Gambusia affinis (western mosquitofish): 122821562
Help
Entry
122821562 CDS
T07758
Symbol
notch3
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 3
KO
K20995
Notch 3
Organism
gaf
Gambusia affinis (western mosquitofish)
Pathway
gaf04330
Notch signaling pathway
gaf04371
Apelin signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gaf00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
122821562 (notch3)
04371 Apelin signaling pathway
122821562 (notch3)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
EGF_2
Ank_2
Ank
EGF_3
Notch
NODP
NOD
Ank_3
Ank_4
Ank_5
EGF_Teneurin
cEGF
EGF_DL_JAG
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122821562
NCBI-ProteinID:
XP_043955540
LinkDB
All DBs
Position
LG19:19736148..19764640
Genome browser
AA seq
2474 aa
AA seq
DB search
MEGNMQWIIFSLLLCFHIGEGFRCVDKNRPCQNGATCIDSPSRCICRPGFIGPFCQHLDP
CHRSPCLNGAACKSDVVNDIPQYKCVCQRGFRGQDCSLIDACATSPCANGARCVNWNNHY
NCSCPPGYQGKNCRSDIDECRKPGACLNGGLCLNLVGSFRCQCPLGYSGRTCEVSTLPCA
PSQCLNGGTCRQTSDHSYECACLPGFQGHNCENNVDDCPGHKCMNEGLCVDGVNTYNCQC
PPEWTGQYCAEDVNECLMQPNACHNGGTCFNTIGGHTCVCVNGWTGDDCSENIDDCAIAI
CFNGATCHDRVASFFCECPVGKTGLLCHLDDACVSNPCNEGAVCDTNPLNGRAICTCPAG
FVGGACNQDMDECSIGANPCEHFGKCVNTEGSFQCQCGRGYAGPRCEIDINECLSMPCQN
DATCLDRIGEFTCICMPGYMGTFCEIDIDDCESNPCVNDGICRDMVNGFTCTCQPGFTGT
MCQIDIDECASTPCQNGAKCYDRPNGYECRCAEGYEGRLCEINVNNCQPDPCHHGTCIDG
IASYTCNCDPGYTGYRCENQLNECHSNPCQNGGKCVDRVNKYICQCQHGTSGTNCEINFD
DCASNPCDYGICKDGINRYDCVCKPGFTGPKCNVEIDECASSPCRNGGTCIDEENGFHCQ
CPEGFKPPYCYSQVDECGSSPCVHGSCREDINGYRCDCEPGWVGKNCDLDRNDCLPSPCQ
NAGTCIDKLNGFTCKCRQGFRGNLCQVNNNECASSPCLNKGTCVDGVASFTCLCELPYSG
PTCAEVLTPCFPNPCANHAVCTHTPDYLGYQCNCQPGWQGQLCNIDMNECMSNPCKNRGT
CTNTLGGFVCSCRAGFTGLTCETDINDCFPNPCLSGGSCTDGVNSFHCSCLPGFTGPRCA
LEINECQSFPCKNGGTCTDYVNSYTCSCPPGFTGIHCETNIPDCTESSCFNGGTCTDKIN
GYACTCRSGFTGSHCQYEVNECDSQPCLNGGTCQDALESFRCSCPKGFEGSRCQTPVDWC
RRLSLCQNGGRCRQKDASFSCDCPNGWSGRYCDIPNMSCETAARKRGIQTDELCHHGGHC
VNSGNTHICKCPADYTGSYCEIQVDQCEDKPCRNGATCRSYVGGYQCDCMPGYTGQTCEI
EINECQSHPCQNGGTCIDLVGHYICSCPPGTLGVLCEINEDDCAPPLRLRGAPPKCLNNG
TCVDRVGGHRCNCPPGFTGDRCEGDINECLSNPCSSTNSLDCIQLSNDYLCVCKPGFTGR
RCQNRFSVCESQPCHNGGACSVTSSAPLGYTCTCQLGYAGPNCERSMSCQELSCYNGGSC
ALTKRGTRCVCLSGFGGPQCQHRSNDGCSSKPCQNGGLCTEETSFPFFHCQCPSGFMGKR
CEQSKSEHPSLSCPRADCQGKANDGVCDKECNTLPCRWDGGDCSLAVNPWAHCKDPRCWR
AFNNSQCDEFCNNPECLYDNFDCRSKEKVCNPIYASYCDAHYADGQCDQGCNTEECGWDG
LDCAETVPEDLANGVLVLVVLLPPDKLLLTGKAFLQKLSAILHTSVRFRLDENGDAMILP
YTRREARLKRELGHQNEVVGSIVYLEIDNRLCIRDSEDCFPTAKSAAEYLGALSATEMLN
FPYPLREVRGEKIPVGPDPPIMILLTRWMVPCLVLIFVLVILVIGMLITRRKREHSTLWF
PEGFFLKKEPSSNKNRREPVGQDALGLKHMPKTVEESLLGDHSDQWMDSDCPEAKRLKVE
EPSMLSDSEDAVDCRQWTQHHLVAADIRVPPTIALTPPQGEFESDCMDVNVRGPDGFTPL
MLASFCGGGLEPEVTEEEESEECSANIISDLIYQGASLAAQTDRTGETALHLAARYARAD
AAKRLLDAGADANAQDNTGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATDLDSRMYDGSTALILA
