KEGG   Gossypium arboreum (tree cotton): 108475937
Entry
108475937         CDS       T05776                                 
Name
(RefSeq) pumilio homolog 2 isoform X1
  KO
K17943  pumilio RNA-binding family
Organism
gab  Gossypium arboreum (tree cotton)
SSDB
Motif
Pfam: NABP PUF PUF_NOP9
Other DBs
NCBI-GeneID: 108475937
NCBI-ProteinID: XP_052887258
LinkDB
Position
7:complement(88013907..88020982)
AA seq 1042 aa
MLSELGRRPMIQNSEGSFGDDLEEVDLLLREQRCRQDPDDLERALNLYRSGSAPPTVDGS
LSAVGGLFGGGAAAAAGSGATPFSAFHGIKNGNGFASEEELRSDPSYHSYYYSNVNLNPR
LPPPLLSKEDWKYAQRLKGGNSVIGGVGDKRKMNRVDNGSSRSMFSMPPGFDSRKQEIEV
EAEKGRSSAEWGGNGLIGISGIGLGSKQKSLAEIFQDDLGHTAPVARIPSRPASRNAFDE
NFENGGSAELTSSDTLRSSVSLQGSSAVHNIGPPTSYTYADAVGASLSRSTTPDPQLVAR
APSPCLTPIGGGRVGNSDKRSINSPSTFGGITSGLNESGDLVAAMSGMNLSSNGVIDEDN
QLPSQIEQDVENHQNYLFGLQDGQSHIKQQAYLKTSESGHLHMPSANGNGVRSELKNPSL
LSDRQAQLQKSALPSNNSYLKGSPTSTLNGGGSLPARYQHNVLSGYSLNPALASVMASQP
GTGNLPPLFESVAASSAIAVPGMDSRVLGRGLGSGQSNSNAASELHTFGRGGSQIVGNAL
QASLIDPMYLQYLRTSDYTAAQLAALNDPSMDRNFLGNSYMNLLELQKAYLGTLLSPQKS
PYGVPLGAKSGSSNIHGFYGSPTFGAGMSYPGSPLASPVIPNSPVGPGSPMRHSDLNMCF
PSGMRNLAGGVMGPWHFDAGCNMDESFASSLLEEFKSNKTKCFELLEIAGHVVEFSADQY
GSRFIQQKLETATTEEKNMVYEEIMPQALALMTDVFGNYVIQKFFEHGLPAQRRELADKL
FGHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVDTDQKIKMVRELDGSVMRCVRDQNGNHVIQKCIECV
SEEHIQFIVTTFFDQVVTLSTHPYGCRVIQRILEHCKNPKTQNKVMDEILGSVSMLAQDQ
YGNYVVQHVLEHGKPHERSIIIKELAGKIVQMSQQKFASNVVEKCLTFGGPAERLLLVNE
MLGSTDENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQRELILSRIKVHLNALKKYTYGKHIV
ARVEKLVAAGERRIAAQSPRPA
NT seq 3129 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttatccgaactgggcaggagaccgatgatacaaaatagtgaaggatcatttggggat
gatttggaggaggtagaccttttgctccgtgaacagcgttgtaggcaagaccctgatgat
ctcgaacgtgcgctaaacttgtacagaagtggctctgcgcctcctaccgtagacggctca
ctgagtgcagttggcgggttgtttgggggaggagctgctgctgctgctggtagtggggct
acccccttttcagcttttcatgggataaaaaatggaaatgggtttgcgtcggaggaagag
cttaggtctgatccatcatatcattcatactattactcaaatgtgaatctcaacccgagg
cttccaccccctttgctttccaaggaggattggaagtatgcacagaggttgaaaggaggg
aattcagtcataggtggggttggagataagagaaaaatgaatagggttgataatggtagt
agtaggtcgatgttttcgatgccaccagggtttgattcaaggaaacaagagattgaagta
gaggcagagaagggtcgtagctcagcggagtggggtggcaatggactgattggtatatct
ggtatcggacttggaagcaaacagaaaagccttgctgaaatttttcaggatgatttggga
cacactgctccagtcgcaaggataccatcacgtcctgccagccgtaatgcttttgatgag
aactttgagaatggaggttctgctgagctgacttcttcagatactttacggtcaagtgtg
