Gossypium arboreum (tree cotton): 108489212
Help
Entry
108489212 CDS
T05776
Name
(RefSeq) clathrin interactor EPSIN 3 isoform X1
KO
K12471
epsin
Organism
gab
Gossypium arboreum (tree cotton)
Pathway
gab04144
Endocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gab00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04144 Endocytosis
108489212
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
gab04131
]
108489212
Membrane trafficking [BR:
gab04131
]
Endocytosis
Clathrin-mediated endocytosis
Other core components
108489212
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ENTH
ANTH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108489212
NCBI-ProteinID:
XP_017649060
LinkDB
All DBs
Position
10:40329395..40338085
Genome browser
AA seq
1159 aa
AA seq
DB search
MKKALGQTVRDLKRGVNKKVLKVPGIEQKVLDATSNEPWGPHGSLLADIAMATRNYHEYQ
IIMAVIWKRMSDTGKNWRHVYKGLTVLEYLVAHGSERVIDDIREHAYQISSLSDFQYIDS
SGRDQGSNIRKKSQSLVVLVNDKERIIEVRQKAAANKDKFRSTSTGGMNRAGSGGQGDRY
DYDYQYGYRDDDRYGRYPDSNSRDGDRYSRDNEDRYGRDGYRDDDYKGRSTSVDGDQYGT
RSRSSDRDHAFDDDGDSSRGSNARADDYSQDGSFYRRHEQKFSEQNNGAPPSYEAVNESH
SPVHSERDGEISVAAAPRSSSPPASSNPNLATSDFGNLASPSNKNVEAFNAFDPRVSVSA
ASASAPVSTPAPAPPTASTSSEIDLLGALSDSWAVVPTLSETPAAEADAHAKGSMPSFAA
NPSASNSGNQGFDDPFGDGPFKAFPSGDAASAQQQILTPATTFQATMSQNMEAVQPPSVK
SEIVTGFDFGESFSAYSTLNASNSQPSSGNFQFLHQELSDPNQEDDILAEILPPSGPAND
AALHTVFSAPSSQSALPVATYGQHAQPGANMYQPAQPSANPYGQLAQPSANPYGQNGQPS
ANPYGQPEQPNANPYGQNGQPSANPYGQPVQPSTNPYGQNGHSSANPYGQPVQPSANPYS
QNGQPSANLYGLPAPPSANPYGQSSANPYGQPTQPNADPYGQSAQPNANPYSQPAQANAN
PYSQPVQVHANPYDQPAQPSANPYNQPAQPNANPYSQPTQPNANPYGQPVQPSANPYAQP
TQSVSAAPQIPGSAAQSSNGSLMIGSNGPVSSQMAAQPPTPAAPATQFNTGNFISKQGSA
VPVESQSAPQTTNDSGAHNNSDVLGGFFSQPGSNASVAPQTVPPSSTGALAIVPQPSKDK
FEPKSAVWADTLSRGLVNLNISGPKTNPLSDIGVDFDAINRKEKRLEKPAPTAITSTVTM
GKAMGSGSGIGRAGASVLRAPANPMVGSGMGMGMGGGPVGGVGMGGYVGMNQQPMGMGMG
MNMGMNPGMGMNNMGMNPGMGMSNMGINPGMGMSNMGMNPGMGMSNMGMNPGMGMSNMGM
NKGMGMNMGMNPGMGMNNMGMNPGMEMNNMGMSAGMGMNMGMGQATHMQSQSGMPGGYNP
MMGSSGYSQQQHGGGGGYR
NT seq
3480 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaggccttaggccaaactgttagagaccttaagagaggagttaataagaaagtt
cttaaagttcctggaatagagcagaaggttcttgatgccaccagcaatgagccctggggt
cctcatgggtcacttcttgcagatattgcaatggctactagaaactatcatgaataccag
ataatcatggcagtaatctggaaacgtatgagtgacactggaaagaattggcgtcatgtc
tacaagggtctgactgttttggagtaccttgttgcccatggatcagagcgtgtcatagat
gacataagagaacacgcatatcaaatatcaagtttgtccgactttcagtacattgattcc
agtggaagggaccagggtagcaatattcgaaaaaaatctcagagccttgtggttcttgta
aatgataaagaaaggataattgaagtaagacagaaggctgcagccaacaaggacaagttt
cggagcacatcaacaggtggaatgaatagggcaggttcggggggacagggggacagatat
gattatgattatcaatatggttatagagatgatgatcggtatggtagatatccagattca
aacagtcgtgatggagatcgctacagcagagataatgaagaccgctatggcagggatggt
tacagggatgatgactacaaaggtagaagtacaagtgttgatggtgatcaatatggcacc
agaagtaggagctctgatagagaccatgcttttgatgatgatggtgattcatcacggggc