ARLAVEGMVEELITCHADVNAVDELGKSALHWAAAVNNVDATIALLKNGANKDMQDLKEE
TPLFLAAREGSCEAVKVLLAHFSNREITDHMDRLPRDIALERMHHDIVQLLDEYNTVRSP
QGHGAAGHQLAGGHTLSPLMCPPSAFLPSLKNTPQSKKNRRPGVKGSSLGGQHASLKESV
KARNKKLTLDMQSALLDSSVTLSPVDSLDSPHGGASNAGYITNPTSPVAMQSPGLFHSSM
SVPNTPMVHSSMLEGGGPFAVSLAQINDIGAGAMSMQGHVSMASDVNHGYVLSSGQLGVN
MGIVSPVSVPFDWHNRMPPSSQCGQQVVNIVQSSQAGMHVQSPAMQQQNMLMHQQQLYRS
PMLQPTPVTSTQAIGTVKLPSIAEQQQLINHNITNQPSMGPMGTSTPPTPQTSQPPPSFF
QQHQQQQHQQQLPQQSSQPPVQPTQGAAAAAAQPAQVLSSQPSGSAAGNEDYPTPPSQHS
YSSTLDATPKHFHNLPSEHPYLTPSPESPEHWSSPSPHCVSDWSDSTPSPAVAVPNQTQI
TQIPEANGKMQVFA
NT seq
7425 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagggaatatgcaatggattattttctcgcttttattgtgctttcatattggtgaa
gggttccgctgtgtggataaaaacaggccctgtcaaaatggagcgacatgcatagattct
ccctctagatgcatatgtcgtcctggattcattggccctttttgtcaacacctggatccc
tgtcatcgatccccatgtctgaatggagcagcttgcaagagtgatgtggtcaatgatatt
ccacagtacaaatgtgtgtgccaaagaggtttcagaggtcaagactgctccctcattgat
gcttgtgccacaagcccatgtgctaacggggctcgctgtgtcaattggaataaccattac
aactgttcctgcccgcccgggtaccagggaaagaattgccgcagtgatattgatgagtgt
cgcaaacctggcgcttgtctcaatggtggcctgtgtctgaacttggttgggtccttccgc
tgccagtgtccactaggatacagtggtcgtacgtgtgaggtgtctaccttaccctgtgcc
ccatctcagtgtctcaatgggggcacctgtcgccagacaagtgaccattcctatgagtgt
gcttgcctaccaggatttcagggacacaactgtgagaacaatgtggacgactgcccaggt
cacaagtgcatgaatgaaggactatgtgtggatggagtgaatacatacaactgccagtgt
ccaccagaatggacaggacaatactgtgctgaagatgtcaatgagtgcctcatgcaacct
aatgcatgccataatggaggcacttgcttcaacactatcggtggtcatacatgcgtctgt
gtcaatggttggactggagatgactgcagtgagaacatcgatgactgtgcaatagctatt
tgcttcaacggtgccacatgccatgaccgtgtagcatccttcttctgcgagtgtccagtt
gggaagacaggtctgctttgtcatctggatgatgcatgtgtcagcaacccttgcaatgag
ggggccgtgtgtgacaccaatccccttaatggtcgtgctatttgcacctgtcccgctggt
tttgttggtggtgcctgcaatcaggatatggatgagtgttccattggtgcaaacccttgt
gagcattttggaaaatgtgtaaacacagaaggctcctttcagtgtcagtgtggtcgtgga
tatgctggcccacgttgtgaaattgacatcaatgaatgcctttccatgccctgtcagaat
gatgccacctgcttggaccgcattggagagttcacttgcatatgcatgccaggttatatg
gggactttctgtgaaattgacattgatgactgtgagagcaacccatgtgtgaatgatggc
atctgtcgggacatggtcaacggcttcacttgcacctgtcagccagggtttactggcacc
atgtgtcaaattgacatagatgagtgtgctagcactccctgccagaatggagcaaaatgc
tatgaccggcccaatggatatgagtgccggtgcgctgaaggttatgaagggagactttgt
gaaattaatgtcaacaactgtcaacctgacccatgccaccatggcacttgcatagatggc
attgccagctacacatgtaattgtgatcccggatatacaggctatcgctgtgaaaaccaa
cttaatgagtgccacagcaatccttgtcagaatgggggcaagtgtgtggaccgggtcaat
aagtatatttgtcagtgccagcatggaacttcaggtacaaactgtgagataaactttgat
gattgtgccagtaacccttgtgattatggcatctgtaaagatggcatcaaccgctatgat
tgtgtttgcaaacctggctttacaggtccaaaatgtaatgtggaaatagatgagtgtgca
tctagcccctgtagaaatgggggaacgtgtattgatgaagaaaatggattccactgccag
tgtcctgaaggctttaaacccccttactgttactcccaggtggatgagtgtggcagcagc
