Gossypium arboreum (tree cotton): 108475937
Help
Entry
108475937 CDS
T05776
Name
(RefSeq) pumilio homolog 2 isoform X1
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
gab
Gossypium arboreum (tree cotton)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108475937
NCBI-ProteinID:
XP_052887258
LinkDB
All DBs
Position
7:complement(88013907..88020982)
Genome browser
AA seq
1042 aa
AA seq
DB search
MLSELGRRPMIQNSEGSFGDDLEEVDLLLREQRCRQDPDDLERALNLYRSGSAPPTVDGS
LSAVGGLFGGGAAAAAGSGATPFSAFHGIKNGNGFASEEELRSDPSYHSYYYSNVNLNPR
LPPPLLSKEDWKYAQRLKGGNSVIGGVGDKRKMNRVDNGSSRSMFSMPPGFDSRKQEIEV
EAEKGRSSAEWGGNGLIGISGIGLGSKQKSLAEIFQDDLGHTAPVARIPSRPASRNAFDE
NFENGGSAELTSSDTLRSSVSLQGSSAVHNIGPPTSYTYADAVGASLSRSTTPDPQLVAR
APSPCLTPIGGGRVGNSDKRSINSPSTFGGITSGLNESGDLVAAMSGMNLSSNGVIDEDN
QLPSQIEQDVENHQNYLFGLQDGQSHIKQQAYLKTSESGHLHMPSANGNGVRSELKNPSL
LSDRQAQLQKSALPSNNSYLKGSPTSTLNGGGSLPARYQHNVLSGYSLNPALASVMASQP
GTGNLPPLFESVAASSAIAVPGMDSRVLGRGLGSGQSNSNAASELHTFGRGGSQIVGNAL
QASLIDPMYLQYLRTSDYTAAQLAALNDPSMDRNFLGNSYMNLLELQKAYLGTLLSPQKS
PYGVPLGAKSGSSNIHGFYGSPTFGAGMSYPGSPLASPVIPNSPVGPGSPMRHSDLNMCF
PSGMRNLAGGVMGPWHFDAGCNMDESFASSLLEEFKSNKTKCFELLEIAGHVVEFSADQY
GSRFIQQKLETATTEEKNMVYEEIMPQALALMTDVFGNYVIQKFFEHGLPAQRRELADKL
FGHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVDTDQKIKMVRELDGSVMRCVRDQNGNHVIQKCIECV
SEEHIQFIVTTFFDQVVTLSTHPYGCRVIQRILEHCKNPKTQNKVMDEILGSVSMLAQDQ
YGNYVVQHVLEHGKPHERSIIIKELAGKIVQMSQQKFASNVVEKCLTFGGPAERLLLVNE
MLGSTDENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQRELILSRIKVHLNALKKYTYGKHIV
ARVEKLVAAGERRIAAQSPRPA
NT seq
3129 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttatccgaactgggcaggagaccgatgatacaaaatagtgaaggatcatttggggat
gatttggaggaggtagaccttttgctccgtgaacagcgttgtaggcaagaccctgatgat
ctcgaacgtgcgctaaacttgtacagaagtggctctgcgcctcctaccgtagacggctca
ctgagtgcagttggcgggttgtttgggggaggagctgctgctgctgctggtagtggggct
acccccttttcagcttttcatgggataaaaaatggaaatgggtttgcgtcggaggaagag
cttaggtctgatccatcatatcattcatactattactcaaatgtgaatctcaacccgagg
cttccaccccctttgctttccaaggaggattggaagtatgcacagaggttgaaaggaggg
aattcagtcataggtggggttggagataagagaaaaatgaatagggttgataatggtagt
agtaggtcgatgttttcgatgccaccagggtttgattcaaggaaacaagagattgaagta
gaggcagagaagggtcgtagctcagcggagtggggtggcaatggactgattggtatatct
ggtatcggacttggaagcaaacagaaaagccttgctgaaatttttcaggatgatttggga
cacactgctccagtcgcaaggataccatcacgtcctgccagccgtaatgcttttgatgag
aactttgagaatggaggttctgctgagctgacttcttcagatactttacggtcaagtgtg
