Gossypium arboreum (tree cotton): 108474267
Help
Entry
108474267 CDS
T05776
Name
(RefSeq) piezo-type mechanosensitive ion channel homolog
KO
K22128
piezo-type mechanosensitive ion channel component 1/2
Organism
gab
Gossypium arboreum (tree cotton)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gab00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
gab04131
]
108474267
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
gab04040
]
108474267
Membrane trafficking [BR:
gab04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Others
Others
108474267
Ion channels [BR:
gab04040
]
Other channels
Mechanosensitive channel (Piezo)
108474267
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Piezo_cap
Piezo_THU9_anchor
THU_Piezo1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108474267
NCBI-ProteinID:
XP_017631707
LinkDB
All DBs
Position
11:complement(13335474..13352834)
Genome browser
AA seq
2476 aa
AA seq
DB search
MGNFLAGFLLPLLLLTAALSNWSLISLVDLVAFLLIQYTAPKIGFRFRRQYLLLWPVIIF
SLLVFSSQAVYLVVWAVEGYKQSVGEAWWMKLIGFMIIQSWKSPTVIYFLAVQLLVVIVA
VLDIHDNRFGLVQWRCSCWSHFLTAIERLGSHLRVTSCLLLPPIQLVAGISHPSWISLPF
FVSSCVGLVDWSLTSNFLGLFRFWKALQLYAGFNIVLLYVYQIPLEFSDMLQRIADFVGL
FKISSTSEWPEICSAVSLVLFYIMLSYVKYDLEEMDFIMSMQESNLTEQLLPSKHSFFIR
QSRSGVRHTNVLLRKAAFRTFTINFFTYGFPVSLFALSFWSFHFASICAFGLLAYVGYIL
YALPSLFRLHRLNGLLLVFILSWAVSTYIFNVAFAFLNRNFGKDMGIWEMVGFWHYPIPG
FFLLAQFCLGILVALGNLVNNSVFVYLSDKDALSSNNSPGEVDGETKVFIVATIAWGLRK
CSRAIMLALIFIIAMKSGFIHAIYIIFFLIYLLSHNISRNIRRSLILLCEAHFALLYLLQ
IDLISNVLEQKCSSIFEIMSQLGVLKHHSSWNFLEIALLGCFCAIHNHGFEVLFSFSAIV
QHTPCPPVGFSILRAGLNKSVLLSVYVSPNTSFCYDNPSYERTIASFLSGIGQKFLSIYR
SCGTYIALLTILLTVFMVTPNYISFGYIFLLLVWIIGRQLGERTKRHLWFPLKTYAVMVF
IFVYSVSSFTSFRIWLSGFMDLYFYLGYESEASLLDNIWQSLAVLIVMQLYSYERRKNKN
YRTSFSNPLDSGVLGFAKRFLIWHSQKILFVSLFYASLSPICAFGFLYLLGLVICSTLPK
ASRIPSKSCLVYTGFLVTTEYLFQMWGKQAGMFPGQKHSYLSLILGLRVYELGFWGVESG
LRGKVLVITACVLQYNVFFWLDNMPTCISNKGKWEEPCPLFLSAEDAFTNGFMSNGEDKP
STIGTVPIRQVRPANSSWASLSLALSQALRPASSKAGGSEVSSRRKFSFGYFWGSTKESH
KWNRKRILALREERFETQKALLKIYLKFWIENMFNLLGLEINMIALLLASFALLNAISML
YIALVAACVLLNRWIIRKLWPVLVFLFASILILEYIAIWKSMFPPNQRSQTEIRCHDCWK
NSASYFRYCRSCWLGLIIDDPRMLISYFLVFLLASFKLHADHSSYFSQSTYQKMMSQHKN
LFVWRDLSFEMKSMWTFLDYIRLYCYCHLLDLVLVLILITGTLEYDILHLGYLAFALVFF
RMRLEILKKKNKMFKFLRIYNFVVIVLSLAYQSPFVGEFSSGKCNSVNYIYDVIGFYKYD
YGFRINTRSVLVEIIIFMLVSLQSYMFSSQESDYVSRYLEAEQIGAIVREQEKKAAWKTA
QLQQSRESEEKKHQRNVQVEKMKSEMLNLQIQLHNMNSIASLSDVSPDDESLQRSVSLTS
NRDIGPPDKEESTLWEREQTIKEDIVSPPEAHACAACIKGENPEVVESPKNSMEHRPCEI
TEIEHDADHAIFDTEKRGKSQSKDNPLISAVHLLGDGVSQVQSIGNQAVNNLVNFLNIKP
DDSVMNEHSSVKGEAYDETESQKMQNMNLNRSSSLQSDKISNTTSLQLGRILCHIWSQMQ
SNNNVVCYCLFVVVFLWNFGLLSMVYLAALFLYALCVNNGPTYIFWVIMLIYTEAYILFQ
YMYQIAIQHCGLSINSDLLRNIGFPTCEIKSSFVVCSLPLFLVYLFTLIQSSISAKDGEW
MFSTDFNFHRRSSHYRKEVLVNYSWSKRVSKLLQYVINRVKQVTRRFFWYWKSLIQGAET
