KEGG   Gossypium arboreum (tree cotton): 108479224
Entry
108479224         CDS       T05776                                 
Name
(RefSeq) pumilio homolog 5
  KO
K17943  pumilio RNA-binding family
Organism
gab  Gossypium arboreum (tree cotton)
SSDB
Motif
Pfam: PUF PUF_NOP9 NABP
Other DBs
NCBI-GeneID: 108479224
NCBI-ProteinID: XP_017637179
LinkDB
Position
3:75632832..75643948
AA seq 1011 aa
MATESPMRMIESSGATKWRTSKDALVFDSQLKDMEVEELTMLLKGQKIRGDQTDTVPNRS
GSAPPSMEGSFTALGNLLAQKNTSLTSSLANLSSVIDKCESEEQLRSHPAYFAYYCSNIN
LNPRLPLPLISHENRRLARHIGGFGSNWRATSVDDSGNGSLPFYRTSLTTHKEEVEDDRS
SPIQALDKWAEDSNEPLLEQDLATFPGRHKSLVDLIQEDFPRTPSPVYSQSRSSGITTAD
EPIDHDVNAISSNFSSINSSSKVPESVVHSSDACMDTNAPDAHAISLIPHKDSSETSIQS
SQCPEQVVRLSTSSKNDTNVKDAKSDADSSGDVSQSVILSTVESRMRQKQEAQQSHGRNM
PQEYYSSIQPASPHQAQGLPAQASSQGLSHLYSHSRFSSVASQPLLHSSGLTLPMYATAA
PYMTSANPLYANFQPSGLYASQYNIGGYPLNPAFLPPFMGGYPSHAAISLPFDSTASGSS
FNNRTYGASTGENTPHTSDLQHLGHFYGQHGLVLPPSLVDPLHMQYLPHSFSSTYGASVQ
HGHLSSTGASGGQIDSFVQKESSGAAYIGDPKVQPPINGRLSIPNPGKVGSIGGGFYGGH
HSMGVIAQYPTSPVASPLMPSSPVGGMTPLGRRNETRFPPKAGPYSAWQGQRVSSFEDSK
RHSFLEELKSSNARKFELSDIFGRIVEFSVDQHGSRFIQQKLEHCCIEDKEFVYKEVLPH
ASRLMTDVFGNYVIQKFFEHGSCEQRNELSDQLVGNMLNFSLQMYGCRVIQKALEVIDLD
KKTRLVQELDGHVMKCVRDQNGNHVIQKCIECIPTDRIGFIISAFRGQVATLSTHPYGCR
VIQRVLEHCSNKLQSKCIIDEILDAAYDLSQDQYGNYVTQHVLERGKPHERSHIISKLTG
KIVQMSQHKYASNVVEKCLEYGDVAEREHLVEEIIGQSDENDSLLTMMKDQFANYVVQKV
LEVSNDRQRELLLDRVRVHLNALKKYTYGKHIAARFEQLLGEESDASASGH
NT seq 3036 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcaactgagagcccgatgcgaatgatagaaagtagtggggccacaaagtggcgcact
tcaaaggatgctttagtatttgattcacagttgaaggatatggaagtagaggagttgaca
atgcttttgaaaggacaaaaaatccgtggagatcaaacagatacagtgccaaatcgaagt
gggagtgctccaccaagtatggaaggttcatttacagcacttggaaaccttttggctcaa
aagaacactagcctgacttcaagcctggcaaatttgagcagtgtcattgacaagtgtgag
tctgaggagcaactgcgttctcatccagcttattttgcttactattgctccaacattaac
ttaaatccaaggcttccactgcccctcatctcacatgaaaaccgacgcttggcacgccat
attggtggtttcggtagtaactggagagcaacatctgtggatgatagtggcaatgggtcg
ttacctttttatcgaacttcactcactacacataaggaggaagttgaggatgatagatca
tcccctatacaagctttagacaagtgggcagaagatagtaatgagcctttgcttgaacaa
gacttagcaactttccctggtcgccacaagagtttggttgatctgatacaggaagacttc
ccccgcaccccttcacctgtgtatagtcagtcacgttcatcaggcatcaccacagcagat
gaaccaatagatcatgatgttaatgccatctcgtcaaatttttcttccattaactcttct
tcaaaagtacctgaatcggtcgtgcattcttctgatgcctgcatggatacaaatgccccg
