Gossypium arboreum (tree cotton): 108464334
Help
Entry
108464334 CDS
T05776
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: probable methyltransferase PMT5
KO
K23870
putative pectin methyltransferase [EC:2.1.1.-]
Organism
gab
Gossypium arboreum (tree cotton)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gab00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09191 Unclassified: metabolism
99980 Enzymes with EC numbers
108464334
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Methyltransf_29
Methyltransf_11
Methyltransf_25
Methyltransf_31
Methyltransf_12
Methyltransf_23
Anamorsin_N
MTS
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108464334
NCBI-ProteinID:
XP_052880549
LinkDB
All DBs
Position
13:29822282..29828091
Genome browser
AA seq
655 aa
AA seq
DB search
MLFTVLGDLSAKGVDCLVAFQSLKFKVLDMRSPLLNKLSVIFGPRPPVSWLLLCFVSVLA
LIAVFGSSSSNSFDSVTSTPVPEIFTNYRRLKEQAAVDYFELRTILSGSSRQRELGLCCK
ERENYVPCYNVTANLISGFKDGEEFDRRCEVPRQGSWCLVRPPKDYKIPLRWPAGRDVIW
SGNIKITKDQFLSSGGVTKRIMLLEENQIAFHPEDGLIFDGVKDYSRQIAEMLGLGSDSE
LFQAGVRTVLDIGCGFGSFGAHLVSLKLMTLCIAAYEATGSQVQLALERGLPAMIGNFIS
RQLPYPSLSFDMVHCAQCGIVWDKKEGIFLIEIDRLLKPGGYFVLTSPTSKPQGSSTSMK
KRNMLTPLEQYTEKICWSLIAQQDDTFIWQKTADAHCYSSNKKNDVPLCKEGYDAPYYQA
LVPCITGTSSKRWIPIQNRSSSSDLSSAELEDIDVGXSCAGVSPEDFFEDLQVWKLALKN
YWSLLTPLIFSDHPKRPGDEDPLPPFNMVRNVMDMNAHYGGLNAAFLEERKSVWVMNVVP
VRAHNTLPLILDRGFLGVLHDWCEPFPTYPRTYDLLHANGLLSHLTSERCGLMELFIEMD
RILRPEGWVVLSDKLGVIELARAHATQIRWDARVIDLQNGSDERLLVCQRPFVKK
NT seq
1968 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttttcacagttcttggagacttaagcgctaaaggggttgattgtttagtggctttc
caatctttaaagtttaaagttttggacatgagaagccccttgctcaataaactatctgtt
attttcggtcctagaccgcctgtcagttggttgttattatgctttgtcagtgtgcttgcg
ctgattgcagtctttggatcatcgtcttcaaattcatttgactctgtaacttccactccc
gtacctgagatctttacaaactatagaaggctaaaggagcaagcagcagttgattatttt
gagttgagaactatcttgtcaggatctagtcggcaaagggagcttggcctttgttgcaaa
gaaagagaaaattatgtaccttgttataatgtaactgcaaatttgatatcagggtttaaa
gatggagaggagtttgatcgacgttgtgaagtgccaaggcaaggaagctggtgtttagtt
cgccctccaaaagattataagattccactccgttggcctgctggtagggatgtgatatgg
agtggaaatatcaagataacaaaagaccaattcctttcgtctggaggcgtgacaaaaaga
atcatgttgctagaagagaatcaaattgctttccaccctgaagatggcttaatctttgat
ggtgtcaaagattattctcgtcagattgcagagatgttgggactgggaagcgactctgaa
ttgtttcaagccggagtacgcactgtacttgatattggttgtggatttggaagttttgga
gctcatttagtttcactgaagttaatgactctttgtattgccgcatatgaggcaacggga
agccaagttcagctagctcttgagagaggtcttcccgcaatgattggaaacttcatatca
aggcaactgccatatccatcattatcatttgacatggttcattgtgctcagtgcggtatt
gtttgggacaagaaagaggggattttccttatagagatagatcggttactcaagcctgga
ggttattttgttttaacctcaccaacaagtaagccacaaggaagttcaacaagtatgaag
aaaagaaacatgttaacaccactggaacaatatactgaaaaaatttgttggagtcttatt
gctcagcaggatgatactttcatctggcagaaaacagctgatgctcattgctattcttct
aacaagaagaacgatgtacctctttgcaaagaaggatatgatgcaccctattatcaggcc
ttggtaccatgtattactggaacttccagcaaacgctggattcctattcagaacaggtcc
tctagctcagatttgagctcagcggagcttgaagatattgatgtaggttaatcttgtgca
ggagttagtccagaggatttctttgaagacttgcaagtttggaaattagctttaaaaaac
tattggtctttgcttacaccattaattttctctgaccatcccaagaggccaggagatgaa
gatcctttgccaccatttaatatggtacgcaatgtgatggacatgaatgctcattatggg
ggtttgaatgctgcatttctggaggaaaggaaatcggtgtgggtgatgaatgttgtgcct
gttagggcacacaatacgcttcctctcattcttgaccggggttttcttggtgttttgcac
gactggtgtgaacccttcccaacatatcctcgaacgtatgatttgcttcatgcaaatggg
ctcctctcacatctcacttcagagaggtgtggcttgatggagttatttatagagatggat
cgaattcttcgtcctgagggctgggttgtgctctctgataaattaggagttatagagttg
gcacgtgcacatgctacacaaatacgatgggatgcaagggtgatcgaccttcagaatggt
agtgacgagcgcctacttgtttgtcagagaccttttgtgaagaaatga
DBGET
integrated database retrieval system