PPYFVQLSMDVHLWPDDGVQPERVESGINRLLEIVHDERCTKKISGHCPFASRVQVQSIK
RSQENQNVALIVFEVVYASRLTGCTSADWYKSLTPAADVAKEIRKAKHAGLVEEMGFPYQ
ILSAVGGGKREFDLYAYIFVADLTVFFLVAMFYQSLIKNNSEILNVYQLEDQFPIEFVII
LMIIFFLIVVDRVLYLCSFAAGKVIFYLFNLVLFTYSITRYAWRMKPSDQHAGKLALRAI
FLAKAISLALQGVQIRHGIPQKATLYWQFLTSKVSRINYLGYRLYRALPFLYELRCVLDW
SCTTTSLTMYDWLKLEDINASLYLAKCDAVLNRATHRQGEKQKKMTKCCNGICLFFILIC
VIWTPMLMYSSGNPTNIANPINDASFQLDISTGGGRLTLYQTTLCEKLQWDNLNSDVNFD
AYNKNDIQLICCQADATILWLVSDVVQRRFIEFLDWDMDMVITSTWLLTRERPKGKEVVK
YEKPVDSKDLPEPSDVQKVFNGSTISFRIYNLYPRYFRVTGSGEVRSFEQEVTSGPISVS
ADLVINRAASEWWSFHDLDSSHIRGCGGLTGPTAVIVSEETPPQGILGDTLSKFSIWGLY
ITFVLAVGRFIRLQCSDLRMRIPFENLPSCDRLIAICENIYAARAEGELGVEEVLYWTLV
KIYRSPHMLLEYTKPD
NT seq
7431 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggaaattttcttgctgggtttctcttgcctctgctgcttctaacggctgcattgagc
aattggagtttgatctctcttgttgatttggtagctttccttctcattcagtatactgca
cccaaaataggattccgtttccggaggcaatatttgttactttggcctgttatcatcttt
tccctacttgttttttcctcacaagctgtatatcttgttgtatgggcggttgaaggttat
aaacagagtgtaggagaggcttggtggatgaaactaattggttttatgataatccaatct
tggaaatctcctactgtgatttatttcttggctgtacaactgctagtggtgatcgttgct
gtgcttgatatacatgataacagatttggtcttgtccaatggcggtgttcttgttggagt
catttcttaacagctatcgaacgtttaggttcccatcttagagttacttcctgtttgctt
ctacctcctattcagctggttgcgggaattagccatccctcttggatttctttgcctttt
tttgttagtagttgtgttgggctagtggattggtctttgacaagcaattttctaggacta
ttcaggttctggaaggctctccagctttatgcaggtttcaacatcgtcttgctttacgtg
tatcagatccctttagagttttcagatatgttacagaggattgctgattttgttggtcta
ttcaaaatatcttcaacatctgagtggcctgaaatatgctctgctgtttctcttgtactt
ttttacatcatgctatcctatgtcaaatatgatttggaggaaatggattttatcatgtcc
atgcaagaaagtaacttgacagagcaactacttccgtcaaagcattcattcttcattcgt
caatcaagatctggtgtacggcataccaatgttttactacgaaaggcagctttccggact
ttcaccatcaactttttcacttatggttttccagtatccttgtttgccctttccttttgg
agttttcattttgcaagtatatgtgcttttgggctacttgcatatgttggctacattctg
tatgcccttccttcactgtttcgtttacaccggttaaatgggctccttcttgtcttcatt
ctctcgtgggctgttagtacctatatattcaatgtagcatttgcattcttgaataggaat
tttgggaaggatatgggaatttgggagatggttggattttggcattatcccataccaggg
tttttcttgcttgcacaattttgtctaggaattttggttgctttgggtaatcttgtaaat
aactctgttttcgtctacttatctgataaggatgcactatcatcaaacaactctcctggg
gaagtggatggagagaccaaggtattcattgtggctacaattgcatggggattgcgaaaa
tgttctcgagctatcatgcttgctctgatatttatcatagcaatgaaatccggatttatc
catgctatatatataattttctttttgatctatcttttgagccacaacatcagcagaaat
atacgccggtctctgattcttctttgtgaagctcacttcgcattattgtaccttcttcag
attgatttgatctctaatgttttggagcaaaaatgctcctcaatttttgaaatcatgtcg
cagttaggtgtccttaaacatcacagctcgtggaactttctggaaatagctttgctcggt
tgcttctgtgcgatacataaccatgggtttgaggtgcttttttcattctcagcaattgtg
cagcacaccccttgtcctcctgttgggttcagcatcttgagagctggtttaaacaaatct
gtcctcttgtcagtatatgtatccccaaacacatccttctgctatgataatccttcttac
gagagaacgatagcatcattccttagtggaattgggcagaaatttttatcaatatatcga