agtcttcaaggatcatctgcagtccataacattgggccacctacttcatacacttatgct
gatgctgtaggggcttccttgtctaggagtactactcctgatccccaacttgttgctagg
gctcctagtccttgtcttacaccaattggaggaggcagagttggtaactcggacaaaaga
agcataaatagtccaagcacatttgggggtatcacatctggtctcaatgagtctggtgat
ctggtagctgctatgtctggcatgaatctgtcatctaatggtgtgattgatgaagataac
caattaccgtcacagattgaacaagatgttgaaaaccatcagaattatttatttggcctt
caagatggtcagagtcatatcaaacagcaggcgtacttgaagacatctgaatctggccat
ttacatatgccttcagctaacggtaatggggtcagatcagaactcaaaaacccatccttg
ctatctgataggcaagctcagctccagaaatctgcccttccctctaacaattcttacttg
aaaggatcacctacttccacactcaatggtggaggcagtttacctgctcggtatcagcat
aatgtgttaagtggttactctctaaatcctgctttagcttctgtgatggctagccaacct
ggaactggcaatctgccaccactgtttgaaagtgttgctgcttcgtcagctattgctgtc
cccggaatggactccagagtgcttggaagaggtttggggtctggacaaagcaattcaaat
gctgcttccgagttgcatacttttggtagaggtggaagccaaatagtggggaatgctctg
caggcgtctttgattgatcctatgtatcttcagtatctgaggacttctgattacactgca
gcgcagcttgcagctcttaatgatccctccatggataggaacttcctgggtaattcatac
atgaacttgcttgagcttcaaaaagcttatcttggaactctgctatcacctcagaaatct
ccttatggtgttcccttaggtgctaaatctggtagttctaatattcatggtttttatgga
agccccacttttggagctggcatgtcgtatccaggaagccccttagcaagtcctgttatt
cccaattctccagttggacctggtagtcctatgagacatagtgacctgaatatgtgtttt
ccttccgggatgaggaatctagctgggggtgtcatgggaccctggcatttcgatgcagga
tgtaacatggatgaaagctttgcttcctccctacttgaagagtttaaaagcaataaaaca
aagtgttttgaacttttggaaattgctggtcatgttgttgagttcagcgcggatcagtat
ggcagccgatttattcagcaaaagcttgaaactgctaccacggaagagaaaaatatggtt
tatgaggagatcatgcctcaagctcttgctttgatgactgatgtctttggtaattatgtc
attcaaaagtttttcgaacatggacttccagctcagagaagagaacttgctgacaagctt
tttggccatgttttaacactaagtcttcaaatgtatggttgtcgggtgatccagaaggct
atagaagttgttgatacggatcagaagattaaaatggttcgagagcttgatggtagtgtt
atgcgttgtgtacgtgatcagaatggcaaccatgtcatccagaagtgtattgaatgtgtt
tctgaggagcacattcaatttatagttacaacgttttttgatcaagttgtgaccctttcc
actcatccatatgggtgccgagtgatacagaggatactggagcactgcaagaacccaaaa
acacagaataaggttatggatgagattttaggatctgttagcatgttggcacaagaccag
tatggcaattatgttgtccagcatgtgctagagcatggaaagcctcatgagcgttcaatt
ataataaaggagttagctggaaagattgtccagatgagtcagcagaagtttgcctctaat
gtggttgagaagtgcttaacttttggtggtcctgctgaacgactgttattggtgaatgaa
atgcttggttctactgatgagaatgagcctctacaggcaatgatgaaagatcagtttgca
aactatgtggtacagaaagtactcgagacttgtgatgaccagcaacgtgagctgatcctt
tctcgaattaaggtccatttaaatgcattgaagaagtacacttacggaaagcatattgtt
gcgcgtgtagagaaacttgttgctgctggggaaaggagaattgccgcgcagtctccacgc
cctgcttag

DBGET integrated database retrieval system