggagaaagaagaagttggttgatggt
ggtgatagttcatcattattttcgatgcaacctggtctttatgtgcaacaaggacaaaat
gatttgatggaactgaggaatgccaatgcaaggaatatgtccaggaagatgtctgctgag
tggcttgatagaggcccagatggtttggctccactgtctggtactgggattggtgcaagg
aggaagagttttgctgacattcttcagggtggacttgatcgacctgccatcttaactggc
cacctgtcaaggccagcaagtcgaaatactttcagtgatatgttggatgtggctagcatt
gctgatcccagccctcctggttttggtagtggagcagagtccttggagggcttgcctgct
ggtgtagctcatcttaagagccatggtaaaaccacttctcactcttttgcctctgctgtg
ggttcttcgctatcaaggagtacaactcctgaacaacatttagttgggaggtctcctggt
tctggacttcctcctgttgggagcaaggtcagcctagtagataaaaagaatattgttgga
tcaaatgctcaaaatgggcattcgtctgctgtgcctgaacttgctgaacttgcagctaca
atatctgggttgaacttatcgaaaactagacatgcagatgagaatagccacatgcgatct
catcttcaggctgatctgggtaatcagctgaattttccattaagcatgccaaatggtcat
agtcatagtgtgcagcagcaattcattgacaagtccagtgctgaaaagctctcattttct
ccaaactatattgacttcgcaagggaaaaggggattgcacctaatattaatgcttctaag
attagttccaatggggaagtcaggattcccaaaagaacttcctcttctgcagatctttat
gcaaaagtgcatccttctggatttggaagtttggaaggatctgatgttgcacatcccaat
gtgaatcttttgaacacagatttcattggccgtctacctggtgcttattcggttaaccag
aagctaaattctgcggttaagaacaatttaagtgcaggttcctccttgactggtactggt
gataggcaaagttcaaatagagcaggaaatcaagggtctgacctcctttctccacttgta
gatcctcgttttatccaatacttacaaagaacttcttatgggacaactgcggctagtcct
gattctttgcttgctgggaaccatggtggtactttgcatggggatttggatggccttcaa
aaggcatacattgaggcaatactagctcagcagaagcagcagtatgaattgtcgctttta
ggtaaagctggtggtctaaatcagggctattatgggaattcttcatatggtctcggcatg
ccatatgctggaaacccactggcaaattctgtacttgcgaacattggttctgggagcata
cagaatgatagaactgcacgttttaattcaatgatgagaagctcatcagggtcatggcac
tcagatatcagtagtagtatggatggaagatatgtatcatctttattggatgaatttaag
aacaacaagactaggtcttttgaactcttagacattgttgaccatgttgttgaattcagt
acggatcagtacgggagtcgctttattcagcagaaattagaaactgccacggaggaagag
aagatcaaaatatttcctaagattattccccatgctcgtgctttgatgactgatgtcttt
ggaaattatgttatacagaaattttttgagcatggtacagaaagtcaaagagtggagtta
gccactcagcttacaggtcatgtgttgcctcttagccttcaaatgtatggttgcagagtg
attcaaaaggctttagaagtggttaatgtggaccagcaaaccagaatggtggcagagctt
gatggttcaatcatgaaatgtgttcatgatcagaacggtaatcatgttattcaaaagtgt
atagagtgtgtccctcaggaccgaattcaatttatcatttcagctttctatggccaagtg
gtggcgctttcttcccacccttatggttgtcgtgtcattcagagggtgctggaacattgc
aatgatgcaaaaacccaacaaatcattatggatgagatcatgcaatctgtatgcactcta
gcacaagatcaatatgggaattatgttattcagcatgttcttgaacacggtaagccacat
gagcggtccactatcatcagcaagcttgctggacaaattgtgaagatgagtcagcagaaa
tttgcttctaatgtcgttgaaaagtgcttgacttttggtgggccacaggaacgacaaatt
ctggtcaacgagatgcttggttcaaccgatgaaaatgagccattacaggctatgatgaaa
gatcaatttggaaactatgtcgtgcaaaaggttctcgaaacatgcgatgatcaaaatctt
gagttgattctttctcgaatcaaggtccatttaaatggcctgaagaggtatacttacggg
aaacatattgtttcccgtgttgagaagcttattgcaactggagaaaggcgtataggatta
ctatccagcctatcctcattgagctcctga
DBGET
integrated database retrieval system