Gossypium arboreum (tree cotton): 108475993
Help
Entry
108475993 CDS
T05776
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
gab
Gossypium arboreum (tree cotton)
Pathway
gab03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gab00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
108475993
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
gab03019
]
108475993
Messenger RNA biogenesis [BR:
gab03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
108475993
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108475993
NCBI-ProteinID:
XP_017633515
UniProt:
A0A0B0N540
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(133372394..133374701)
Genome browser
AA seq
457 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEDRLKEYFGQYGDILQTVVMRDKVTGRPRGFGFVVFSDPSVI
DTVLQEKHTIDGRTVEAKRALSREEQQTSARSGNFNQGRNSGGGGNIRTKKIFVGGLPPT
LTEDGFRQYFEAYGHVTDVVIMYDQNTQRPRGFGFISFDSEEAVDRVLHKSFHDLNGKQV
EVKPALPKDANPGGASRSMGGGAGGFGGYQGYGSSGGNSSSYDGRMDSNYMRAQGTGAGF
PPYGSSGYAPGYGYGPASNGVGYGSYGNYGGAGAGYGAPAGAAYGNPNAGYASGPPGAPR
SSWGTQTPSGYGAMGYGNAAPWGAGPGSGGPGSAATGQSPTGATGYGGQGYGYGGYGGND
GSYGNAGYGAAGGRSGGTPNSNASAGGGDMQGSGGGYMGGGYGDVNGSSGYGNASWRSDS
SQGSGNYGGSQANGPHGGQGGYGGGYGGAQGRQAQQQ
NT seq
1374 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaggggaagctgtttattggagggatatcatgggaaacaagtgaggat
aggctaaaggagtactttggccagtacggcgacatcttgcagactgttgttatgagagat
aaggtcacggggagacctcgtggctttggatttgttgtcttctcagatccgtccgtcatc
gatactgttcttcaagaaaagcataccattgatggtagaacggttgaggcaaagagggca
ttatctagagaggagcagcaaacttccgctagatctggtaattttaatcagggtagaaat
tctggaggtggtggaaatatcagaaccaagaagatttttgttggagggttgcctccgact
ttaactgaagatggatttcgccaatactttgaggcttatggtcatgtaactgatgtagta
atcatgtatgaccagaatacccagaggcctcgtgggtttggttttatctccttcgacagt
gaagaggcggttgatagggttttgcacaagagttttcatgatttgaatggcaaacaagtt
gaagtgaaaccggcccttcctaaagatgccaatcctggtggggctagccggtctatgggt
ggtggtgccggtggttttggaggttaccagggatatggttcttctggtgggaattcaagt
tcttatgatggtcgtatggactccaattacatgcgtgcccagggcactggagctggcttt
ccaccttatggttcatcaggatatgcacctggttatggttatggtcctgctagtaatggt
gttggttatggtagttatggcaattatggtggtgcaggtgctggttatggtgcccctgcc
ggtgcagcttatgggaatcccaatgctggctatgcaagtgggcctcctggtgcccctaga
agttcatggggcactcaaactccatctggttatggtgctatgggttatgggaatgctgct
ccttggggtgctggtcctggtagcggtggtccaggttctgcagctactggccaatcaccc
actggagctactgggtacggtggtcaaggttatggatatgggggatatggaggtaatgat
ggatcttatgggaacgctggttatggggctgctggaggtcgttctggtggtactccaaat
agtaatgctagtgcaggtgggggagatatgcaagggagcggtggtggttacatgggaggt
ggatatggtgatgtaaatggaagttcagggtatggaaatgcatcatggaggtctgattca
tcccaaggttcaggaaattatgggggtagtcaggccaatggtcctcatggtggacaaggt
ggttatggtggtgggtatggtggtgcacagggccgacaagctcaacagcagtga
DBGET
integrated database retrieval system
