Gossypium arboreum (tree cotton): 108475912
Help
Entry
108475912 CDS
T05776
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
gab
Gossypium arboreum (tree cotton)
Pathway
gab03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gab00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
108475912
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
gab03019
]
108475912
Messenger RNA biogenesis [BR:
gab03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
108475912
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108475912
NCBI-ProteinID:
XP_017633382
LinkDB
All DBs
Position
3:133325243..133329355
Genome browser
AA seq
458 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEDRLKEYFGQYGDILQTVVMRDKVTGRPRGFGFVVFSDPSVL
DTVLQEKHTIDGRTVEAKRALSREEQQTSARSGNFNQARNSGGGGNIRTKKIFVGGLPPT
LTEDGFRQYFEAYGHVTDVVIMYDQNTQRPRGFGFISFDTEDAVDRVLHKSFHDLNGKQV
EVKRALPKDANPGGVSRTMSGGASGFGGYQGYGSSGGNSSSYDGRMDSNSYMRAQGTGAG
FPPYGSSGYAPGYGYGPANNGVGYGSYGNYGGAGAGYGAPAGAAYGNPNAGYASGPPGAP
RSSWGTQAPSGYGAMGYGNAAPWGAGAGSGGPGSAATGQSPTGATGYGGQGYGYGGYGGN
DGSYGNAGYGAAGGRSGGTPNSNAGAGGGDLQGSGGGYMGSGYGDVNGSSGYGNATWRSD
SSQGSGNYGGAQANGPHGGQGGYGGGYGGAQGRQAQQQ
NT seq
1377 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaggggaagctgtttattggagggatatcatgggaaacaagtgaggat
aggttaaaggaatattttggtcagtacggcgacatcttgcagactgttgttatgagagat
aaggttacggggagacctcgtggctttggattcgttgtcttctcagatccgtcggttctc
gatactgttcttcaagaaaagcacaccattgatggtagaacggttgaggcaaagagggcg
ttatctagagaggagcagcaaacgtctgctagatctggtaattttaatcaggctagaaat
tccggaggtggtggaaatatcaggaccaagaagatttttgttggaggactgcctccgacc
ttgactgaagacgggtttcgccaatactttgaggcatatggtcatgtaactgatgtagta
atcatgtatgaccagaatactcagcggcctcgagggtttggttttatctccttcgacact
gaagatgcagttgacagggttttgcacaagagttttcatgatttgaatggcaagcaagtt
gaagtgaagcgggcccttcccaaagatgcaaaccccggtggggttagccgtactatgagt
ggtggtgccagtggttttggaggttaccagggttatggttcttctggtgggaattcaagt
tcttatgatggtcgaatggactccaatagttacatgcgtgctcagggtactggagctggc
tttccaccttatggctcatcaggatatgcacctggttacggttatggtcctgctaataat
ggtgtaggttatggtagttatggaaattatggtggtgcaggtgctggttatggtgctcct
gcaggtgcagcttatgggaaccctaatgctggttatgcaagtgggcctcctggtgcccct
agaagttcatggggcactcaagctccttctggttatggtgctatgggttatgggaatgct
gctccttggggtgctggtgctggtagtggtggtccaggttctgcagctactggccaatct
cccactggagctactgggtatgggggtcaaggttatggatatggtggatatggtggtaat
gatggatcttatgggaatgctggctatggggctgctggaggtcgttctggtggtactcca
aatagtaatgctggtgcaggtgggggagatctacaagggagtggtggtggttacatggga
agtgggtatggtgatgtaaatggaagttcagggtatggaaatgcaacatggaggtctgat
tcatcccaaggttctggaaattatgggggtgctcaggcaaatggtcctcatggtggacaa
ggtggttatggtggtgggtacggcggtgctcagggccgacaagctcagcaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
