Gossypium arboreum (tree cotton): 108475336
Help
Entry
108475336 CDS
T05776
Name
(RefSeq) LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO1
Organism
gab
Gossypium arboreum (tree cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_1
LRR_8
LRR_4
LRR_6
LRRNT_2
LRR_9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108475336
NCBI-ProteinID:
XP_017632787
LinkDB
All DBs
Position
5:58367453..58375176
Genome browser
AA seq
1089 aa
AA seq
DB search
MLLVLEGCRWCTIDACLEHERIALLHLKPFFNYRHQLQSWVEVKGSDCCKWEGVECNTTT
RRVILLSLNSTRWDDNMDYNMDNRNLNAWYLNASMFLPFEELKSLYLSGNAIGGNLENEG
FGKLSSTLSNLEILDLSENYLNDSILLSLSELSSLRYLDLSSNQFEGSSHPRAFQLLSRL
NNLETLDLSGNSLKNSILFHMRNLSSLKTLRLSGNQLKGKLLVHIQGLNNLTNLKYLDLS
GNNIESISNQDGIQLRLTNLEELDLSGNLFRNNTISSLEGLSSLKSLTLSYNHLQGSLDI
KDGDRKLELTHLEELYLDGNQFNTSVFASLNKLSNLKSLSIRGNQLKGSIDMKDLEAFIN
LRELDMSGNELKDLVIHQGWCDLRNLEVLDVSDNALEGMLSPCFSNLTSLRELDISGNHF
QIPLSFAPFANLSNLKALSIDENKMVMEPSFYTSIPKFQLEAISLLKCITSQQLSLKLPT
FLYYQYDLRYVDLSQNNVSGTFPTWLLENNTKLGVLILRGNSFTGPLSLPSAPNSNVSLI
DISQNKLQGQIPTSICSTFPHLSRLFLSKNAFEGNIPLCLSGLKDLSFLDLSNNQLYGKV
PEELITKGSLIILRLSNNNLSGNVVPVILNANGVQNLYLDGNNFSGEMTNVDVSTFEFPN
SLSEIDLSNNKLHGKLPRWIRNASFLVRLALSNNGFEGSIPLEFCKLNRLEFLDLSQNNL
SGSVPSCFNPPNIEHVHLHRNRLRGPLSLAFYNSSSLVTLDLRGNNLTGSIPKWIDTLSS
LSVLLLKDNHFHGKVPVQLCKLHSLSIIDLSQNMFSGPIPSCLGNLSLPIQGNKNLGIGF
YGLPIEEDESTSIVTRGISYPESYLEEVIEFTTKSGFYSYKGDILSYMTGVDLSCNNFTG
HIPPELGNLSEIHSLNLSHNKLTGVIPSSFSKLQHIESLDLSYNNLSGEIPNQLVDLNYL
EVFSVAYNNLSGSIPEPKAQFGTFIENSYEGNPFLCGAILHKSCSNTDSPSTISTVSKDK
GEDGLIDTYGFCVSFLVSYVVVLLTIFVVLYINPYWRRAWFSLVGKYITTCRCSHVSNFL
TYHIFKQCV
NT seq
3270 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgttggtgttagaaggatgcagatggtgtactattgatgcttgtttggagcatgag
agaatcgctctcttgcatctcaagcctttcttcaattatcgtcatcaattgcaaagttgg
gttgaggtgaagggctcagattgttgtaaatgggaaggagttgagtgtaacaccaccact
aggagagtcatactactctcccttaattctacaagatgggatgacaatatggattacaac
atggataataggaatctcaatgcctggtatctcaatgcctctatgtttcttccatttgag
gaattgaagagtctttatttgtcgggaaatgccataggtggtaaccttgaaaatgaaggt
tttggaaaactatcatccacattgagtaatttggagatccttgacttaagtgaaaattac
ttgaatgatagcattttgttatctttgagtgagctttcatctctccggtatttagatcta
tcatccaaccaatttgaaggatcaagtcatccaagagcttttcaattgctttcaagactc
aataacttggaaactcttgatttaagtgggaattctttgaagaatagcattttgttccat
atgagaaatctttcatccttgaagactttaagattgagtggtaatcagttgaaaggaaag
ctgctggttcatattcaaggattgaataatttgacaaacttgaaatacttggatttaagt
ggcaacaacattgaaagcatctcaaaccaagatggaatacaactgaggttaacaaacttg
gaggaacttgatttgagtggtaatctctttcggaataacacaatttcctctcttgaaggg
