Gossypium arboreum (tree cotton): 11540271
Help
Entry
11540271 CDS
T05776
Symbol
ndhF, GoarCp079
Name
(RefSeq) NADH dehydrogenase subunit 5
KO
K05577
NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5 [EC:
7.1.1.2
]
Organism
gab
Gossypium arboreum (tree cotton)
Pathway
gab00190
Oxidative phosphorylation
gab01100
Metabolic pathways
Module
gab_M00145
NAD(P)H:quinone oxidoreductase, chloroplasts and cyanobacteria
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gab00001
]
09100 Metabolism
09102 Energy metabolism
00190 Oxidative phosphorylation
11540271 (ndhF)
Enzymes [BR:
gab01000
]
7. Translocases
7.1 Catalysing the translocation of protons
7.1.1 Linked to oxidoreductase reactions
7.1.1.2 NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
11540271 (ndhF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Proton_antipo_C
Proton_antipo_M
Proton_antipo_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
11540271
NCBI-ProteinID:
YP_005089055
UniProt:
H2B8A9
LinkDB
All DBs
Position
Pltd:132243..134444
Genome browser
AA seq
733 aa
AA seq
DB search
MEHADQYSWIIPFVPLPIPILIGMGLLLFPTATKNLRRMWAFPNILLLSIVMIFSLDLSI
QQINGSSIYQYVWSWTINNDFSFEFGYFIDSLTSIMSILITTVGIFVLIYSDNYMSHDEG
YLRFFAYMSLFNTSMLGLVTSCNLIQIYIFWELVGMCSYLLIGFWFTRPAAANACQKAFV
TNRIGDFGLLLGILGFYWITGSFEFQDLFEIFNNLIYNNEVHFLFVTLCASLLFAGAVAK
SAQFPLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGIFLVARLLPLFIVIPYIMNLISLIGII
TVLLGATLALAQNDIKRGLAYSTMSQLGYMMLALGMGSYRAALFHLITHAYSKALLFLAS
GSIIHSMEAIVGYSPEKSQNMVFMGGLRKHVPVTQIAFLVGTLSLCGIPPLACFWSKDEI
LSDSWLYSPIFAIIAWSTAGLTAFYMFRIYLLTFEGHLNVHFQKYSGKKSSSFYSIKLWG
KEEQKIINRNFRLFPLLTMNNNEQPYTIGGKKEARITITNFGYKKAFSYPHESDNTMLFP
MLILLLFTLFVGAIAIPFNQEGMHLDILSKLLTPSINLLHQNSNDFEDSYQFFKNATFSV
SIACFGIFTAFLLYKPFYSSVQNLNLLNSFVKRGPKRILLDKMIYLIYDWSYNRGYIDMF
YSISLTKGIRGLAELTHFFDRRVIDGITNGVGITSFFVGESVKYLGGSRISFYLLLYLVY
VFIFLVISYFILF
NT seq
2202 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagcatgcagatcaatattcatggatcataccttttgttccacttcccattcctatt
ttaataggaatgggactcctactttttccgacggcaacaaaaaatcttcgtcgtatgtgg
gcttttcccaatattttattgttaagtatagttatgattttttcgctcgatctgtctatt
cagcaaataaatggaagttctatctatcaatatgtatggtcttggaccatcaataatgat
ttttctttcgagtttggctactttattgattcacttacctctattatgtcaatattaatc
actactgttggaatttttgttcttatttatagtgacaattatatgtctcatgatgaagga
tatttgagattttttgcttatatgagtttgttcaatacttcaatgttgggattagttact
agttgtaatttgatacaaatttatattttttgggaattagttggaatgtgttcttatcta
ttaataggtttttggttcacacgacccgctgcggcaaacgcttgtcaaaaagcgtttgta
actaatcggataggcgattttggtttattattaggaatcttaggtttttattggataacg
ggaagtttcgaatttcaagatttgttcgaaatatttaataacttgatttataataatgag
gttcattttttatttgttactttatgtgcctctttattatttgccggcgcagttgctaaa
tctgctcaatttcctcttcatgtatggttacctgatgccatggaggggcctactcctatt
tcggctcttatacatgctgccactatggtagctgcgggaatttttcttgtagcccgcctg
cttcctctttttatagttataccttacataatgaatctaatatctttgataggtataata
acggtattattaggggctactttagcccttgctcaaaacgatattaagaggggtttagcc
tattctacaatgtcccaactgggttatatgatgttagctctaggtatggggtcttatcga
gccgctttatttcatttgattactcatgcttattcgaaagcgttgttgtttttagcatcc
ggatcgattattcattccatggaagctattgttggatattctccagagaaaagccagaat
atggtttttatgggcggtttaagaaagcacgtgcccgttacccaaattgcttttttagta
ggtacactttctctttgcggtattccaccccttgcttgtttttggtccaaagatgaaatt
cttagtgacagttggttgtattcaccgatttttgcaataatagcttggtccactgccgga
ttaacagcattttatatgtttcggatctatttacttacttttgaaggacatttaaacgtt
cattttcaaaaatatagtggcaaaaaaagtagctctttctattcaataaaactatggggt
aaagaagagcaaaaaataattaacagaaattttcgtttatttcctttattaacaatgaat
aacaacgagcagccatatacaattggtggaaaaaaagaagctcgtattactattacgaat
tttggctacaagaaggctttttcttatcctcatgaatcagataatactatgctatttcct
atgcttatattgcttctatttactttatttgttggagctatagcaattccttttaatcaa
gaaggaatgcatttggatatattatccaaattattaactccatctataaatcttttacat
caaaattcaaatgattttgaggattcgtatcaattttttaaaaatgcaactttttcagtg
agtatagcttgtttcggaatatttacagcattccttttatataaacctttttattcatct
gtacaaaatttaaacttactaaattcatttgtgaaaaggggtcctaaaagaattttattg
gataaaatgatatatttgatatatgattggtcatataatcgtggttacatagatatgttt
tattcaatatccttaacaaaaggtataagaggattggccgaactaactcatttttttgat
aggcgagtaatcgatggaattacaaatggagtaggcattacaagtttttttgtgggagaa
agtgtaaaatatctagggggaagtcgcatctcgttttatctattattgtatttagtttat
gtattcatttttttagtaatttcctactttattttattttaa
DBGET
integrated database retrieval system