agtcttcaaggatcatctgcagtccataacattgggccacctacttcatacacttatgct
gatgctgtaggggcttccttgtctaggagtactactcctgatccccaacttgttgctagg
gctcctagtccttgtcttacaccaattggaggaggcagagttggtaactcggacaaaaga
agcataaatagtccaagcacatttgggggtatcacatctggtctcaatgagtctggtgat
ctggtagctgctatgtctggcatgaatctgtcatctaatggtgtgattgatgaagataac
caattaccgtcacagattgaacaagatgttgaaaaccatcagaattatttatttggcctt
caagatggtcagagtcatatcaaacagcaggcgtacttgaagacatctgaatctggccat
ttacatatgccttcagctaacggtaatggggtcagatcagaactcaaaaacccatccttg
ctatctgataggcaagctcagctccagaaatctgcccttccctctaacaattcttacttg
aaaggatcacctacttccacactcaatggtggaggcagtttacctgctcggtatcagcat
aatgtgttaagtggttactctctaaatcctgctttagcttctgtgatggctagccaacct
ggaactggcaatctgccaccactgtttgaaagtgttgctgcttcgtcagctattgctgtc
cccggaatggactccagagtgcttggaagaggtttggggtctggacaaagcaattcaaat
gctgcttccgagttgcatacttttggtagaggtggaagccaaatagtggggaatgctctg
caggcgtctttgattgatcctatgtatcttcagtatctgaggacttctgattacactgca
gcgcagcttgcagctcttaatgatccctccatggataggaacttcctgggtaattcatac
atgaacttgcttgagcttcaaaaagcttatcttggaactctgctatcacctcagaaatct
ccttatggtgttcccttaggtgctaaatctggtagttctaatattcatggtttttatgga
agccccacttttggagctggcatgtcgtatccaggaagccccttagcaagtcctgttatt
cccaattctccagttggacctggtagtcctatgagacatagtgacctgaatatgtgtttt
ccttccgggatgaggaatctagctgggggtgtcatgggaccctggcatttcgatgcagga
tgtaacatggatgaaagctttgcttcctccctacttgaagagtttaaaagcaataaaaca
aagtgttttgaacttttggaaattgctggtcatgttgttgagttcagcgcggatcagtat
ggcagccgatttattcagcaaaagcttgaaactgctaccacggaagagaaaaatatggtt
tatgaggagatcatgcctcaagctcttgctttgatgactgatgtctttggtaattatgtc
attcaaaagtttttcgaacatggacttccagctcagagaagagaacttgctgacaagctt
tttggccatgttttaacactaagtcttcaaatgtatggttgtcgggtgatccagaaggct
atagaagttgttgatacggatcagaagattaaaatggttcgagagcttgatggtagtgtt
atgcgttgtgtacgtgatcagaatggcaaccatgtcatccagaagtgtattgaatgtgtt
tctgaggagcacattcaatttatagttacaacgttttttgatcaagttgtgaccctttcc
actcatccatatgggtgccgagtgatacagaggatactggagcactgcaagaacccaaaa
acacagaataaggttatggatgagattttaggatctgttagcatgttggcacaagaccag
tatggcaattatgttgtccagcatgtgctagagcatggaaagcctcatgagcgttcaatt
ataataaaggagttagctggaaagattgtccagatgagtcagcagaagtttgcctctaat
gtggttgagaagtgcttaacttttggtggtcctgctgaacgactgttattggtgaatgaa
atgcttggttctactgatgagaatgagcctctacaggcaatgatgaaagatcagtttgca
aactatgtggtacagaaagtactcgagacttgtgatgaccagcaacgtgagctgatcctt
tctcgaattaaggtccatttaaatgcattgaagaagtacacttacggaaagcatattgtt
gcgcgtgtagagaaacttgttgctgctggggaaaggagaattgccgcgcagtctccacgc
cctgcttag
DBGET
integrated database retrieval system