ccatgtgtccatggctcctgcagagaggacataaatggataccgttgtgactgtgaacct
ggatgggttgggaagaactgtgacctggacaggaatgactgtttaccaagtccttgtcaa
aatgctggaacttgcatagataaacttaatggttttacctgcaagtgtcgccaagggttc
agaggtaacctctgccaggtgaacaacaatgaatgtgcttccagtccctgtctaaataag
ggaacttgtgtggatggtgttgcaagtttcacatgtctatgtgagctcccctatagtgga
cctacttgtgctgaggtcctcacaccttgcttccctaacccttgtgccaatcatgcagtc
tgtacccacaccccagactacctgggttatcagtgtaactgccagccagggtggcaaggt
cagttgtgtaacatagatatgaatgaatgcatgtcaaatccctgcaaaaaccgtgggacc
tgcacaaacacgctaggaggctttgtgtgttcctgtagagcaggatttacagggctgact
tgtgaaacagatatcaatgactgttttcccaacccttgcttaagtggaggttcgtgtaca
gatggcgtgaactcatttcactgtagttgcttgcctggcttcacaggccctagatgtgcc
ctggagatcaatgaatgtcaaagtttcccctgtaaaaatggaggcacctgtacagattat
gtcaactcttacacatgtagttgcccacctggctttactggcatccactgtgaaaccaac
attccagattgcactgaaagctcttgctttaatggagggacttgcacagacaaaatcaat
ggctatgcttgcacctgtcgctctggcttcactggctcccactgccagtatgaagtaaat
gaatgtgactctcagccatgtctaaacggaggcacctgtcaagatgccctggagtccttc
cgctgttcctgtccgaagggctttgaaggcagcaggtgccagacaccagttgactggtgc
cgacgcttgtctctgtgccagaatggaggacgttgccgccaaaaggatgcgtctttcagt
tgtgattgtcctaatggttggtctggacgttattgtgacatcccaaacatgtcttgtgaa
acagcagctcgcaagaggggaatccaaacagatgagctttgccaccatggtggtcactgc
gtcaactctggcaatacacacatttgtaaatgccctgctgactacactgggagttattgt
gaaatacaagtggaccaatgtgaagacaaaccttgtcgcaatggtgccacctgcaggtca
tatgttggcgggtaccagtgtgattgcatgcctggctatactggacagacatgtgagatt
gaaatcaatgagtgccagtctcatccatgccagaatgggggcacttgtattgatctagtt
ggacattatatctgctcttgtccccccggcacactgggtgttctctgtgagattaatgag
gatgactgtgcaccaccactgaggctacgaggtgctccacccaagtgtctcaataacgga
acctgtgtagacagagttggtggtcatcgctgcaattgtccaccgggtttcacaggagac
agatgtgagggagacataaatgagtgtctctcaaacccttgtagttccaccaacagtctt
gactgcatccagttgtccaatgattacctgtgtgtctgcaagccagggtttacaggacga
aggtgtcagaacaggttcagtgtgtgtgaatctcagccttgtcataacgggggtgcctgt
tcagtaactagcagtgcccctctgggatacacctgtacatgtcaacttggttatgctggt
ccaaactgtgaaaggagcatgtcctgccaggagctgtcttgctacaatggggggagttgt
gcccttaccaagaggggaacacgctgtgtgtgcttgtcaggctttggtgggccccaatgt
cagcatcgcagtaatgatgggtgctcttccaagccatgccagaatggaggcctgtgcact
gaagaaaccagcttcccatttttccactgccagtgcccaagtggatttatgggaaaacgg
tgcgaacaaagcaaatctgagcatccgtctctctcctgccctagggcagattgtcaaggc
aaagccaatgatggtgtttgtgacaaggaatgtaatacacttccttgtcgttgggatggt
ggtgactgctccctggcagtgaatccctgggctcattgcaaagacccccgctgttggcgt
gccttcaacaatagccagtgtgatgaattctgtaacaaccccgagtgtctatatgacaat
tttgactgcagaagcaaagaaaaagtttgcaatccaatatatgcaagttactgcgacgcc
cattatgctgatggtcagtgtgaccagggctgcaacacagaagagtgtggttgggatggc
ttagattgtgcagagacggttccagaggatcttgccaatggtgttttggtgttggtcgtc
cttctgcctccagacaagcttctcctcactggcaaagcttttttgcagaaattgagtgct
atcctgcacacttcagtacgcttcagattggatgaaaatggagacgcaatgatccttcct
tacacccgtcgagaggcgcgcctcaaacgagaacttggacatcaaaatgaagttgttggg