ctttcaagcctaaagtctttgactttgtcctacaaccatttgcaaggctcattagatatt
aaagatggtgatagaaaactggagttgacccacttggaagagctttatttagatggaaat
cagttcaatactagtgtatttgcatcccttaacaagctttcaaatttgaaatctttgagc
ataaggggcaatcaattgaaaggatcaatagatatgaaagatttggaagcatttatcaat
ttaagggaactagatatgagcggcaatgaattgaaagatttggtgatccaccaaggatgg
tgtgatctaaggaaccttgaagtgttggatgtgagtgacaatgcacttgaggggatgctt
tctccttgttttagtaacttgacatctcttcgtgagttagatatttcaggaaaccatttt
caaattccgctatcattcgcaccatttgcaaatctttcaaacctcaaagccctttcaatt
gatgaaaacaagatggtaatggaaccttccttttatacctcaatcccaaagtttcaattg
gaagccatcagtttgttgaagtgcataacatctcaacaactcagtcttaaacttcctacc
ttcctttactatcaatatgacttaagatatgtggatctttctcaaaacaatgtcagtgga
acattcccaacttggttgttagaaaacaacacaaagttaggagttctcatcttgaggggt
aattcttttacaggtcctctctcattaccgtcagctcctaattctaatgtgtctttaatt
gacatatcccaaaacaaattacaaggtcaaattccgaccagtatatgttcaacttttcca
catttgagtcggttattcttatccaagaatgcttttgaaggtaatatcccactttgttta
agtggcttaaaggacttatcttttttagatctatcaaacaatcaattgtatggaaaagta
ccagaagagttgatcacgaaaggctcactgatcattttgaggctatcaaataacaacctc
agtggaaatgtagttcctgtgattctcaacgcaaatggggtgcagaatttatatttggat
ggaaataatttttcaggagagatgacaaatgttgatgtgtctacttttgagtttccaaat
tcactaagcgaaattgatctcagtaacaacaagttgcatggaaagctcccaagatggata
aggaatgcatcgtttttggtgagattagctttgtccaacaatggtttcgagggttctatt
ccattggaattttgcaagttgaataggttggaatttttggatctttctcaaaataattta
tctggctctgtaccgtcatgttttaatccaccaaacatagagcatgtccacctccacagg
aatagattgagaggtccactatcacttgctttttataatagctcttcactagtgacttta
gatcttagaggaaacaatttgacaggtagtattccaaaatggattgacacactttcttct
ttgagtgttcttctcttgaaagataatcattttcacggcaaagttccagttcagttgtgc
aagttgcattctttaagcatcatagatctttctcaaaatatgttttctggtcctatacct
tcttgtttgggaaatttatctcttccaatacaagggaataagaatctaggaattgggttc
tatggtctgcctatagaagaggatgaatcaacatccattgtgacgagaggaatttcctat
cctgaaagctacttagaagaagtaatagagttcacaacaaagagtgggttctattcatac
aagggtgacatcctttcatatatgactggggttgatttatcttgcaacaacttcactggt
catatcccaccagaattagggaacttgagtgaaatccattctttaaacttgtcacacaat
aagttgactggagttataccctcatcattctcaaaacttcagcacattgagagtttggac
ctttcttacaacaacttgagtggtgaaatccccaatcaattggtagacttgaactatttg
gaggttttcagcgtggcatacaacaacttgtcaggtagtattcctgaaccaaaagctcaa
tttgggacctttattgaaaacagttatgagggaaatccttttctttgtggagctatattg
cataaaagttgttccaataccgattcaccatcaacgatatcaactgtatcaaaagataaa
ggagaagatggtttgatagatacttatggtttttgtgtgagctttttggtttcttatgta
gttgttttgttgacaatttttgttgtcctctacataaatccatactggcgaagagcttgg
ttttctctcgttgggaaatatatcaccacctgtcgctgctcacatgtgagcaattttctt
acttatcacattttcaagcaatgtgtttag
DBGET
integrated database retrieval system