Gossypium arboreum (tree cotton): 108483519
Help
Entry
108483519 CDS
T05776
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
gab
Gossypium arboreum (tree cotton)
Pathway
gab03015
mRNA surveillance pathway
gab03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gab00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
108483519
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
108483519
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
gab03041
]
108483519
Spliceosome [BR:
gab03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
108483519
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108483519
NCBI-ProteinID:
XP_017642457
UniProt:
A0ABR0R648
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(4698840..4702973)
Genome browser
AA seq
453 aa
AA seq
DB search
MYGQDGGEAAPPSYAGGYGGSGGYGGGGGGYGGGGGRGGSGGHGDRGGGGRGGAGGGGYG
GGYQNRGGGGGYQGGERAGRGGGGRGGGRGGSGRDGDWLCPNPSCGNLNFARRVECNKCG
APSPAGAGGDRGSGSTSGGYSRGGGGGGYGGNRGGRDGGRGGYDGARNNNYDGGRGGNND
NRSSGSRGGSYGSSQGGEDSGYSQVPPPAPNSYGGNYPPAPNAYGGNANYGMDSVPPPTS
YTGGPTSYPSSYGGPVGGYAGEGLSDVRTGGRGGPPGGFGSGGPRNQGGGYGGPPVEAPA
KIKQCDGNCGDSCDNSRIYITNLPPDVTIEELRDLFGGIGQVGRIKQKRGYKDQWPWNIK
IYTDDKGNQKGDAVLSYEDPQAAHSAGSFFNNHVMRGYTIGVAMAEKTALKVHDHGGGKG
GYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHHYGGNRSRPY
NT seq
1362 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacggtcaagacggaggcgaagctgctccgccttcatatgctggtggttatggcgga
tctggaggctatggcggcggcggcgggggttacggtggtggtggcggacgaggtggaagt
ggaggtcatggggatcgtggtggaggcggcagaggaggagctggaggtggagggtatggc
ggtggttatcaaaatcgaggaggcggtggaggctatcaaggtggagagcgtgctggaaga
ggtggcgggggaagaggtggtggtcgtggtggaagcggacgtgatggtgattggctttgc
cctaaccccagctgtgggaacttgaactttgcacgaagagttgaatgtaacaaatgcggt
gcaccatctcctgcgggtgctggtggtgatcgtggtagtggtagtactagtggtggttat
agcagaggaggtggtggtgggggatatggtggtaatcgcggaggtagagatgggggtaga
ggtggttatgatggtgcgaggaataacaactatgatggaggcagagggggaaataatgat
aatagaagcagtggtagtagaggtggttcttatggaagtagtcaagggggagaagatagt
gggtacagtcaagttcctcctccagcgcccaattcttatggtgggaattatccacctgct
cctaatgcatatggtgggaatgcaaattatggaatggactcagtccctccacctacgagc
tatactggtggacctacatcatacccttcatcttatggtggccctgtgggtggttatgct
ggtgagggtttgagtgatgtgaggactggtggtcgtggtggacctcctggtgggtttggt
tctggtggtcctcgaaatcagggaggtggttatggtgggcctcctgttgaagcaccggct
aagatcaagcagtgtgacggcaactgtggggattcttgcgacaactcaagaatatacata
acaaatttgccacctgatgtcactattgaagaattaagagacctttttggcggcattgga
caagttggaagaattaagcagaagcgtggctataaagatcaatggccatggaatattaaa
atatacacagatgataaaggaaaccagaaaggcgatgcagttttgtcttacgaagatcct
caggctgctcactctgctggcagtttctttaacaatcatgtcatgagaggctatacgatt
ggcgtggctatggcagagaagactgcgctcaaagtacatgatcatggaggtggtaaaggt
ggctacggaggtggtggcgacaggcgcagggatagttacagagatggtggttctgggcca
gataggcatcactatggcggaaatcgttcgcgcccatactga
DBGET
integrated database retrieval system