tctatagtctatctggagatagacaaccgtttgtgcattcgagattcagaggactgtttc
ccgacagctaaaagtgcagcagagtatcttggagctctatctgcaacagaaatgctcaac
ttcccttatcctcttcgagaagtcagaggagaaaagatccccgttggtccagatccacca
ataatgattctacttacccgatggatggtgccctgtttagtgttaatttttgttttggtc
atccttgtgattggcatgttgataactcgtcggaagcgtgaacacagcaccctttggttc
cctgaaggcttctttcttaagaaggaacccagcagtaacaaaaaccgcagggaacctgta
ggtcaagatgctcttggactgaaacacatgccaaaaacagttgaggaatctctcctcggt
gatcacagtgatcagtggatggactcagattgcccagaagccaaacgactcaaggttgag
gagccaagcatgctctcagacagcgaagatgcagtggactgcagacagtggacccagcat
catctcgtagctgcagacatccgtgtaccacccacgatagccctcacaccacctcaagga
gaatttgaaagtgactgcatggacgttaatgtccgaggcccagatggttttacacctctg
atgctggcatcattctgtggaggcggcctagaacctgaggtgacagaggaggaggagagt
gaagagtgctctgccaacattatctctgacttaatctaccagggtgcatcactcgctgca
caaacagaccgtactggcgagacagcactccacttggcggctcgctacgcacgtgctgat
gctgcaaagcgcctgctggatgccggagcagacgccaatgctcaagataacacgggacga
acaccgttacatgctgctgtggctgcagatgcacagggtgtcttccagattttgattcga
aatcgcgccactgatctggactcccgtatgtacgatggctctactgctctaatcctggct
gcacgactggcagtggaaggcatggttgaggaactaattacatgccatgcagatgtcaat
gcagtcgatgaattgggtaaatctgctttgcattgggctgcagctgtaaacaatgtagat
gctactattgctttgctgaaaaatggcgccaacaaagatatgcaagatctgaaggaggag
acccctctgttccttgcagcccgtgaaggaagttgtgaggcagtgaaggtgctccttgct
cacttctcaaacagagaaattacagaccacatggacaggctgccgagagacattgctcta
gagcgtatgcaccacgatattgtacaacttcttgatgaatacaacacagtaaggagtccc
cagggtcatggagcagctggacaccaactcgcaggaggccacactctatctcctctcatg
tgccctcccagtgccttcctccctagtctgaagaacaccccacagagcaagaagaaccgc
cggcctggggtcaaaggttccagcctgggaggccagcatgcaagtctcaaggagtcagta
aaggctcgcaataagaagctaactctggacatgcagagtgccttattggatagctcggtt
actctgtccccagtggactccttagactcaccgcacgggggagctagcaatgctggctac
atcaccaatccaacgtcacccgttgccatgcagtcaccaggtcttttccattcctccatg
tctgttccaaacaccccaatggttcacagtagcatgttggaaggagggggcccatttgca
gtgtctcttgcacaaattaatgacattggagcgggagcaatgtccatgcagggccatgtc
tctatggcctcagatgtcaaccatggctatgtgctgagctctggccagctgggggtcaac
atgggcatagtcagtcctgtcagtgtgccatttgactggcacaatcgcatgcctccatcc
tctcagtgtggtcagcaggttgtgaatattgtgcagagtagtcaagcaggcatgcatgtc
cagagcccagccatgcagcaacagaacatgctgatgcaccaacagcagctctaccgcagt
ccaatgctgcagcccacaccggttacctccactcaggccatcggcacagtgaagctgcct
tccattgcagagcaacagcagctcattaatcacaacatcaccaaccagccaagcatgggt
cctatgggaacgtctacgccacctaccccacaaacctcgcagcctccaccatcattcttc
cagcagcatcagcagcagcagcatcagcagcagctgcctcagcagtcgtctcagcctcct
gttcagcctacccaaggagcagcagcagcagcagcccagccagctcaggtcctttcctcc
cagccaagtggtagcgctgcagggaacgaggattatccaacacctccttcccaacacagt
tattcatccacattagatgccacacccaagcatttccacaatttgcccagtgagcaccca
tatctgacaccctctccagagtctccagagcactggtccagtccctctccccactgcgtc
tctgattggtcagattccacaccaagcccagctgtcgctgtccccaaccagacccaaatt
actcaaatcccagaggccaatggcaagatgcaggtgtttgcatga
DBGET
integrated database retrieval system