gatgctcatgctattagtttgataccccacaaggattcttcagagacctctattcagagc
tcgcaatgtcctgaacaggtggttagattatcaacatcttcaaaaaatgataccaatgtg
aaagatgctaagtcagatgcggattcctctggtgatgtttcacagtctgtcatactttcc
actgtagagtccagaatgaggcaaaaacaagaagcacagcagtctcatggaaggaatatg
cctcaagaatattattcatccattcaaccagcttctccacatcaggcccaaggacttcca
gcacaggccagttctcaaggattgagccatctgtatagccattctaggttctcttctgtg
gcatcacaaccattattgcattcttctggactcacgcttcccatgtatgcaacagcagca
ccatatatgacttctgcaaacccactttatgccaattttcagccatctggtctatatgct
tcacaatacaatatcggtggatatccattgaatcctgcatttcttcccccatttatgggt
ggatacccttctcatgctgctatttctttgccatttgactctactgcttctggttcaagc
ttcaataatcgaacttatggtgcttcaactggggaaaacactcctcatacaagtgattta
cagcatcttggccacttctatgggcagcatggattagtgctgccaccttccttagtcgat
ccacttcatatgcaatacctcccacattcgtttagcagcacatatggtgcttctgttcag
catggtcatttgtcatcaactggtgcttctgggggccaaattgattcttttgtgcagaaa
gagtcaagtggtgctgcttatattggagatccaaaagttcagcctcctattaatgggagg
ctaagcattccaaatcctgggaaagttggaagtattggtggtggcttttatggaggtcac
cacagcatgggtgttattgcccaataccctacatcaccagttgctagtccgctgatgcca
tcatcaccggtaggtggaatgactcctctaggtcgcagaaatgaaactaggtttcctcca
aaagcaggaccttattctgcatggcaaggacagagagtcagcagctttgaggactccaaa
aggcattcctttctcgaagaactgaaatccagcaatgcccgaaaatttgagctctctgat
atatttggtcgtatagttgaattcagtgttgatcaacatgggagtcgatttatccagcag
aagctggagcattgctgtattgaggacaaggagtttgtttacaaagaagtccttccgcat
gcttcaagattaatgactgatgtttttggtaattacgtcattcaaaagttctttgagcat
gggagttgcgagcagcgaaatgaactttctgatcaactggttggaaatatgttaaacttt
agtctgcaaatgtatggttgtcgtgtgatacagaaggcgttggaagtgattgatcttgat
aaaaaaacccgacttgtccaggagcttgatggtcatgttatgaaatgtgtacgtgatcaa
aatgggaatcacgtcatacaaaagtgtatagagtgtatccctactgatagaattgggttt
attatttcggcatttcgtggtcaagttgccaccctttctactcatccctatggttgtcgt
gtcattcagagagttttggagcattgttcaaacaaactgcaaagcaaatgcatcattgat
gaaattttggatgctgcttacgacctttctcaagatcagtatggaaattatgttacacag
catgttttggagaggggaaagccgcatgaaaggagccacattattagcaagttgactggg
aaaattgtacaaatgagtcaacataaatatgcatcaaatgttgttgagaagtgcttggag
tatggtgatgttgctgaacgagagcatttggttgaggagataatcggacagtctgatgaa
aatgactctttattgactatgatgaaggaccaatttgcaaattatgtggtccagaaggtt
cttgaagtaagcaatgataggcaacgggaactattactggatcgtgtaagagttcatctt
aatgctttgaagaaatatacttacgggaaacacattgctgctaggtttgagcaactgctt
ggtgaagaaagcgatgcctcagcctcggggcattag

DBGET integrated database retrieval system