tcatgtggaacctacatcgctttgctgactattcttcttacagttttcatggtgacaccc
aactatatatcatttggatacatcttccttcttcttgtttggattatcggaagacaactt
ggtgagagaacaaaaaggcacttatggtttccattaaaaacatatgctgtcatggtgttc
atttttgtctatagcgtaagcagttttaccagctttaggatttggttgtctggatttatg
gatctgtacttttatttgggttatgaatctgaggcttcattgttggataatatttggcaa
tctctagcagttttaattgtgatgcaactttatagctatgaaaggaggaagaacaagaac
tacaggactagtttttccaatcctttagattctggggtacttggctttgccaagcgattt
ctgatttggcacagccagaagatcctgtttgtctcattattctatgcgtctttgtctcca
atttgtgcttttggattcttgtatctacttggccttgtcatatgttcaactttacctaag
gcttctcggatcccatccaaatcatgcttagtttatactggatttctggtcacaacagag
tatctttttcagatgtggggtaaacaagctggaatgtttccagggcaaaaacattcttat
ctgtcactcattttgggtctccgagtatatgagctgggattttggggtgtagaatcgggc
ttgaggggaaaggtgctggtaattactgcatgtgtccttcagtacaatgtcttcttttgg
ttggataatatgccaacctgtatttcaaataaaggcaagtgggaagaaccttgtccttta
tttttgtcagcagaggatgccttcaccaatggcttcatgtctaatggggaagataaacca
tctactattggaacggtacctataagacaagtcagaccagcaaacagttcatgggcatct
ttgagccttgctttatctcaagcgcttcgtcctgcatcctcgaaagcaggaggctctgag
gttagcagcaggagaaaattttcatttggatatttttggggaagtaccaaggagagtcac
aagtggaacaggaagaggatccttgcactaagagaagaaagattcgagactcagaaggct
ctcttaaaaatatatttgaaattctggatagaaaacatgtttaaccttcttggtcttgag
attaatatgattgctttgcttcttgcaagtttcgctttgttgaatgccatttctatgcta
tatattgcattagttgctgcttgtgttcttttgaatcgctggataatacgtaaattatgg
ccagtgcttgtattcttgtttgcttccattctcatccttgagtatatcgccatctggaag
agtatgtttcctccgaatcaacggagtcagactgaaatccgctgccatgactgctggaaa
aactcagcttcatatttccggtattgtaggagctgttggctgggactgatcattgatgat
ccccgaatgcttatcagctactttttggtctttctgctggctagtttcaaacttcatgca
gatcactcatcctatttctctcagtcaacctatcagaaaatgatgtctcagcataaaaat
ttatttgtttggcgagatctctcttttgaaatgaaaagcatgtggacttttcttgactac
ataagactttattgttattgccatctattggaccttgtcctggtactgattttgattact
ggaactcttgagtatgatattctgcaccttggttatcttgcttttgctcttgtttttttt
cggatgaggcttgaaattctcaagaagaagaataaaatgttcaagttcttgcgtatctac
aacttcgtggtcattgttctttctcttgcctatcaatctccttttgtaggggagtttagt
tctgggaagtgcaactctgtgaactacatatacgatgtcattggattttataagtatgac
tatgggtttcgaattaataccagatctgtactcgttgagattatcatttttatgttggta
tcccttcagtcatatatgttttcctcccaagagtctgattatgtgtcacgatatcttgaa
gcagagcaaattggtgccattgtacgcgagcaagagaaaaaagctgcatggaaaactgca
cagttacaacagagtcgtgaatctgaggagaagaaacatcagcgcaacgtgcaagtggag
aagatgaaatctgagatgcttaacttgcaaatacagcttcataacatgaactcaattgca
agtctgagtgatgtttctcctgatgatgaaagcctacagaggagtgtttctcttacttca
aatagggatattgggcctcctgacaaagaggaaagcactctttgggagcgagagcaaaca
attaaggaggatattgtatcccctcctgaagcacatgcatgtgctgcttgtattaaagga
gaaaatcctgaagtagtggaatctccgaagaattccatggaacataggccctgtgagatc
accgaaattgagcatgatgctgatcatgctatttttgatacagagaaaagggggaaaagc
caatcaaaggacaatcctttaatttctgctgtacacctcttaggtgatggtgtttctcag
gtacagtccattggaaatcaggctgttaataaccttgtcaatttcttgaacattaaacct
gatgattcagttatgaatgagcactcgtctgtcaagggtgaggcatatgatgagactgag