agcaatgctagagctgatgattattctcaggatggaagtttctatagacggcatgagcag
aagttctctgaacaaaataatggtgctcctcctagttatgaagcagtaaatgaatctcat
agtcctgtccatagtgaaagggatggagaaatttcagtagcagctgctcccaggtcatct
tctcctcctgctagcagtaatcctaacctagcaacgtctgattttggtaatttagcatct
ccttcaaataaaaatgtggaggctttcaatgcatttgatccacgtgtttcagtttcagct
gcctctgccagtgctcctgtttctacacctgcccctgctcctcccactgcttcaaccagt
tctgaaatagacttactcggtgcactgtcagattcatgggcggttgtgccaactctatct
gaaacccctgctgctgaggctgatgcccatgctaaaggttctatgccctcctttgctgct
aatccatcagcatctaactccggaaatcagggttttgatgatccatttggtgatggtcct
tttaaggctttcccttcaggggatgctgcctcagctcagcaacaaatattgactccggcg
actactttccaggctacaatgagccaaaatatggaagcagttcagccaccttctgtaaaa
tctgagattgtcacaggcttcgacttcggggaatcattctctgcctactccactctcaat
gcctcaaacagtcaaccttcatcaggaaatttccagtttttgcatcaagaattgtcagat
ccaaatcaggaagatgatatattggcagaaatccttccaccctctggacctgcaaatgat
gcagctttacatacagtcttttcagcaccatccagccaatctgcactacctgtagctact
tatggccagcatgcacaaccaggtgctaatatgtaccaacccgcgcagccaagtgcgaat
ccatatggccagcttgctcagcccagtgctaatccatatggccaaaatgggcaaccaagt
gctaatccctatggccagcctgagcagcccaatgctaatccatatggccaaaatgggcaa
ccaagtgctaatccctatggccagcctgtgcagcccagtactaacccatatggccaaaat
gggcactcaagtgctaatccctatggccagcctgtgcagcccagtgctaacccatacagc
caaaacgggcagccaagtgctaatctctatggcctgcctgcgccacccagtgcaaaccca
tatggccagtcaagtgctaatccctatggccagccaacacaaccaaatgctgatccttat
ggtcaatctgcacaaccaaatgctaatccgtatagtcaaccagcacaagcaaatgctaat
ccatacagccaacctgtacaggtacatgctaatccatatgaccaacctgctcagccaagt
gctaatccatacaaccaacctgctcagccgaatgctaatccatacagccagcctacacag
cctaatgctaatccatatggccaacctgttcagccaagtgctaatccatatgcccaaccc
acacagtctgtgtctgcagcccctcaaattccaggatctgctgctcagagcagcaatggg
agcttaatgataggttctaatggtcctgtcagttcacaaatggctgctcaacctccaact
cctgctgcaccagctactcagtttaacactggaaactttatttcaaagcagggttctgct
gtgccagttgagtcgcagagtgctcctcaaaccacaaacgattcaggtgcacataataac
agtgatgtcctgggaggcttcttttcacaaccaggatcgaatgcttcagtggcaccacag
actgttcctccctcatcaacaggagcacttgctatagttccgcaaccatcgaaggataaa
tttgagcccaagtcagcagtttgggctgatacattgagcagaggactggtcaatttgaat
atatctggacctaaaacaaacccactgtctgatattggagttgactttgatgctattaat
cggaaggaaaagaggttggaaaagcctgccccaactgcaataacgtctactgtcacaatg
ggtaaagctatgggatctggttctggaattggccgtgctggtgctagtgttctcagagct
ccagcaaatcctatggtgggttccggcatgggtatgggaatgggtggtggtcctgttgga
ggtgttggcatgggaggctatgttggtatgaatcaacaacctatgggcatgggaatgggg
atgaacatgggcatgaacccaggcatggggatgaacaacatgggcatgaatccaggcatg
gggatgagcaatatgggcataaatccaggcatggggatgagcaatatgggcatgaatcca
ggcatggggatgagcaatatgggcatgaatccaggcatggggatgagtaatatgggcatg
aataaaggcatggggatgaacatgggcatgaatccaggcatggggatgaacaacatgggc
atgaatccaggcatggagatgaacaatatgggcatgagcgcaggcatggggatgaacatg
ggaatggggcaggcaacccacatgcaatctcaaagtgggatgcctggcggttacaaccct
atgatgggttccagtggctactctcaacagcaacatggtggtggtggtggttaccgatga
DBGET
integrated database retrieval system