agccaaaagatgcagaatatgaatttgaatcgttcttcttctctgcaatctgataaaatt
tccaatactacaagtttgcagctgggaaggatcttatgccatatatggtcccaaatgcag
tctaataacaatgttgtgtgctactgcctattcgtcgttgtctttctgtggaacttcggt
ttgctttctatggtgtatcttgcagctcttttcttgtatgctctatgtgtgaataacgga
ccaacttatatcttctgggttattatgctcatttacactgaggcttacattttgtttcag
tacatgtaccaaattgcaatccagcattgtggtttgagtattaattctgacctacttcgt
aacataggatttcctacttgtgaaatcaagtcatcttttgttgtgtgttcgttgcctcta
tttcttgtctacttatttaccctcatacagagctctataagtgcaaaagatggcgaatgg
atgttctctactgactttaacttccataggaggagttctcattatagaaaagaggttctt
gtgaactacagctggagcaaaagggtgtcaaagttgctccaatatgtaataaatagggtg
aaacaggtaactagaagattcttctggtactggaaatcattgatacagggggcagaaact
cctccttattttgttcaactgtcaatggatgttcacttatggccagatgatggggtacag
ccagaaagggtcgagtctggtataaaccgactactcgagatagttcatgatgaaagatgt
actaaaaaaatctctggtcattgtccatttgctagtagggttcaggttcaaagcattaaa
agaagtcaagaaaaccaaaatgtagctttgattgtttttgaggtggtttatgcatctcgc
ttgacaggatgcacgtcagcagattggtacaagtctctaactccagcagctgatgtggca
aaagaaattcgcaaggcaaagcatgctgggcttgttgaagagatgggattcccttaccaa
atactctctgcagttggtggtggaaaacgggaatttgatctctacgcttacatttttgtt
gctgatcttactgtttttttcttagtcgcaatgttctaccaatctctcataaagaacaac
agtgaaattttaaatgtttatcagctagaagatcaatttcctatagagttcgtaattatc
ttaatgatcatctttttcttgatcgttgttgatcgtgtactttatctatgttcattcgca
gcaggaaaagttattttctaccttttcaacctcgttctcttcacatattcgattacaagg
tatgcttggcggatgaaaccttcagaccagcatgctggaaaactagcactccgtgcgatc
tttcttgctaaagcaatttctttagcacttcagggtgtacaaattcgacatggaattcct
cagaaagccaccttgtattggcagtttttgaccagcaaggtttcaagaattaattacttg
ggctataggctttatcgggctctaccatttctttatgaattacgatgtgtactcgattgg
tcatgcacgacgacatctttgaccatgtatgactggctcaaactggaagacataaatgca
agtctgtaccttgccaaatgcgatgcagtgttgaatagagctacgcacagacaaggagag
aagcaaaaaaaaatgaccaagtgctgcaatgggatctgtctgttctttatattaatttgt
gttatctggactcctatgctgatgtacagcagtggtaatccgacaaatattgcaaatccc
attaatgatgcaagttttcaactggatattagtactggtggtggaaggttgaccttgtat
cagacaacactttgtgaaaagctccaatgggataatctcaattctgatgttaattttgat
gcctacaataagaatgatatacaattgatatgctgccaagctgatgcaactattttgtgg
ctcgtctctgatgtagttcagagaaggtttattgagttccttgactgggatatggacatg
gttataacttctacatggctgcttacaagagaacgaccaaagggcaaggaagtcgtgaaa
tatgagaaacctgttgattccaaggatcttccagaaccttcagatgtccaaaaggtcttc
aatggttctacaatcagctttaggatatataatctttatccaagatacttccgtgtcact
ggttccggtgaagtcagatcttttgagcaagaggttacttcaggacctatttcagtgagt
gcagatcttgttatcaatcgcgcagcttctgagtggtggtcattccatgatctcgattca
tctcatataaggggctgcggaggtttgacaggacctacagccgtcatagtatccgaagaa
acaccaccacagggtatacttggagacacgctaagcaagttcagcatttggggtctctac
attacttttgtgcttgctgttggccgctttatcaggcttcaatgttccgatttaagaatg
aggataccgtttgaaaacctgccttcctgtgacaggttgatagccatctgtgaaaatata
tatgctgcaagagcagaaggtgagcttggagttgaagaggtcctttactggacccttgtg
aagatttataggtcacctcacatgctgcttgagtataccaaacccgactag
DBGET
integrated database retrieval system
